El documento describe el uso del software MEGA DNA para construir un árbol filogenético utilizando 30 muestras del gen 16S. Explica los pasos para recolectar las secuencias del gen 16S de una base de datos, alinear las secuencias y construir el árbol filogenético. Concluye que el software MEGA DNA es útil para este propósito y permite agrupar las especies de acuerdo a su categoría u otras características similares.

1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERIA AMBIENTAL
“USO DEL SOFTWARE MEGA
DNA”
ESTUDIANTE:
MAMANI MAMANI , Josselyn Leidy
ASIGNATURA:
BIOTECNOLOGIA
DOCENTE:
Dr. HEBERT HERNAN SOTO GONZALES
CODIGO:
2018205065
FECHA DE ENTREGA:
22 de octubre, 2021
Ilo - Perú

2. INTRODUCCION
Actualmente contiene instalaciones para construir alineaciones de secuencias, inferir historias
filogenéticas y realizar análisis evolutivos moleculares. En la versión 6.0, MEGA ahora permite
la inferencia de árboles del tiempo, ya que implementa el método RelTime para estimar los
tiempos de divergencia para todos los puntos de ramificación en una filogenia. Un nuevo asistente
de Timetreeen MEGA6 facilita esta inferencia de árbol de tiempo al proporcionar una interfaz
gráfica de usuario (GUI) para especificar la filogenia y las restricciones de calibración paso a
paso. Esta versión también contiene algoritmos mejorados para buscar los árboles óptimos bajo
criterios evolutivos e implementa una gestión de memoria más avanzada que puede duplicar el
tamaño de los conjuntos de datos de secuencia a los que se puede aplicar MEGA. Tanto la GUI
como las versiones de línea de comandos de MEGA6 se pueden descargar de
www.megasoftware.net de forma gratuita.
El software Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) es una aplicación de escritorio
diseñada para el análisis comparativo de secuencias de genes homólogos, ya sea de familias
multigénicas o de diferentes especies, con especial énfasis en inferir relaciones evolutivas y
patrones de evolución de ADN y proteínas. Además de las herramientas para el análisis estadístico
de datos, MEGA proporciona muchas facilidades convenientes para el ensamblaje de conjuntos
de datos de secuencia a partir de archivos o repositorios basados en la web, e incluye herramientas
para la presentación visual de los resultados obtenidos en forma de árboles filogenéticos
interactivos y matrices evolutivas de distancia. Aquí discutimos la motivación, los principios de
diseño y las prioridades que han dado forma al desarrollo de MEGA.

3. 1. OBJETIVO
- Realizar un árbol filogenético con 30 muestras de gen 16s usando el MEGA DNA
2. MATERIALES Y METODOS
2.1.MATERIALES
- LAPTOP
- SOFTWARE MEGA
2.2.METODO:
En este presente trabajo se dio con la finalidad de realizar un árbol filogenético solo usando 30
muestras de GEN 16S usando el software MEGA DNA.
3. PROCEDIMIENTO
1. PRIMER PASO: Primero abrimos MEGA Y seleccionamos ALIGN , Luego un clic en
QUERY DATABANKS , en la barrita de buscador escribimos 16S Y nos arrojara unos
20 resultados . En este trabajo utilizaremos el GEN16S y de los 20 resultados solo
usaremos 10 Nucleótidos.
2. SEGUNDO PASO: Seleccionamos un nucleótido

4. 3. TERCER PASO: Al seleccionar, damos clic en SEARCH. Y nos mostrara un montón
de resultados. Pero como en el presente trabajo solo usaremos el gen 16S , damos clic en
OTHER ESCHERICHIS COLI 16S REFQEQ SEQUENCES(3)
Al dar clic, nos arrogara resultados que son del GEN 16S .

5. 4. CUARTO PASO: Seleccionamos un gen y luego un toque en el signo mas . como en la
siguiente imagen
Luego nos aparecerá una ventanita, aquí es donde no cambiamos nada solo le damos clic en OK

6. 5. QUINTO PASO: Es donde aparece otra ventana
6. SEXTO PASO: se repite 3 secuencias de cada género. Aquí es donde vamos a editar
(borrar una pequeña parte del nombre).
7. SÉPTIMO PASO: le damos clic en MUSCLE, para que seleccione todas las muestras
de color amarillo. Y es donde aparecerá otra ventana (no cambiamos nada) y le damos
clic en OK.

7. 8. OCTAVO PASO: se alineo y vamos a comenzar a borrar las partes blancas. luego
comenzamos a guardar
9. NOVENO PASO: Regresamos al MEGA y seleccionamos en PHYLOGENY y damos
clic en la cuarta opción, luego seleccionamos el archivo que hemos guardado

8. 4. RESULTADOS
5. CONCLUSION
Finalizando este trabajo, se pudo observar la gran utilidad del software MEGA DNA. Dándonos
mas de 10 especies para elegir y así poder elaborar el árbol filogenético, en el árbol se pudo
observar que se agruparon de su misma categoría. O alguna característica similar. También del
software tiene muchas ventajas una de ellas sirve para guardar y compartir un sin fin de archivos.