El documento describe el software MEGA X, utilizado para el análisis evolutivo mediante la secuenciación del ADN, destacando su evolución hacia una versión multiplataforma más accesible para usuarios de Linux y Windows. Se detalla un enfoque práctico para la identificación y análisis filogenético de secuencias del gen 16S rRNA, utilizando alineamientos y árboles filogenéticos. Los resultados demuestran la eficacia de esta metodología en la identificación de más de 20 especies bacterianas en bases de datos.

1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL
“SOFTWARE MEGA DNA”
CURSO: BIOTECNOLOGIA
Estudiante:
FLORES FLORES, DIEGO HERNAN
Docente:
SOTO GONZALES, HEBERT HERNAN
SETIEMBRE – 2021
ILO – PERÚ

2. INTRODUCCION
Durante la última década, la secuenciación del genoma se ha convertido en un medios
eficientes y potentes para investigar una amplia gama de sistemas biológicos, desde
estudios a gran escala de diversidad biológica hasta el seguimiento de la evolución y el
origen de patógenos microbios. Los numerosos pasos necesarios para obtener
información interpretable. y los resultados procesables de datos de secuencia sin procesar
requieren invariablemente un análisis comparativo de secuencias moleculares para
descubrir diferencias del genoma funcional y adaptativo.
El software Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) proporciona herramientas para
realizar dichos análisis. MEGA incluye un amplio repertorio de programas para
ensamblar alineamientos de secuencia, inferir árboles evolutivos, estimar distancias y
diversidades genéticas, inferir secuencias ancestrales, calcular árboles de tiempo y probar
la selección (Kumar et al. 2016). Durante los últimos 25 años, MEGA.
El uso en el análisis evolutivo se ha citado en más de cien mil estudios en diversos campos
biológicos.
MEGA en plataformas informáticas (MEGA X), se desarrolló por primera vez para MS
DOS a principios de la década de 1990 (Kumar et al. 1994) y luego actualizado para su
uso en EM Windows ocho veces, incluidos MEGA 1 a MEGA 6 y MEGA-CC y MEGA-
MD (Kumar et al. 2001, 2016). Algunos de las versiones de MEGA se han empaquetado
para sistemas Linux utilizando la capa de compatibilidad WINE para sistemas operativos
compatibles con POSIX y la herramienta Wineskin (construida en WINE) para sistemas
macOS. Estas versiones se han descargado sobre 200.000 veces. Pero la solución de
emulación de Windows ad hoc es lento y relativamente inestable en comparación con el
rendimiento en MS Windows. Los emuladores no se pueden utilizar de forma eficaz para
la última versión de 64 bits de MEGA que está diseñada para manejar análisis de memoria
intensiva de grandes contemporáneos conjuntos de datos (Kumar et al. 2016), por lo que
se requiere una solución más completa para los usuarios de plataformas alternativas.
Por lo tanto, MEGA se ha transformado en una versión multiplataforma que se ejecuta de
forma nativa en Linux y Microsoft. Windows. Este avance elimina el uso exclusivo de

3. Windows limitación de MEGA, que se ha vuelto particularmente aguda debido al
creciente uso de Linux en la investigación biológica.
La transformación también allana el camino para el desarrollo de una Versión MEGA X
para macOS en un futuro próximo.
OBJETIVOS
• Identificar y evaluar el uso del programa MEGA-X, con el prefijo 16S de ADN.
• Determinar el uso del programa MEGA-X.
METODOLOGIA
Programa Mega
Se trata de un programa para realizar alineamientos múltiples y árboles
filogenéticos. Para los alineamientos múltiples recurre a otro programa que
es el de mayor difusión para realizar esta tarea, que es CLUSTAL,
concretamente la versión CLUSTALW que es la versión que opera online
Procedimiento
En primer lugar, hay que abrir un nuevo archivo pulsando la techa “Align” y luego
en el desplegable que se abre “Query Databanks”.

4. Trabajamos con el Gen 16 S
Es un gen ribusomico, se utiliza mayormente para gen de bacteria.
Ingresamos “16S”, y elegimos el Gen.
Para esta práctica escogemos un tamaño de máximo 1500

5. Añadimos al Alineamiento
No editamos nada, solo presionamos Ok
Se obtiene la secuencia del GEN

6. Continuamos la misma secuencia para completar 30 datos de gen, de 3 por grupo.
Modificamos los nombres y grabamos la sesión.
Exportamos, en formato MEGA, FASTA, NEXUS PAUP.

7. Luego alineamos según formato DNA, (eliminamos los errores) y guardamos.
Luego, en la página de inicio del programa MEGA se pulsa en la tecla
“Phylogeny” con lo que se abre un menú desplegable, en el que debe elegirse el
procedimiento para el cálculo de árbol filogenético.

8. RESULTADOS
Se puso a identificar 30 compuestos de ADN (16S), con la finalidad de construir un árbol
PHYLOGENY:
Prueba de 30 compuestos de ADN
Armando del Árbol PHYLOGENY

9. CONCLUSIONES
• La identificación bacteriana basada en la amplificación, secuenciamiento y
análisis filogenético del gen 16S ARNr demostró ser una técnica altamente
específica y confiable.
• Se identificaron MAS DE 20 especies bacterianas previamente descritas en bases
de datos.
BIBLIOGRAFIA
• OP-MOLB180096 1547..1549 (megasoftware.net)
• Hogar (megasoftware.net)
• manual.pdf (megasoftware.net)
• 0379-3982-tem-30-s1-30.pdf (scielo.sa.cr)
• Microsoft PowerPoint - guia_rapida_COMPARACION_SECUENCIAS [Modo de
compatibilidad] (unileon.es)