Este documento describe el uso del software MEGA para realizar un análisis filogenético de 10 microorganismos basado en su gen 16s. Explica que MEGA permite alinear las secuencias de los microorganismos, exportar los alineamientos en diferentes formatos y construir un árbol filogenético que muestre las relaciones evolutivas entre los microorganismos. El procedimiento incluye abrir MEGA, seleccionar los genes a analizar, alinear las secuencias, exportar los alineamientos y generar el árbol filogené

1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL
INFORME MEGA DNA
CURSO : BIOTECNOLOGÍA
SEMESTRE : VII
DOCENTE : DR. HEBERT SOTO
ALUMNA : EMILY CUSILAYME ROMERO
ILO - PERÙ
OCTUBRE 22 - 2021

2. 1 INTRODUCCION:
La secuenciación de genomas es un proceso que determina el orden o la secuencia
de los nucleótidos (p. ej., A, C, G y U) en cada uno de los genes presentes en el genoma
del virus. La secuenciación completa del genoma puede revelar la secuencia de alrededor
de 13 500 letras de todos los genes del genoma del virus.
El análisis de genética evolutiva molecular (MEGA) es un software de
computadora para realizar análisis estadísticos de la evolución molecular y para construir
árboles filogenéticos. Incluye muchos métodos y herramientas sofisticados para filo
genómica y filo medicina. Tiene licencia como software gratuito propietario. El proyecto
para desarrollar este software fue iniciado por el liderazgo de Masatoshi Nei en su
laboratorio en la Universidad Estatal de Pensilvania en colaboración con su estudiante de
posgrado Sudhir Kumar y el becario postdoctoral Koichiro Tamura. Nei escribió una
monografía (págs. 130) que describe el alcance del software y presenta los nuevos
métodos estadísticos que se incluyeron en MEGA. El conjunto completo de programas
de computadora fue escrito por Kumar y Tamura. Las computadoras personales carecían
de la capacidad de enviar la monografía y el software de forma electrónica, por lo que se
entregaron por correo postal. Desde el principio, se pretendía que MEGA fuera fácil de
usar e incluyera únicamente métodos estadísticos sólidos. MEGA se ha actualizado y
ampliado varias veces y actualmente todas estas versiones están disponibles en el sitio
web de MEGA. La última versión, MEGA7, se ha optimizado para su uso en sistemas
informáticos de 64 bits. MEGA está en dos versiones. Una interfaz gráfica de usuario está
disponible como programa nativo de Microsoft Windows. Una versión de línea de
comando, MEGA-Computing Core (MEGA-CC), está disponible para operación nativa
multiplataforma. El método es ampliamente utilizado y citado. Con millones de descargas

3. en los lanzamientos, MEGA se cita en más de 85.000 artículos. La quinta versión ha sido
citada más de 25.000 veces en 4 años.
2MARCOTEORICO
• INFERENCIA DE ÁRBOLES FILOGENÉTICOS
Un árbol filogenético (resultado de un análisis filogenético), es una
representación esquemática de entidades biológicas que están conectadas
por descendencia común, pueden ser especies o grupos taxonómicos
mayores.
• ALINEACIÓN DE SECUENCIAS
Un alineamiento de secuencias en bioinformática es una forma de
representar y comparar dos o más secuencias o cadenas de ADN, ARN, o
estructuras primarias proteicas para resaltar sus zonas de similitud, que
podrían indicar relaciones funcionales o evolutivas entre los genes o
proteínas consultados.

4. 3.PROCEDIMIENTO
• Como primer paso es abrir el programa que vamos a utilizar que viene ser MEGA
para hacer el alineamiento, damos click en el banco de genes y se nos abrira una
ventana.
• En este caso trabajamos con el gen “16s” y podemos obervar una variedad de gene
en la cual trabajaremos 10 microorganismos.

5. • Hacemos click en el microorganismo deseado y nos abrira una ventana.
• Hacemos click nuevamente en añadir alineamiento

6. • Se nos abrirar una ventana nueva de las secuencias de los microorganismos
coloridos.
• Una vez escogidos los 10 microorganismos nos dara las secuencias como se
observa en la imagen.
• Nos quedara secuencias en espacios en blanco, simplemente lo borramos, pero
primero el muscle nos facilitara alinear de forma ordenada, no debe pasar el 50
%.

7. • Luego exportamos los alineamientos de todos los modos Meg, Fasta y Nexus.
• Para terminar al tener todos los alineamientos, le damos clic en “PHYLOGENY”
y abrimos el archivo que se guardó.

8. • Y finalmente se abrirá nuestra estructura árbol filogenético.
4.BIBLIOGRAFIA
https://www.megasoftware.net/web_help_10/index.htm#t=First_Time_User.htm