LA ESTRUCTURA DE LAS
                  PROTEÍNAS

                     Bioquímica 2º bachillerato




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LA DISPOSICIÓN ESPACIAL

        Una proteína sólo es funcional (activa) si tiene
        una determinada forma en el espacio

        ESTRUCTURAS: grados de plegamiento en el
        espacio.
              • E. Primaria: zig-zag
              • E. Secundaria: proteínas fibrosas
              • E. Terciaria: proteínas globulares
              • E. Cuaternaria: proteínas oligoméricas


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ESTRUCTURA PRIMARIA
       es


   La secuencia de aminoácidos de una proteína.
            se dispone en            Una proteína con “n” aminoácidos podría tener



    ZIG-ZAG                       20n


        Según el número de aminoácidos en la E1:
        • n<10: oligopéptido
        • 10< n <100: polipéptido (PM < 5000)
        • n > 100: proteína (PM entre 5000 y 40.000.000)



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ESTRUCTURA PRIMARIA




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ESTRUCTURA PRIMARIA
        la primera que se determinó


                         por
 INSULINA                             SANGER




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PASO A E. SECUNDARIA




                                                  Los cuatro átomos del enlace
                                                  peptídico en el mismo plano.
                                                  Rotaciones posibles:
                                                      Enlace φ (phi) : N – Ca
                                                      Enlace ψ (psi): Ca - C


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PASO A E. SECUNDARIA

                                              • Los enlaces φ y ψ pueden,
                                                teóricamente, tomar valores
                                                entre –180o y +180o.
                                              • Según valores de φ y ψ se
                                                obtendrán los distintos tipos
                                                de E2.
                                              • Pero no todas las estructuras
                                                son estables.
                                              • Las estructuras estables en
                                                DIAGRAMA DE
                                                RAMANCHANDRAN
  Según los valores de φ y ψ sólo son
  estables unas estructuras secundarias.
  En el diagrama las zonas más oscuras
  son las más estables.
                                                           Y SON …

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HÉLICE α




                                                            Linus Pauling
                                                           (P. Nobel, 1954,
                                                                1962)




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HÉLICE α

   -Plegamiento dextrógiro.
                                              (1,4)
   -Puentes de hidrógeno intracatenarios


    • CARACTERÍSTICAS:
         – 0’54 nm de avance por
           vuelta.
         – 3’6 residuos por vuelta.
         – Giro de 100o por cada
           aminoácido.
         – Grupos R hacia el exterior.


               Se rompe prolina e hidroxiprolina


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LÁMINA β
                            Se mantiene la estructura en Zig-Zag




                                N-C ; N-C                               N-C ; C-N




               (antiparalela)                              (paralela)



                        Puentes de hidrógeno intercatenarios



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LÁMINA β

                                          Grupo R hacia ambos lados de la hoja
                                          de modo alternativo.
                                Giro de
                                180
                                grados
                                          Muy estable.




                                                                        FIBROÍNA




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LA HÉLICE DE COLÁGENO

                                                       - Contiene prolina
                                                       - Levógira
                                                       -Una vuelta de hélice cada
                                                        tres aminoácidos.
                                                       -No forma puentes de
                                                       hidrógeno.
                                                       -Más extendida que la
                                                       héice α.


                                                           E. TERCIARIA




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DEFINITIVAMENTE




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ESTRUCTURA TERCIARIA
     Conformación espacial que tiene una proteína en su estado
     nativo. Es estable. Depende de la E1.




                                                             FABP


    FERRITINA

     Observa cómo regiones
     de E2 están plegadas
     en el espacio

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ESTRUCTURA TERCIARIA
   ¿Por qué una proteína se pliega así y no de otra manera? –
   Depende de estas interacciones según la posición de los
   aminoácidos E1




       Si una proteína no tiene su forma nativa NO PUEDE
       LLEVAR A CABO SU FUNCIÓN.

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LA MIOGLOBINA

     • John Kendrew y col.
       en 1950 (por
       difracción de rayos X)
     • Proteína fijadora de
       O2 en el músculo.
     • Masa: 16700
     • 153 residuos de
       aminoácidos.




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LA MIOGLOBINA
   • Grupo HEMO con Fe.
   • Todos los grupos R polares
     salvo 2 en el exterior.
   • Tan compacta que en el
     interior sólo caben 4
     moléculas de H2O.
   • Consta de ocho segmentos
     de hélice a conectadas por
     bisagras (prolina)
   • Hélice a de mayor
     longitud: 23 aminoácidos.




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DOMINIOS Y BISAGRA
                                          Regiones o unidades compactas
                                          de E3 de una proteínas de
                                          elevado peso molecular unidas
                                          entre sí por regiones bisagra.


                                            Los dominios son estables y
                                            pueden aparecer en
                                            diferentes proteínas



                                     En la imagen los tres
                                     dominios de la piruvato
                                     quinasa


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ESTRUCTURA CUATERNARIA

        Es la resultante de la unión de varias
        subunidades (o protómeros), cada una con
        su E3.
        Unión por:Puentes de hidrógeno o Fuerzas
        de Van der Waals.
            Más inhabitual por puentes disulfuro.
        Las proteínas con E4 se denominan
        oligoméricas.
        oligoméricas
        Son de elevado peso molecular.



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LA HEMOGLOBINA
      • Formada por cuatro
        monómeros
        (tetrámero):
           – Dos subunidades α (141
             aa)
           – Dos subunidades β (146
             aa)
      • Cada subunidad con un
        grupo prostético HEMO
        (con Fe).
      • Función: transporte de
        oxígeno en la sangre.                      DESOX IHEMOGLOBINA
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LA HEMOGLOBINA
      • La oxihemoglobina y la
        desoxihemoglobina
        poseen E4 diferentes.
      • Las secuencias de
        mioglobinas y cadenas
        α y β de hemoglobinas
        son muy parecidas:
        MOLÉCULA
        ANTECESORA COMÚN.
      • Se ha dada
        CONSERVACIÓN
                                                       OX IHEMOGLOBINA
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PASO DE PROCOLÁGENO A
             TROPOCOLÁGENO.
              (paso de E2 a E4)

      • Ruptura de flecos por
        las procolágeno
        peptidasas.
      • En la matriz celular.
      • Posteriormente el
        tropocolágeno se
        polimeriza en fibra de
        colágeno.
      • Es un mecanismo de
        protección.


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ESTRUCTURA CUATERNARIA


          Se unen girando
          y enrollándose unas
          sobre otras a derechas
           dextrógiras




                                                           Gran estabilidad




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Estructura de-las-proteinas-jano

  • 1.
    LA ESTRUCTURA DELAS PROTEÍNAS Bioquímica 2º bachillerato © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 2.
    LA DISPOSICIÓN ESPACIAL Una proteína sólo es funcional (activa) si tiene una determinada forma en el espacio ESTRUCTURAS: grados de plegamiento en el espacio. • E. Primaria: zig-zag • E. Secundaria: proteínas fibrosas • E. Terciaria: proteínas globulares • E. Cuaternaria: proteínas oligoméricas © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 3.
    ESTRUCTURA PRIMARIA es La secuencia de aminoácidos de una proteína. se dispone en Una proteína con “n” aminoácidos podría tener ZIG-ZAG 20n Según el número de aminoácidos en la E1: • n<10: oligopéptido • 10< n <100: polipéptido (PM < 5000) • n > 100: proteína (PM entre 5000 y 40.000.000) © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 4.
    ESTRUCTURA PRIMARIA © -PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 5.
    ESTRUCTURA PRIMARIA la primera que se determinó por INSULINA SANGER © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 6.
    PASO A E.SECUNDARIA Los cuatro átomos del enlace peptídico en el mismo plano. Rotaciones posibles: Enlace φ (phi) : N – Ca Enlace ψ (psi): Ca - C © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 7.
    PASO A E.SECUNDARIA • Los enlaces φ y ψ pueden, teóricamente, tomar valores entre –180o y +180o. • Según valores de φ y ψ se obtendrán los distintos tipos de E2. • Pero no todas las estructuras son estables. • Las estructuras estables en DIAGRAMA DE RAMANCHANDRAN Según los valores de φ y ψ sólo son estables unas estructuras secundarias. En el diagrama las zonas más oscuras son las más estables. Y SON … © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 8.
    HÉLICE α Linus Pauling (P. Nobel, 1954, 1962) © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 9.
    HÉLICE α -Plegamiento dextrógiro. (1,4) -Puentes de hidrógeno intracatenarios • CARACTERÍSTICAS: – 0’54 nm de avance por vuelta. – 3’6 residuos por vuelta. – Giro de 100o por cada aminoácido. – Grupos R hacia el exterior. Se rompe prolina e hidroxiprolina © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 10.
    LÁMINA β Se mantiene la estructura en Zig-Zag N-C ; N-C N-C ; C-N (antiparalela) (paralela) Puentes de hidrógeno intercatenarios © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 11.
    LÁMINA β Grupo R hacia ambos lados de la hoja de modo alternativo. Giro de 180 grados Muy estable. FIBROÍNA © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 12.
    LA HÉLICE DECOLÁGENO - Contiene prolina - Levógira -Una vuelta de hélice cada tres aminoácidos. -No forma puentes de hidrógeno. -Más extendida que la héice α. E. TERCIARIA © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 13.
    DEFINITIVAMENTE © - PROFESORJANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 14.
    ESTRUCTURA TERCIARIA Conformación espacial que tiene una proteína en su estado nativo. Es estable. Depende de la E1. FABP FERRITINA Observa cómo regiones de E2 están plegadas en el espacio © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 15.
    ESTRUCTURA TERCIARIA ¿Por qué una proteína se pliega así y no de otra manera? – Depende de estas interacciones según la posición de los aminoácidos E1 Si una proteína no tiene su forma nativa NO PUEDE LLEVAR A CABO SU FUNCIÓN. © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 16.
    LA MIOGLOBINA • John Kendrew y col. en 1950 (por difracción de rayos X) • Proteína fijadora de O2 en el músculo. • Masa: 16700 • 153 residuos de aminoácidos. © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 17.
    LA MIOGLOBINA • Grupo HEMO con Fe. • Todos los grupos R polares salvo 2 en el exterior. • Tan compacta que en el interior sólo caben 4 moléculas de H2O. • Consta de ocho segmentos de hélice a conectadas por bisagras (prolina) • Hélice a de mayor longitud: 23 aminoácidos. © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 18.
    DOMINIOS Y BISAGRA Regiones o unidades compactas de E3 de una proteínas de elevado peso molecular unidas entre sí por regiones bisagra. Los dominios son estables y pueden aparecer en diferentes proteínas En la imagen los tres dominios de la piruvato quinasa © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 19.
    ESTRUCTURA CUATERNARIA Es la resultante de la unión de varias subunidades (o protómeros), cada una con su E3. Unión por:Puentes de hidrógeno o Fuerzas de Van der Waals. Más inhabitual por puentes disulfuro. Las proteínas con E4 se denominan oligoméricas. oligoméricas Son de elevado peso molecular. © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 20.
    LA HEMOGLOBINA • Formada por cuatro monómeros (tetrámero): – Dos subunidades α (141 aa) – Dos subunidades β (146 aa) • Cada subunidad con un grupo prostético HEMO (con Fe). • Función: transporte de oxígeno en la sangre. DESOX IHEMOGLOBINA © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 21.
    LA HEMOGLOBINA • La oxihemoglobina y la desoxihemoglobina poseen E4 diferentes. • Las secuencias de mioglobinas y cadenas α y β de hemoglobinas son muy parecidas: MOLÉCULA ANTECESORA COMÚN. • Se ha dada CONSERVACIÓN OX IHEMOGLOBINA © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 22.
    PASO DE PROCOLÁGENOA TROPOCOLÁGENO. (paso de E2 a E4) • Ruptura de flecos por las procolágeno peptidasas. • En la matriz celular. • Posteriormente el tropocolágeno se polimeriza en fibra de colágeno. • Es un mecanismo de protección. © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A
  • 23.
    ESTRUCTURA CUATERNARIA Se unen girando y enrollándose unas sobre otras a derechas dextrógiras Gran estabilidad © - PROFESOR JANO es Víctor M. Vitoria – B I O L O G Í A

Notas del editor

  • #15 FABP – Fatty acids binding protein, es una proteína que transporta ácidos grasos.