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Dr. Eduardo Terranova DMTV
Asesor en Transferencia Tecnológica
28/12/2016 1www.eduardo-terranova.com
Breves conceptos sobre la GTT
El mundo productivo tiene características de
complejidad sin precedentes.
Nunca como en la actualidad, se han combinado de
manera tan profunda, universos que en otros tiempos
eran independientes e inconexos.
28/12/2016 2www.eduardo-terranova.com
La producción agrícola ganadera, moderna, así como la
industria alimentaria y agroindustria en general,
requieren de sofisticados sistemas de control y análisis
en sus procesos productivos y de biotransformación.
Estos procesos son extensos, complejos y sobre todo
polifacéticos, pues abarcan factores como: naturaleza,
biología de los organismos involucrados y tecnologías
de transformación para los productos finales.
28/12/2016 3www.eduardo-terranova.com
Estos sectores cada vez mas interrelacionados, tienen sus
requerimientos propios de control de eficiencia y
eficacia.
Se requiere conocer componentes biológicos,
características precisas de los componentes químicos.
Es necesario detectar presencia de agentes biológicos
contaminantes, adulterantes y factores que afectan la
calidad de los productos o materias primas. Sin
mencionar factores de inocuidad y bioseguridad
exigidos en forma creciente en el mundo
28/12/2016 4www.eduardo-terranova.com
Ciclo de trabajo tipo y tecnologías
involucradas
Elegiremos como ejemplo, el principal rubro de
producción y exportación del Uruguay para hacer el
seguimiento de la cadena tecnológica involucrada
directa o indirectamente.
Producción carne bovina:
Ciclo completo incluyendo productos de exportación.
28/12/2016 5www.eduardo-terranova.com
Producción Ganadera
Para ser sintéticos, comenzaremos a considerar los
procesos productivos a partir de las unidades
ganaderas puestas en campo productivo. Esto implica
que obviaremos los segmentos anteriores que implican
la selección, producción de gametos y embriones ,
actividad de cabañas y sus tecnologías implicadas.
Estas serán tratadas en otra instancia
28/12/2016 6www.eduardo-terranova.com
Controles de factores que requieren Tecnologías
específicas , sin considerar sanidad animal
Control de calidad de suelos y pasturas: análisis de
nutrientes en ambos medios.
Control de praderas y raciones suplementarias en
sistemas de producción intensiva
Controles de suelos, silos y ensilajes: Micotoxinas
Controles de Pesticidas en suelos agua y forrajes
28/12/2016 7www.eduardo-terranova.com
Tecnologías correspondientes
Tecnologías de análisis elemental: espectrofotometría de
absorción atómica (AA), espectrofotometría de plasma
acoplado (ICP), cromatografía liquida de alta
eficiencia (HPLC), cromatografía iónica (IC),
espectrometría de masas (LC-MSMS; qTOF) y
Cromatografía Preparativa.
Análisis genético automático (secuenciación, genotipado
STR y SNP) y PCR cuantitativa en tiempo real (OGMs)
Secuenciación Masiva de Nueva Generación (NGS),
como gran capítulo de desarrollo tecnológico mas
reciente.
28/12/2016 8www.eduardo-terranova.com
Al enunciar tecnologías, estamos mencionado de hecho,
diferentes laboratorios especializados expertos en cada
una de ellas.
En efecto así ocurre. Existen diversos laboratorios
diseminados por el territorio que realizan análisis
concretos y especificos.
Resulta obvio que no encontraremos éstos
equipamientos en un establecimiento ganadero o
planta industrial u hospital.
En esta comunicación nos referiremos solamente a las
tecnologías moleculares como epicentro.
28/12/2016 9www.eduardo-terranova.com
¿Como definimos transferencia de
tecnología?
“La transferencia de tecnología es el proceso en el que
se transfieren habilidades, conocimiento, tecnologías,
métodos de fabricación e instalaciones entre los
gobiernos o las universidades y otras instituciones.
Su objetivo es asegurar que los avances científicos y
tecnológicos sean accesibles a un mayor número de
usuarios que puedan desarrollar y explotar aún más
esas tecnologías en nuevos productos, procesos,
aplicaciones, materiales o servicios.1”
28/12/2016 10www.eduardo-terranova.com
¿Cómo definimos el concepto de
gestión?
“Del latín gestĭo, el concepto de gestión hace referencia
a la acción y a la consecuencia de administrar algo.
Al respecto, hay que decir que gestionar es llevar a
cabo diligencias que hacen posible la realización de
una acción específica.”
28/12/2016 11www.eduardo-terranova.com
Nuestra concepción de GTT
comprende
Detectar
necesidad en
campo
identificar
productores
de
conocimiento
y solución
convocar a los
generadores
de la solución
Tomar la
solución
aplicar la
solución a
nivel de
campo
28/12/2016 12www.eduardo-terranova.com
En éste círculo virtuoso, es necesario tener una
visión global y holística del contexto.
Determinar las necesidades a conformar
observando las demandas y características
externas (mercados, gobiernos, agencias).
28/12/2016 13www.eduardo-terranova.com
Resultados de la GTT
Producto mejorado a adaptable
a condicionantes del mercado
capacidad de
aplicación de
solución al
campo
vínculo
biunívoco con
academia
Conocimiento
de campo y
objetivación de
necesidades
tecnológicas
28/12/2016 14www.eduardo-terranova.com
Áreas de experiencia en aplicación
de GTT.
 Sanidad y producción animal
 Sanidad y producción vegetal
 Microbiología agraria e industrial
 Selección asistida por marcadores genéticos (animal y vegetal)
 Caracterización de componentes y diseño de fórmulas alimentarias infantiles en
lácteos.
 Ambientalismo: detección de contaminación química y biológica de suelos y
aguas: Pesticidas y biota oportunista (algas cianofitas y producción de Micro
cistinas)
 Seguridad alimentaria (E. coli O157 H7, STECS, …)
 Residuos en alimentos (carnes: pesticidas, disruptores endocrinológicos,
hormonas, antibióticos)
 Farmacocinética: Biodisponibilidad y bioequivalencia en específicos
veterinarios.
 Control de drogas de abuso: anabólicos, dopaje en animales de deporte y cabaña.
 Medicina Veterinaria: desarrollo y puesta a punto de técnicas de diagnóstico
molecular.
28/12/2016 15www.eduardo-terranova.com
Aplicaciones en Genómica
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 16
3
Natch CS---Sansure Patented Fully
Automated Nucleic Acid Extraction System
 Extremely workflow optimization
 Unexpected operation reliability
 Unimaginable cost effectiveness
28/12/2016 17www.eduardo-terranova.com
5
Natch CS--Megnetic beads+One tube
• 48 samples throughput ≤90 min for mag kits
• 96 samples throughput ≤30 min for fast kits
• Original blood collection tubes for extraction
• Room temperature chemical lysis for 10 min
28/12/2016 18www.eduardo-terranova.com
6
Natch CS +Unified Extraction platform
• Unified extraction platform for different type of samples
• One stop workstation from DNA/RNA extraction to PCR set up
• 14 PCR thermocyclers' validation with Natch CS
28/12/2016 19www.eduardo-terranova.com
7
Natch CS--Standardization Layout of PCR Laboratory
28/12/2016 20www.eduardo-terranova.com
8
Natch CS--Larger Piping Volume
Piping Volume :
10-1000μL
28/12/2016 21www.eduardo-terranova.com
9
Natch CS--Self Elevating Magnetic Grate
28/12/2016 22www.eduardo-terranova.com
10
Natch CS--Humanized Design
Air gapPortable Tips
28/12/2016 23www.eduardo-terranova.com
11
Natch CS--Humanized
Dismountable Design
Design
Visual Operation window
No. 1 compact system ever in history to save your space!
28/12/2016 24www.eduardo-terranova.com
12
Natch CS --A Perfect Partner of Molecular diagnostic laboratory
Every Molecular diagnostic laboratory deserve a Natch CS!
28/12/2016 25www.eduardo-terranova.com
Red Operativa de Preparación de
Muestras Especializadas por Aplicación
para Núcleo de Secuenciación NGS
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 26
Ejemplos de Remitentes a Núcleo Analítico
Preparación
de Librerías
para
genómica
Preparación
de Librerías
para
Microbiología
(infectologia)
Centro de
Secuenciación
Masiva de
Aplicación
Genérica
Optimización de plataformas
 Creación de Centros de Secuenciación
Reciben las muestras preparadas por especialidad, respetando
las condiciones específicas de su proceso.
Generan los informes de secuencias que retornan a los
laboratorios remitentes.
 Creación laboratorios preparadores de muestras para
NGS ubicados in situ donde se requiere una aplicación concreta.
Equipado con los instrumentos y reactivos especialmente
destinados a la aplicación, que redundará en un chip que se remite
al núcleo de secuenciación, evitando multiplicación de costos.
Resultado de la Red Optimizada
 La Tecnología NGS, debido a su idiosincrasia requiere de
grandes cantidades de muestras para procesar una sola
corrida.
 El costo operativo por muestra resulta muy atractivo. Sin
embargo, requiere de grandes volúmenes para alimentar al
sistema.
 Las muestras son altamente específicas para cada
aplicación. Su método de preparación requiere reactivos y
consumibles específicos y en gran cantidad
 La creación de laboratorios preparadores de muestras in
situ, hace factible la inversión para cada uno de los
usuarios y la del Núcleo que solo invierte en la plataforma
instrumental central.
Aplicaciones en Genómica
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 30
PCR Y qPCR
 PCR: Técnicas e instrumentación para detección de Fragmentos
de DNA, cDNA genómico o general. Aplicado a micro organismos,
factores de expresión y detección de eventos genéticos de orden
cualitativo.
 qPCR: Técnicas para la detección de productos de amplificación
in vitro y su cuantificación en tiempo real durante la etapa
exponencial de amplificación. Aplicado a la detección de genes
de expresión y mecanismos de cinética de transcripción de DNA
Genómico, aplicado a procesos dinámicos y funcionales.
Existen numerosos kits comerciales de diagnóstico para un amplio
portafolios de patologías y estudios genéticos aplicados a diferentes
áreas. Esto incluye plataformas instrumentales, reactivos, consumibles
validados y kits de reactivos personalizados para estudios de expresión
génica, polimorfismos SNPs, Oncología, entre otros.
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 31
Secuenciación y Análisis Genético
Definimos y diferenciamos ambos términos como entidades
separadas.
- Secuenciación: Técnicas destinadas a determinar las
secuencias nucleotídicas de un fragmento o la totalidad de
un genoma y determinación de mutaciones puntuales
relacionadas a patologìas. (Métodos de Sanger,
Pirosecuenciación, o Secuenciación Masiva de Nueva
Generación –NGS_)
- Análisis de Fragmentos: Análisis de fragmentos de ADN
genómico que se comportan como unidad genética y
analítica a los efectos de su estudio automatizado.
Generalmente se transmiten en forma mendeliana y se
relacionan con caracteres genotípicos de interés.
(Microsatélites, AFLP)
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 32
Secuenciación Masiva de Nueva
Generación (NGS)
 Se trata de la tecnología mas nueva e innovadora per se
Por estar en constante actualización y generando nuevos
campos de aplicación en la totalidad del espectro de la
genómica.
De la evolución competitiva de las grandes compañías
surgió el liderazgo internacional de ILLUMINA.
Liderazgo que se soporta en el constante y racional
proceso de creación de métodos aplicados y adecuados
a las condiciones reales de cada sector.
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 33
Secuenciación Sanger y
Pirosecuenciación
Siendo la primera, la tecnología líder en el mundo
desde fines de la década del noventa, tuvo su papel
protagónico en la secuenciación del Genoma Humano
en 2000 y predominó como Gold Standard de los
estudios de Genómica.
Áreas de Aplicación NGS
Tecnología ILLUMINA
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 35
Areas de Aplicación
 Ciencias Básicas
 Genómica aplicada:
o perinatología y Screening prenatal de
enfermedades cromosómicas
o Enfermedades Raras
 Transplantes de órganos y Tejidos: Genotipado HLA.
 Oncología y Genómica Médica
 Microbiología en todas sus áreas.
 Veterinaria: Patología Animal y Producción
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 36
 Agronomía :
 Producción vegetal
 Patología vegetal
 Aplicaciones Forenses
 Aplicaciones ambientales y agroindustrias
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 37
Concepto de Ciclo de Trabajo
 Muestras a procesar
 Muestras de diferente naturaleza: Muestras biológicas
sangre, suero, plasma, líquidos biológicos, biopsias
líquidas, tejidos y órganos, alimentos, materias primas,
muestras de suelos y vegetales.
 Métodos a correr:
 métodos analíticos específicos para cada tipo de muestra
 Soluciones a aportar
 Elección del método óptimo para análisis
 Medios y herramientas
 Selección óptima de la/s tecnología/s disponible/s
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 38
Tecnología para la Preparación de
Muestras para NGS
Tecnología de Análisis Automático de Fragmentos por
electroforesis Capilar:
Advanced Analytical,
Fragment Analyzer
¿Qué aporta la tecnología de análisis de fragmentos?
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 39
Fragment Analysis Mejora el Flujo de Trabajo
mediante las siguientes prestaciones:
1. Producción de Librerías para NGS
2. Análisis de fragmentos de DNA Genómico hasta
40,000 pb
3. Fragmentos de DNA de hasta 20,000 pb
4. Procesamiento de RNA total, RNA Mensajero, cDNA
y microRNA
5. Análisis de Genética Reversa (TILLiNG), Detección
de Mutaciones
6. SSR, Genotipado y Análisis de Fragmentos de PCR
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 40
Fragment Analyzer
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 41
Data Analysis Software
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 42
Tecnología actualizada
28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 43
Medios y Herramientas
Identificación, de los tipos de instrumentación adecuada y su
integración óptima en base al objetivo general del núcleo
tecnológico.
Determinación de flujo de personal y materiales en planta.
 Fase Preparativa: métodos, equipos e insumos para
extracción / Purificación de Acidos Nucleicos.
PreAmplificación . Preparación de librerías específicas por
aplicación para NGS
 Fase de Procesamiento, Post Amplificación: Selección e
integración de Instrumentación y materiales,. Métodos y
técnicas.
 Fase de derivatización a estudios pormenorizados:
Secuenciación Sanger o PPS o NGS
 Interpretación de resultados y elaboración de informes
28/12/2016 44www.eduardo-terranova.com
CICLO DE TRABAJO
Corte/ fijaciónj.Microsc. Proces. ImagenImag. Molec. RESULTADOSP-
INFORME
PCR-RTPCRSEQ./ NGS RESULTADO
Extracción, Separación, Análisis
Purific.
28/12/2016 45www.eduardo-terranova.com
Curva de Aprendizaje
Nuestra propuesta contempla una transferencia total de
tecnología, que incluye Hardware, software, métodos y
bibliotecas puestos a punto, así como entrenamiento
especializado con seguimiento para asegurar que el
equipo técnico del laboratorio esté produciendo
resultados con parámetros de GLP en un período de 3
a 6 meses.
28/12/2016 46www.eduardo-terranova.com
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Introducción a la Gestión de Transferencia de Tecnología

  • 1. Dr. Eduardo Terranova DMTV Asesor en Transferencia Tecnológica 28/12/2016 1www.eduardo-terranova.com
  • 2. Breves conceptos sobre la GTT El mundo productivo tiene características de complejidad sin precedentes. Nunca como en la actualidad, se han combinado de manera tan profunda, universos que en otros tiempos eran independientes e inconexos. 28/12/2016 2www.eduardo-terranova.com
  • 3. La producción agrícola ganadera, moderna, así como la industria alimentaria y agroindustria en general, requieren de sofisticados sistemas de control y análisis en sus procesos productivos y de biotransformación. Estos procesos son extensos, complejos y sobre todo polifacéticos, pues abarcan factores como: naturaleza, biología de los organismos involucrados y tecnologías de transformación para los productos finales. 28/12/2016 3www.eduardo-terranova.com
  • 4. Estos sectores cada vez mas interrelacionados, tienen sus requerimientos propios de control de eficiencia y eficacia. Se requiere conocer componentes biológicos, características precisas de los componentes químicos. Es necesario detectar presencia de agentes biológicos contaminantes, adulterantes y factores que afectan la calidad de los productos o materias primas. Sin mencionar factores de inocuidad y bioseguridad exigidos en forma creciente en el mundo 28/12/2016 4www.eduardo-terranova.com
  • 5. Ciclo de trabajo tipo y tecnologías involucradas Elegiremos como ejemplo, el principal rubro de producción y exportación del Uruguay para hacer el seguimiento de la cadena tecnológica involucrada directa o indirectamente. Producción carne bovina: Ciclo completo incluyendo productos de exportación. 28/12/2016 5www.eduardo-terranova.com
  • 6. Producción Ganadera Para ser sintéticos, comenzaremos a considerar los procesos productivos a partir de las unidades ganaderas puestas en campo productivo. Esto implica que obviaremos los segmentos anteriores que implican la selección, producción de gametos y embriones , actividad de cabañas y sus tecnologías implicadas. Estas serán tratadas en otra instancia 28/12/2016 6www.eduardo-terranova.com
  • 7. Controles de factores que requieren Tecnologías específicas , sin considerar sanidad animal Control de calidad de suelos y pasturas: análisis de nutrientes en ambos medios. Control de praderas y raciones suplementarias en sistemas de producción intensiva Controles de suelos, silos y ensilajes: Micotoxinas Controles de Pesticidas en suelos agua y forrajes 28/12/2016 7www.eduardo-terranova.com
  • 8. Tecnologías correspondientes Tecnologías de análisis elemental: espectrofotometría de absorción atómica (AA), espectrofotometría de plasma acoplado (ICP), cromatografía liquida de alta eficiencia (HPLC), cromatografía iónica (IC), espectrometría de masas (LC-MSMS; qTOF) y Cromatografía Preparativa. Análisis genético automático (secuenciación, genotipado STR y SNP) y PCR cuantitativa en tiempo real (OGMs) Secuenciación Masiva de Nueva Generación (NGS), como gran capítulo de desarrollo tecnológico mas reciente. 28/12/2016 8www.eduardo-terranova.com
  • 9. Al enunciar tecnologías, estamos mencionado de hecho, diferentes laboratorios especializados expertos en cada una de ellas. En efecto así ocurre. Existen diversos laboratorios diseminados por el territorio que realizan análisis concretos y especificos. Resulta obvio que no encontraremos éstos equipamientos en un establecimiento ganadero o planta industrial u hospital. En esta comunicación nos referiremos solamente a las tecnologías moleculares como epicentro. 28/12/2016 9www.eduardo-terranova.com
  • 10. ¿Como definimos transferencia de tecnología? “La transferencia de tecnología es el proceso en el que se transfieren habilidades, conocimiento, tecnologías, métodos de fabricación e instalaciones entre los gobiernos o las universidades y otras instituciones. Su objetivo es asegurar que los avances científicos y tecnológicos sean accesibles a un mayor número de usuarios que puedan desarrollar y explotar aún más esas tecnologías en nuevos productos, procesos, aplicaciones, materiales o servicios.1” 28/12/2016 10www.eduardo-terranova.com
  • 11. ¿Cómo definimos el concepto de gestión? “Del latín gestĭo, el concepto de gestión hace referencia a la acción y a la consecuencia de administrar algo. Al respecto, hay que decir que gestionar es llevar a cabo diligencias que hacen posible la realización de una acción específica.” 28/12/2016 11www.eduardo-terranova.com
  • 12. Nuestra concepción de GTT comprende Detectar necesidad en campo identificar productores de conocimiento y solución convocar a los generadores de la solución Tomar la solución aplicar la solución a nivel de campo 28/12/2016 12www.eduardo-terranova.com
  • 13. En éste círculo virtuoso, es necesario tener una visión global y holística del contexto. Determinar las necesidades a conformar observando las demandas y características externas (mercados, gobiernos, agencias). 28/12/2016 13www.eduardo-terranova.com
  • 14. Resultados de la GTT Producto mejorado a adaptable a condicionantes del mercado capacidad de aplicación de solución al campo vínculo biunívoco con academia Conocimiento de campo y objetivación de necesidades tecnológicas 28/12/2016 14www.eduardo-terranova.com
  • 15. Áreas de experiencia en aplicación de GTT.  Sanidad y producción animal  Sanidad y producción vegetal  Microbiología agraria e industrial  Selección asistida por marcadores genéticos (animal y vegetal)  Caracterización de componentes y diseño de fórmulas alimentarias infantiles en lácteos.  Ambientalismo: detección de contaminación química y biológica de suelos y aguas: Pesticidas y biota oportunista (algas cianofitas y producción de Micro cistinas)  Seguridad alimentaria (E. coli O157 H7, STECS, …)  Residuos en alimentos (carnes: pesticidas, disruptores endocrinológicos, hormonas, antibióticos)  Farmacocinética: Biodisponibilidad y bioequivalencia en específicos veterinarios.  Control de drogas de abuso: anabólicos, dopaje en animales de deporte y cabaña.  Medicina Veterinaria: desarrollo y puesta a punto de técnicas de diagnóstico molecular. 28/12/2016 15www.eduardo-terranova.com
  • 16. Aplicaciones en Genómica 28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 16
  • 17. 3 Natch CS---Sansure Patented Fully Automated Nucleic Acid Extraction System  Extremely workflow optimization  Unexpected operation reliability  Unimaginable cost effectiveness 28/12/2016 17www.eduardo-terranova.com
  • 18. 5 Natch CS--Megnetic beads+One tube • 48 samples throughput ≤90 min for mag kits • 96 samples throughput ≤30 min for fast kits • Original blood collection tubes for extraction • Room temperature chemical lysis for 10 min 28/12/2016 18www.eduardo-terranova.com
  • 19. 6 Natch CS +Unified Extraction platform • Unified extraction platform for different type of samples • One stop workstation from DNA/RNA extraction to PCR set up • 14 PCR thermocyclers' validation with Natch CS 28/12/2016 19www.eduardo-terranova.com
  • 20. 7 Natch CS--Standardization Layout of PCR Laboratory 28/12/2016 20www.eduardo-terranova.com
  • 21. 8 Natch CS--Larger Piping Volume Piping Volume : 10-1000μL 28/12/2016 21www.eduardo-terranova.com
  • 22. 9 Natch CS--Self Elevating Magnetic Grate 28/12/2016 22www.eduardo-terranova.com
  • 23. 10 Natch CS--Humanized Design Air gapPortable Tips 28/12/2016 23www.eduardo-terranova.com
  • 24. 11 Natch CS--Humanized Dismountable Design Design Visual Operation window No. 1 compact system ever in history to save your space! 28/12/2016 24www.eduardo-terranova.com
  • 25. 12 Natch CS --A Perfect Partner of Molecular diagnostic laboratory Every Molecular diagnostic laboratory deserve a Natch CS! 28/12/2016 25www.eduardo-terranova.com
  • 26. Red Operativa de Preparación de Muestras Especializadas por Aplicación para Núcleo de Secuenciación NGS 28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 26
  • 27. Ejemplos de Remitentes a Núcleo Analítico Preparación de Librerías para genómica Preparación de Librerías para Microbiología (infectologia) Centro de Secuenciación Masiva de Aplicación Genérica
  • 28. Optimización de plataformas  Creación de Centros de Secuenciación Reciben las muestras preparadas por especialidad, respetando las condiciones específicas de su proceso. Generan los informes de secuencias que retornan a los laboratorios remitentes.  Creación laboratorios preparadores de muestras para NGS ubicados in situ donde se requiere una aplicación concreta. Equipado con los instrumentos y reactivos especialmente destinados a la aplicación, que redundará en un chip que se remite al núcleo de secuenciación, evitando multiplicación de costos.
  • 29. Resultado de la Red Optimizada  La Tecnología NGS, debido a su idiosincrasia requiere de grandes cantidades de muestras para procesar una sola corrida.  El costo operativo por muestra resulta muy atractivo. Sin embargo, requiere de grandes volúmenes para alimentar al sistema.  Las muestras son altamente específicas para cada aplicación. Su método de preparación requiere reactivos y consumibles específicos y en gran cantidad  La creación de laboratorios preparadores de muestras in situ, hace factible la inversión para cada uno de los usuarios y la del Núcleo que solo invierte en la plataforma instrumental central.
  • 30. Aplicaciones en Genómica 28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 30
  • 31. PCR Y qPCR  PCR: Técnicas e instrumentación para detección de Fragmentos de DNA, cDNA genómico o general. Aplicado a micro organismos, factores de expresión y detección de eventos genéticos de orden cualitativo.  qPCR: Técnicas para la detección de productos de amplificación in vitro y su cuantificación en tiempo real durante la etapa exponencial de amplificación. Aplicado a la detección de genes de expresión y mecanismos de cinética de transcripción de DNA Genómico, aplicado a procesos dinámicos y funcionales. Existen numerosos kits comerciales de diagnóstico para un amplio portafolios de patologías y estudios genéticos aplicados a diferentes áreas. Esto incluye plataformas instrumentales, reactivos, consumibles validados y kits de reactivos personalizados para estudios de expresión génica, polimorfismos SNPs, Oncología, entre otros. 28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 31
  • 32. Secuenciación y Análisis Genético Definimos y diferenciamos ambos términos como entidades separadas. - Secuenciación: Técnicas destinadas a determinar las secuencias nucleotídicas de un fragmento o la totalidad de un genoma y determinación de mutaciones puntuales relacionadas a patologìas. (Métodos de Sanger, Pirosecuenciación, o Secuenciación Masiva de Nueva Generación –NGS_) - Análisis de Fragmentos: Análisis de fragmentos de ADN genómico que se comportan como unidad genética y analítica a los efectos de su estudio automatizado. Generalmente se transmiten en forma mendeliana y se relacionan con caracteres genotípicos de interés. (Microsatélites, AFLP) 28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 32
  • 33. Secuenciación Masiva de Nueva Generación (NGS)  Se trata de la tecnología mas nueva e innovadora per se Por estar en constante actualización y generando nuevos campos de aplicación en la totalidad del espectro de la genómica. De la evolución competitiva de las grandes compañías surgió el liderazgo internacional de ILLUMINA. Liderazgo que se soporta en el constante y racional proceso de creación de métodos aplicados y adecuados a las condiciones reales de cada sector. 28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 33
  • 34. Secuenciación Sanger y Pirosecuenciación Siendo la primera, la tecnología líder en el mundo desde fines de la década del noventa, tuvo su papel protagónico en la secuenciación del Genoma Humano en 2000 y predominó como Gold Standard de los estudios de Genómica.
  • 35. Áreas de Aplicación NGS Tecnología ILLUMINA 28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 35
  • 36. Areas de Aplicación  Ciencias Básicas  Genómica aplicada: o perinatología y Screening prenatal de enfermedades cromosómicas o Enfermedades Raras  Transplantes de órganos y Tejidos: Genotipado HLA.  Oncología y Genómica Médica  Microbiología en todas sus áreas.  Veterinaria: Patología Animal y Producción 28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 36
  • 37.  Agronomía :  Producción vegetal  Patología vegetal  Aplicaciones Forenses  Aplicaciones ambientales y agroindustrias 28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 37
  • 38. Concepto de Ciclo de Trabajo  Muestras a procesar  Muestras de diferente naturaleza: Muestras biológicas sangre, suero, plasma, líquidos biológicos, biopsias líquidas, tejidos y órganos, alimentos, materias primas, muestras de suelos y vegetales.  Métodos a correr:  métodos analíticos específicos para cada tipo de muestra  Soluciones a aportar  Elección del método óptimo para análisis  Medios y herramientas  Selección óptima de la/s tecnología/s disponible/s 28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 38
  • 39. Tecnología para la Preparación de Muestras para NGS Tecnología de Análisis Automático de Fragmentos por electroforesis Capilar: Advanced Analytical, Fragment Analyzer ¿Qué aporta la tecnología de análisis de fragmentos? 28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 39
  • 40. Fragment Analysis Mejora el Flujo de Trabajo mediante las siguientes prestaciones: 1. Producción de Librerías para NGS 2. Análisis de fragmentos de DNA Genómico hasta 40,000 pb 3. Fragmentos de DNA de hasta 20,000 pb 4. Procesamiento de RNA total, RNA Mensajero, cDNA y microRNA 5. Análisis de Genética Reversa (TILLiNG), Detección de Mutaciones 6. SSR, Genotipado y Análisis de Fragmentos de PCR 28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 40
  • 42. Data Analysis Software 28/12/2016 www.eduardo-terranova.com 42
  • 44. Medios y Herramientas Identificación, de los tipos de instrumentación adecuada y su integración óptima en base al objetivo general del núcleo tecnológico. Determinación de flujo de personal y materiales en planta.  Fase Preparativa: métodos, equipos e insumos para extracción / Purificación de Acidos Nucleicos. PreAmplificación . Preparación de librerías específicas por aplicación para NGS  Fase de Procesamiento, Post Amplificación: Selección e integración de Instrumentación y materiales,. Métodos y técnicas.  Fase de derivatización a estudios pormenorizados: Secuenciación Sanger o PPS o NGS  Interpretación de resultados y elaboración de informes 28/12/2016 44www.eduardo-terranova.com
  • 45. CICLO DE TRABAJO Corte/ fijaciónj.Microsc. Proces. ImagenImag. Molec. RESULTADOSP- INFORME PCR-RTPCRSEQ./ NGS RESULTADO Extracción, Separación, Análisis Purific. 28/12/2016 45www.eduardo-terranova.com
  • 46. Curva de Aprendizaje Nuestra propuesta contempla una transferencia total de tecnología, que incluye Hardware, software, métodos y bibliotecas puestos a punto, así como entrenamiento especializado con seguimiento para asegurar que el equipo técnico del laboratorio esté produciendo resultados con parámetros de GLP en un período de 3 a 6 meses. 28/12/2016 46www.eduardo-terranova.com