El documento describe la simulación de electroforesis en gel de agarosa de secuencias de ADN usando el software SnapGene. Se obtuvieron las secuencias de ADN de un artículo científico y se cargaron en SnapGene. Luego, se simuló la electroforesis en gel de agarosa para visualizar los fragmentos de ADN según su tamaño. Los resultados concuerdan con los reportados en el artículo y demuestran la utilidad de SnapGene para simular experimentos de biología molecular.
Este informe describe la simulación molecular de ADN utilizando el software SnapGene. Se explica cómo se utilizó SnapGene para importar secuencias de ADN de un artículo científico, simular su electroforesis en gel de agarosa y analizar sus secuencias. Las conclusiones son que SnapGene es una herramienta efectiva para visualizar y analizar fragmentos de ADN y comprender mejor su estructura y función.
INFORME PRACTICA SIMULACION DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA-SOSA PINO.pdfFlaviaSosaPino
Este documento presenta el informe de una práctica dirigida sobre técnicas moleculares de electroforesis de ADN simulada en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene. El estudiante obtuvo secuencias de ADN de bacterias contaminantes de agua y suelo de un artículo del NCBI, y las cargó en SnapGene para simular una electroforesis y observar el comportamiento de los fragmentos de ADN. El estudiante concluyó que SnapGene es una herramienta útil para este tipo de simulaciones, y reconoció
SIMULACIÓN MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAPGENE-CUELA CAMACHO AGUSTÍN...AgustnJuniorCuelaCam
Este documento describe la simulación de electroforesis de ADN usando el software SnapGene. Presenta información sobre NCBI, electroforesis, SnapGene y agarosa. Luego detalla los pasos del método, que incluyen descargar secuencias de ADN del NCBI, importarlas a SnapGene, y simular su separación en un gel de agarosa usando la herramienta de simulación de gel de SnapGene. Concluye que SnapGene es útil para visualizar y editar secuencias de ADN, y que la electroforesis separa fragmentos de ADN por tama
PRACTICA DE SIMULACION DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSAMaribelMamaniGoya
El documento describe la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software SnapGene de 13 cepas bacterianas descritas en un artículo. Se utilizaron los códigos de acceso de NCBI para descargar las secuencias, las cuales fueron guardadas en SnapGene. Luego, se simuló la electroforesis de cada secuencia mostrando el rango de PCR y permitiendo visualizar las bandas sin problemas. El software permitió realizar satisfactoriamente la tarea.
SIMULACIÓN MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAPGENE.pdfMayraTavaraLira
El documento describe la simulación de una electroforesis en gel de agarosa usando el software SnapGene. Los datos utilizados provienen de un artículo científico sobre la identificación de bacterias en una zona afectada por un derrame de petróleo. El resumen describe el procedimiento llevado a cabo, incluyendo la obtención de secuencias de ADN del artículo, la simulación de la electroforesis en SnapGene y el análisis de los resultados.
Este documento describe el uso del software SnapGene para simular un gel de electroforesis de ADN. Se utilizaron las secuencias de 13 microorganismos obtenidas del NCBI y se cargaron en SnapGene. Luego, se simuló un gel de agarosa que separó las moléculas de ADN según su tamaño, visualizando las secuencias de los 13 microorganismos. El procedimiento permitió familiarizarse con las funciones básicas de SnapGene para la visualización y edición de secuencias de ADN.
Este documento describe una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software SnapGene. Explica brevemente las funcionalidades de SnapGene y conceptos clave como ADN, ARN, secuencias de ADN y electroforesis. Luego detalla la metodología para realizar la simulación de electroforesis en SnapGene y analizar los resultados obtenidos.
Este documento presenta los resultados de una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software Snapgene. Se descargaron las secuencias del gen 16S de 10 especies bacterianas de la base de datos NCBI y se cargaron en Snapgene. Luego, se simuló un gel de agarosa del 1% para visualizar el comportamiento de las secuencias al someterlas a electroforesis.
Este informe describe la simulación molecular de ADN utilizando el software SnapGene. Se explica cómo se utilizó SnapGene para importar secuencias de ADN de un artículo científico, simular su electroforesis en gel de agarosa y analizar sus secuencias. Las conclusiones son que SnapGene es una herramienta efectiva para visualizar y analizar fragmentos de ADN y comprender mejor su estructura y función.
INFORME PRACTICA SIMULACION DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA-SOSA PINO.pdfFlaviaSosaPino
Este documento presenta el informe de una práctica dirigida sobre técnicas moleculares de electroforesis de ADN simulada en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene. El estudiante obtuvo secuencias de ADN de bacterias contaminantes de agua y suelo de un artículo del NCBI, y las cargó en SnapGene para simular una electroforesis y observar el comportamiento de los fragmentos de ADN. El estudiante concluyó que SnapGene es una herramienta útil para este tipo de simulaciones, y reconoció
SIMULACIÓN MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAPGENE-CUELA CAMACHO AGUSTÍN...AgustnJuniorCuelaCam
Este documento describe la simulación de electroforesis de ADN usando el software SnapGene. Presenta información sobre NCBI, electroforesis, SnapGene y agarosa. Luego detalla los pasos del método, que incluyen descargar secuencias de ADN del NCBI, importarlas a SnapGene, y simular su separación en un gel de agarosa usando la herramienta de simulación de gel de SnapGene. Concluye que SnapGene es útil para visualizar y editar secuencias de ADN, y que la electroforesis separa fragmentos de ADN por tama
PRACTICA DE SIMULACION DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSAMaribelMamaniGoya
El documento describe la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software SnapGene de 13 cepas bacterianas descritas en un artículo. Se utilizaron los códigos de acceso de NCBI para descargar las secuencias, las cuales fueron guardadas en SnapGene. Luego, se simuló la electroforesis de cada secuencia mostrando el rango de PCR y permitiendo visualizar las bandas sin problemas. El software permitió realizar satisfactoriamente la tarea.
SIMULACIÓN MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAPGENE.pdfMayraTavaraLira
El documento describe la simulación de una electroforesis en gel de agarosa usando el software SnapGene. Los datos utilizados provienen de un artículo científico sobre la identificación de bacterias en una zona afectada por un derrame de petróleo. El resumen describe el procedimiento llevado a cabo, incluyendo la obtención de secuencias de ADN del artículo, la simulación de la electroforesis en SnapGene y el análisis de los resultados.
Este documento describe el uso del software SnapGene para simular un gel de electroforesis de ADN. Se utilizaron las secuencias de 13 microorganismos obtenidas del NCBI y se cargaron en SnapGene. Luego, se simuló un gel de agarosa que separó las moléculas de ADN según su tamaño, visualizando las secuencias de los 13 microorganismos. El procedimiento permitió familiarizarse con las funciones básicas de SnapGene para la visualización y edición de secuencias de ADN.
Este documento describe una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software SnapGene. Explica brevemente las funcionalidades de SnapGene y conceptos clave como ADN, ARN, secuencias de ADN y electroforesis. Luego detalla la metodología para realizar la simulación de electroforesis en SnapGene y analizar los resultados obtenidos.
Este documento presenta los resultados de una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software Snapgene. Se descargaron las secuencias del gen 16S de 10 especies bacterianas de la base de datos NCBI y se cargaron en Snapgene. Luego, se simuló un gel de agarosa del 1% para visualizar el comportamiento de las secuencias al someterlas a electroforesis.
simulacion de electroforesis en Gel Agarosa mediante Software SnapGenekatlheen ale espinoza
La electroforesis puede separar fragmentos de ADN y ARN en función de su tamaño, poder visualizarlos mediante una sencilla tinción, y de esta forma determinar el contenido de ácidos nucleicos que se encuentra en una muestra, teniendo una estimación de su concentración y grado de entereza. Podemos además extraer del gel los fragmentos de ADN que sean de interés, para posteriormente utilizarlos en diferentes aplicaciones. Existen programas como el SnapGene que ayudan a simular estos procesos, para poder conocer anticipadamente los resultados de la manipulación que se realicen.
El SnapGene proporciona una forma sencilla y segura de planificar, visualizar y documentar los procedimientos diarios de biología molecular.
Este documento presenta los resultados de un análisis de secuencias del gen 16S utilizando los programas BioEdit y BLAST. Se analizaron 48 secuencias y se reporta para cada una su código, calidad, tamaño, organismo más similar y porcentaje de identidad. La mayoría de las secuencias mostraron alta similitud con géneros de Enterobacteriaceae como Klebsiella, Enterobacter y Pseudomonas.
SIMULACION MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAPGENE.pdfAnyeliCossiCruz
Este documento describe el uso del software SnapGene para simular procesos moleculares relacionados con el ADN, como la electroforesis en gel de agarosa. Explica brevemente el descubrimiento del ADN y proporciona detalles sobre SnapGene, la electroforesis, el ADN y los geles de agarosa. A continuación, detalla la metodología para descargar secuencias de ADN de la página web NCBI y simular una electroforesis en gel de agarosa usando SnapGene. Finalmente, presenta conclusiones sobre lo aprendido con respecto a la
INFORME - “SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA CON EL SOFTWARE SNA...DayanaHerrera55
En la actualidad la historia de la Biotecnología ha ido evolucionando, hace siglos atrás descubrimos las enzimas y como poder verlas con ayuda del microscopio, sin embargo, en nuestra época desarrollamos instrumentos más motorizados, con más exactitud, mejor imagen y diagnóstico, lo que nos ayuda a tener una investigación a más a detalle sobre el ADN, siendo una de esas el software SnapGene.
Simulacion de electroforesis en gel agarosa juan carlos bustinza coilajuancarlos74381
Algunas diferencias principales entre ADN y ARN son:
- Composición: El ADN contiene desoxirribosa mientras que el ARN contiene ribosa como azúcar pentosa en su estructura.
- Ubicación: El ADN se encuentra principalmente en el núcleo celular, mientras que el ARN se encuentra tanto en el núcleo como en el citoplasma de la célula.
- Estructura: El ADN tiene forma de doble hélice, mientras que el ARN puede adoptar diferentes estructuras como simple hélice o bucles.
INFORME: SIMULACIÓN MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAP GENE.pdfStefaniBrillyArevalo
El documento describe una simulación molecular del ADN utilizando el software SnapGene. Estudiantes de la Universidad Nacional de Moquegua realizaron la simulación agregando enzimas al plásmido pgem t-easy en SnapGene para adquirir conocimientos sobre el proceso. Primero buscaron y descargaron 10 secuencias al azar del banco de datos NCBI, luego las abrieron en SnapGene y simularon su digestión con enzimas diferentes para cada secuencia. Finalmente obtuvieron un gráfico que muestra los resultados de la simulación.
PRÁCTICA DE SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA UTILIZANDO EL PROGRAMA SNAP GENECON DATOS DEL ARTICULO CIENTIFICO "AISLAMIENTO DE BACTERIAS CON POTENCIAL BIORREMEDIADOR Y ANALISIS DE COMUNIDADES BACTERIANAS DE ZONA IMPACTADA POR PETROLEO EN CONDORCANQUI - AMAZONAS - PERÚ.
Simulación de Electroforesis en Gel de Agarosa utilizando el programa Snap GeneBrayan Chipana
SnapGene proporciona una forma sencilla y segura de planificar, visualizar y documentar los procedimientos diarios de biología molecular. El software tiene una interfaz intuitiva que puede realizar visualización de secuencias de ADN, anotación de secuencias, edición de secuencias, clonación, visualización de proteínas y simulación de métodos de clonación comunes.
INFORME DE SIMULACION MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAP GENE.pdfMarisolPariiPm
Este documento presenta una simulación de electroforesis en gel de agarosa de 10 secuencias de ADN bacterianas utilizando el software SnapGene. Se descargaron las secuencias del NCBI y se cargaron en el programa para simular su separación en un gel de agarosa al 1%. Los resultados muestran la migración diferencial de las 10 secuencias a través del gel debido a sus diferencias de tamaño.
Práctica de simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el prog...brendacahuanasillo
Este documento describe una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene con datos de un artículo científico. Se identificaron 13 cepas bacterianas aisladas y se obtuvieron sus secuencias del NCBI. Luego, se cargaron las secuencias en SnapGene y se simuló la electroforesis para visualizar el comportamiento de los fragmentos de ADN. El resultado mostró la migración de las 13 especies en el gel de acuerdo a su tamaño.
INFORME SOBRE TECNICAS MOLECULARES-ELECTROFORESIS.pdfCynthiaTChavez
Este documento describe los pasos realizados para simular un gel de agarosa usando el software SnapGene. Se obtuvieron secuencias de un artículo y se buscaron en NCBI para exportarlos a formato FASTA. Luego se abrieron en SnapGene, se guardaron como archivos SnapGene DNA y se simuló el gel de agarosa. Los resultados mostraron la migración de las secuencias en el gel.
Este documento presenta los resultados de una práctica de bioinformática utilizando el programa BioEdit para identificar especies a partir de secuencias de ADN. Se analizaron 15 secuencias y se identificaron diversas especies de Klebsiella, Enterobacter y Bacillus con porcentajes de identificación que variaron entre un 73.75% a un 98.61%. El documento concluye que gracias a las herramientas de bioinformática es posible identificar especies de manera efectiva para mejorar la investigación biotecnológica y ambiental.
Este documento describe la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene con datos de un artículo científico sobre el aislamiento de bacterias con potencial biorremediador. El objetivo general fue realizar la simulación, mientras que los objetivos específicos fueron analizar las secuencias de 13 bandas de nucleótidos y identificar el gel de agarosa. La metodología incluyó descargar las secuencias del NCBI, abrir SnapGene, simular el gel de agarosa al 1% y visualizar el comportamiento de los 13
Es un software de clonación que ayudas en planear y simulando manipulaciones de ADN.
Nos serviría para la aplicación de diversos puntos que tratemos referente a la ingeniería ambiental, como por ejemplo el ADN, ARN, NUCLEOTIDOS, entre otros.
Este documento describe cómo usar el programa bioinformático MEGA DNA para crear dendrogramas a partir de artículos científicos. Se explica el procedimiento de alinear secuencias de ADN obtenidas de la base de datos NCBI y construir un árbol filogenético usando las herramientas de MEGA DNA como MUSCLE y UPGMA. Finalmente, se logra crear un dendograma basado en secuencias de 16S rDNA extraídas de un artículo científico.
SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA EMPLEANDO EL SOFTWARE SNAPGENE...ShirleyColana
Este documento presenta un informe sobre la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software SnapGene. Se describen brevemente los conceptos clave de electroforesis, ADN, gel de agarosa y simulación molecular. Luego, se detallan los pasos seguidos para descargar secuencias de ADN de un artículo científico, abrirlas en SnapGene y simular su separación en un gel de agarosa. El resultado final fue una simulación del patrón de bandas que se obtendría al separar las muestras de ADN por
Informe de práctica de simulación de electroforesis en gel de agarosa utiliza...GustavoGonzaloEduard
Este documento describe una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software SnapGene con datos de un artículo científico. Se utilizaron secuencias de ADN descargadas del NCBI y cargadas en SnapGene para simular su separación en un gel de agarosa del 1%. La simulación mostró el comportamiento y tamaños de las 13 secuencias. El documento también explica conceptos como electroforesis, gel de agarosa, NCBI, gen 16S y la diferencia entre ADN y ARN.
Este documento describe el uso del software SnapGene para simular una electroforesis en gel utilizando datos de un artículo científico. Explica brevemente el funcionamiento de SnapGene y conceptos clave como electroforesis, ADN, gel y la base de datos NCBI. Luego detalla los materiales, métodos y resultados de la simulación de electroforesis en SnapGene basada en la secuenciación de bacterias en un artículo sobre biorremediación.
Nforme de practica virtual santi colque gustavo gonzalo eduardoGustavoGonzaloEduard
Este informe describe el montaje de la estructura del ADN en papel y la verificación de la secuencia genética utilizando BLASTn. La metodología incluyó imprimir la estructura del ADN, cortar y pegar las partes para formar la doble hélice, y obtener una secuencia que correspondió a E. coli a través de BLASTn. El informe concluye que el ADN almacena y transmite la información genética entre generaciones.
simulacion de electroforesis en Gel Agarosa mediante Software SnapGenekatlheen ale espinoza
La electroforesis puede separar fragmentos de ADN y ARN en función de su tamaño, poder visualizarlos mediante una sencilla tinción, y de esta forma determinar el contenido de ácidos nucleicos que se encuentra en una muestra, teniendo una estimación de su concentración y grado de entereza. Podemos además extraer del gel los fragmentos de ADN que sean de interés, para posteriormente utilizarlos en diferentes aplicaciones. Existen programas como el SnapGene que ayudan a simular estos procesos, para poder conocer anticipadamente los resultados de la manipulación que se realicen.
El SnapGene proporciona una forma sencilla y segura de planificar, visualizar y documentar los procedimientos diarios de biología molecular.
Este documento presenta los resultados de un análisis de secuencias del gen 16S utilizando los programas BioEdit y BLAST. Se analizaron 48 secuencias y se reporta para cada una su código, calidad, tamaño, organismo más similar y porcentaje de identidad. La mayoría de las secuencias mostraron alta similitud con géneros de Enterobacteriaceae como Klebsiella, Enterobacter y Pseudomonas.
SIMULACION MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAPGENE.pdfAnyeliCossiCruz
Este documento describe el uso del software SnapGene para simular procesos moleculares relacionados con el ADN, como la electroforesis en gel de agarosa. Explica brevemente el descubrimiento del ADN y proporciona detalles sobre SnapGene, la electroforesis, el ADN y los geles de agarosa. A continuación, detalla la metodología para descargar secuencias de ADN de la página web NCBI y simular una electroforesis en gel de agarosa usando SnapGene. Finalmente, presenta conclusiones sobre lo aprendido con respecto a la
INFORME - “SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA CON EL SOFTWARE SNA...DayanaHerrera55
En la actualidad la historia de la Biotecnología ha ido evolucionando, hace siglos atrás descubrimos las enzimas y como poder verlas con ayuda del microscopio, sin embargo, en nuestra época desarrollamos instrumentos más motorizados, con más exactitud, mejor imagen y diagnóstico, lo que nos ayuda a tener una investigación a más a detalle sobre el ADN, siendo una de esas el software SnapGene.
Simulacion de electroforesis en gel agarosa juan carlos bustinza coilajuancarlos74381
Algunas diferencias principales entre ADN y ARN son:
- Composición: El ADN contiene desoxirribosa mientras que el ARN contiene ribosa como azúcar pentosa en su estructura.
- Ubicación: El ADN se encuentra principalmente en el núcleo celular, mientras que el ARN se encuentra tanto en el núcleo como en el citoplasma de la célula.
- Estructura: El ADN tiene forma de doble hélice, mientras que el ARN puede adoptar diferentes estructuras como simple hélice o bucles.
INFORME: SIMULACIÓN MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAP GENE.pdfStefaniBrillyArevalo
El documento describe una simulación molecular del ADN utilizando el software SnapGene. Estudiantes de la Universidad Nacional de Moquegua realizaron la simulación agregando enzimas al plásmido pgem t-easy en SnapGene para adquirir conocimientos sobre el proceso. Primero buscaron y descargaron 10 secuencias al azar del banco de datos NCBI, luego las abrieron en SnapGene y simularon su digestión con enzimas diferentes para cada secuencia. Finalmente obtuvieron un gráfico que muestra los resultados de la simulación.
PRÁCTICA DE SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA UTILIZANDO EL PROGRAMA SNAP GENECON DATOS DEL ARTICULO CIENTIFICO "AISLAMIENTO DE BACTERIAS CON POTENCIAL BIORREMEDIADOR Y ANALISIS DE COMUNIDADES BACTERIANAS DE ZONA IMPACTADA POR PETROLEO EN CONDORCANQUI - AMAZONAS - PERÚ.
Simulación de Electroforesis en Gel de Agarosa utilizando el programa Snap GeneBrayan Chipana
SnapGene proporciona una forma sencilla y segura de planificar, visualizar y documentar los procedimientos diarios de biología molecular. El software tiene una interfaz intuitiva que puede realizar visualización de secuencias de ADN, anotación de secuencias, edición de secuencias, clonación, visualización de proteínas y simulación de métodos de clonación comunes.
INFORME DE SIMULACION MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAP GENE.pdfMarisolPariiPm
Este documento presenta una simulación de electroforesis en gel de agarosa de 10 secuencias de ADN bacterianas utilizando el software SnapGene. Se descargaron las secuencias del NCBI y se cargaron en el programa para simular su separación en un gel de agarosa al 1%. Los resultados muestran la migración diferencial de las 10 secuencias a través del gel debido a sus diferencias de tamaño.
Práctica de simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el prog...brendacahuanasillo
Este documento describe una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene con datos de un artículo científico. Se identificaron 13 cepas bacterianas aisladas y se obtuvieron sus secuencias del NCBI. Luego, se cargaron las secuencias en SnapGene y se simuló la electroforesis para visualizar el comportamiento de los fragmentos de ADN. El resultado mostró la migración de las 13 especies en el gel de acuerdo a su tamaño.
INFORME SOBRE TECNICAS MOLECULARES-ELECTROFORESIS.pdfCynthiaTChavez
Este documento describe los pasos realizados para simular un gel de agarosa usando el software SnapGene. Se obtuvieron secuencias de un artículo y se buscaron en NCBI para exportarlos a formato FASTA. Luego se abrieron en SnapGene, se guardaron como archivos SnapGene DNA y se simuló el gel de agarosa. Los resultados mostraron la migración de las secuencias en el gel.
Este documento presenta los resultados de una práctica de bioinformática utilizando el programa BioEdit para identificar especies a partir de secuencias de ADN. Se analizaron 15 secuencias y se identificaron diversas especies de Klebsiella, Enterobacter y Bacillus con porcentajes de identificación que variaron entre un 73.75% a un 98.61%. El documento concluye que gracias a las herramientas de bioinformática es posible identificar especies de manera efectiva para mejorar la investigación biotecnológica y ambiental.
Este documento describe la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene con datos de un artículo científico sobre el aislamiento de bacterias con potencial biorremediador. El objetivo general fue realizar la simulación, mientras que los objetivos específicos fueron analizar las secuencias de 13 bandas de nucleótidos y identificar el gel de agarosa. La metodología incluyó descargar las secuencias del NCBI, abrir SnapGene, simular el gel de agarosa al 1% y visualizar el comportamiento de los 13
Es un software de clonación que ayudas en planear y simulando manipulaciones de ADN.
Nos serviría para la aplicación de diversos puntos que tratemos referente a la ingeniería ambiental, como por ejemplo el ADN, ARN, NUCLEOTIDOS, entre otros.
Este documento describe cómo usar el programa bioinformático MEGA DNA para crear dendrogramas a partir de artículos científicos. Se explica el procedimiento de alinear secuencias de ADN obtenidas de la base de datos NCBI y construir un árbol filogenético usando las herramientas de MEGA DNA como MUSCLE y UPGMA. Finalmente, se logra crear un dendograma basado en secuencias de 16S rDNA extraídas de un artículo científico.
SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA EMPLEANDO EL SOFTWARE SNAPGENE...ShirleyColana
Este documento presenta un informe sobre la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software SnapGene. Se describen brevemente los conceptos clave de electroforesis, ADN, gel de agarosa y simulación molecular. Luego, se detallan los pasos seguidos para descargar secuencias de ADN de un artículo científico, abrirlas en SnapGene y simular su separación en un gel de agarosa. El resultado final fue una simulación del patrón de bandas que se obtendría al separar las muestras de ADN por
Informe de práctica de simulación de electroforesis en gel de agarosa utiliza...GustavoGonzaloEduard
Este documento describe una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software SnapGene con datos de un artículo científico. Se utilizaron secuencias de ADN descargadas del NCBI y cargadas en SnapGene para simular su separación en un gel de agarosa del 1%. La simulación mostró el comportamiento y tamaños de las 13 secuencias. El documento también explica conceptos como electroforesis, gel de agarosa, NCBI, gen 16S y la diferencia entre ADN y ARN.
Este documento describe el uso del software SnapGene para simular una electroforesis en gel utilizando datos de un artículo científico. Explica brevemente el funcionamiento de SnapGene y conceptos clave como electroforesis, ADN, gel y la base de datos NCBI. Luego detalla los materiales, métodos y resultados de la simulación de electroforesis en SnapGene basada en la secuenciación de bacterias en un artículo sobre biorremediación.
Nforme de practica virtual santi colque gustavo gonzalo eduardoGustavoGonzaloEduard
Este informe describe el montaje de la estructura del ADN en papel y la verificación de la secuencia genética utilizando BLASTn. La metodología incluyó imprimir la estructura del ADN, cortar y pegar las partes para formar la doble hélice, y obtener una secuencia que correspondió a E. coli a través de BLASTn. El informe concluye que el ADN almacena y transmite la información genética entre generaciones.
Similar a INFORME SIMULACIÓN MOLECULAR DE ADN USANDO SOFTWARE SNAPGENE - SUNMI YUNGURI HUAMANI.pdf (20)
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“Año de la unidad, la paz y el desarrollo”
INFORME:
“SIMULACIÓN MOLECULAR DE ADN USANDO SOFTWARE SNAPGENE”
Trabajo Presentado por:
Yunguri Huamani, Sunmi Miriam
Curso:
Biotecnología
Docente:
Soto Gonzales, Hebert Hernan
ILO-PERU
Junio, 2023
3. 1
INDICE
INTRODUCCIÓN...............................................................................................................2
OBJETIVOS........................................................................................................................3
Objetivo General ...........................................................................................................3
Objetivos Específicos....................................................................................................3
MARCO TEÓRICO ...........................................................................................................3
1. El ADN ................................................................................................................3
2. Secuencia del ADN..............................................................................................3
3. Nucleótidos ..........................................................................................................4
4. Gel de Agarosa.....................................................................................................4
5. Software Snapgene...............................................................................................4
6. NCBI....................................................................................................................5
METODOLOGÍA ...............................................................................................................5
1) Materiales.............................................................................................................5
2) Procedimiento (paso a paso)................................................................................5
CONCLUSIONES.............................................................................................................10
BIBLIOGRAFIA...............................................................................................................10
4. 2
INTRODUCCIÓN
El estudio del ADN es fundamental para comprender los procesos biológicos y desentrañar
los secretos de la herencia y la evolución. Con el advenimiento de la secuenciación de
próxima generación, se ha generado una gran cantidad de datos genómicos.
SnapGene ofrece una representación gráfica clara y concisa de las secuencias de ADN, lo
que facilita su comprensión y manipulación. Los usuarios pueden cargar secuencias desde
bases de datos públicas o ingresar sus propias secuencias personalizadas. El software permite
la manipulación de secuencias mediante funciones como el corte y pegado, la inserción de
fragmentos de ADN y la eliminación de segmentos no deseados.
Además de la manipulación básica de secuencias, SnapGene ofrece herramientas
avanzadas para el diseño de cebadores y sondas, el análisis de restricción y clonación, la
simulación de la PCR y la creación de mapas de restricción. Estas funciones permiten a los
científicos planificar y simular experimentos antes de realizarlos en el laboratorio, ahorrando
tiempo y recursos.
La capacidad de compartir secuencias y anotaciones con otros científicos también es una
característica destacada de SnapGene. El software permite la exportación de secuencias y
mapas de restricción en formatos estándar que se pueden compartir y colaborar con otros
investigadores de manera eficiente.
En resumen, el estudio del ADN es esencial en la investigación biológica y SnapGene se
ha convertido en una herramienta indispensable en este campo. Su capacidad para visualizar,
simular y analizar secuencias de ADN de manera eficiente ha simplificado la investigación
genética y ha permitido a los científicos acelerar el diseño y la planificación de experimentos.
Con su interfaz amigable y potentes herramientas de análisis, SnapGene ha facilitado el
estudio y la comprensión del ADN en el contexto de la biología molecular.
5. 3
OBJETIVOS
Objetivo General
● Desarrollar la electroforesis en gel de agarosa para evaluar su secuencia de ADN con
el Software SnapGene con datos proporcionados de un artículo en específico.
Objetivos Específicos
● Demostrar los conocimientos captados en clase sobre el uso del Software SnapGene
● Analizar las secuencias de ADN usando el Software SnapGene
MARCO TEÓRICO
1. El ADN
El ADN, o ácido desoxirribonucleico, es una molécula esencial presente en los seres vivos
que lleva la información genética hereditaria. El ADN también es objeto de estudio en el
campo de la biología molecular. Las técnicas de secuenciación del ADN permiten determinar
el orden exacto de las bases nitrogenadas en un fragmento de ADN. Esto ha llevado al
desarrollo de la genómica, que se encarga de estudiar los genomas completos de los
organismos, y ha permitido avances significativos en la comprensión de la estructura y
función de los genes, así como en el diagnóstico y tratamiento de enfermedades genéticas.
2. Secuencia del ADN
La secuencia de ADN se refiere al orden específico de las bases nitrogenadas (adenina,
timina, citosina y guanina) a lo largo de una cadena de ADN. Cada secuencia de ADN es
única y codifica la información genética necesaria para el funcionamiento de un organismo.
La secuencia de ADN se representa mediante una serie de letras que corresponden a las
bases nitrogenadas. Por ejemplo, una secuencia de ADN podría ser: ATGCGCTAAGTC.
Esta secuencia indica el orden en el que se encuentran las bases nitrogenadas en una cadena
de ADN.
6. 4
La secuencia de ADN es esencial, ya que determina la secuencia de aminoácidos en una
proteína, la cual a su vez desempeña un papel clave en la estructura y función de los
organismos. La secuencia de ADN también puede contener regiones reguladoras que
controlan la expresión de los genes, así como elementos repetitivos y secuencias no
codificantes de función desconocida.
3. Nucleótidos
Los nucleótidos son las unidades fundamentales que componen los ácidos nucleicos. Están
compuestos por un grupo fosfato, un azúcar y una base nitrogenada. Los nucleótidos se unen
entre sí para formar cadenas que conforman el ADN y el ARN, y la secuencia específica de
las bases nitrogenadas en los nucleótidos es crucial para la codificación de la información
genética y la función biológica de los ácidos nucleicos.
4. Gel de Agarosa
El gel de agarosa es un medio sólido utilizado en la electroforesis en gel para separar y
visualizar fragmentos de ADN, ARN y proteínas según su tamaño. Su estructura porosa
permite la migración diferencial de las moléculas durante la electroforesis, lo que permite su
separación y análisis. El gel de agarosa es una herramienta esencial en la investigación y la
biología molecular para el estudio de fragmentos de ADN y ARN en diversos contextos,
como la secuenciación genética, la detección de mutaciones y el análisis de expresión génica.
5. Software Snapgene
SnapGene es un software de biología molecular ampliamente utilizado que permite a los
científicos visualizar, simular y analizar secuencias de ADN. Se ha convertido en una
herramienta indispensable en la investigación y el diseño de experimentos genéticos. Al
proporcionar una interfaz intuitiva y potentes herramientas de análisis, SnapGene facilita la
7. 5
manipulación y comprensión de las secuencias de ADN. En este contexto, SnapGene se ha
convertido en una herramienta esencial para los investigadores, ya que les permite visualizar
y analizar estas secuencias de ADN de manera rápida y eficiente.
6. NCBI
El NCBI (National Center for Biotechnology Information) es un centro de investigación y
recursos en biología molecular y bioinformática. Fue creado por el Instituto Nacional de
Salud de los Estados Unidos (NIH) y alberga una amplia variedad de bases de datos y
herramientas utilizadas por la comunidad científica a nivel mundial.
METODOLOGÍA
1) Materiales
● Laptop
● Sitio Web NCBI
● Software SnapGene
2) Procedimiento (paso a paso)
A. El artículo a considerar lleva por título “Aislamiento de bacterias con potencial
biorremediador y análisis de comunidades bacterianas de zona impactada por
derrame de petróleo en Condorcanqui – Amazonas – Perú” y consideraremos los
siguientes datos.
8. 6
B. Buscamos la página web de NCBI e ingresamos los datos de la tabla 1.
C. Damos click al primer resultado, luego seleccionamos la opción Send to,
seleccionamos el archivo en formato FASTA y lo guardamos dando click en Create
File.
9. 7
D. Hacemos el mismo proceso con todos los códigos de la tabla 1 y guardamos los
archivos en una carpeta.
E. Abrimos el software de SnapGene y seleccionamos en Open-Files, abrimos los
archivos que guardamos para luego cambiar de formato y guardar en formato
SnapGene ADN.
10. 8
F. Nos dirigimos en la parte superior y damos click en Tools, abrimos la ventana y
seleccionamos Simulate Agarose Gel.
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G. Finalmente, hacemos lo mismo con las demás secuencias de ADN y obtenemos la
simulación de Gel de Agarosa.
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CONCLUSIONES
● Se puede evidenciar que se logró llevar a cabo la simulación de electroforesis en Gel
de Agarosa utilizando el programa de SnapGene de manera eficiente y sencilla debido
a su comprensible manejo de herramientas para estas simulaciones.
● La aplicación de conocimientos ya aprendidos previamente en clase con el biólogo
sobre las secuencias de ADN, así como, el uso de la página web NCBI fueron
fundamentales para llevar a cabo el siguiente informe usando SnapGene.
● Los resultados obtenidos, nos han mostrado a detalle fragmentos de las secuencias de
ADN en función a su tamaño de los diferentes nucleótidos. También, los datos
concuerdan con los descubrimientos reportados en el artículo científico y nos asegura
un buen proceso en la metodología desarrollada.
BIBLIOGRAFIA
GSL Biotech LLC. (2020, 7 julio). SnapGene | Software for everyday molecular
biology. SnapGene. https://www.snapgene.com/
Nucleótido. (s. f.). Genome.gov. https://www.genome.gov/es/genetics-
glossary/Nucleotido
Secuenciación de ADN. (s. f.). Genome.gov. https://www.genome.gov/es/genetics-
glossary/Secuenciacion-del-ADN
Electroforesis. (s. f.). Genome.gov. https://www.genome.gov/es/genetics-
glossary/Electroforesis#:~:text=La%20electroforesis%20es%20una%20t%C3%A9
cnica,gel%20o%20de%20otra%20matriz.
Método: Gel de electroforesis Agarosa. (2017, 26 octubre). Conogasi.