5. MODELO DE ESTRUCTURAS DE RNA POLIMERASAS BASADOS EN
ANALISIS CRISTALOGRAFICOS
Caja -10: TATAAT
σ
Caja -35: TTGACA β
ADN αI
RNA POLIMERASA β’ α II
DE BACTERIAS
( procariote )
ω
10
Caja TATA 9
Caja CAAT
ADN RBP 2
12 3
Tipo α
11
RNA POLIMERASA II
DE LEVADURAS
5 RBP 1
( eucariote ) 8 ( 12 subunidades )
CTD
6 Tipo ω
6. RNA POLIMERASAS DE EUCARIOTES
N U C L E A R E S
MITOCONDRIAL
I II III
Subunidades de 195 – 197 Kd 240 – 214 Kd 155 Kd
alto Peso 117 – 126 140 138
Molecular
Subunidades de Varias, entre Varias, entre Varias, entre
bajo Peso 16 a 61 Kd 16 a 41 Kd 19 a 89 Kd 65 Kd
Molecular
Formas 2 a 3 tipos 3 a 4 tipos 2 a 4 tipos 1 tipo
Variables
Nucleolo HnRNA, tRNA
RNA sintetizado rRNA (28S, mRNA ARN rRNA 5S mt RNA
18S y 5.8S) viral SnRNA
SnARN
Inhibición por No Si (muy Si (menos No
alfa amanitina sensible) sensible)
7. SECUENCIAS PROMOTORAS Y REGULADORAS DE UN
GEN DE LA CLASE II
PROMOTOR
INTENSIFICADOR
- 150 - 50 - 30 - 20 +1 20 - 200
5’
3’
SDE CAAT GC TATA
3’ 5’
8. Enhancer
GCCATCGGGC
HAT
TF II D
Pol II
CREB TF II E
TAFs Transcripción
TF II F TF II H
TBP
TF II A
.
TF II B
AGGTCA TGACCT
Sitio de Inicio de la
CRE Factores Generales de Transcripción
Transcripción
Caja TATA: -25
Caja CAAT
10. A Iniciación de la transcripción por unión de la RNA Polimerasa en el
sitio de inicio.
RNA POLIMERASA
Factor σ
COMPLEJO CERRADO
11. B Apertura de la doble hélice del ADN e Iniciación de la COMPLEJO
cadena de ARN con la unión de los primeros dos ABIERTO
Ribonucleósidos Trifosfatos
ARN POLIMERASA Factor σ ( bacterias )
3’
5’ RNA
NACIENTE
4 (NTP)n
C Elongación de la cadena de (PPi)n
RNA por adición de NTPs
3’
40 nucleótidos / Segundo
RNA
Nus A
5’
12. Rho
3’
5’
RNA
D Terminación y liberación de la Polimerasa y el
RNA completado dependiente de Rho RNA
Rho POLIMERASA
3’
RNA
5’
DNA
13. ESTRUCTURA DE TALLO – BUCLE DEL EXTREMO 3’ QUE INDICA
TERMINACION DE UN RNA TRANSCRITO INDEPENDIENTE DE RHO
U U
U U
C....G
C.…G
U.…A Tallo rico
C….G en G + C
G….C
G….C
A….U
A….U
A….U
A–U–U U – U – U – U – U – OH
Secuencias
desapareadas
de Us
14. PAUSA
3’
RNA
E Modelo de terminación de la transcripción
independiente de rho ( ρ )
5’ ISOMERIZACION
3’
RNA
5’
TERMINACION
15. PROCESAMIENTO DE LOS mRNAs EUCARIOTICOS
Exones Intrones
HnRNA
5’ 3’
Añadido de
Poli A
Añadido del Intrones
Cap
Cap
A A A A A A A A ……..
A
5’ mRNA 3’
Cola de poli A
16. AGG GU A AG
sn RNP U1 sn RNP U2
AGG GU A AG
C C A 5’ sn RNP U2
3’
snRNP U4/U6 +
sn RNP U1 snRNP U5
U2 U1
U4 / U6
U5
snRNPs
A
17. Secuencia Señal de
AAUAAA
Poli-A en el DNA
Factor Específico de
Corte y
P P P P P Poliadenilación
CTD
CPSF Secuencia
Dominio del CstF
RNA señal de
extremo C- Dominio CTD Poli-A en el
5’ RNA
Terminal
Factor Estimulante
CstF
de Corte
Corte del
RNA
CPSF
5’ 3’
Poli-A Polimerasa
(PAP) PAP
5’ 3’
Proteína Unidora de
Poli-A
3’
5’ AAAAAAA
Proteína Unidora de
Poli-A Adicional
5’ AAAAAAA AAAAAAA
Figura Nº 4.15. Poliadenilación y Terminación de la síntesis de un
mRNA eucariótico.
18. Receptor de Complejo del
Transporte Poro Nuclear
nuclear Casquete
5’
A
A
A
AAAAAAA A
A
A
Proteína de unión
al poli-A NUCLEO CITOPLASMA
AAAAAAA
19. NUCLEO CITOPLASMA
ADN
TRANSCRIPCION
Hn RNA
PROCESAMIENTO
m RNA
AAAAAAAAAA …. A
TRADUCCION
(Síntesis Proteica)
m RNA
AAAAAAAAAA …. A
20. TRANSCRIPCION POR LA RNA POLIMERASA I
DNA
Pre-rRNA
45 S
rRNA 28 S 5.8 S rRNA 18 S
Estructura de una unidad de transcripción de rRNA
Nucleolo: Cromosoma ---- GEN Organizador Nucleolar
“TANDEM”
21. ESQUEMA DE LA TRANSCRIPCION Y PROCESAMIENTO DE LOS rRNAs EUCARIOTICOS
DNA GEN DE DNA RIBOSOMAL
Transcripción y
RNA Polimerasa I metilación
CORTE
3’ 5’
28 S 5.8 S 18 S Pre- rRNA 45 S
CORTE
3’ Pre- rRNA 41 S
5’
28 S 5.8 S 18 S
CORTE CORTE
Pre – rRNA 32 S Pre – rRNA 20 S
CORTE
rRNA 28 S
rRNA 18 S
rRNA 5.8 S
22. TRANSCRIPCION POR LA RNA POLIMERASA III
+1 +47 +96 +121
TF III A
RNA Polimerasa III
+1 +47 +96 +121
TF III A
Contactos Proteína-Proteína entre
TF III A y la RNA Polimerasa III
Factores de Transcripción para genes eucarióticos de la Clase III
23. INTRON
DNA
RNA Polimerasa III Transcripción
Endonucleasa Exonucleasa
5’ P – P – P – OH 3’
RNAasa P
TRANSCRIPTO PRIMARIO
Intrón
ESQUEMA PARA EL
PROCESAMIENTO DE UN tRNA
EUCARIOTICO Añadido de CCA – OH y
modificaciones en el
extremo 3’
24. Añadido de CCA – OH y
modificaciones en el
extremo 3’
ESQUEMA PARA EL H
PROCESAMIENTO DE UN tRNA O 3’
EUCARIOTICO
A
C
C
5’ P
Intrón