ACES se originó como una transformación de la Federación de Cooperativas Andaluzas de Enseñanza (FECAE), que comenzó en 1983 cuando un grupo pequeño de cooperativas educativas empezaron a reunirse para intercambiar experiencias sobre su modelo educativo y organizacional. FECAE creció para representar a más cooperativas educativas y defender sus intereses. En 2000, FECAE inició la Asociación Andaluza de Centros de Enseñanza de Economía Social (ACES) para representar a más tipos de centros educativos y constituirse como