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PROCEDIMIENTOS PARA LA
    SOBREPRODUCCIÓN
MICROBIANA DE METABOLITOS
POTENCIAL GENÉTICO

La información genética de los organismos les da a
éstos las características de lo que son (fenotipo) y
pueden ser (genotipo). Esta información va codificada
en el ADN en prácticamente todos los organismos, a
excepción de algunos virus y viroides que la portan en
el ARN.

En los procariotes (bacterias y arqueas), el ADN se
ubica en un cromosoma en el citoplasma celular, y
muchos veces también existe ADN extracromosomal
(PLÁSMIDO).
POTENCIAL GENÉTICO


En general, los microorganismos aislados de la
naturaleza producen metabolitos de interés industrial
en bajas concentraciones, por lo tanto se hace
necesario incrementar estos rendimientos para lograr
una mayor rentabilidad de los procesos.

Formas de mejorar el rendimiento:
•Optimización del medio de cultivo y condiciones de
operación, limitada por la capacidad de síntesis
máxima del producto deseado que tiene el organismo.
•Mejoramiento genético de la cepa.
POTENCIAL GENÉTICO


Con el organismo mejorado, se reexaminan las
condiciones del cultivo para lograr nuevamente la
máxima productividad.

Programas de desarrollo involucran una continua
modificación genética del microorganismo, seguida
por una readaptación del medio de cultivo a los nuevos
requerimientos, mejoras de las condiciones de
operación y de los procesos de purificación.
MEJORAMIENTO GENÉTICO


Obtención de cepas modificadas genéticamente:

• Selección natural de variantes

• Mutación inducida

• Recombinación genética.
SELECCIÓN NATURAL
• En una gran masa celular la población es
  heterogénea (cambios al momento de reproducirse)

• Puede presentar problemas de rendimientos (las
  variantes con menor nivel de producción que la
  población parental)

• Cambios definitivos (mutaciones) diferente a las
  variaciones fenotípicas (condiciones ambientales y
  afectan a toda la población). Son estables y
  hereditarios, con una frecuencia estadísticamente
  medible (tasa de mutación).
MUTACION ESPONTÁNEA


Cambio ocurrido en la secuencia de las bases del
  genoma y que se transmite a su descendencia.
• La frecuencia de mutaciones espontáneas varía
  entre 10-6 a 10-9 mutaciones por genoma y por
  generación.
• Para un valor medio de 10-7 se deberán estudiar un
  gran número de organismos (> 107 ) en la búsqueda
  del tipo deseado.
• Útil observar las características morfológicas de las
  colonias, para seleccionar y estudiar los clones.
• Selección de cepas: medios de cultivo para cepas
  mutantes resistentes a drogas, metales, etc.
MUTACION INDUCIDA

Se    emplea un agente mutágeno para generar
     mutaciones en una población de microorganismos.

Empíricamente el empleo de diferentes agentes resulta
  en el aislamiento de distintos "espectros" de
  mutantes.

El incremento de su productividad puede ser el
   resultado de una modificación en los mecanismos
   de control que limitan el nivel de producción y/o de
   una variación en los precursores que llevan al
   producto (Aconsejable conocer las rutas y
   mecanismos de control de la biosíntesis del
AGENTES MUTAGÉNICOS

Físicos: luz ultravioleta (λ de 200 a 300 nm y exposición entre
    0.5 y 20 minutos), tratando de lograr un porcentaje de
    muerte entre el 90 y 99.9%.

2) Químicos: Concentraciones del orden de 0.05 M con
   exposiciones de 0.5 a 12 horas.
Acido nitroso (transiciones A-T o G-C) y/o deleciones por
   uniones cruzadas en el interior de la cadena.
N-metil-N'-nitro-N-nitrosoguanidina (NTG), potente, produce
   alta tasa de mutación con bajo porcentaje de mortandad.
Análogos de base. Producen transiciones, como el 5-
   bromuracilo y la 2-aminopurina.
Mutágenos estructurales, como la proflavina o naranja acridina
   que actuán como agentes de intercalado en la estructura,
   promoviendo adiciones o deleciones simples durante la
   síntesis
MUTACION INDUCIDA
         Mutantes con niveles mejorados de metabolitos
                          primarios

•   Inhibición por producto final, al evitar su síntesis se
    elimina el control de la ruta metabólica.
    Productos esenciales para el crecimiento, adicionar para
    cubrir solo el desarrollo celular evitando la inhibición o
    represión.
    MUTANTES AUXOTRÓFICOS candidatos a cepas
    altamente productoras, si la mutación ocurre en el sitio
    correcto.
    Selección de auxótrofos por técnicas de enriquecimiento o
    mediante la identificación visual de mutantes.

•   Mutantes con la permeabilidad alterada. Mutante de
    Corynebacterium glutamicum, con bajas concentraciones de
    biotina (5 mg/L) puede excretar glutamato (50 g/L) Sugiere
MUTACION INDUCIDA

 Mutantes con niveles mejorados de metabolitos primarios

• Mutantes productores de enzimas de interés industrial.
Mutantes productoras de enzimas en ausencia de inductor y aún
   en presencia de represores.
Las mutaciones pueden tener lugar en un gen regulador,
   eliminando la producción de un represor activo, o si se
   producen en el operador, se podría evitar la unión del
   represor.
Los mutantes que producen enzimas inducibles en ausencia de
   inductor se denominan mutantes constitutivos.
¿Cómo aislarlos?
MUTACION INDUCIDA

Mutantes con       mejores    rendimientos    de   metabolitos
  secundarios

Represión catabólica por glucosa y/o la fuente de nitrógeno (en
    especial amonio). La producción de cefalosporinas por
    Streptomyces clavuligerus se reprime por amonio.
Síntesis de metabolitos secundarios regulada por mecanismos de
    control genéticamente, las mutaciones pueden tener efectos
    importantes en el mejoramiento de cepas.
Los programas iniciales en la industria de antibióticos inducían
    mutaciones con éxito. Caso de la penicilina, primeras cepas
    de Penicillum chrysogenum producían alrededor de 20
    unidades/mL, en 1980 se tienen concentraciones cercanas a
    60.000 U/mL (35 mg/mL ).
RECOMBINACIÓN GENÉTICA

Programa de mejoramiento reagrupando las potencialidades de
   distintas variantes con el objeto de seleccionar la mejor
   combinación de genes responsables de codificar la
   producción de determinado metabolito.

Recombinación genética, proceso que genere nuevas
   combinaciones de genes los cuales estaban originalmente en
   individuos diferentes.

El intercambio de material genético entre diferentes especies
   puede también ser alcanzado por fusión celular. Ejemplo,
   obtención de hibridomas por fusión de linfocitos con células
   de mieloma (cáncer de piel) de ratón u otro animal.
RECOMBINACIÓN GENÉTICA

Obtención de nuevas cepas por Ingeniería Genética.

La década de 1970 marca el comienzo de la unión entre las
   técnicas bioquímicas para manipular el ADN in vitro con las
   técnicas genéticas para transferir el ADN de una célula a
   otra. La nueva metodología resultante conocida con el
   nombre de Ingeniería Genética ha revolucionado el campo
   específico de la Biotecnología.
A través del procedimiento de clonado de ADN, genes de
   cualquier tipo pueden ser tomados de su ambiente natural,
   analizados, alterados y reinsertados en el mismo tipo de
   organismo o en otro diferente.
TRANSFERENCIA DE
MATERIAL GENÉTICO
PROCARIOTAS
                             GEN ESTRUCTURAL

                                                                                            DNA
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EUCARIOTAS    I1   E1   I2    I3     E2    E3        I4       E5     I6    E6   I7

                                                                                                  DNA

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                             E1 E2        E3    E4           E5       E6
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¿Porqué utilizar bacterias?

Las bacterias tienen cuatro ventajas importantes
para los “experimentos de genética de tipo
tradicional“:

1. Son haploides (no hay enmascaramiento)
2. Cada 20 minutos se produce una nueva
generación
3.   Fácil    para    crecer   en    ENORMES
CANTIDADES
4.   Los    individuos   de    estas   grandes
poblaciones        son       GENETICAMENTE
IDENTICAS.
El cromosoma de Escherichia coli
es único, circular y contiene cerca
de 4.7 millones de pares de bases.
Tiene cerca de 1 mm de longitud
pero solo 2 nm de ancho.
Cromosoma de
Escherichia coli
PLASMIDO. Material
                   genético extracromosomal



Escherichia coli




                                   ADN CROMOSOMAL
Hay TRES TIPOS PRINCIPALES                   de
transferencia genética en bacterias:

1. Transformación – la bacteria toma ADN
externo.

2. Conjugación – el ADN es transferido de
una célula bacteriana a otra, vía “pili sexual".

3. Transducción – el ADN se introduce a la
bacteria mediante un bacteriofago.
Transformación

Es el proceso donde la bacteria controla la
toma de una parte de un ADN. Usualmente,
este proceso es utilizado en el laboratorio
para introducir una pieza pequeña de ADN
(como un PLASMIDO) dentro de una célula
bacteriana.
Proceso de
transformación
Conjugación bacteriana
          Es el poceso donde el
          ADN     es transferido de
          una    célula    bacteriana
          donadora a una célula
          receptora por contacto
          célula – célula.
          Se   ha    observado     en
          muchas            especies
          bacterianas y es bien
          entendido en Escherichia
          coli   (descubierto     por
          Joshua     Lederberg      in
          1951).
“Generando un mapa genético“
A través del proceso de conjugación, al hacer
experimentos    con    diferentes  tiempos    de
duración, es posible generar un mapa genético de
de E. coli!
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  • 1. PROCEDIMIENTOS PARA LA SOBREPRODUCCIÓN MICROBIANA DE METABOLITOS
  • 2. POTENCIAL GENÉTICO La información genética de los organismos les da a éstos las características de lo que son (fenotipo) y pueden ser (genotipo). Esta información va codificada en el ADN en prácticamente todos los organismos, a excepción de algunos virus y viroides que la portan en el ARN. En los procariotes (bacterias y arqueas), el ADN se ubica en un cromosoma en el citoplasma celular, y muchos veces también existe ADN extracromosomal (PLÁSMIDO).
  • 3. POTENCIAL GENÉTICO En general, los microorganismos aislados de la naturaleza producen metabolitos de interés industrial en bajas concentraciones, por lo tanto se hace necesario incrementar estos rendimientos para lograr una mayor rentabilidad de los procesos. Formas de mejorar el rendimiento: •Optimización del medio de cultivo y condiciones de operación, limitada por la capacidad de síntesis máxima del producto deseado que tiene el organismo. •Mejoramiento genético de la cepa.
  • 4. POTENCIAL GENÉTICO Con el organismo mejorado, se reexaminan las condiciones del cultivo para lograr nuevamente la máxima productividad. Programas de desarrollo involucran una continua modificación genética del microorganismo, seguida por una readaptación del medio de cultivo a los nuevos requerimientos, mejoras de las condiciones de operación y de los procesos de purificación.
  • 5. MEJORAMIENTO GENÉTICO Obtención de cepas modificadas genéticamente: • Selección natural de variantes • Mutación inducida • Recombinación genética.
  • 6. SELECCIÓN NATURAL • En una gran masa celular la población es heterogénea (cambios al momento de reproducirse) • Puede presentar problemas de rendimientos (las variantes con menor nivel de producción que la población parental) • Cambios definitivos (mutaciones) diferente a las variaciones fenotípicas (condiciones ambientales y afectan a toda la población). Son estables y hereditarios, con una frecuencia estadísticamente medible (tasa de mutación).
  • 7. MUTACION ESPONTÁNEA Cambio ocurrido en la secuencia de las bases del genoma y que se transmite a su descendencia. • La frecuencia de mutaciones espontáneas varía entre 10-6 a 10-9 mutaciones por genoma y por generación. • Para un valor medio de 10-7 se deberán estudiar un gran número de organismos (> 107 ) en la búsqueda del tipo deseado. • Útil observar las características morfológicas de las colonias, para seleccionar y estudiar los clones. • Selección de cepas: medios de cultivo para cepas mutantes resistentes a drogas, metales, etc.
  • 8. MUTACION INDUCIDA Se emplea un agente mutágeno para generar mutaciones en una población de microorganismos. Empíricamente el empleo de diferentes agentes resulta en el aislamiento de distintos "espectros" de mutantes. El incremento de su productividad puede ser el resultado de una modificación en los mecanismos de control que limitan el nivel de producción y/o de una variación en los precursores que llevan al producto (Aconsejable conocer las rutas y mecanismos de control de la biosíntesis del
  • 9. AGENTES MUTAGÉNICOS Físicos: luz ultravioleta (λ de 200 a 300 nm y exposición entre 0.5 y 20 minutos), tratando de lograr un porcentaje de muerte entre el 90 y 99.9%. 2) Químicos: Concentraciones del orden de 0.05 M con exposiciones de 0.5 a 12 horas. Acido nitroso (transiciones A-T o G-C) y/o deleciones por uniones cruzadas en el interior de la cadena. N-metil-N'-nitro-N-nitrosoguanidina (NTG), potente, produce alta tasa de mutación con bajo porcentaje de mortandad. Análogos de base. Producen transiciones, como el 5- bromuracilo y la 2-aminopurina. Mutágenos estructurales, como la proflavina o naranja acridina que actuán como agentes de intercalado en la estructura, promoviendo adiciones o deleciones simples durante la síntesis
  • 10. MUTACION INDUCIDA Mutantes con niveles mejorados de metabolitos primarios • Inhibición por producto final, al evitar su síntesis se elimina el control de la ruta metabólica. Productos esenciales para el crecimiento, adicionar para cubrir solo el desarrollo celular evitando la inhibición o represión. MUTANTES AUXOTRÓFICOS candidatos a cepas altamente productoras, si la mutación ocurre en el sitio correcto. Selección de auxótrofos por técnicas de enriquecimiento o mediante la identificación visual de mutantes. • Mutantes con la permeabilidad alterada. Mutante de Corynebacterium glutamicum, con bajas concentraciones de biotina (5 mg/L) puede excretar glutamato (50 g/L) Sugiere
  • 11. MUTACION INDUCIDA Mutantes con niveles mejorados de metabolitos primarios • Mutantes productores de enzimas de interés industrial. Mutantes productoras de enzimas en ausencia de inductor y aún en presencia de represores. Las mutaciones pueden tener lugar en un gen regulador, eliminando la producción de un represor activo, o si se producen en el operador, se podría evitar la unión del represor. Los mutantes que producen enzimas inducibles en ausencia de inductor se denominan mutantes constitutivos. ¿Cómo aislarlos?
  • 12. MUTACION INDUCIDA Mutantes con mejores rendimientos de metabolitos secundarios Represión catabólica por glucosa y/o la fuente de nitrógeno (en especial amonio). La producción de cefalosporinas por Streptomyces clavuligerus se reprime por amonio. Síntesis de metabolitos secundarios regulada por mecanismos de control genéticamente, las mutaciones pueden tener efectos importantes en el mejoramiento de cepas. Los programas iniciales en la industria de antibióticos inducían mutaciones con éxito. Caso de la penicilina, primeras cepas de Penicillum chrysogenum producían alrededor de 20 unidades/mL, en 1980 se tienen concentraciones cercanas a 60.000 U/mL (35 mg/mL ).
  • 13. RECOMBINACIÓN GENÉTICA Programa de mejoramiento reagrupando las potencialidades de distintas variantes con el objeto de seleccionar la mejor combinación de genes responsables de codificar la producción de determinado metabolito. Recombinación genética, proceso que genere nuevas combinaciones de genes los cuales estaban originalmente en individuos diferentes. El intercambio de material genético entre diferentes especies puede también ser alcanzado por fusión celular. Ejemplo, obtención de hibridomas por fusión de linfocitos con células de mieloma (cáncer de piel) de ratón u otro animal.
  • 14. RECOMBINACIÓN GENÉTICA Obtención de nuevas cepas por Ingeniería Genética. La década de 1970 marca el comienzo de la unión entre las técnicas bioquímicas para manipular el ADN in vitro con las técnicas genéticas para transferir el ADN de una célula a otra. La nueva metodología resultante conocida con el nombre de Ingeniería Genética ha revolucionado el campo específico de la Biotecnología. A través del procedimiento de clonado de ADN, genes de cualquier tipo pueden ser tomados de su ambiente natural, analizados, alterados y reinsertados en el mismo tipo de organismo o en otro diferente.
  • 16.
  • 17. PROCARIOTAS GEN ESTRUCTURAL DNA TRANSCRIPCION mRNA TRADUCCION PROTEINA EUCARIOTAS I1 E1 I2 I3 E2 E3 I4 E5 I6 E6 I7 DNA TRANSCRIPCION mRNA primario PROCESAMIENTO E1 E2 E3 E4 E5 E6 MENSAJERO FUNCIONAL TRADUCCION PROTEINA
  • 18. ¿Porqué utilizar bacterias? Las bacterias tienen cuatro ventajas importantes para los “experimentos de genética de tipo tradicional“: 1. Son haploides (no hay enmascaramiento) 2. Cada 20 minutos se produce una nueva generación 3. Fácil para crecer en ENORMES CANTIDADES 4. Los individuos de estas grandes poblaciones son GENETICAMENTE IDENTICAS.
  • 19. El cromosoma de Escherichia coli es único, circular y contiene cerca de 4.7 millones de pares de bases. Tiene cerca de 1 mm de longitud pero solo 2 nm de ancho.
  • 21.
  • 22. PLASMIDO. Material genético extracromosomal Escherichia coli ADN CROMOSOMAL
  • 23. Hay TRES TIPOS PRINCIPALES de transferencia genética en bacterias: 1. Transformación – la bacteria toma ADN externo. 2. Conjugación – el ADN es transferido de una célula bacteriana a otra, vía “pili sexual". 3. Transducción – el ADN se introduce a la bacteria mediante un bacteriofago.
  • 24. Transformación Es el proceso donde la bacteria controla la toma de una parte de un ADN. Usualmente, este proceso es utilizado en el laboratorio para introducir una pieza pequeña de ADN (como un PLASMIDO) dentro de una célula bacteriana.
  • 26. Conjugación bacteriana Es el poceso donde el ADN es transferido de una célula bacteriana donadora a una célula receptora por contacto célula – célula. Se ha observado en muchas especies bacterianas y es bien entendido en Escherichia coli (descubierto por Joshua Lederberg in 1951).
  • 27.
  • 28. “Generando un mapa genético“ A través del proceso de conjugación, al hacer experimentos con diferentes tiempos de duración, es posible generar un mapa genético de de E. coli!
  • 29. azi – azida de sodio; ton – fago T1
  • 31.
  • 32.
  • 33. El genoma del fago se integra en el cromosoma bacteriano en un sitio específico.