Breve reseña de nuestra actividad específica en esta área, orientada al sector productivo y aplicado en nuestra región de influencia: Uruguay, Paraguay y Bolivia.
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Introducción a la Gestión de Transferencia de Tecnología
1. Dr. Eduardo Terranova DMTV
Asesor en Transferencia Tecnológica
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2. Breves conceptos sobre la GTT
El mundo productivo tiene características de
complejidad sin precedentes.
Nunca como en la actualidad, se han combinado de
manera tan profunda, universos que en otros tiempos
eran independientes e inconexos.
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3. La producción agrícola ganadera, moderna, así como la
industria alimentaria y agroindustria en general,
requieren de sofisticados sistemas de control y análisis
en sus procesos productivos y de biotransformación.
Estos procesos son extensos, complejos y sobre todo
polifacéticos, pues abarcan factores como: naturaleza,
biología de los organismos involucrados y tecnologías
de transformación para los productos finales.
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4. Estos sectores cada vez mas interrelacionados, tienen sus
requerimientos propios de control de eficiencia y
eficacia.
Se requiere conocer componentes biológicos,
características precisas de los componentes químicos.
Es necesario detectar presencia de agentes biológicos
contaminantes, adulterantes y factores que afectan la
calidad de los productos o materias primas. Sin
mencionar factores de inocuidad y bioseguridad
exigidos en forma creciente en el mundo
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5. Ciclo de trabajo tipo y tecnologías
involucradas
Elegiremos como ejemplo, el principal rubro de
producción y exportación del Uruguay para hacer el
seguimiento de la cadena tecnológica involucrada
directa o indirectamente.
Producción carne bovina:
Ciclo completo incluyendo productos de exportación.
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6. Producción Ganadera
Para ser sintéticos, comenzaremos a considerar los
procesos productivos a partir de las unidades
ganaderas puestas en campo productivo. Esto implica
que obviaremos los segmentos anteriores que implican
la selección, producción de gametos y embriones ,
actividad de cabañas y sus tecnologías implicadas.
Estas serán tratadas en otra instancia
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7. Controles de factores que requieren Tecnologías
específicas , sin considerar sanidad animal
Control de calidad de suelos y pasturas: análisis de
nutrientes en ambos medios.
Control de praderas y raciones suplementarias en
sistemas de producción intensiva
Controles de suelos, silos y ensilajes: Micotoxinas
Controles de Pesticidas en suelos agua y forrajes
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8. Tecnologías correspondientes
Tecnologías de análisis elemental: espectrofotometría de
absorción atómica (AA), espectrofotometría de plasma
acoplado (ICP), cromatografía liquida de alta
eficiencia (HPLC), cromatografía iónica (IC),
espectrometría de masas (LC-MSMS; qTOF) y
Cromatografía Preparativa.
Análisis genético automático (secuenciación, genotipado
STR y SNP) y PCR cuantitativa en tiempo real (OGMs)
Secuenciación Masiva de Nueva Generación (NGS),
como gran capítulo de desarrollo tecnológico mas
reciente.
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9. Al enunciar tecnologías, estamos mencionado de hecho,
diferentes laboratorios especializados expertos en cada
una de ellas.
En efecto así ocurre. Existen diversos laboratorios
diseminados por el territorio que realizan análisis
concretos y especificos.
Resulta obvio que no encontraremos éstos
equipamientos en un establecimiento ganadero o
planta industrial u hospital.
En esta comunicación nos referiremos solamente a las
tecnologías moleculares como epicentro.
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10. ¿Como definimos transferencia de
tecnología?
“La transferencia de tecnología es el proceso en el que
se transfieren habilidades, conocimiento, tecnologías,
métodos de fabricación e instalaciones entre los
gobiernos o las universidades y otras instituciones.
Su objetivo es asegurar que los avances científicos y
tecnológicos sean accesibles a un mayor número de
usuarios que puedan desarrollar y explotar aún más
esas tecnologías en nuevos productos, procesos,
aplicaciones, materiales o servicios.1”
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11. ¿Cómo definimos el concepto de
gestión?
“Del latín gestĭo, el concepto de gestión hace referencia
a la acción y a la consecuencia de administrar algo.
Al respecto, hay que decir que gestionar es llevar a
cabo diligencias que hacen posible la realización de
una acción específica.”
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12. Nuestra concepción de GTT
comprende
Detectar
necesidad en
campo
identificar
productores
de
conocimiento
y solución
convocar a los
generadores
de la solución
Tomar la
solución
aplicar la
solución a
nivel de
campo
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13. En éste círculo virtuoso, es necesario tener una
visión global y holística del contexto.
Determinar las necesidades a conformar
observando las demandas y características
externas (mercados, gobiernos, agencias).
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14. Resultados de la GTT
Producto mejorado a adaptable
a condicionantes del mercado
capacidad de
aplicación de
solución al
campo
vínculo
biunívoco con
academia
Conocimiento
de campo y
objetivación de
necesidades
tecnológicas
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15. Áreas de experiencia en aplicación
de GTT.
Sanidad y producción animal
Sanidad y producción vegetal
Microbiología agraria e industrial
Selección asistida por marcadores genéticos (animal y vegetal)
Caracterización de componentes y diseño de fórmulas alimentarias infantiles en
lácteos.
Ambientalismo: detección de contaminación química y biológica de suelos y
aguas: Pesticidas y biota oportunista (algas cianofitas y producción de Micro
cistinas)
Seguridad alimentaria (E. coli O157 H7, STECS, …)
Residuos en alimentos (carnes: pesticidas, disruptores endocrinológicos,
hormonas, antibióticos)
Farmacocinética: Biodisponibilidad y bioequivalencia en específicos
veterinarios.
Control de drogas de abuso: anabólicos, dopaje en animales de deporte y cabaña.
Medicina Veterinaria: desarrollo y puesta a punto de técnicas de diagnóstico
molecular.
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18. 5
Natch CS--Megnetic beads+One tube
• 48 samples throughput ≤90 min for mag kits
• 96 samples throughput ≤30 min for fast kits
• Original blood collection tubes for extraction
• Room temperature chemical lysis for 10 min
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19. 6
Natch CS +Unified Extraction platform
• Unified extraction platform for different type of samples
• One stop workstation from DNA/RNA extraction to PCR set up
• 14 PCR thermocyclers' validation with Natch CS
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25. 12
Natch CS --A Perfect Partner of Molecular diagnostic laboratory
Every Molecular diagnostic laboratory deserve a Natch CS!
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26. Red Operativa de Preparación de
Muestras Especializadas por Aplicación
para Núcleo de Secuenciación NGS
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27. Ejemplos de Remitentes a Núcleo Analítico
Preparación
de Librerías
para
genómica
Preparación
de Librerías
para
Microbiología
(infectologia)
Centro de
Secuenciación
Masiva de
Aplicación
Genérica
28. Optimización de plataformas
Creación de Centros de Secuenciación
Reciben las muestras preparadas por especialidad, respetando
las condiciones específicas de su proceso.
Generan los informes de secuencias que retornan a los
laboratorios remitentes.
Creación laboratorios preparadores de muestras para
NGS ubicados in situ donde se requiere una aplicación concreta.
Equipado con los instrumentos y reactivos especialmente
destinados a la aplicación, que redundará en un chip que se remite
al núcleo de secuenciación, evitando multiplicación de costos.
29. Resultado de la Red Optimizada
La Tecnología NGS, debido a su idiosincrasia requiere de
grandes cantidades de muestras para procesar una sola
corrida.
El costo operativo por muestra resulta muy atractivo. Sin
embargo, requiere de grandes volúmenes para alimentar al
sistema.
Las muestras son altamente específicas para cada
aplicación. Su método de preparación requiere reactivos y
consumibles específicos y en gran cantidad
La creación de laboratorios preparadores de muestras in
situ, hace factible la inversión para cada uno de los
usuarios y la del Núcleo que solo invierte en la plataforma
instrumental central.
31. PCR Y qPCR
PCR: Técnicas e instrumentación para detección de Fragmentos
de DNA, cDNA genómico o general. Aplicado a micro organismos,
factores de expresión y detección de eventos genéticos de orden
cualitativo.
qPCR: Técnicas para la detección de productos de amplificación
in vitro y su cuantificación en tiempo real durante la etapa
exponencial de amplificación. Aplicado a la detección de genes
de expresión y mecanismos de cinética de transcripción de DNA
Genómico, aplicado a procesos dinámicos y funcionales.
Existen numerosos kits comerciales de diagnóstico para un amplio
portafolios de patologías y estudios genéticos aplicados a diferentes
áreas. Esto incluye plataformas instrumentales, reactivos, consumibles
validados y kits de reactivos personalizados para estudios de expresión
génica, polimorfismos SNPs, Oncología, entre otros.
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32. Secuenciación y Análisis Genético
Definimos y diferenciamos ambos términos como entidades
separadas.
- Secuenciación: Técnicas destinadas a determinar las
secuencias nucleotídicas de un fragmento o la totalidad de
un genoma y determinación de mutaciones puntuales
relacionadas a patologìas. (Métodos de Sanger,
Pirosecuenciación, o Secuenciación Masiva de Nueva
Generación –NGS_)
- Análisis de Fragmentos: Análisis de fragmentos de ADN
genómico que se comportan como unidad genética y
analítica a los efectos de su estudio automatizado.
Generalmente se transmiten en forma mendeliana y se
relacionan con caracteres genotípicos de interés.
(Microsatélites, AFLP)
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33. Secuenciación Masiva de Nueva
Generación (NGS)
Se trata de la tecnología mas nueva e innovadora per se
Por estar en constante actualización y generando nuevos
campos de aplicación en la totalidad del espectro de la
genómica.
De la evolución competitiva de las grandes compañías
surgió el liderazgo internacional de ILLUMINA.
Liderazgo que se soporta en el constante y racional
proceso de creación de métodos aplicados y adecuados
a las condiciones reales de cada sector.
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34. Secuenciación Sanger y
Pirosecuenciación
Siendo la primera, la tecnología líder en el mundo
desde fines de la década del noventa, tuvo su papel
protagónico en la secuenciación del Genoma Humano
en 2000 y predominó como Gold Standard de los
estudios de Genómica.
35. Áreas de Aplicación NGS
Tecnología ILLUMINA
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36. Areas de Aplicación
Ciencias Básicas
Genómica aplicada:
o perinatología y Screening prenatal de
enfermedades cromosómicas
o Enfermedades Raras
Transplantes de órganos y Tejidos: Genotipado HLA.
Oncología y Genómica Médica
Microbiología en todas sus áreas.
Veterinaria: Patología Animal y Producción
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38. Concepto de Ciclo de Trabajo
Muestras a procesar
Muestras de diferente naturaleza: Muestras biológicas
sangre, suero, plasma, líquidos biológicos, biopsias
líquidas, tejidos y órganos, alimentos, materias primas,
muestras de suelos y vegetales.
Métodos a correr:
métodos analíticos específicos para cada tipo de muestra
Soluciones a aportar
Elección del método óptimo para análisis
Medios y herramientas
Selección óptima de la/s tecnología/s disponible/s
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39. Tecnología para la Preparación de
Muestras para NGS
Tecnología de Análisis Automático de Fragmentos por
electroforesis Capilar:
Advanced Analytical,
Fragment Analyzer
¿Qué aporta la tecnología de análisis de fragmentos?
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40. Fragment Analysis Mejora el Flujo de Trabajo
mediante las siguientes prestaciones:
1. Producción de Librerías para NGS
2. Análisis de fragmentos de DNA Genómico hasta
40,000 pb
3. Fragmentos de DNA de hasta 20,000 pb
4. Procesamiento de RNA total, RNA Mensajero, cDNA
y microRNA
5. Análisis de Genética Reversa (TILLiNG), Detección
de Mutaciones
6. SSR, Genotipado y Análisis de Fragmentos de PCR
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44. Medios y Herramientas
Identificación, de los tipos de instrumentación adecuada y su
integración óptima en base al objetivo general del núcleo
tecnológico.
Determinación de flujo de personal y materiales en planta.
Fase Preparativa: métodos, equipos e insumos para
extracción / Purificación de Acidos Nucleicos.
PreAmplificación . Preparación de librerías específicas por
aplicación para NGS
Fase de Procesamiento, Post Amplificación: Selección e
integración de Instrumentación y materiales,. Métodos y
técnicas.
Fase de derivatización a estudios pormenorizados:
Secuenciación Sanger o PPS o NGS
Interpretación de resultados y elaboración de informes
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45. CICLO DE TRABAJO
Corte/ fijaciónj.Microsc. Proces. ImagenImag. Molec. RESULTADOSP-
INFORME
PCR-RTPCRSEQ./ NGS RESULTADO
Extracción, Separación, Análisis
Purific.
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46. Curva de Aprendizaje
Nuestra propuesta contempla una transferencia total de
tecnología, que incluye Hardware, software, métodos y
bibliotecas puestos a punto, así como entrenamiento
especializado con seguimiento para asegurar que el
equipo técnico del laboratorio esté produciendo
resultados con parámetros de GLP en un período de 3
a 6 meses.
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