El puerto de San Borja y el comercio entre las ciudades de Santo Tomé y San Borja tienen una larga historia que se remonta al siglo XVII. El puerto se utilizó para transacciones pacíficas desde 1800 y las dos ciudades establecieron fuertes lazos comerciales y de amistad a pesar de las invasiones ocasionales. En 1946 se estableció oficialmente el servicio de transbordadores y balsas entre las ciudades, lo que impulsó aún más el comercio transfronterizo y las relaciones entre el