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Recombinación Homóloga 
y Específica de Sitio
Etapas de la recombinación:
ADN Heterodúplex 
1.-Molécula Articulada 
2.-Articulación Recombinante 
3.-ADN heteroduplex(híbrido)
Resolución 
Se requieren dos hendiduras 
más… 
•Siempre deja una región heterodúplex como residuo 
•No siempre se acompaña de recombinación en los 
flancos 
•Longitud no menor de 75bp
Las roturas de la doble cadena 
inician la recombinación. 
 Inicio del intercambio 
génico por rotura de la 
doble cadena. 
 Endonucleasa: inicia la 
recombinación. 
 Exonucleasa: corta una 
cadena a cada lado de la 
rotura y genera extremos 
3`. 
 Invasión por una cadena 
única.
Complejo Sinaptonémico. 
Los cromosomas se aparean para formar el complejo 
sinaptonemico. 
Cada cromosoma se condensa alrededor de una estructura 
llamada elemento axial. 
El complejo sinaptonemico se forma después de roturas de 
doble cadena.
Las Secuencias chi Estimulan el 
Sistema RecBCD Bacteriano. 
•Un sitio chi se puede activar con 
una rotura de la doble cadena. 
•El complejo RecBCD ejerce 
varias actividades. 
•Su participación en la 
recombinación es preveer una 
región de una sola cadena con un 
extremo 3` libre. 
•La RecBCD cuando alcanza el 
sitio chi el complejo entra en 
pausa. El reconocimiento del sitio 
chi hace que la subunidad RecD 
se desactive.
Las reacciones se 
coordinan en un ADN 
sustrato que tiene un sitio 
chi. 
La nucleasa RecBCD se 
acerca a una secuencia chi 
desde un lado y degrada el 
ADN a medida que avanza; 
en el sitio chi hace un corte 
endonucleolítico, pierde 
RecD y conserva solo la 
actividad de helicasa.
Proteínas de transfería: 
catalizan la asimilación de una 
sola cadena 
La RecA facilita la 
asimilación de cadenas 
únicas invasoras en el ADN 
dúplex, siempre y cuando 
una de las cadenas 
reactivas tengan un extremo 
libre. 
La RecA forma filamentos con el ADN de una o dos 
cadenas y cataliza la capacidad de un ADN de una 
sola cadena con un extremo 3´libre de desplazar a su 
contraparte en una cadena dúplex de ADN.
El sistema Ruv resuelve las uniones 
holliday 
El complejo Ruv actúa sobre uniones 
recombinantes 
La RuvA reconoce la estructura de la 
unión y la RuvB es una helicasa que 
cataliza la migración de ramas 
La RuvC escinde uniones para generar 
productos intermedios de 
recombinación. 
Complejo asimétrico
La conversión génica contribuye a 
la recombinación interalélica 
El ADN heteodúplex creado por 
recombinación puede tener 
secuencias con apareamiento 
erróneo, donde los alelos 
recombinantes no son idénticos. 
Los sistemas de reparación 
pueden retirar apareamiento 
erróneos si cambian una de las 
cadenas, de modo que su 
secuencia sea complementaria a 
al otra. 
La formación de esporas en los ascomicetos permiten la 
determinación de la constitución genética cada una de 
las cadenas de ADN involucradas en la meiosis.
Superenrollamiento 
Positivo 
Más estrecho 
Más pares de bases 
por giro 
Negativo 
Gira una en torno a 
otra, menos apretadas 
Menos bases por giro
Número de Enlaces: veces que una cadena cruza 
sobre la otra. 
Isómeros Topológicos 
“Diferentes números de enlaces reflejan distintos 
grados de superenrollamiento” 
Número de Contorsiones(T): Total de giros de la 
doble elice. 
Número de Torcimientos (W): Giro de eje de la 
cadena dúplex en el espacio. 
ΔL= Δ W+ΔT
Topoisomerasas 
Catalizan cambios en la topología. 
Actúan sin importar su secuencia. 
Los extremos generados por rotura 
nunca están libres, mantienen en 
enlaces covalentes con una molécula 
de tirosina de la enzima
Tipo 1.- haciendo rotura transitoria de la 
cadena de ADN. 
Tipo II.- Introducen una rotura transitoria en la 
doble cadena. 
Grupo A.-Enlace con un fosfato 5´ 
Grupo B.-Enlace con un fosfato 3´ 
Girasas: Pueden introducir superhélices 
negativas. 
Girasas inversas: Pueden introducir 
superhélices positivas.
Girasa
La recombinación especializada 
involucra sitios específicos 
La recombinación 
especializada comprende 
una reacción entre sitio 
específicos que n tienen 
que ser homólogos 
El DNA del fago circular 
se convierte en un 
profago integrado por 
una recombinacion 
reciproca entre attP y 
attB
La recombinación especifica de 
sitio comprende rotura y reunión 
Se hacen 
escisiones a 
intevalos de 7 bp 
en los genes attB 
y attP y los 
extremos se unen 
en forma cruzada
La recombinación especia de sitio 
simula la actividad de la 
topoisomerasa
Se muestra la reacción catalizada 
por una integrase. La enzima es 
una proteína monomérica que tiene 
un sitio activo capaz de cortar y 
ligar el DNA. 
La reacción comprende el ataque 
de una tirosina en un enlace 
fosfodiester.
Esta imagen muestra la 
reacción inmediata con 
base en la estructura 
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Recombinacion

  • 1. Recombinación Homóloga y Específica de Sitio
  • 2.
  • 3.
  • 4. Etapas de la recombinación:
  • 5. ADN Heterodúplex 1.-Molécula Articulada 2.-Articulación Recombinante 3.-ADN heteroduplex(híbrido)
  • 6. Resolución Se requieren dos hendiduras más… •Siempre deja una región heterodúplex como residuo •No siempre se acompaña de recombinación en los flancos •Longitud no menor de 75bp
  • 7. Las roturas de la doble cadena inician la recombinación.  Inicio del intercambio génico por rotura de la doble cadena.  Endonucleasa: inicia la recombinación.  Exonucleasa: corta una cadena a cada lado de la rotura y genera extremos 3`.  Invasión por una cadena única.
  • 8. Complejo Sinaptonémico. Los cromosomas se aparean para formar el complejo sinaptonemico. Cada cromosoma se condensa alrededor de una estructura llamada elemento axial. El complejo sinaptonemico se forma después de roturas de doble cadena.
  • 9. Las Secuencias chi Estimulan el Sistema RecBCD Bacteriano. •Un sitio chi se puede activar con una rotura de la doble cadena. •El complejo RecBCD ejerce varias actividades. •Su participación en la recombinación es preveer una región de una sola cadena con un extremo 3` libre. •La RecBCD cuando alcanza el sitio chi el complejo entra en pausa. El reconocimiento del sitio chi hace que la subunidad RecD se desactive.
  • 10. Las reacciones se coordinan en un ADN sustrato que tiene un sitio chi. La nucleasa RecBCD se acerca a una secuencia chi desde un lado y degrada el ADN a medida que avanza; en el sitio chi hace un corte endonucleolítico, pierde RecD y conserva solo la actividad de helicasa.
  • 11. Proteínas de transfería: catalizan la asimilación de una sola cadena La RecA facilita la asimilación de cadenas únicas invasoras en el ADN dúplex, siempre y cuando una de las cadenas reactivas tengan un extremo libre. La RecA forma filamentos con el ADN de una o dos cadenas y cataliza la capacidad de un ADN de una sola cadena con un extremo 3´libre de desplazar a su contraparte en una cadena dúplex de ADN.
  • 12. El sistema Ruv resuelve las uniones holliday El complejo Ruv actúa sobre uniones recombinantes La RuvA reconoce la estructura de la unión y la RuvB es una helicasa que cataliza la migración de ramas La RuvC escinde uniones para generar productos intermedios de recombinación. Complejo asimétrico
  • 13. La conversión génica contribuye a la recombinación interalélica El ADN heteodúplex creado por recombinación puede tener secuencias con apareamiento erróneo, donde los alelos recombinantes no son idénticos. Los sistemas de reparación pueden retirar apareamiento erróneos si cambian una de las cadenas, de modo que su secuencia sea complementaria a al otra. La formación de esporas en los ascomicetos permiten la determinación de la constitución genética cada una de las cadenas de ADN involucradas en la meiosis.
  • 14. Superenrollamiento Positivo Más estrecho Más pares de bases por giro Negativo Gira una en torno a otra, menos apretadas Menos bases por giro
  • 15. Número de Enlaces: veces que una cadena cruza sobre la otra. Isómeros Topológicos “Diferentes números de enlaces reflejan distintos grados de superenrollamiento” Número de Contorsiones(T): Total de giros de la doble elice. Número de Torcimientos (W): Giro de eje de la cadena dúplex en el espacio. ΔL= Δ W+ΔT
  • 16. Topoisomerasas Catalizan cambios en la topología. Actúan sin importar su secuencia. Los extremos generados por rotura nunca están libres, mantienen en enlaces covalentes con una molécula de tirosina de la enzima
  • 17. Tipo 1.- haciendo rotura transitoria de la cadena de ADN. Tipo II.- Introducen una rotura transitoria en la doble cadena. Grupo A.-Enlace con un fosfato 5´ Grupo B.-Enlace con un fosfato 3´ Girasas: Pueden introducir superhélices negativas. Girasas inversas: Pueden introducir superhélices positivas.
  • 18.
  • 20. La recombinación especializada involucra sitios específicos La recombinación especializada comprende una reacción entre sitio específicos que n tienen que ser homólogos El DNA del fago circular se convierte en un profago integrado por una recombinacion reciproca entre attP y attB
  • 21. La recombinación especifica de sitio comprende rotura y reunión Se hacen escisiones a intevalos de 7 bp en los genes attB y attP y los extremos se unen en forma cruzada
  • 22. La recombinación especia de sitio simula la actividad de la topoisomerasa
  • 23. Se muestra la reacción catalizada por una integrase. La enzima es una proteína monomérica que tiene un sitio activo capaz de cortar y ligar el DNA. La reacción comprende el ataque de una tirosina en un enlace fosfodiester.
  • 24. Esta imagen muestra la reacción inmediata con base en la estructura cristalina. La estructura del complejo Cre-Lox muestra dos moléculas de Cre, cada una unida por una longitud de 15 bp al DNA.