Estimar el impacto de la presencia de Ómicron en la evolución promedio diaria de los nuevos contagiados, nuevos fallecidos, casos hospitalizados y casos en UCI en Colombia, utilizando la base de datos de casos, la información sobre el genoma y el estado de vacunación procedente de las fuentes Oficiales.

1. Impacto de Ómicron en los Contagios en Colombia
Matemática, Administradora Pública y Magister Científico-Estadística
Analítica y Datos –Beatriz García Peña
1. Objetivo
Estimar el impacto de la presencia de Ómicron en la evolución de los nuevos
contagios, fallecidos, hospitalizados y en UCI diarios en Colombia, utilizando la
base de datos de casos y la información sobre el genoma del Instituto Nacional
de Salud, la cual fue consultada en su sitio web oficial el 16 de febrero de 2022
y el infograma diario de los logros en materia de vacunación en Colombia
publicado en Twitter del Ministerio de Salud y Protección Social.
2. Palabras claves
Intervalos de confianza, pruebas de hipótesis, inferencia
estadística, base de datos de casos del Instituto Nacional de
Salud, Informes sobre la distribución geográfica de los linajes
de SARS-Cov-2 circulantes en Colombia del Instituto Nacional
de Salud, avance de la vacunación en Colombia del Ministerio
de Salud y Protección Social, Beatriz García Peña, Analítica y
Datos
4. Contagio en Colombia a 15 de febrero de 2022- Día 720 del Contagio y correspondiente a lo ocurrido hasta el 31 de enero de 2022
6. Conclusiones
Ómicron:
• aumento significativamente los nuevos contagios en diciembre de 2021.
• aumento significativamente los nuevos fallecidos en enero de 2022 llegando a ser significativamente
igual al de toda la pandemia sin Ómicron.
• aumento significativamente los activos hospitalizados en enero de 2022.
• aumento significativamente los activos en UCI en enero de 2022.
9. Fuentes de Información
• [1] Instituto Nacional de Salud.(2022). Base de datos sobre casos positivos. Instituto Nacional de Salud. Consultada en
https://www.ins.gov.co/Noticias/Paginas/Coronavirus.aspx
• [2] Instituto Nacional de Salud.(2022).Base de datos sobre muestras. Instituto Nacional de Salud. Consultada en
https://www.ins.gov.co/Noticias/Paginas/Coronavirus.aspx
• [3] Instituto Nacional de Salud. (2022). Distribución geográfica de los linajes de SARS-COV-2 circulantes en Colombia. Instituto
Nacional de salud. Consultado en https://www.ins.gov.co/Noticias/Paginas/Coronavirus.aspx
• [4] Ministerio de salud. (2022). Plan Nacional de Vacunación. Consultado en https://twitter.com/minsaludcol
• [5] DANE. (2021). Anexo Proyecciones de Población Nacional. DANE. Consultado en
https://www.dane.gov.co/index.php/estadisticas-por-tema/demografia-y-poblacion/proyecciones-de-poblacion
• [6] BBC News Mundo. (2022). Covid-19: ¿cómo es la nueva subvariante ómicron BA.2 y qué tanto debe preocuparnos?. BBC.com
en https://www.bbc.com/mundo/noticias-60230350
• [7] La Republica. (2022). Esto es todo lo que debe conocer sobre BA.2, la nueva subvariante de ómicron. LaRepublica.co.
Consultada en https://www.larepublica.co/globoeconomia/esto-es-todo-lo-que-debe-conocer-sobre-ba2-la-nueva-subvariante-de-
omicron-3292971
3. Metodología
• Acceso y validación de la base de datos
• Clasificación de la base de datos de casos según la presencia
o no de la variante ómicron en Colombia, desde el 5 de
diciembre de 2021 se considera con presencia de Ómicron
• Establecimiento de los escenarios de comparación
• Cálculos de los intervalos de confianza del 99%
• Pruebas de hipótesis utilizando la información gráfica de los
intervalos de confianza
5. Estimación del Efecto de la Presencia de la Variante Ómicron
Los nuevos contagios diarios en Colombia
presentan un máximo que asciende a 35.106
correspondiente al 3 de enero del 2022, van 44
días en descenso. El promedio diario de nuevos
contagios es de 7.483.
Nota: Los Nuevos contagios se representan con respecto a la fecha de inicio
de síntomas de los casos.
7. Recomendaciones
Recomendamos realizar estas estimaciones con sus respectivas
sensibilizaciones por lo menos dos meses después ya que en ese lapso de
tiempo la información sobre nuevos contagios y nuevos fallecidos se
consolidan y los efectos se precisan mucho más.
8. Divulgación
Las diferentes versiones de la presente investigación se han remitido al
sector gobierno, a organismos de control, a académicos, a medios de
comunicación y a organismos internacionales como la Organización
Panamericana de la Salud. A su vez se divulga en redes sociales, páginas
web, boletines electrónicos, informes de investigación en Scribd y mediante
correos electrónicos.
Los nuevos fallecidos diarios en Colombia presentan
un máximo que asciende a 660 fallecidos en 24 horas
correspondiente al 21 de junio de 2021, van 240 días
en descenso. El promedio de nuevos fallecidos es de
196.
El valor pico de los nuevos recuperados diarios en
Colombia ascienden a 61.040 correspondiente al
15 de junio de 2021, van 246 días en descenso.
Los nuevos recuperados diarios presentan un
promedio de 8.290 casos.
Hasta el 15 de febrero del 2022 el 84,5% y el
15,5% de los recuperados en Colombia son por
tiempo clínico y por recuperación certificada con
prueba PCR, respectivamente.
Los casos activos diarios en Colombia presentan un
pico que asciende a 189.390 correspondiente al 28
de junio de 2021 y su promedio diario es de 73.953
casos. Hasta el 15 de febrero del 2022 el 74,9%,
16,9% y 8,2% de los casos activos se encuentran
en atención domiciliaria, en hospital y en UCI,
respectivamente.
Al 15 de febrero de 2022 los contagios acumulados
en Colombia se descomponen en activos (0,40%),
fallecidos acumulados (2,28%), los recuperados
acumulados (96,97%) y los casos que no aplican
(0,35%).
Hasta el 15 de febrero de 2022 los contagiados
acumulados en Colombia se descomponen en
asintomáticos (10,3%), sintomáticos (89,4%) y
casos que no aplican (0,3%).
El factor de contagios se estima utilizando
un intervalo de confianza del 99% y fluctúa
entre 1,016 y 1,033.
La evolución diaria de las nuevas pruebas PCR en
Colombia presenta un promedio de 27.868 pruebas
y un máximo de 68.576, el 11 de enero de 2022.
Hasta el 15 de febrero de 2022 se han aplicado
19.897.542 pruebas PCR de las cuales 4.641.694
son positivas, arrojando una positividad acumulada
de 23,3.
La atención diaria en la Casa, el Hospital y en UCI tiene un máximo de 172.174, 22.247 y 3.541 correspondientes al 15 de enero de 2022, al 11 de julio de 2021 y al
28 enero de 2021, respectivamente.
35.106
0
5.000
10.000
15.000
20.000
25.000
30.000
35.000
40.000
27-feb
17-mar
5-abr
24-abr
13-may
1-jun
20-jun
9-jul
28-jul
16-ago
4-sep
23-sep
12-oct
31-oct
19-nov
8-dic
27-dic
15-ene
3-feb
22-feb
13-mar
1-abr
20-abr
9-may
28-may
16-jun
5-jul
24-jul
12-ago
31-ago
19-sep
8-oct
27-oct
15-nov
4-dic
23-dic
11-ene
30-ene
18-feb
Evolución de los Nuevos Contagios Diarios
Colombia
660
0
50
100
150
200
250
300
350
400
450
500
550
600
650
700
17-mar
5-abr
24-abr
13-may
1-jun
20-jun
9-jul
28-jul
16-ago
4-sep
23-sep
12-oct
31-oct
19-nov
8-dic
27-dic
15-ene
3-feb
22-feb
13-mar
1-abr
20-abr
9-may
28-may
16-jun
5-jul
24-jul
12-ago
31-ago
19-sep
8-oct
27-oct
15-nov
4-dic
23-dic
11-ene
30-ene
18-feb
Evolución de Nuevos Fallecidos Diarios
Colombia
61.040
0
10.000
20.000
30.000
40.000
50.000
60.000
70.000
6-mar
25-mar
13-abr
2-may
21-may
9-jun
28-jun
17-jul
5-ago
24-ago
12-sep
1-oct
20-oct
8-nov
27-nov
16-dic
4-ene
23-ene
11-feb
2-mar
21-mar
9-abr
28-abr
17-may
5-jun
24-jun
13-jul
1-ago
20-ago
8-sep
27-sep
16-oct
4-nov
23-nov
12-dic
31-dic
19-ene
7-feb
26-feb
Evolución de los Nuevos Recuperados Diarios
Colombia
0
20.000
40.000
60.000
80.000
100.000
120.000
140.000
160.000
180.000
200.000
29-jul
19-ago
9-sep
30-sep
21-oct
11-nov
2-dic
23-dic
13-ene
3-feb
24-feb
17-mar
7-abr
28-abr
19-may
9-jun
30-jun
21-jul
11-ago
1-sep
22-sep
13-oct
3-nov
24-nov
15-dic
5-ene
26-ene
16-feb
Evolución de la Atención de los Activos en
Colombia
En Hogar En Hospital En UCI
0%
20%
40%
60%
80%
100%
29-jul
29-ago
29-sep
29-oct
29-nov
29-dic
29-ene
28-feb
31-mar
30-abr
31-may
30-jun
31-jul
31-ago
30-sep
31-oct
30-nov
31-dic
31-ene
28-feb
Evolución de las Distribución % de los Contagios
Acumulados en Colombia por Componentes
Colombia
Activos Fallecidos Recuperados
0%
20%
40%
60%
80%
100%
6/03/2020
6/04/2020
6/05/2020
6/06/2020
6/07/2020
6/08/2020
6/09/2020
6/10/2020
6/11/2020
6/12/2020
6/01/2021
6/02/2021
6/03/2021
6/04/2021
6/05/2021
6/06/2021
6/07/2021
6/08/2021
6/09/2021
6/10/2021
6/11/2021
6/12/2021
6/01/2022
6/02/2022
Evolución % de los Contagiados por Condición de
Asintomáticos y Sintomáticos según Fecha de
Diagnóstico
Colombia
Asintomático Sintomático
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
70%
80%
90%
100%
13/03/2020
13/04/2020
13/05/2020
13/06/2020
13/07/2020
13/08/2020
13/09/2020
13/10/2020
13/11/2020
13/12/2020
13/01/2021
13/02/2021
13/03/2021
13/04/2021
13/05/2021
13/06/2021
13/07/2021
13/08/2021
13/09/2021
13/10/2021
13/11/2021
13/12/2021
13/01/2022
13/02/2022
Evolución % de los Recuperados por Tipo de
Recuperación según Fecha de Recuperación
Colombia
PCR Tiempo
172.174
0
20.000
40.000
60.000
80.000
100.000
120.000
140.000
160.000
180.000
200.000
Evolución de los Casos Activos en Casa
Colombia
22.247
0
5.000
10.000
15.000
20.000
25.000
25-mar
10-abr
26-abr
12-may
28-may
13-jun
29-jun
15-jul
31-jul
16-ago
1-sep
17-sep
3-oct
19-oct
4-nov
20-nov
6-dic
22-dic
7-ene
23-ene
8-feb
24-feb
12-mar
28-mar
13-abr
29-abr
15-may
31-may
16-jun
2-jul
18-jul
3-ago
19-ago
4-sep
20-sep
6-oct
22-oct
7-nov
23-nov
9-dic
25-dic
10-ene
26-ene
11-feb
27-feb
Evolución de los Casos Activos en Hospital
Colombia
3.541
0
500
1.000
1.500
2.000
2.500
3.000
3.500
4.000
25-mar
12-abr
30-abr
18-may
5-jun
23-jun
11-jul
29-jul
16-ago
3-sep
21-sep
9-oct
27-oct
14-nov
2-dic
20-dic
7-ene
25-ene
12-feb
2-mar
20-mar
7-abr
25-abr
13-may
31-may
18-jun
6-jul
24-jul
11-ago
29-ago
16-sep
4-oct
22-oct
9-nov
27-nov
15-dic
2-ene
20-ene
7-feb
25-feb
Evolución de los Casos Activos en UCI
Colombia
68.576
0
10.000
20.000
30.000
40.000
50.000
60.000
70.000
80.000
4-mar
23-mar
11-abr
30-abr
19-may
7-jun
26-jun
15-jul
3-ago
22-ago
10-sep
29-sep
18-oct
6-nov
25-nov
14-dic
2-ene
21-ene
9-feb
28-feb
19-mar
7-abr
26-abr
15-may
3-jun
22-jun
11-jul
30-jul
18-ago
6-sep
25-sep
14-oct
2-nov
21-nov
10-dic
29-dic
17-ene
5-feb
24-feb
Evolución de las Nuevas Pruebas PCR Aplicadas
Colombia
1,016
1,033
0,00
0,50
1,00
1,50
2,00
2,50
3,00
3,50
28-feb
21-mar
12-abr
4-may
26-may
17-jun
9-jul
31-jul
22-ago
13-sep
5-oct
27-oct
18-nov
10-dic
1-ene
23-ene
14-feb
8-mar
30-mar
21-abr
13-may
4-jun
26-jun
18-jul
9-ago
31-ago
22-sep
14-oct
5-nov
27-nov
19-dic
10-ene
1-feb
23-feb
Monitoreo al Factor de Contagios
Colombia
Factor Contagios LI 99% LS 99%
Informe No. 31 de la distribución geográfica de los linajes de SARS-CoV-2 circulantes en Colombia de fecha
febrero 3 de 2022. y % de prevalencia por fecha de Muestreo, Instituto Nacional de Salud
Con respecto a los logros en materia de vacunación se han aplicado en promedio 206.925 nuevas dosis diarias con un máximo de 594.993 correspondientes al 6 de
agosto de 2021. Los colombianos vacunados al 15 de febrero ascienden a 32.922.693 equivalente al 64,5% de la población colombiana. El máximo de nuevas
personas vacunadas por días asciende a 410.219 correspondiente al 8 de septiembre de 2021 y diariamente en promedio se alcanza la vacunación completa de
97.117 personas. Las nuevas terceras dosis tienen un promedio de 54.206 diario y un máximo de 216.598 que ocurrió el 18 de enero de 2022. Al 15 de febrero del
2022 se han aplicado 7.426.279 dosis de refuerzo.
Nota: La población de Colombia utilizada es 51.049.498 correspondiente al año 2021.
594.993
0
100.000
200.000
300.000
400.000
500.000
600.000
700.000
Evolución de las Nuevas Dosis Diarias Aplicadas
Vacunación en Colombia
410.219
0
50.000
100.000
150.000
200.000
250.000
300.000
350.000
400.000
450.000
Evolución de las Nuevas Personas Vacunadas
Colombia
216.598
0
50.000
100.000
150.000
200.000
250.000
Evolución de las Nuevas Dosis Diarias de Refuerzo
Colombia
El promedio diario de nuevos contagiados en diciembre de
2021 es significativamente superior del registrado en la
pandemia sin Ómicron y en la pandemia sin Ómicron con
vacunación y con aplicación de refuerzos.
El promedio diario de nuevos contagiados en enero de
2022 es significativamente inferior al registrado en la pandemia
sin Ómicron y en diciembre de 2021. Pero es significativamente
superior al de la pandemia sin Ómicron con vacunación y con
aplicación de refuerzos.
6.474
1.813
16.881
3.237
7.061
2.023
20.505
5.151
7.648
2.233
24.129
7.064
0
5.000
10.000
15.000
20.000
25.000
30.000
Nuevos Contagiados Sin
Omicron
Nuevos Contagiados Sin
Omicron -Con
Vacunación y Con
Refuerzo-
Nuevos Contagiados Dic
Con Omicron -Con
Vacunación y Con
Refuerzo-
Nuevos contagiados Ene
Con Omicron -Con
Vacunación y Con
Refuerzo-
Intervalos del 99% de Confianza del Promedio
Diario de los Contagiados
Colombia
185
35
42
176
201
37
60
201
217
40
78
225
0
100
200
300
Nuevos Fallecidos
Sin Omicron
Nuevos Fallecidos
Sin Omicron -Con
Vacunación y Con
Refuerzo-
Nuevos Fallecidos
Dic Con Omicron -
Con Vacunación y
Con Refuerzo-
Nuevos Fallecidos
Ene Con Omicron -
Con Vacunación y
Con Refuerzo-
Intervalos del 99% de Confianza del Promedio
Diario de los Fallecidos
Colombia
El promedio diario de nuevos fallecidos en diciembre de
2021 es significativamente inferior del registrado en la pandemia
sin Ómicron y significativamente superior del correspondiente
de la pandemia sin Ómicron con vacunación y con aplicación de
refuerzos.
El promedio diario de nuevos fallecidos en enero de 2022
es significativamente igual al registrado en la pandemia sin
Ómicron y significativamente superior al del mes de diciembre
de 2021 y al de la pandemia sin Ómicron con vacunación y con
aplicación de refuerzos.
12.622
2.433
1.107
4.655
13.213
2.975
1.427
5.088
13.803
3.517
1.748
5.520
0
2.000
4.000
6.000
8.000
10.000
12.000
14.000
Activos Hospitalizados
Sin Omicron
Activos Hospitalizados
Sin Omicron -Con
Vacunacion y Con
Refuerzos
Activos Hospitalizados
Dic Con Omicron -
Con Vacunación y
Con Refuerzo-
Activos Hospitalizados
Ene Con Omicron -
Con Vacunación y
Con Refuerzo-
Intervalos del 99% de Confianza del Promedio
Diario de los Casos Activos Hospitalizados
Colombia
El promedio diario de los activos hospitalizados en
diciembre de 2021 es significativamente inferior del registrado
en la pandemia sin Ómicron y de la pandemia sin Ómicron con
vacunación y con aplicación de refuerzos.
El promedio diario de activos hospitalizados en enero de
2022 es significativamente superior al del mes de diciembre de
2021 y al de la pandemia sin Ómicron con vacunación y con
aplicación de refuerzos. Pero significativamente inferior del de la
pandemia sin Ómicron.
1.710
249 321
913
1.805
273
371
985
1.901
297
421
1.057
0
500
1.000
1.500
2.000
Activos en UCI Sin
Omicron
Activos en UCI Sin
Omicron -Con
Vacunación y Con
Refuerzo-
Activos en UCI Dic
Con Omicron -Con
Vacunación y Con
Refuerzo-
Activos en UCI Ene
Con Omicron -Con
Vacunación y Con
Refuerzo-
Intervalos del 99% de Confianza del Promedio
Diario de los Casos Activos en UCI
Colombia
El promedio diario de los activos en UCI en diciembre de
2021 es significativamente inferior del registrado en la pandemia
sin Ómicron y significativamente superior del de la pandemia sin
Ómicron con vacunación y con aplicación de refuerzos.
El promedio diario de activos en UCI en enero de 2022 es
significativamente superior al del mes de diciembre de 2021 y al
de la pandemia sin Ómicron con vacunación y con aplicación de
refuerzos. Pero significativamente inferior al de la pandemia sin
Ómicron.
Consideraciones utilizadas para el establecimiento del efecto de la variante Ómicron:
• presencia de la cita variante a partir del 5 de diciembre de 2021, según información genómica suministrada por el Instituto Nacional de Salud
• Cálculo de los intervalos de confianza desplazados en +15 días, es decir, el intervalo de diciembre se calcula desde el 19 de diciembre de 2021
al 15 de enero de 2022 y el de enero desde el 16 de enero hasta el 15 de febrero de 2022.
• Dado que en los meses de presencia de Ómicron se adelanta el Plan Nacional de Vacunación con su componente de administración de
vacunas y de dosis de refuerzo, el escenario base de comparación es sin Ómicron combinado con vacunación y con aplicación de dosis de
refuerzo y el más amplio que hace referencia al registrado desde el momento de inicio de la pandemia sin Ómicron en el cual se aplica
vacunación pero sin aplicación de dosis de refuerzo o sin aplicación de dosis de vacunación, escenario denominado sin Ómicron. Estos
escenarios corresponden a una partición del continuo de la pandemia en Colombia.