Agrigenomica.Productos de I/D

1. En la actualidad y en el mercado internacional,
los productos primarios, ya no son tales, sino
que constan de un componente productivo
zootécnico sanitario, un componente industrial y
un componente de información asociada.
La información adjunta al producto como
insumo y valor agregado como ser trazabilidad y
producción asistida por bioinformática genética

2. Nuestra concepción de Gestión de
Transferencia de Tecnología
comprende
Detectar
necesidad en
campo
identificar
productores
de
conocimiento
y solución
convocar a
los
generadores
de la solución
Tomar la
solución
aplicar la
solución a
nivel de
campo
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3. Resultados de la GTT
Generación de Status Sanitario y Productivo
de Establecimiento y su Rodeo. Integrable a
información de Trazabilidad
Integración de la
Información y
creación de
Bancos de Datos
Vínculo con Usinas
generadoras de
métodos
(Academia) y
Unidades
ejecutoras
Objetivación de
necesidades
tecnológicas
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4. ¿En qué consiste la integración
tecnológica?
combinación de eficiencias específicas
de los tecnologías y métodos
seleccionados para cada núcleo
operativo, conformando un flujo de
trabajo global.

5. Objetivos
•Facilitación de acceso y desarrollo de
servicios de análisis en Genómica.
•Promoción y facilitación de actividades I+D.
•Promoción de sinergia con empresas de
biotecnología, el mercado y la academia.
•Lograr proyectos rentables desde una óptica
financiera.

6. Características operativas:
Gestión de transferencia de
tecnología

7. Acciones y tipo de
producto a desarrollar
Primer Nivel de Planificación:
•Confección de Librerías in situ, para las
aplicaciones de los clientes usuarios finales del
servicios de NGS.
•Envío a centro de secuenciación de librerías y
kits pre diseñados y configurados.
•Estos centros de secuenciación pueden ser
integrados al paquete de productos del proyecto
o utilizarse plataformas preexistentes.

8. Modo de ejecución de la Unidad de Producción
de Librerías
•Laboratorios de preparación de Librerías
in situ.
•Centro de diseño y creación de Librerías
(OXYGENE); GENLIVES

9. Usina de Métodos
•La Usina de Métodos deberá ser uno de los
Focos de una Elipse, que constituirá el Centro
de una Cuenca. Se entenderá por tal a la zona
de influencia entre los establecimientos
agropecuarios y los centros efectores,
ejecutantes de la tecnología.
•Generará los métodos y pruebas piloto de
técnicas
•Formación de RRHH.

10. Centro de Secuenciación de
la Cuenca
Unidad Efectora: destinada a la aplicación
de los servicios y actividades generadas en
la Usina de Métodos.
.

11. Unidad Efectora
•La Unidad Efectora, será el mecanismo de
aplicación y ejecución de las técnicas
desarrolladas en la Usina de Métodos.
•Habrá tantas unidades efectoras como
especialidades en base a la tecnología
requerida.
•La totalidad de Efectoras constituirá el
segundo Foco de la Elipse que forma el Centro
de la Cuenca

12. Red de Trabajo y Cuenca de Remisión
de Muestras y Bancos de Datos
Centro de Secuenciación
* *
Usina Unidad Efectora
Microbiología
Genómica
Genómica
vegetal
Metagenómica
Banco de datos
de Manejo–
Trazabilidad de
establecimiento
Bancos de datos
sanitarios y
genotípicos de
rodeo (cada
animal)
Genómica
animal

13. Fortalezas
•Servicios inexistentes para demanda
insatisfecha en la región.
•Generación de Polo de Desarrollo regional
•Aval Científico de IPM y trayectoria de
LATU.
•Generación de conocimiento novedoso en
materia de I/D en las áreas productivas y
ambientales

14. Resultado de la Red
Optimizada
• La Tecnología NGS, debido a su idiosincrasia requiere de
grandes cantidades de muestras para procesar una sola
corrida.
• El costo operativo por muestra resulta muy atractivo. Sin
embargo, requiere de grandes volúmenes para alimentar al
sistema.
• Las muestras son altamente específicas para cada
aplicación. Su método de preparación requiere reactivos y
consumibles específicos y en gran cantidad
• La creación de laboratorios preparadores de muestras in
situ, hace factible la inversión para cada uno de los
usuarios y la del Núcleo que solo invierte en la plataforma
instrumental central.
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15. Productos
Caracterización de Status Sanitario de
Establecimiento y Rodeo por técnicas de
Metagenómica.
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16. Fundamento
Caracterización de status sanitario de los
rodeos de establecimiento lechero:
Consiste en la identificación de todas las cepas
de microorganismos patógenos - capaces de
producir Mastitis - presentes en cada cuarto
de la Glándula Mamaria de cada Vaca en
Producción de cada establecimiento mediante
técnicas de Metagenómica por secuenciacion
masiva de nueva generación ILLUMINA.
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17. Status Sanitario
La técnica de Metagenómica permite la identificación
taxonómica de cada especie y cepa.
Detecta a todos estos agentes en simultánea en una
sola maniobra analítica, aún cuando no generen
manifestaciones clínicas en el animal.
La información genética relevada, es almacenada en
bancos de datos, con lo que se puede definir
prevalencia de cepas en cada animal y en el
establecimiento.
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18. Status Sanitario
La identificación de cepas se acompaña con
información de estados de resistencia y
susceptibilidad genética a antibióticos.
Estos bancos de datos permiten establecer un
status sanitario de los rodeos así como del
establecimiento.
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19. Status Sanitario y
Planificación
La realización de éstas técnicas y la generación de
Bancos de Datos de cepas por cuarto y glándula
mamaria a nivel de cada animal, hacen posible:
Trazabilidad, planificación de estrategias
sanitarias y productivas, optimización de
estrategias terapéuticas y económicas, basadas en
el conocimiento de la resistencia a antibióticos de
la población presente en ese establecimiento y
animal en concreto; refugo de animales
portadores.
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20. Evitar repetición de tratamientos y pruebas fallidas de
antibióticos, así como estudios de sensibilidad e
identificación microbiana convencionales.
Mejorar el rendimiento lechero de cada animal en
base al conocimiento a priori y objetivo de su
status sanitario.
Mejorar la calidad de producto a nivel de
establecimiento, con la consiguiente categorización
de remitente.
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21. Como se aplica el método?
Estableciendo un «Tiempo cero» en el inicio del
ciclo productivo, se realiza el paneo general
del rodeo identificando mediante protocolo
adecuado de colección y registro de muestras
de leche, determinando Animal,
correspondencia entre muestra y cuarto de la
glándula, abarcando los cuatro cuartos en
cada glándula y la totalidad de los animales en
producción.
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22. Con la información generada y almacenada, se
habilita la proyección de las estrategias
productivas y sanitarias para el resto del ciclo
productivo. Durante el transcurso de éste, solo
será necesario aplicar técnicas convencionales
de screening para el monitoreo periódico y
evaluación de progreso. La inversión en
colección de datos y generación de
información, se realiza sólo una vez en cada
ciclo productivo.
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23. La información de los bancos de datos se puede cruzar con
información de trazabilidad general y con bancos de datos
para otras aplicaciones sanitarias, zootécnicas o
comerciales con impacto tecnológico sin precedentes.
En suma, la tecnología de secuenciación masiva de nueva
generación hace posible la proyección y planificación de
estrategias, evaluación de costos de producción y
racionalización de los mismos.
Resolución de problemas basados en su identificación precisa
y temprana.
Generación de información aplicable a innovación,
investigación y desarrollo.
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24. Dr. Eduardo Terranova
Gestión de Transferencia de Tecnología
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