Este documento describe los diferentes enfoques de la sistemática, incluyendo la sistemática filogenética (cladismo), la sistemática evolutiva, la taxonomía numérica y la sistemática molecular. Explica que la sistemática estudia la diversidad biológica y construye clasificaciones de organismos, y que las clasificaciones son hipótesis que se prueban con evidencia. También discute conceptos como homología, sinapomorfia y simplesiomorfia.
10. Darwin también discutió las dificultades clasificatorias que surgen cuando una misma característica esta presente en dos o más especies que no tienen un antecesor común que la posea. Estas características se denominananalógias o homoplasiase incluyen convergencias, paralelismos y reversiones. Ejemplo:
11. Sistemática filogenética (cladismo) Propone la construcción de grupos sistemáticos a través del reconocimiento de características, es decir aquellas que permiten identificar a todos los miembros de un grupo más s ancestro inmediato; estas características se denominan sinapomorfias, son caracteres homólogos heredados del ancestro común de todos los mamíferos de ese grupo. Por lo contrario, las simplesiomorfiasconstituyen características primitivas, que se mantienen presentes desde ancestros remotos; por las simplesiomorfias, seria imposible generar grupos descendientes.
12. Ejemplo: La columna vertebral es un carácter primitivo y compartido por todos los vertebrados, incluidos los mamíferos. Sinapomorfias
13. Las glándulas mamarias y los pelos constituyen sinapomorfias del taxón mamíferos que sirve para definirlos como grupo. A su vez, la columna vertebral es una sinapomorfia de los vertebrados en relación con el resto de los grupos. Simplesiomorfias
14. Otras escuelas sistemáticas Sistemática evolutiva.-La sistemática evolutiva utiliza cuatro criterios principales: la discrepancia morfológica, el nicho adaptativo, la riqueza en especies y la monofilia mínima. Taxonomía numérica (fenética).- Se basa en técnicas matemáticas que permiten establecer clasificaciones (fenogramas) fundadas en el grado de similitud global ("overall similarity"). La escuela fenética toma el máximo número de caracteres disponibles sin preocuparse de su significado evolutivo, no diferenciando entre homología y homoplasia. Sistemática cladista (Cladística).- Presenta una consistencia lógica más robusta y menos subjetiva que las otras escuelas, es importante recordar que sus clasificaciones son hipótesis históricas realizadas sobre un conocimiento incompleto del mundo natural y que, como en cualquier disciplina científica, esas hipótesis son perfectibles.
15. La sistemática molecular La electroforesis y la secuenciación de proteínas aportaron a la aparición de los métodos de secuenciación de los ácidos nucleicos , hibridación del DNA y análisis de los polimorfismos de fragmentos de restricción. Los neutralistas propusieron usar la acumulación de cambios en las secuencias de aminoácidos de ciertas proteínas como un reloj molecular de la evolución. Usando la cantidad de diferencias acumuladas en la secuencia de aminoácidos en ciertas proteínas, este método permitió estimar el tiempo de divergencia entre un par de especies. La velocidad del cambio estimado por el reloj molecular varia de acuerdo con la importancia de cada proteína en el organismo y funcionalidad . El desarrollo de técnicas robotizadas de secuenciación condujo a la acumulación masiva de secuencias biológicas en bases de datos de genes, proteínas y genomas completos.