Este documento describe el uso del software MEGA X para generar un árbol filogenético de 15 secuencias de ADN del gen niFH. Se explica el procedimiento de alineamiento de las secuencias y construcción del árbol, el cual muestra las relaciones evolutivas entre las especies. El resultado proporciona información sobre las similitudes y diferencias entre los genes analizados.
El documento describe un estudio que realizó el alineamiento de secuencias de ADN y la construcción de un árbol filogenético utilizando el programa MEGA X. Se alinearon 20 muestras de ADN basadas en el gen 16S y se construyó un árbol filogenético que muestra las relaciones evolutivas entre los organismos. El estudio concluyó que MEGA X es una herramienta útil para este tipo de análisis moleculares.
Este documento presenta dos ejercicios resueltos de genética cuantitativa. El primer ejercicio pide determinar la amplitud de variación en el peso de la descendencia de una cruz específica de melones. El segundo ejercicio analiza diferentes resultados observados en alturas de plantas de maíz y propone genotipos que podrían explicarlos, así como la posibilidad de obtener plantas de más de 18 dm a través de selección. También presenta un tercer ejercicio sobre la estimación de la heredabilidad en sentido estricto del peso
6 diseños completamente aleatorizado y bloques al azarrbarriosm
Este documento presenta una introducción a los diseños experimentales, en particular a los experimentos completamente aleatorizados. Explica conceptos como tratamientos, errores experimentales, análisis de varianza y comparación de medias. Incluye un ejemplo de un experimento completamente aleatorio con seis variedades de papa y cuatro repeticiones, donde se realiza el análisis de varianza correspondiente.
Este documento explica el concepto de potencial químico del agua, que es una medida de la energía disponible para la reacción o movimiento del agua. Describe cómo el agua se mueve de una región de alto potencial a una de bajo potencial, cediendo energía. También cubre factores como la concentración, temperatura y presión que pueden crear gradientes en el potencial químico del agua y generar su movimiento.
El documento describe los pasos para la extracción de ADN vegetal. Explica que la extracción requiere lisar la pared celular, membrana plasmática y membrana nuclear para liberar el ADN, el cual se aísla mediante precipitación con alcohol. Luego detalla los materiales y métodos utilizados en un experimento para extraer ADN de fresas usando este método artesanal.
Este documento resume la técnica del ADN recombinante, explicando que involucra la manipulación de moléculas de ADN para unir segmentos de diferentes orígenes y luego introducirlos en células. Describe los pasos del procedimiento y algunos usos como la producción de insulina y somatotropina. También menciona riesgos potenciales como la contaminación y efectos impredecibles.
La PCR es un método para amplificar segmentos específicos de ADN. Se realiza haciendo múltiples copias de un segmento de ADN mediante la repetición de ciclos de calentamiento y enfriamiento. Cada ciclo duplica la cantidad de ADN, permitiendo la producción de billones de copias de una secuencia de ADN en pocas horas. La PCR fue inventada en 1984 y se ha convertido en una herramienta fundamental de la biología molecular con amplias aplicaciones.
El documento describe un experimento para extraer ADN de un plátano utilizando materiales comunes de laboratorio. Se preparó una solución salina-jabonosa y se trituró el plátano en ella para romper las células. Luego se filtró para separar el material sólido y se añadió alcohol, haciendo precipitar el ADN. El procedimiento permitió visualizar el ADN del plátano en forma de red ramificada, confirmando que contiene 11 cromosomas como la mayoría de los plátanos.
El documento describe un estudio que realizó el alineamiento de secuencias de ADN y la construcción de un árbol filogenético utilizando el programa MEGA X. Se alinearon 20 muestras de ADN basadas en el gen 16S y se construyó un árbol filogenético que muestra las relaciones evolutivas entre los organismos. El estudio concluyó que MEGA X es una herramienta útil para este tipo de análisis moleculares.
Este documento presenta dos ejercicios resueltos de genética cuantitativa. El primer ejercicio pide determinar la amplitud de variación en el peso de la descendencia de una cruz específica de melones. El segundo ejercicio analiza diferentes resultados observados en alturas de plantas de maíz y propone genotipos que podrían explicarlos, así como la posibilidad de obtener plantas de más de 18 dm a través de selección. También presenta un tercer ejercicio sobre la estimación de la heredabilidad en sentido estricto del peso
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Este documento presenta una introducción a los diseños experimentales, en particular a los experimentos completamente aleatorizados. Explica conceptos como tratamientos, errores experimentales, análisis de varianza y comparación de medias. Incluye un ejemplo de un experimento completamente aleatorio con seis variedades de papa y cuatro repeticiones, donde se realiza el análisis de varianza correspondiente.
Este documento explica el concepto de potencial químico del agua, que es una medida de la energía disponible para la reacción o movimiento del agua. Describe cómo el agua se mueve de una región de alto potencial a una de bajo potencial, cediendo energía. También cubre factores como la concentración, temperatura y presión que pueden crear gradientes en el potencial químico del agua y generar su movimiento.
El documento describe los pasos para la extracción de ADN vegetal. Explica que la extracción requiere lisar la pared celular, membrana plasmática y membrana nuclear para liberar el ADN, el cual se aísla mediante precipitación con alcohol. Luego detalla los materiales y métodos utilizados en un experimento para extraer ADN de fresas usando este método artesanal.
Este documento resume la técnica del ADN recombinante, explicando que involucra la manipulación de moléculas de ADN para unir segmentos de diferentes orígenes y luego introducirlos en células. Describe los pasos del procedimiento y algunos usos como la producción de insulina y somatotropina. También menciona riesgos potenciales como la contaminación y efectos impredecibles.
La PCR es un método para amplificar segmentos específicos de ADN. Se realiza haciendo múltiples copias de un segmento de ADN mediante la repetición de ciclos de calentamiento y enfriamiento. Cada ciclo duplica la cantidad de ADN, permitiendo la producción de billones de copias de una secuencia de ADN en pocas horas. La PCR fue inventada en 1984 y se ha convertido en una herramienta fundamental de la biología molecular con amplias aplicaciones.
El documento describe un experimento para extraer ADN de un plátano utilizando materiales comunes de laboratorio. Se preparó una solución salina-jabonosa y se trituró el plátano en ella para romper las células. Luego se filtró para separar el material sólido y se añadió alcohol, haciendo precipitar el ADN. El procedimiento permitió visualizar el ADN del plátano en forma de red ramificada, confirmando que contiene 11 cromosomas como la mayoría de los plátanos.
Este documento presenta nueve problemas de genética que involucran cruces de cobayas, plantas y ratones. 1) Describe las proporciones esperadas de la descendencia de cruces de cobayas negras y blancas. 2) Explica los genotipos y fenotipos esperados al cruzar plantas con flores de color blanco y rojo. 3) Analiza tres cruces de tomates con diferentes caracteres y determina los genotipos de los progenitores. 4) Calcula las proporciones fenotípicas esperadas al cruzar ratones heter
Este documento presenta una introducción a los métodos analíticos instrumentales más importantes, incluyendo espectroscopía atómica y molecular, métodos electroquímicos y cromatografía. Explica que los métodos instrumentales se basan en medir propiedades físico-químicas y cómo su uso ha aumentado con el desarrollo de la electrónica. Además, describe brevemente algunos métodos específicos como la espectroscopía de absorción atómica, resonancia magnética nuclear, y cromatografía de
El documento presenta información sobre microbiología y biotecnología. Explica que la microbiología estudia los microorganismos y sus aplicaciones en áreas como la medicina, la industria y la agricultura. Luego describe cómo la biotecnología utiliza microorganismos y sus componentes para producir bienes como medicamentos, alimentos y biocombustibles. Finalmente, resume algunos avances recientes en biotecnología para la salud como métodos de diagnóstico viral y producción de vacunas e insulina.
El documento resume los estudios pioneros de Gregor Mendel sobre genética en plantas de chícharos y el establecimiento de sus leyes de la herencia. Describe las leyes de segregación y distribución independiente de alelos, así como conceptos como genotipo, fenotipo y proporciones esperadas en cruces monohíbridas, dihíbridas y polihíbridas. Explica los métodos para analizar más de un rasgo como cruces múltiples y el cuadro de Punnett.
Las leguminosas constituyen una gran familia de plantas cuyo origen es el trópico húmedo. Se han descrito aproximadamente 700 géneros y 14,000 especies de leguminosas. Aunque su origen fue en el trópico, las leguminosas han migrado y adaptado a diferentes climas. Las leguminosas representan una fuente importante de proteína para humanos y animales.
El documento describe los conceptos clave de la biodiversidad, incluyendo su definición, los diferentes tipos de diversidad (dentro de especies, entre especies, ecológica y de ecosistemas), y los métodos para medir la biodiversidad a través de índices de riqueza, diversidad, equidad, dominancia y rareza. Además, explica conceptos como la evolución, selección natural, especiación, y los diferentes modelos para medir la acumulación de especies.
Este documento resume los conceptos básicos de genética mendeliana como caracteres, genes, alelos, genotipo y fenotipo. Explica los experimentos de Mendel con guisantes, incluyendo sus cruces de razas puras para obtener las generaciones F1 y F2. Detalla las dos leyes de Mendel: 1) la uniformidad de la F1 y 2) la segregación de alelos y proporción 3:1 en la F2. Finalmente, describe el cruce de prueba o retrocruzamiento para determinar el genotipo.
Este documento presenta 10 problemas resueltos relacionados con el equilibrio de Hardy-Weinberg. Los problemas cubren temas como el cálculo de frecuencias genotípicas y alélicas en poblaciones en equilibrio, pruebas de ji-cuadrado para determinar si una población se ajusta al equilibrio, y cálculos de probabilidades de herencia de diferentes rasgos en función de las frecuencias alélicas.
Este documento describe diferentes métodos para medir la biodiversidad a nivel de especies, incluyendo índices para medir la riqueza de especies (diversidad alfa) dentro de comunidades, así como índices para evaluar la estructura de las comunidades basados en la abundancia relativa de las especies. Se explican índices como el de Margalef, Menhinick, Simpson, Shannon-Wiener, así como métodos no paramétricos como Chao 1, Jacknife y funciones de acumulación de especies. El documento provee una clasificación de
El documento describe los experimentos de cruzamiento de plantas de guisantes realizados por Gregor Mendel que llevaron al descubrimiento de las leyes de la herencia mendeliana. Mendel realizó cruces monohíbridos y dihíbridos entre variedades puras de guisantes que diferían en características como el color y la textura de las semillas. En la primera generación filial de los cruces monohíbridos, solo se observó el fenotipo dominante. En generaciones posteriores reapareció el fenotipo recesivo, sigui
Este documento describe la técnica de electroforesis de ADN. Explica que la electroforesis permite separar fragmentos de ADN en función de su tamaño mediante la aplicación de un campo eléctrico a través de un gel. También describe los diferentes tipos de geles que se pueden usar como agarosa o poliacrilamida, así como técnicas avanzadas como la electroforesis de campo pulsado que permite separar moléculas de ADN muy grandes.
Este documento trata sobre la herencia de diferentes características en humanos y animales. Explica que algunos genes se expresan de manera diferente dependiendo del sexo, siendo dominantes en uno y recesivos en el otro. Da ejemplos como la alopecia y presencia de cuernos en ovinos. También describe el síndrome de Waardenburg y sus tipos.
El documento describe los experimentos pioneros de Gregor Mendel con guisantes que establecieron las bases de la genética moderna. Mendel cruzó variedades puras de guisantes que diferían en características como el color y la forma de la semilla. Observó que las características se transmitían de forma predecible de una generación a la siguiente según las leyes de la herencia que propuso. Sus experimentos demostraron que los caracteres se heredan como unidades discretas (genes) y que los alelos se segregan e independizan durante la formación de gametos.
Este documento describe los medios de cultivo y su historia. Explica que un medio de cultivo es un material de crecimiento para microorganismos. En 1881, Koch desarrolló un método para cultivar bacterias en gelatina sólida y placa para obtener cultivos puros. En 1882, Hesse introdujo el agar como solidificante de cultivos. En 1887, Petri comenzó a usar placas de vidrio planas ahora llamadas placas de Petri para cultivar muestras. El documento también presenta un procedimiento para preparar un medio de cultivo de agar
Este documento describe los genes letales, incluyendo ejemplos como la esclerosis tuberosa y la enfermedad de Tay-Sachs. Explica que los genes letales pueden ser dominantes o recesivos y causar la muerte en diferentes etapas de la vida. También analiza un caso de enanismo acondroplásico dominante con efecto letal recesivo y calcula las proporciones genotípicas y fenotípicas esperadas en la descendencia.
Este documento presenta los resultados de un laboratorio sobre espectrofotometría realizado por estudiantes de la Universidad de Antioquia. Los estudiantes determinaron la longitud de onda óptima para tres soluciones de color mediante espectros de absorción y evaluaron la precisión y exactitud del espectrofotómetro. Concluyeron que el instrumento cumple con los estándares de calidad requeridos y que la espectrofotometría es una herramienta útil en el campo de la microbiología.
Este documento describe diferentes métodos para medir la diversidad beta o diversidad entre hábitats, incluyendo índices de similitud, índices de reemplazo de especies, y métodos de ordenación y clasificación. La diversidad beta representa el grado de cambio en la composición de especies entre hábitats y puede medirse cualitativa o cuantitativamente.
El documento describe los conceptos fundamentales de la biología molecular, incluyendo la estructura y función del ADN, el dogma central de la biología molecular (replicación, transcripción y traducción), y los procesos de replicación del ADN. Explica que el ADN almacena y transmite la información genética en forma de un código escrito con cuatro bases nitrogenadas, y que este código es copiado y expresado a través de la replicación, transcripción y traducción para sintetizar proteínas y regular las actividades celulares.
El documento habla sobre las técnicas de bioremediación para limpiar el medio ambiente contaminado. Explica que la contaminación producida por el desarrollo industrial ha superado la capacidad de los ecosistemas para limpiarse a sí mismos, lo que ha llevado a la acumulación de contaminantes. La bioremediación usa microorganismos para acelerar la degradación de contaminantes y reducir sus efectos dañinos en los ecosistemas y la salud humana. También describe varios tipos de contaminación como la del suelo, agua
Este documento describe los principios básicos del diseño y construcción de iniciadores y sondas de DNA para ingeniería genética. Explica que los iniciadores son secuencias cortas de ácido nucleico que sirven como punto de inicio para la replicación del DNA. Luego detalla varios criterios importantes para el diseño de iniciadores como la longitud, contenido GC, temperatura de fusión, especificidad y evitar la formación de dímeros. También cubre el uso de iniciadores degenerados y la importancia de validar la especificidad de la secuencia del
Este informe describe el uso del software MEGA para alinear secuencias de ADN y construir un árbol filogenético. Se alinearon las secuencias del gen 16S de 30 bacterias utilizando MEGA y se construyó un árbol filogenético para analizar las relaciones evolutivas entre las bacterias basadas en sus secuencias de ADN. El informe concluye que MEGA es una herramienta útil para el alineamiento de secuencias y el análisis filogenético.
El documento presenta los resultados de un análisis de secuencia del gen 16S utilizando los programas BioEdit, BLAST y Excel. Se analizaron 3 muestras de ADN y se identificó el tamaño de la secuencia, el organismo y el porcentaje de identidad para cada muestra utilizando las herramientas BioEdit, BLAST y una tabla en Excel.
Este documento presenta nueve problemas de genética que involucran cruces de cobayas, plantas y ratones. 1) Describe las proporciones esperadas de la descendencia de cruces de cobayas negras y blancas. 2) Explica los genotipos y fenotipos esperados al cruzar plantas con flores de color blanco y rojo. 3) Analiza tres cruces de tomates con diferentes caracteres y determina los genotipos de los progenitores. 4) Calcula las proporciones fenotípicas esperadas al cruzar ratones heter
Este documento presenta una introducción a los métodos analíticos instrumentales más importantes, incluyendo espectroscopía atómica y molecular, métodos electroquímicos y cromatografía. Explica que los métodos instrumentales se basan en medir propiedades físico-químicas y cómo su uso ha aumentado con el desarrollo de la electrónica. Además, describe brevemente algunos métodos específicos como la espectroscopía de absorción atómica, resonancia magnética nuclear, y cromatografía de
El documento presenta información sobre microbiología y biotecnología. Explica que la microbiología estudia los microorganismos y sus aplicaciones en áreas como la medicina, la industria y la agricultura. Luego describe cómo la biotecnología utiliza microorganismos y sus componentes para producir bienes como medicamentos, alimentos y biocombustibles. Finalmente, resume algunos avances recientes en biotecnología para la salud como métodos de diagnóstico viral y producción de vacunas e insulina.
El documento resume los estudios pioneros de Gregor Mendel sobre genética en plantas de chícharos y el establecimiento de sus leyes de la herencia. Describe las leyes de segregación y distribución independiente de alelos, así como conceptos como genotipo, fenotipo y proporciones esperadas en cruces monohíbridas, dihíbridas y polihíbridas. Explica los métodos para analizar más de un rasgo como cruces múltiples y el cuadro de Punnett.
Las leguminosas constituyen una gran familia de plantas cuyo origen es el trópico húmedo. Se han descrito aproximadamente 700 géneros y 14,000 especies de leguminosas. Aunque su origen fue en el trópico, las leguminosas han migrado y adaptado a diferentes climas. Las leguminosas representan una fuente importante de proteína para humanos y animales.
El documento describe los conceptos clave de la biodiversidad, incluyendo su definición, los diferentes tipos de diversidad (dentro de especies, entre especies, ecológica y de ecosistemas), y los métodos para medir la biodiversidad a través de índices de riqueza, diversidad, equidad, dominancia y rareza. Además, explica conceptos como la evolución, selección natural, especiación, y los diferentes modelos para medir la acumulación de especies.
Este documento resume los conceptos básicos de genética mendeliana como caracteres, genes, alelos, genotipo y fenotipo. Explica los experimentos de Mendel con guisantes, incluyendo sus cruces de razas puras para obtener las generaciones F1 y F2. Detalla las dos leyes de Mendel: 1) la uniformidad de la F1 y 2) la segregación de alelos y proporción 3:1 en la F2. Finalmente, describe el cruce de prueba o retrocruzamiento para determinar el genotipo.
Este documento presenta 10 problemas resueltos relacionados con el equilibrio de Hardy-Weinberg. Los problemas cubren temas como el cálculo de frecuencias genotípicas y alélicas en poblaciones en equilibrio, pruebas de ji-cuadrado para determinar si una población se ajusta al equilibrio, y cálculos de probabilidades de herencia de diferentes rasgos en función de las frecuencias alélicas.
Este documento describe diferentes métodos para medir la biodiversidad a nivel de especies, incluyendo índices para medir la riqueza de especies (diversidad alfa) dentro de comunidades, así como índices para evaluar la estructura de las comunidades basados en la abundancia relativa de las especies. Se explican índices como el de Margalef, Menhinick, Simpson, Shannon-Wiener, así como métodos no paramétricos como Chao 1, Jacknife y funciones de acumulación de especies. El documento provee una clasificación de
El documento describe los experimentos de cruzamiento de plantas de guisantes realizados por Gregor Mendel que llevaron al descubrimiento de las leyes de la herencia mendeliana. Mendel realizó cruces monohíbridos y dihíbridos entre variedades puras de guisantes que diferían en características como el color y la textura de las semillas. En la primera generación filial de los cruces monohíbridos, solo se observó el fenotipo dominante. En generaciones posteriores reapareció el fenotipo recesivo, sigui
Este documento describe la técnica de electroforesis de ADN. Explica que la electroforesis permite separar fragmentos de ADN en función de su tamaño mediante la aplicación de un campo eléctrico a través de un gel. También describe los diferentes tipos de geles que se pueden usar como agarosa o poliacrilamida, así como técnicas avanzadas como la electroforesis de campo pulsado que permite separar moléculas de ADN muy grandes.
Este documento trata sobre la herencia de diferentes características en humanos y animales. Explica que algunos genes se expresan de manera diferente dependiendo del sexo, siendo dominantes en uno y recesivos en el otro. Da ejemplos como la alopecia y presencia de cuernos en ovinos. También describe el síndrome de Waardenburg y sus tipos.
El documento describe los experimentos pioneros de Gregor Mendel con guisantes que establecieron las bases de la genética moderna. Mendel cruzó variedades puras de guisantes que diferían en características como el color y la forma de la semilla. Observó que las características se transmitían de forma predecible de una generación a la siguiente según las leyes de la herencia que propuso. Sus experimentos demostraron que los caracteres se heredan como unidades discretas (genes) y que los alelos se segregan e independizan durante la formación de gametos.
Este documento describe los medios de cultivo y su historia. Explica que un medio de cultivo es un material de crecimiento para microorganismos. En 1881, Koch desarrolló un método para cultivar bacterias en gelatina sólida y placa para obtener cultivos puros. En 1882, Hesse introdujo el agar como solidificante de cultivos. En 1887, Petri comenzó a usar placas de vidrio planas ahora llamadas placas de Petri para cultivar muestras. El documento también presenta un procedimiento para preparar un medio de cultivo de agar
Este documento describe los genes letales, incluyendo ejemplos como la esclerosis tuberosa y la enfermedad de Tay-Sachs. Explica que los genes letales pueden ser dominantes o recesivos y causar la muerte en diferentes etapas de la vida. También analiza un caso de enanismo acondroplásico dominante con efecto letal recesivo y calcula las proporciones genotípicas y fenotípicas esperadas en la descendencia.
Este documento presenta los resultados de un laboratorio sobre espectrofotometría realizado por estudiantes de la Universidad de Antioquia. Los estudiantes determinaron la longitud de onda óptima para tres soluciones de color mediante espectros de absorción y evaluaron la precisión y exactitud del espectrofotómetro. Concluyeron que el instrumento cumple con los estándares de calidad requeridos y que la espectrofotometría es una herramienta útil en el campo de la microbiología.
Este documento describe diferentes métodos para medir la diversidad beta o diversidad entre hábitats, incluyendo índices de similitud, índices de reemplazo de especies, y métodos de ordenación y clasificación. La diversidad beta representa el grado de cambio en la composición de especies entre hábitats y puede medirse cualitativa o cuantitativamente.
El documento describe los conceptos fundamentales de la biología molecular, incluyendo la estructura y función del ADN, el dogma central de la biología molecular (replicación, transcripción y traducción), y los procesos de replicación del ADN. Explica que el ADN almacena y transmite la información genética en forma de un código escrito con cuatro bases nitrogenadas, y que este código es copiado y expresado a través de la replicación, transcripción y traducción para sintetizar proteínas y regular las actividades celulares.
El documento habla sobre las técnicas de bioremediación para limpiar el medio ambiente contaminado. Explica que la contaminación producida por el desarrollo industrial ha superado la capacidad de los ecosistemas para limpiarse a sí mismos, lo que ha llevado a la acumulación de contaminantes. La bioremediación usa microorganismos para acelerar la degradación de contaminantes y reducir sus efectos dañinos en los ecosistemas y la salud humana. También describe varios tipos de contaminación como la del suelo, agua
Este documento describe los principios básicos del diseño y construcción de iniciadores y sondas de DNA para ingeniería genética. Explica que los iniciadores son secuencias cortas de ácido nucleico que sirven como punto de inicio para la replicación del DNA. Luego detalla varios criterios importantes para el diseño de iniciadores como la longitud, contenido GC, temperatura de fusión, especificidad y evitar la formación de dímeros. También cubre el uso de iniciadores degenerados y la importancia de validar la especificidad de la secuencia del
Este informe describe el uso del software MEGA para alinear secuencias de ADN y construir un árbol filogenético. Se alinearon las secuencias del gen 16S de 30 bacterias utilizando MEGA y se construyó un árbol filogenético para analizar las relaciones evolutivas entre las bacterias basadas en sus secuencias de ADN. El informe concluye que MEGA es una herramienta útil para el alineamiento de secuencias y el análisis filogenético.
El documento presenta los resultados de un análisis de secuencia del gen 16S utilizando los programas BioEdit, BLAST y Excel. Se analizaron 3 muestras de ADN y se identificó el tamaño de la secuencia, el organismo y el porcentaje de identidad para cada muestra utilizando las herramientas BioEdit, BLAST y una tabla en Excel.
INFORME 05 - Filogenia molecular de genes ribomales y construcción de un dend...Yanira Mamani Velasquez
Análisis de secuencias biológicas debido a su gran importancia dentro de la biotecnología. Aplicación del software MEGA y creación de un árbol filogenético.
Este documento describe cómo usar el programa bioinformático MEGA DNA para crear dendrogramas a partir de artículos científicos. Se explica el procedimiento de alinear secuencias de ADN obtenidas de la base de datos NCBI y construir un árbol filogenético usando las herramientas de MEGA DNA como MUSCLE y UPGMA. Finalmente, se logra crear un dendograma basado en secuencias de 16S rDNA extraídas de un artículo científico.
ELABORACIÓN DE DENDROGRAMAS A PARTIR DE ARTÍCULOS CIENTÍFICOS UTILIZANDO EL P...AnyeliCossiCruz
Este documento describe el uso del programa bioinformático MEGA DNA para elaborar dendrogramas a partir de artículos científicos. Explica que MEGA DNA permite alinear secuencias de ADN, construir árboles filogenéticos y analizar relaciones evolutivas. También presenta algunas aplicaciones de MEGA DNA en ingeniería ambiental como el análisis de comunidades ecológicas, diagnóstico de enfermedades y análisis de bacterias y hongos. El objetivo de la práctica es que los estudiantes
ELABORACIÓN DE DENDROGRAMAS A PARTIR DE ARTÍCULOS CIENTÍFICOS UTILIZANDO EL P...JosueCalcinaFuentes1
Este documento describe los pasos para elaborar dendrogramas a partir de artículos científicos utilizando el programa bioinformático MEGA DNA. Se obtuvieron 31 códigos de ADN de un artículo y se alinearon y analizaron las secuencias utilizando MEGA DNA, generando un dendrograma filogenético similar al del artículo original. El proceso permitió aprender sobre el uso de herramientas bioinformáticas para el análisis evolutivo molecular.
ELABORACIÓN DE DENDROGRAMAS A PARTIR DE ARTÍCULOS CIENTÍFICOS UTILIZANDO EL P...DayanaHerrera55
El análisis genético evolutivo molecular (MEGA) es un programa de software bioinformático
para el análisis de secuencias de ADN y proteínas. Es ampliamente utilizado entre biólogos e
investigadores de bioinformática para el análisis filogenético, la reconstrucción del estado de
los caracteres y la alineación de secuencias. El software MEGA permite a los usuarios
construir árboles evolutivos para datos de secuencia y también incluye varios programas para
el análisis estadístico de la evolución molecular.
Alineamiento de secuencias de adn, árbol fitogenéticoBrayan Chipana
Un alineamiento de secuencias en bioinformática es una forma de representar y comparar dos o más secuencias o cadenas de ADN, ARN, o estructuras primarias proteicas para resaltar sus zonas de similitud, que podrían indicar relaciones funcionales o evolutivas entre los genes o proteínas consultados.
Este documento describe el uso de los programas Mega X y NCBI para analizar 30 muestras de ADN. Se realizó la secuenciación de ADN usando Mega X, se alinearon las secuencias y se creó un árbol genealógico que mostró la relación entre las bacterias muestreadas. El documento explica los objetivos, marco teórico, materiales, métodos y conclusiones del análisis de ADN llevado a cabo.
Simulacion de electroforesis en gel agarosa juan carlos bustinza coilajuancarlos74381
Algunas diferencias principales entre ADN y ARN son:
- Composición: El ADN contiene desoxirribosa mientras que el ARN contiene ribosa como azúcar pentosa en su estructura.
- Ubicación: El ADN se encuentra principalmente en el núcleo celular, mientras que el ARN se encuentra tanto en el núcleo como en el citoplasma de la célula.
- Estructura: El ADN tiene forma de doble hélice, mientras que el ARN puede adoptar diferentes estructuras como simple hélice o bucles.
Las 3 oraciones son:
El documento presenta los resultados del análisis de secuencias del gen 16S utilizando programas como BIOEDIT y BLAST. Se analizaron 17 secuencias de diferentes organismos, identificando el organismo con el porcentaje más alto de identidad para cada secuencia. El documento también incluye información sobre los materiales y métodos utilizados para realizar el análisis de secuencias.
INFORME Nº5 FILOGENIA MOLECULAR DE GENES RIBOMALES Y CONSTRUCCIÓN DE UN DENDO...SahuryJellitzaQuispe
Este documento describe el análisis filogenético de genes ribosomales de bacterias utilizando el software MEGA DNA. Se seleccionaron cinco tipos de bacterias de los que se obtuvieron las secuencias de genes del banco de datos NCBI. Luego, se alinearon las secuencias usando el programa MUSCLE e hizo un dendograma automáticamente que muestra las relaciones evolutivas entre los microorganismos.
Este documento describe el proceso de montaje de la estructura del ADN en papel y la verificación de su secuencia genética mediante la aplicación BLAST. Se explican los componentes del ADN como nucleótidos, pares de bases y cromosomas. Luego, se detalla el procedimiento para construir el ADN en papel y analizar la secuencia obtenida en BLAST, la cual arrojó el nombre científico Danio aesculapii. Finalmente, se concluye que esta práctica permitió crear y comparar una secuencia de ADN.
El documento presenta los resultados de una práctica realizada utilizando el software MEGA DNA para elaborar un árbol filogenético a partir de un artículo científico sobre la biodegradación del explosivo PETN. El resumen del documento incluye la introducción al tema, los objetivos planteados, los materiales y métodos empleados como el software MEGA DNA y la obtención del árbol filogenético, y los resultados obtenidos que muestran las relaciones evolutivas entre las especies analizadas.
INFORME: SIMULACIÓN MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAP GENE.pdfStefaniBrillyArevalo
El documento describe una simulación molecular del ADN utilizando el software SnapGene. Estudiantes de la Universidad Nacional de Moquegua realizaron la simulación agregando enzimas al plásmido pgem t-easy en SnapGene para adquirir conocimientos sobre el proceso. Primero buscaron y descargaron 10 secuencias al azar del banco de datos NCBI, luego las abrieron en SnapGene y simularon su digestión con enzimas diferentes para cada secuencia. Finalmente obtuvieron un gráfico que muestra los resultados de la simulación.
Alineamiento de secuencias de adn y generación deMariaArrazola3
Este documento describe el proceso de alineamiento de secuencias de ADN y generación de un árbol filogenético utilizando el programa MEGA. Se alinearon 15 secuencias del gen nifH utilizando MUSCLE y se construyó un árbol filogenético que muestra dos grupos principales, uno formado por Mesorhizobium albiziae y Mesorhizobium septentrionale con una cercanía del 100% y otro formado por Azospirillum brasilense y Azospirillum formosense también con una cercanía del 100%.
Este documento describe los avances recientes en el desarrollo de biosensores basados en nanotecnología para la detección de arsénico, plomo, mercurio y cadmio. Explica cómo los nanomateriales se pueden utilizar en el diseño de biosensores para mejorar la detección de metales pesados. También analiza los mecanismos de toxicidad de estos cuatro metales pesados y los métodos comunes para diagnosticar la toxicidad, como la espectrometría de absorción atómica. La conclusión enfatiza la import
Este documento resume los conceptos clave sobre el estudio de la síntesis de biopolímeros de origen microbiano. Explica que los biopolímeros como el PLA y PHA son producidos por microorganismos de manera natural y pueden usarse como alternativa a los plásticos derivados del petróleo. Describe los procesos de fermentación y síntesis para producir estos biopolímeros y algunas de sus aplicaciones potenciales como empaques biodegradables y sistemas de liberación controlada de fármacos.
Este documento describe la elaboración de maquetas de PCR convencional y PCR en tiempo real realizadas por estudiantes de la Universidad Nacional de Moquegua. Explica los componentes y procedimientos de ambos tipos de PCR. Las maquetas se construyeron con materiales reciclados y buscan mostrar las funciones y partes de un termociclador de PCR de manera visual.
El documento describe la elaboración de maquetas de PCR convencional y PCR en tiempo real utilizando materiales reciclados. Explica que un termociclador es un aparato que permite realizar los ciclos de temperatura necesarios para la amplificación de ADN mediante la técnica de PCR. La PCR permite obtener un gran número de copias de un fragmento de ADN particular y tiene usos como identificar microorganismos causantes de enfermedades o realizar investigaciones científicas. Las estudiantes construirán las maquetas para conocer el funcionamiento y componentes
Zeolitas y su aplicación en la descontaminación de efluentes minerosRosalindaApazaapaza
Este documento presenta un artículo sobre el uso de zeolitas naturales en la descontaminación de efluentes mineros. El artículo describe las propiedades de las zeolitas como su porosidad, adsorción e intercambio iónico y cómo se usan para tratar efluentes que contienen metales pesados procedentes de minas y procesos metalúrgicos. Las zeolitas se usan específicamente para tratar drenaje ácido de mina, efluentes metalúrgicos y contaminación por mercurio, mostrando ser eficientes en la rem
El documento describe la síntesis de zeolita Linde F a partir de una roca volcánica llamada sillar mediante tratamiento alcalino con potasa caústica. Los resultados mostraron que con una concentración de KOH de 3M, un tamaño de partícula de 4mm y un tiempo de tratamiento de 72 horas a 150°C se obtuvo zeolita Linde F con una capacidad de intercambio catiónico de 27.91 meq/100g. El sillar presenta un alto contenido de SiO2 y Al2O3 y reservas disponibles, por lo
Este artículo describe las propiedades y usos de las zeolitas naturales en la descontaminación de efluentes mineros. Explica que las zeolitas son eficientes para remover metales pesados debido a su porosidad y capacidad de intercambio iónico. Señala que pueden usarse para tratar drenajes ácidos de minas, efluentes metalúrgicos y contaminación por mercurio, a bajo costo. Concluye que las zeolitas naturales son una alternativa viable para la eliminación de contaminantes en la minería.
El documento describe el aislamiento y evaluación de bacterias fijadoras de nitrógeno y disolventes de fosfatos de la rizósfera y semillas de lechuga con potencial para promover el crecimiento de la lechuga. Se aislaron siete cepas de Rhizobium de la rizósfera mediante pruebas de nodulación y crecimiento en medios selectivos. Algunas cepas toleraron hasta un 32% de NaCl y disolvieron fosfatos. Las bacterias aisladas de semillas produjeron ácido indolacético. La
La presente investigación evaluó el proceso de biorremediación aeróbica de un suelo contaminado con hidrocarburos de petróleo empleando lodos residuales como fuente alterna de nutrientes. Se demostró que los lodos residuales estimularon la degradación de los hidrocarburos por parte de los microorganismos nativos del suelo. El mejor tratamiento fue aquel que contenía lodos residuales frescos, logrando una remoción del 93% de los hidrocarburos. Mantener el suelo a capacidad de campo y con aireación también permitió
Práctica de simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el prog...RosalindaApazaapaza
El documento describe el uso del programa SnapGene para simular una electroforesis en gel de agarosa utilizando secuencias de ADN extraídas de un artículo científico. El objetivo es aplicar la simulación para analizar 13 secuencias de bacterias. Se utilizan las herramientas de SnapGene y la base de datos NCBI para obtener las secuencias y realizar la simulación que muestra el comportamiento esperado de los nucleótidos en el gel de agarosa.
Este documento describe un estudio que aisló bacterias ácido lácticas del tracto digestivo de lechones y las identificó mediante secuenciación del gen 16S ARNr. Se tomaron muestras del estómago, intestino delgado, intestino grueso y ciego de un lechón de 28 días y se aislaron 19 cepas bacterianas. Cuatro cepas se seleccionaron para su identificación molecular mediante extracción de ADN, PCR y secuenciación. Los análisis de las secuencias mostraron que las cepas correspondían a
El documento presenta información sobre seis tipos diferentes de microorganismos (A, B, C, D, E, F), describiendo para cada uno su tipo, los metabolitos primarios y secundarios que producen, su fuente de carbono y cómo podrían aplicarse en biotecnología e ingeniería ambiental.
La biotecnología ambiental se entiende como la aplicación de herramientas y métodos biotecnológicos a problemas ambientales. Combina biotecnología, con procesos como ingeniería genética, y ecología, con conceptos como ciclos biogeoquímicos. Los reactores de tratamiento de aguas son abundantes pero ignorados por la biotecnología, a pesar de ser sistemas con interacciones ecológicas complejas entre especies microbianas, que el biotecnólogo debería estudiar para optimizar
Este documento presenta un resumen cronológico de los orígenes y desarrollo de la biotecnología ambiental desde la antigüedad hasta la actualidad. Se divide la historia en tres etapas: la etapa empírica desde los orígenes hasta el siglo XIX, la segunda etapa de transición en el siglo XIX, y la tercera etapa moderna desde principios del siglo XX hasta la actualidad, donde se desarrollan aplicaciones como la ingeniería genética. Algunos hitos clave son los descubrimientos de Pasteur
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PC-04-DISEÑOS DE PITS Y STOPES DE UNA MINA A TAJO ABIERTO.pdf
Uso de softward de adn (mega x)
1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONA DE INGENIERIA AMBIENTAL
“Año de la universalización de la salud’’
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERIA AMBIENTAL
TEMA:
USO DEL SOFTWARE MEGA DNA
Curso:
Biotecnología
Presentado por :
Rosalinda Apaza Apaza
Docente :
Dr. Herbert H. Soto Gonzales
Escuela Profesional:
Ingeniería Ambiental
Ciclo: VII
22 de Octubre 2021
ILO -PERU
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INDICE
I. INTRODUCCION .....................................................................................................................3
II. OBJETIVO.................................................................................................................................4
II.I. OBJETIVO GENERAL ..........................................................................................................4
II.II. OBJETIVO ESPECIFICO .....................................................................................................4
III. MARCO TEORICO...............................................................................................................4
III.I. MEGA X................................................................................................................................4
III.II. ARBOL FILOGENETICO ...................................................................................................4
III.III. SECUENCIA ADN............................................................................................................4
IV. METODOLOGIA ..................................................................................................................5
IV.I. MATERIALES .......................................................................................................................5
IV.II. PROCEDIMIENTO ............................................................................................................5
V. RESULTADOS........................................................................................................................12
VI. CONCLUSIONES ...............................................................................................................13
VII. BIBLIOGRAFIA..................................................................................................................14
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I. INTRODUCCION
En esta practica da a conocer el uso de software de genes DNA para reconstruir un árbol
filogenético que contenía con 15 secuencias con el aplicativo de MEGA X .
La Bioinformática ha demostrado obtener mejoras en la investigación en áreas afines.
Biólogos usan programas para alinear secuencias y crear estructuras, que son de importancia
para analizar los resultados dados por dichos programas de software. De esta manera, se ha
logrado descubrir especies nuevas, determinar a qué especie pertenece una muestra de un ser
vivo, curas, entre otros descubrimientos. (Madrigal-Valverde1, 2017)
Como Charles Darwin, creador de la teoría evolutiva, fue la primera persona en plantear un
sistema de clasificación de los seres vivos de acuerdo a su origen; y en 1966 cuando el
biólogo alemán Willi Hennig sentó las bases del análisis filogenético y creó la sistemática
filogenética, de la cual se desprendieron dos ramas, la sistemática hennigiana y la sistemática
cladista, o cladismo. Cada una de ellas defiende la idea de estudiar a las especies según
diversos parámetros. (ciencia, 2020)
Los métodos filogenéticos reconstruyen árboles (dendrogramas) en los que las ramas y los
nodos unen diferentes taxones. Estos taxones pueden ser especies, individuos, genes, etc. Al
recorrer las ramas desde los nodos terminales hacia nodo original recorremos la historia
evolutiva de ese gen o organismo.
Básicamente la técnica consiste en comparar la secuencia de un determinado gen o espacio
intergénico, entre diferentes accesiones . Normalmente se compara la secuencia de una o
varias problema contra la misma secuencia de accesiones depositadas en las bases de datos.
Este proceso nos dará a conocer sus características y identificaciones de cada gen de ADN
con el fin de poder observar su árbol filogenético.
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II. OBJETIVO
II.I. OBJETIVO GENERAL
Conocer la calidad gen 16S y generar un alineamiento de ADN dando una forma de un árbol
filogenético en una base de gen niFH.
II.II. OBJETIVO ESPECIFICO
Identificar y reconocer según la calidad de la secuencia del ADN.
realizar el alineamiento de los genes del ADN.
Elaborar un árbol filogenético del gen niFH.
III. MARCO TEORICO
III.I. MEGA X
Es un software informático para realizar análisis estadísticos de la evolución molecular y para
construir árboles filogenéticos además Implementa muchos métodos analíticos y
herramientas para filo genómica y filo medicina. se ha actualizado para utilizar múltiples
núcleos informáticos para muchos análisis evolutivos moleculares. (Sudhir Kumar, 2018)
III.II. ARBOL FILOGENETICO
es un diagrama que representa las relaciones evolutivas entre organismos y las secuencias de
genes o proteínas pueden compararse entre especies y usarse para construir , según se
muestran en las puntas de las ramas del árbol ya que se conectan entre sí de manera que
representan la historia evolutiva de las especies, esto es, la manera en la que pensamos que
evolucionaron a partir de un ancestro común mediante una serie de eventos de divergencia
(separación en dos ramas). (Filogenia, s.f.)
III.III. SECUENCIA ADN
es una técnica de laboratorio utilizada para determinar la secuencia exacta de las bases (A,
C, G y T) en una molécula de ADN , La secuencia de bases de ADN lleva la información
que una célula necesita para ensamblar proteínas y moléculas de ARN. (Secuenciación del
ADN, s.f.)
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IV. METODOLOGIA
IV.I. MATERIALES
IV.II. PROCEDIMIENTO
Computadora
software MEGA X
Pagina de NCBI
archivos de carpeta
Primeramente, ingresamos al
programa MEGA X, luego se
hace clic en ALING.
donde luego se hace otro clic
en QUERY DALABANKS Al
abrir nos saldrá una pagina
de HOME -NUCLEOTIDE
1
2
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En la parte de la búsqueda se pone
16s o NIFH , para que salga opciones
de muestras donde solo se escogerá
10 muestras .
Donde se obtiene , dar clic en la
opción E-coli rrnA gene .
Una vez seleccionado hacer clic en la
primera muestra.
Hacer clic en T Add Alignmet
3
4
5
6
Una ves obtenido la muestra hacer
clic en la flecha para regresar a la
página principal
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Y así sucesivamente se hará para
toda las muestra que se llegue a
elegir .
Una vez que nos salga una opción
hacer clic en OK , donde nos abre
una pagina de MIX de genes :
Aliganment Explorer
7
8
En este caso es opcional elegir tres
muestras de ADN.
9
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Donde se muestra el resultado de las
10 muestras de ADN
Seleccionamos la parte repetida
para que no salda largo el resultado
10
0
11
0
Hacer clic en EDIT
dentro de ello nos aparecerá varias
opciones donde buscaremos el SELCT ALL
y dar clic
12
0
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Dar clic en la parte de la figura de un
musculo
Luego hacer clic en ALING DNA
13
0
Luego de insertar hacer clic en OK
Seguidamente se procesa esto
tardara unos minutos
14
0
Se obtenio el alineamiento de las
muestras que están insertadas
15
0
10. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
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0
Eliminar las columnas vacías , una
vez seleccionado dar clic a X
Al eliminar se obtiene el resultado
Clic en EXPORTAR
Hacer clic en MEGA FORMAL
Dar un clic en DATA
17
18
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Dar clic en YES
Guardar en un archivo con el nombre
de ALINEAMIENTO Y hacer clic en
guardar y lugo dar clic en OK
Ir a la pagina principal de
MEGA X
Clic en PHYLOGENY
Dar otro clic en
CONSTRUCT/TES UPGMA TREE
Dar clic en OK
19
20
21
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V. RESULTADOS
según los resultados que se obtuvo en la realización del árbol filogenético se han analizado
sus similitudes y diferentes rasgos donde se ha visto que hay especies que se relacionan con
otros genes .
Donde se obtuvo el
ARBOL FITOGENETICO
22
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VI. CONCLUSIONES
En el transcurso del desarrollo nos describe el método de la construcción del árbol
filogenético para el gen niFH donde consta con 15 secuencias con el programa de MEGA X
que es un herramienta que podemos manipular fácilmente ya que nos da opciones de realizar
cualquier tipo de genes y es muy útil para cualquier bioinformacion .
Básicamente la técnica consiste en comparar la secuencia de un determinado gen o espacio
intergénico, Normalmente se compara la secuencia de una o varias problema contra la misma
secuencia de accesiones depositadas en las bases de datos. eliminar los espacios vacíos y
comparar la secuencia con las que están depositadas en las bases de datos, que es lo que se
denomina alineación.
Donde es importante saber que es una parte de la metodología de investigación que se realizo
en este documento con el fin de poder observar el árbol filogenético.
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VII. BIBLIOGRAFIA
ciencia. (6 de mayo de 2020). Obtenido de https://www.significados.com/filogenia/.
Filogenia. (s.f.). Obtenido de https://es.khanacademy.org/science/ap-biology/natural-
selection/phylogeny/a/building-an-evolutionary-tree.
Madrigal-Valverde1, K. A. (2017). Uso de herramientas para alineación de secuencias y creación de
árboles filogenéticos para la determinación de especies. Obtenido de
https://www.scielo.sa.cr/pdf/tem/v30s1/0379-3982-tem-30-s1-30.pdf.
Secuenciación del ADN. (s.f.). Obtenido de https://www.genome.gov/es/genetics-
glossary/Secuenciacion-del-ADN.
Sudhir Kumar, G. S. (2018). MEGA X. Obtenido de https://www.semanticscholar.org/paper/MEGA-
X%3A-Molecular-Evolutionary-Genetics-Analysis-Kumar-
Stecher/df3dd2979920efe6d348edaf0795973ea342d3d8.