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Testing the effect of different terminal sampling strategies in phylogenetic analyses using morphological data matrixes (Msc Biological Sciences Thesis Presentation-Spanish)
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- 15. Análisis de las matrices de datos TNT 1.5 Tree Analysis Using New Technology (Goloboff et al. 2008) Árbol de consenso estricto
- 16. 1 Dos terminales más basales 2 Dos terminales más informativas 3 Más basal y más informativa 4 Tres terminales más basales 5 Dos terminales más basales y la más informativa 6 Tres terminales más informativas 7 Dos terminales más informativas y la más basal 8 Dos terminales más basales y la terminal con un mayor número de pasos acumulados Estrategias de submuestreo
- 17. Determinación de las terminales más basales Contó la cantidad de pasos acumulados para cada una de las terminales anidadas dentro de los clados menos inclusivos Determinación de las terminales más informativas Contó la cantidad de datos faltantes, polimorfismos y caracteres no aplicables de cada terminal y mediante su suma calculó el porcentaje de ambigüedad
- 18. Cuantificación de los resultados Proporción de sinapomorfías ancestrales recuperadas (PSR) 0-1 Mide la proporción de sinapomorfías que soportan el clado submuestreando en común con el original Versión modificada de la distancia de Robinson-Foulds (RF*) 1-0 Proporción de biparticiones que difieren entre ambos árboles Porcentaje de clados recuperados (%CR) 0-100% Clados coincidentes entre el consenso estricto original y el submuestreado
- 19. 4321 Submuestreo y reanálisis RF* PSR %CR Topología luego del submuestreo OG sp1 sp2 sp3 sp6 sp7 sp8 OG sp1 sp2 sp3 sp4 sp5 sp6 sp7 sp8 sp9 Topología original Gráficos de contorno Análisis estadísticos
- 20. RESULTADOS Y DISCUSIÓN Gráficos de contorno %CR 57.7- 84.4% Distancia RF* 0.091- 0.201 PSR 0.382- 0.507
- 24. Análisis estadísticos • La estrategia de submuestreo 2 obtuvo un %CR significativamente mayor que la estrategia 1 • La estrategias de submuestreo 2 y 6 obtuvieron un %CR significativamente mayor que la estrategias 3, 5 y 7 • La estrategia de submuestreo 8 obtuvo una congruencia topológica y optimización de caracteres significativamente menos congruente que las demás estrategias (salvo la estrategia 5)
- 25. CONCLUSIONES • Submuestreando las terminales más informativas se reconstruye más congruentemente la topología • Submuestreando las dos terminales más basales y la terminal más informativa se reconstruyen mejor los estados de los caracteres ancestrales
- 26. FIN