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PROTEÍNAS Y AMINOÁCIDOS
Proteínas
• J.J. Berzelius (Suecia) fue el
  primero en sugerir el término
  proteínas (PROTEIOS:
  primario).
• Son macromoléculas
  consideradas hoy como
  sistemas integrados capaces
  de realizar funciones
  específicas y regulables.
• Existe una clara relación
  entre su estructura y su
  función.
Niveles de acción
QUÉ SON LAS PROTEÍNAS




Son cadenas lineales (no ramificadas) de
aminoácidos, organizadas en estructuras que
dependen de su secuencia y determinan su
función.
LOS AMINOÁCIDOS
Son moléculas con a un grupo Amino (NH3+), un grupo Carboxilo
(COO-) y un Radical o grupo R unidos al Carbono (α)



                           H
                              α         -
                   R       C         COO

                           NH3+
La Secuencia de AAs determina la estructura y
función de la proteína
Enantiómeros




Imágenes especulares
Aminoácidos

                                                                  Cadenas
                                                                  Amídicas


                         Alifáticas Hidroxílicas

   Cadenas Alifáticas              Cadenas
                                   con Azufre           Cadenas
                                                         Ácidas




Grupo Amino
Secundario




                   Cadenas                         Cadenas Aromáticas
                   Básicas
Aminoácidos modificados
Aminoácidos con actividad biológica




                        Neurotransmisores
Ionización de los AAs
AA. Con características especiales
                Glicina Gly G
        COO--
    +
H3 N C H        Radical:   -H
        H       •Es el más pequeño. Poco variable evolutivamente.
                •Se adapta a ambiente Hidrofílico ó Hidrofóbico.
                •Permite gran cercanía entre cadenas polipeptídicas
                           gracias a su pequeño grupo
                •Se encuentra a menudo donde dos polipéptidos
                           entran en contacto muy cercano.


      COO--     Prolina Pro P                     IMINOÁCIDO
    +
H2 N C H        Radical:   - NH2 – (CH2)3 – CH – Amino 2rio
                •Grupo R Hidrofóbico
                •Crea enrollamientos en las cadenas peptídicas.
                •Rompe estructuras secundarias ordenadas.
                           •Alfa   Helice, Hoja Beta. Por ello no varia en la evolución.
EL ENLACE PEPTÍDICO
Formación del enlace peptíco




Los AAs se pueden unir por enlaces peptídicos
Secuencia de la insulina



 La insulina tiene dos cadenas
 unidas por dos puentes
 disulfuro.
 La cadena A tiene 21 aa y la
 B tiene 30 aa
Niveles de organización de las proteínas
Estructura primaria
• Las proteínas difieren en su composición
  y secuencia de aminoácidos.
• Están constituidas solamente por 20
  diferentes alfa - aminoácidos.
• En las proteínas de los organismos todos
  los aminoácidos son L.
• Los 20 aminoácidos no aparecen con la
  misma frecuencia en las proteínas : los
  más abundantes son Gly,Ala, Leu,Val,
  Ser y Glu.
Estructura secundaria
• En 1930 Pauling comenzó
  a estudiar los patrones
  de difracción de rayos X
  de aminoácidos y de
  péptidos pequeños.
• La conformación y la
  estabilidad de las
  proteínas en el estado
  funcional o nativo NO
  dependen solamente de la
  estructura primaria.
• Tipos: hélice α, hoja
  plegada β (estabilizada
  por enlaces de H entre
  COO- y NH)
Hélice α

•   Estructura muy frecuente en las proteínas
•   Forma de espiral – “esqueleto” a derecha
•   3.6 residuos por vuelta
•   Puentes de H intracatenarios: N-H y COO-
    (4 aa)
•   Avance de cada residuo por vuelta 0.15 nm
•   Avance de la vuelta (en el eje) 0.54 nm
•   Cadenas laterales hacia afuera de la helice.
Fig. 5.12b
Carácterísticas de las hélices
             RESIDUO   AVANCE    AVANCE   # ATOMOS
  CLASE        POR       POR       POR     / VUELTA
              VUELTA   RESIDUO   VUELTA
                         (nm)      (nm)


Helice α       3.6      0.15      0.54       13
Helice 310     3.0      0.20      0.60       10

Helice π       4.4      0.12     0.528       16
Estructura secundaria


Hoja plegada beta
• Se forma cuando dos o más
  cadenas polipeptídicas casi
  completamente extendidas se
  alinean lateralmente.
• Pueden tener dos tipos de
  arreglo:
Hoja plegada beta paralela
Hoja plegada beta antiparalela
Estructura secundaria
Giros   β
•   3-4 residuos por giro
•   2 residuos de estruct. contiguas
•   El otro en el extremo del giro
•   Permite acercamiento optimo
    entre cadenas
•   Puentes de H intracatenarios
•   4 tipos
Giros   β
Estructura terciaria

Se encuentra estabilizada
  por:
• Interacciones
  hidrofóbicas.
• Fuerzas de van der
  Waals.
• Puentes de hidrógeno.
• Enlaces iónicos.          Insulina
• Enlaces disulfuro.
Estructura terciaria

                  Se localizan lejos del contacto con el
Leu, Ile, Val,
                  medio acuoso, esenciales para el
Met y Phe
                  mantenimiento de la estabilidad de la
                  proteína nativa.


Asp ,Glu , Lys,   Se localizan en la superficie de la
His y Arg         proteína en contacto con el agua.

                  Se localizan tanto en el interior como en
Ser, Asn, Gln,    la superficie de la proteína globular, la
Thr y Tyr         formación de enlaces de hidrógeno con
                  otros aminoácidos neutraliza su
                  polaridad.
Estructura terciaria

Reglas del plegamiento:
• Distribución particular de residuos
  hidrofílicos e hidrofóbicos.
• Hojas beta en estructuras en barril.
• La estructura terciaria resulta de la
  organización de estructuras secundarias
  conectadas por giros o acodamientos.
• Se dan combinaciones de los motivos.
Estructura terciaria

Por que es importante el plegamiento?
• Porque el plegamiento determina la
  estructura...
• ... Y la función de una proteína es
  dependiente de su estructura!!
• Errores en el plegamiento
  (estructura incorrecta) se asocia a
  enfermedades como: Alzheimer,
  fibrosis quística, enfermedad de las
  vacas locas, etc.
Estructura cuaternaria
• Constituye el arreglo
  espacial geométricamente
  definido entre las
  subunidades que componen
  la proteína.
• Proteínas con masa superior
  a 100 kD.
• Las subunidades pueden ser
  idénticas o no.
• Posibilidad de regulación de
  la acción de la proteína.
• Se estabiliza por fuerzas
  débiles y en algunos casos     Toxina del Antrax
  por enlaces disulfuro.
Hemoglobina
Funciones
Defensa inmunológica



         Presentación antigénica:
         HLA-I y HLA-2




HLA-I
Defensa inmunológica



Anticuerpos (inmunoglobulinas)
Reconocimiento del antígeno
Tipos: IgA, IgG, IgM, IgE, IgD
Movimiento
Movimiento
Soporte y protección
Soporte y protección
Desnaturalización
• Pérdida de la estructura
  natural o nativa y por tanto
  de sus propiedades
  específicas y función.
• Aumentos de temperatura.
• Valores extremos de pH.
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proteinas

  • 2. Proteínas • J.J. Berzelius (Suecia) fue el primero en sugerir el término proteínas (PROTEIOS: primario). • Son macromoléculas consideradas hoy como sistemas integrados capaces de realizar funciones específicas y regulables. • Existe una clara relación entre su estructura y su función.
  • 4. QUÉ SON LAS PROTEÍNAS Son cadenas lineales (no ramificadas) de aminoácidos, organizadas en estructuras que dependen de su secuencia y determinan su función.
  • 5. LOS AMINOÁCIDOS Son moléculas con a un grupo Amino (NH3+), un grupo Carboxilo (COO-) y un Radical o grupo R unidos al Carbono (α) H α - R C COO NH3+ La Secuencia de AAs determina la estructura y función de la proteína
  • 7. Aminoácidos Cadenas Amídicas Alifáticas Hidroxílicas Cadenas Alifáticas Cadenas con Azufre Cadenas Ácidas Grupo Amino Secundario Cadenas Cadenas Aromáticas Básicas
  • 8.
  • 9.
  • 10.
  • 11.
  • 12.
  • 14. Aminoácidos con actividad biológica Neurotransmisores
  • 16.
  • 17. AA. Con características especiales Glicina Gly G COO-- + H3 N C H Radical: -H H •Es el más pequeño. Poco variable evolutivamente. •Se adapta a ambiente Hidrofílico ó Hidrofóbico. •Permite gran cercanía entre cadenas polipeptídicas gracias a su pequeño grupo •Se encuentra a menudo donde dos polipéptidos entran en contacto muy cercano. COO-- Prolina Pro P IMINOÁCIDO + H2 N C H Radical: - NH2 – (CH2)3 – CH – Amino 2rio •Grupo R Hidrofóbico •Crea enrollamientos en las cadenas peptídicas. •Rompe estructuras secundarias ordenadas. •Alfa Helice, Hoja Beta. Por ello no varia en la evolución.
  • 18.
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  • 21. Formación del enlace peptíco Los AAs se pueden unir por enlaces peptídicos
  • 22.
  • 23.
  • 24. Secuencia de la insulina La insulina tiene dos cadenas unidas por dos puentes disulfuro. La cadena A tiene 21 aa y la B tiene 30 aa
  • 25.
  • 26. Niveles de organización de las proteínas
  • 27. Estructura primaria • Las proteínas difieren en su composición y secuencia de aminoácidos. • Están constituidas solamente por 20 diferentes alfa - aminoácidos. • En las proteínas de los organismos todos los aminoácidos son L. • Los 20 aminoácidos no aparecen con la misma frecuencia en las proteínas : los más abundantes son Gly,Ala, Leu,Val, Ser y Glu.
  • 28.
  • 29. Estructura secundaria • En 1930 Pauling comenzó a estudiar los patrones de difracción de rayos X de aminoácidos y de péptidos pequeños. • La conformación y la estabilidad de las proteínas en el estado funcional o nativo NO dependen solamente de la estructura primaria. • Tipos: hélice α, hoja plegada β (estabilizada por enlaces de H entre COO- y NH)
  • 30. Hélice α • Estructura muy frecuente en las proteínas • Forma de espiral – “esqueleto” a derecha • 3.6 residuos por vuelta • Puentes de H intracatenarios: N-H y COO- (4 aa) • Avance de cada residuo por vuelta 0.15 nm • Avance de la vuelta (en el eje) 0.54 nm • Cadenas laterales hacia afuera de la helice.
  • 32.
  • 33. Carácterísticas de las hélices RESIDUO AVANCE AVANCE # ATOMOS CLASE POR POR POR / VUELTA VUELTA RESIDUO VUELTA (nm) (nm) Helice α 3.6 0.15 0.54 13 Helice 310 3.0 0.20 0.60 10 Helice π 4.4 0.12 0.528 16
  • 34. Estructura secundaria Hoja plegada beta • Se forma cuando dos o más cadenas polipeptídicas casi completamente extendidas se alinean lateralmente. • Pueden tener dos tipos de arreglo: Hoja plegada beta paralela Hoja plegada beta antiparalela
  • 35.
  • 36.
  • 38. Giros β • 3-4 residuos por giro • 2 residuos de estruct. contiguas • El otro en el extremo del giro • Permite acercamiento optimo entre cadenas • Puentes de H intracatenarios • 4 tipos
  • 39. Giros β
  • 40.
  • 41. Estructura terciaria Se encuentra estabilizada por: • Interacciones hidrofóbicas. • Fuerzas de van der Waals. • Puentes de hidrógeno. • Enlaces iónicos. Insulina • Enlaces disulfuro.
  • 42. Estructura terciaria Se localizan lejos del contacto con el Leu, Ile, Val, medio acuoso, esenciales para el Met y Phe mantenimiento de la estabilidad de la proteína nativa. Asp ,Glu , Lys, Se localizan en la superficie de la His y Arg proteína en contacto con el agua. Se localizan tanto en el interior como en Ser, Asn, Gln, la superficie de la proteína globular, la Thr y Tyr formación de enlaces de hidrógeno con otros aminoácidos neutraliza su polaridad.
  • 43. Estructura terciaria Reglas del plegamiento: • Distribución particular de residuos hidrofílicos e hidrofóbicos. • Hojas beta en estructuras en barril. • La estructura terciaria resulta de la organización de estructuras secundarias conectadas por giros o acodamientos. • Se dan combinaciones de los motivos.
  • 44.
  • 45.
  • 46. Estructura terciaria Por que es importante el plegamiento? • Porque el plegamiento determina la estructura... • ... Y la función de una proteína es dependiente de su estructura!! • Errores en el plegamiento (estructura incorrecta) se asocia a enfermedades como: Alzheimer, fibrosis quística, enfermedad de las vacas locas, etc.
  • 47. Estructura cuaternaria • Constituye el arreglo espacial geométricamente definido entre las subunidades que componen la proteína. • Proteínas con masa superior a 100 kD. • Las subunidades pueden ser idénticas o no. • Posibilidad de regulación de la acción de la proteína. • Se estabiliza por fuerzas débiles y en algunos casos Toxina del Antrax por enlaces disulfuro.
  • 49.
  • 50.
  • 52. Defensa inmunológica Presentación antigénica: HLA-I y HLA-2 HLA-I
  • 53. Defensa inmunológica Anticuerpos (inmunoglobulinas) Reconocimiento del antígeno Tipos: IgA, IgG, IgM, IgE, IgD
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  • 60. Desnaturalización • Pérdida de la estructura natural o nativa y por tanto de sus propiedades específicas y función. • Aumentos de temperatura. • Valores extremos de pH. • Solventes como alcohol o urea.
  • 61.