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                   10ª Jornada



Aplicación de la terminología SNOMED
CT en el registro de cáncer de mama
  y la codificación de medicamentos
             José Rubio1, Silvia León1
    Raimundo Lozano2, Carlos Codina2, Montserrat
        Muñoz2, Xavier Pastor2, Artur Conesa2
                       (1) Institut Bonanova
                  (2) Hospital Clínic de Barcelona,
                    email: rlozano@clinic.ub.es
Sumario


•   Introducción
•   Objetivo
•   Metodología
•   Resultados
•   Conclusiones
Introducción - SCT
• SNOMED CT es la terminología clínica integral, multilingüe y codificada de
  mayor amplitud, precisión e importancia desarrollada en el mundo,
  incluyendo más de 400.000 conceptos, 1.000.000 de descripciones y
  1.500.000 de relaciones entre los conceptos.
• Por este motivo, desde hace varios años, se viene preconizando el uso de
  SNOMED CT (SCT) para la codificación de la información clínica.
• No obstante, existen todavía pocos estudios relativos a su grado de
  cobertura respecto a los conceptos clínicos manejados habitualmente en
  nuestro entorno.
• El hospital Clínic de Barcelona ha puesto en marcha dos proyectos en los
  cuales se aplica la terminología SCT en dos campos totalmente
  diferenciados:
   – Cáncer de mama
   – Medicamentos
Objetivo

• Evaluar el grado de cobertura de SNOMED CT en:
   – Cáncer de mama
   – Medicamentos
• Representar correctamente cada variable dentro de su contexto
• Asignar un código SCT que represente cada una de las variables
• Realizar un análisis de las dificultades encontradas en la utilización de
  SCT y de la herramienta CliniClue
• Evaluar si SCT es útil para representar información clínica detallada.
Metodología

• Definir las variables que deben ser codificadas:
   – Mediante reuniones periódicas llevadas a cabo por los expertos del
      dominio.
   – Tomando como punto de partida:
             – Catálogo de medicamentos HCB
             – Registro de cáncer de mama
    – Se deciden las variables a codificar:
             – Registro de cáncer de mama:
                  216 variables
             – Medicamentos:
                  Características generales: principio activo, concentración, forma
                    farmacéutica y vía de administración
                  Muestra representativa de 100 medicamentos del catálogo.
Metodología

• Codificación de las variables:
   – Llevada a cabo por los técnicos en documentación sanitaria
   – Mediante la herramienta de trabajo CliniClue a través del campo de
     búsqueda, ejes y jerarquías.
   – Se debe interpretar la variable dentro de su contexto para asignarle el
     código adecuado.

• Revisión y validación de las variables codificadas:
   – Mediante reuniones periódicas con los expertos
   – Se determina si los códigos encontrados son representativos para cada
     una de las variables
   – Se buscan otros códigos alternativos para representar las variables.
Resultados                                    Cáncer de mama


    Resultados de códigos SCT en el registro de cáncer de mama


                     8%
                7%

                                           Códigos encontrados

                                           Códigos no encontrados
          24%
                                           Códigos aproximados
                                   61%
                                           Códigos post coordinados
Resultados                                             Cáncer de mama

• Códigos encontrados (61%):
   – Son los códigos que representan adecuadamente a las variables a las que
     hace referencia
   – Ejemplos:
        Sexo del paciente → 184100006 sexo del paciente (entidad observable)
        Fecha de nacimiento →184099003 fecha de nacimiento (entidad observable)
        Menarquia → 364314008 edad de inicio de la menstruación (entidad observable)

• Códigos no encontrados (24%):
   – Son códigos que nos están incluidos en SCT
   – Ejemplos:
        1er Tratamiento
        Estado hormonal
        Tipo de menopausia
Resultados                                                         Cáncer de mama

• Códigos aproximados (7%):
   – Son códigos que no representan de forma exacta las variables
   – Esto es debido a 3 motivos:
           – Bajo nivel de detalle
                Ejemplos:
                    Edad del 1er hijo → 397669002 edad (calificador)
                    Palpación profesional →13607009 palpación de la mama (procedimiento)

            – Excesivo nivel de detalle
                 Ejemplo:
                     Afectación focal → 384696009 margen de resección quirúrgica afectado por neoplasia
                                                  maligna, unifocal (hallazgo clínico)

            – El código es próximo al concepto pero no lo define en su totalidad
                 Ejemplos:
                    Fecha de finalización → 413947000 fecha en la que se suspendió el tratamiento
                                           (entidad observable)
                    Menopausia natural → 237123000 menopausia normal (hallazgo clínico)
Resultados                                                 Cáncer de mama



• Códigos postcoordinados (8%):
   – Son los variables que necesitan ser representadas con más de un código
   – Ejemplos:
        Fecha 1º visita oncología → 406543005 fecha de la visita (entidad observable)
                                                          +
                            69399002 visita inicial del médico al hospital (procedimiento)
                                                          +
                                     310022001 servicio de oncología clínica (calificador)
Resultados                                                    Farmacia


                   Resultados según características

  Concentración            Forma farmacéutica          Vía administración


       5%                        6%                           5%




            95%                       94%                          95%




            Código encontrado               Código no encontrado
Resultados                                             Farmacia

–   Ejemplos:
     Concentración
        MG (Miligramos)  258684004 miligramo
        UND (Unidad)  No es una unidad de concentración

       Forma farmacéutica
        CAPS (Cápsula)  38549006 cápsula – forma farmacéutica
        FRAS (Frasco)  No es una forma farmacéutica

       Via de administración
        OFT (Oftálmica)  54485002 vía oftálmica
        LOCAL  Vía ambigua
Resultados                                           Farmacia


             Resultados según muestra medicamentos

                                   4%
                             13%


                                              36%
      Término exacto
      Término similar
      Término aproximado
      Término generico
      No existe código     36%

                                        11%
Resultados                                               Farmacia

  – Ejemplos:
       Término exacto (36%): código SCT idéntico
        AZATIOPRINA 50 MG VIAL → 327072003 azatioprina, 50 mg, vial

       Término similar (11%): concepto parecido / validable
          DESMOPRESINA, 10 MCG/DOSIS NEBUL NASAL →
        25914009 acetato de desmopresina, 10 mcg, aerosol nasal

       Término aproximado (36%): diferencia minima
                 GLUCOSA 5% VIAL 500 ML        →
        40628007 glucosa 5%, solución para infusión, bolsa de 250 ml.

       Término genérico (13%): sólo recogen el producto genérico
        FOSFOMICINA, 4G VIAL IV→ 108720006 fosfomicina
Resultados                                            Farmacia


• Códigos no encontrados (4%):
   – Corresponden a preparados propios del hospital o asociaciones de
     varios fármacos.

   – Ejemplos:
       PCA ROVICAINA 0,16% + FENTANILO 1,05 mg / 500 ml
       VASELINA APOSITO, 8,5 x 10 cm (unitul)
       COCIMIENTO DE LLANTEN
Dificultades encontradas
• Herramienta CliniClue:
   – Dificultad para encontrar algunos códigos
• Interpretación de las variables en:
   – Snomed CT:
             Dudas sobre el significado de algunos ejes y a qué hacen referencia
             Dudas sobre la diferencia de mismo concepto representado en
              distintos ejes
             Inexistencia de algunos conceptos que no están incluidos en SCT

    – Datos de origen:
             Interpretación del significado de las variables
             Falta de concreción conceptual del investigador
             Contexto implícito
Dificultades encontradas
– Ejemplos:
    Para el término “lactancia” existen diferentes interpretaciones:
         405028006 establecimiento de la lactancia materna: madre (entidad observable)




         405027001 establecimiento de la lactancia materna: niño (entidad observable)




         413712001 amamantamiento (madre) (entidad observable)
Dificultades encontradas
– Ejemplos:
   Para el término “glucosa” existen diferentes interpretaciones:

     365657003 concentración de glucosa (hallazgo clínico)

     36048009 medición de glucosa (procedimiento)

     226341001 ingesta de glucosa (entidad observable)

     67069006 glucosa (sustancia)
Dificultades encontradas
• Falta de ajuste entre el modelo conceptual de SCT y de las estructuras de
  datos a codificar
  – Ejemplos:
      Para el término “multicéntrico” disponemos de un código SCT para la afirmación, pero no
      para la pregunta o la negación:




          No se encuentra Código SCT                                     No se encuentra Código SCT

                                       255206009 multicéntrico (calificador)
Dificultades encontradas
En cambio para el término “menopausia” disponemos de códigos SCT para la pregunta,
afirmación y negación:




  161712005 menopausia (entidad observable)


                 289903006 menopausia presente (hallazgo clínico)   289904000 menopausia ausente (hallazgo clínico)
Dificultades encontradas
• La estructura organizativa de los medicamentos puede ser diferente
  entre la usada y la de Snomed CT.
Dificultades encontradas
En Snomed CT la estructura organizativa es más amplia.
Dificultades encontradas
Un mismo medicamento puede estar en dos grupos relacionados entre si.
Conclusiones
•   SCT es una terminología útil y detallada para la representación de variables, con una
    cobertura de un 61% en el registro de cáncer de mama y pudiendo llegar a más de
    un 95% en la codificación de medicamentos.
•   Necesidad de crear nuevas extensiones para conceptos no representados en SCT.
•   Es necesario llegar a un consenso por parte de los expertos y establecer unas
    normas para llevar a cabo una codificación de calidad.
•   Es necesario un proceso de aprendizaje de SCT y de la herramienta para la búsqueda
    de códigos y adquirir conocimientos del lenguaje específico de cada dominio.
•   Es importante ubicar cada variable dentro de su contexto, para interpretar los
    conceptos de forma adecuada y realizar una codificación de calidad.
•   Son necesarias revisiones posteriores con los expertos para determinar si los
    códigos encontrados definen adecuadamente los conceptos deseados.
•   Es útil para los propios expertos de los dominios para realizar actualizaciones en sus
    clasificaciones y catálogos en uso actual.
GRACIAS POR SU ATENCIÓN




X Jornada: Envers una assistència sostenible centrada en el pacient
         Fòrum Cis - Barcelona, 18-20 d’abril de 2012

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Aplicación de la terminología SNOMED CT en el registro de cáncer de mama y la codificación de medicamentos

  • 1. ForumCIS 10ª Jornada Aplicación de la terminología SNOMED CT en el registro de cáncer de mama y la codificación de medicamentos José Rubio1, Silvia León1 Raimundo Lozano2, Carlos Codina2, Montserrat Muñoz2, Xavier Pastor2, Artur Conesa2 (1) Institut Bonanova (2) Hospital Clínic de Barcelona, email: rlozano@clinic.ub.es
  • 2. Sumario • Introducción • Objetivo • Metodología • Resultados • Conclusiones
  • 3. Introducción - SCT • SNOMED CT es la terminología clínica integral, multilingüe y codificada de mayor amplitud, precisión e importancia desarrollada en el mundo, incluyendo más de 400.000 conceptos, 1.000.000 de descripciones y 1.500.000 de relaciones entre los conceptos. • Por este motivo, desde hace varios años, se viene preconizando el uso de SNOMED CT (SCT) para la codificación de la información clínica. • No obstante, existen todavía pocos estudios relativos a su grado de cobertura respecto a los conceptos clínicos manejados habitualmente en nuestro entorno. • El hospital Clínic de Barcelona ha puesto en marcha dos proyectos en los cuales se aplica la terminología SCT en dos campos totalmente diferenciados: – Cáncer de mama – Medicamentos
  • 4. Objetivo • Evaluar el grado de cobertura de SNOMED CT en: – Cáncer de mama – Medicamentos • Representar correctamente cada variable dentro de su contexto • Asignar un código SCT que represente cada una de las variables • Realizar un análisis de las dificultades encontradas en la utilización de SCT y de la herramienta CliniClue • Evaluar si SCT es útil para representar información clínica detallada.
  • 5. Metodología • Definir las variables que deben ser codificadas: – Mediante reuniones periódicas llevadas a cabo por los expertos del dominio. – Tomando como punto de partida: – Catálogo de medicamentos HCB – Registro de cáncer de mama – Se deciden las variables a codificar: – Registro de cáncer de mama:  216 variables – Medicamentos:  Características generales: principio activo, concentración, forma farmacéutica y vía de administración  Muestra representativa de 100 medicamentos del catálogo.
  • 6. Metodología • Codificación de las variables: – Llevada a cabo por los técnicos en documentación sanitaria – Mediante la herramienta de trabajo CliniClue a través del campo de búsqueda, ejes y jerarquías. – Se debe interpretar la variable dentro de su contexto para asignarle el código adecuado. • Revisión y validación de las variables codificadas: – Mediante reuniones periódicas con los expertos – Se determina si los códigos encontrados son representativos para cada una de las variables – Se buscan otros códigos alternativos para representar las variables.
  • 7. Resultados Cáncer de mama Resultados de códigos SCT en el registro de cáncer de mama 8% 7% Códigos encontrados Códigos no encontrados 24% Códigos aproximados 61% Códigos post coordinados
  • 8. Resultados Cáncer de mama • Códigos encontrados (61%): – Son los códigos que representan adecuadamente a las variables a las que hace referencia – Ejemplos: Sexo del paciente → 184100006 sexo del paciente (entidad observable) Fecha de nacimiento →184099003 fecha de nacimiento (entidad observable) Menarquia → 364314008 edad de inicio de la menstruación (entidad observable) • Códigos no encontrados (24%): – Son códigos que nos están incluidos en SCT – Ejemplos: 1er Tratamiento Estado hormonal Tipo de menopausia
  • 9. Resultados Cáncer de mama • Códigos aproximados (7%): – Son códigos que no representan de forma exacta las variables – Esto es debido a 3 motivos: – Bajo nivel de detalle Ejemplos: Edad del 1er hijo → 397669002 edad (calificador) Palpación profesional →13607009 palpación de la mama (procedimiento) – Excesivo nivel de detalle Ejemplo: Afectación focal → 384696009 margen de resección quirúrgica afectado por neoplasia maligna, unifocal (hallazgo clínico) – El código es próximo al concepto pero no lo define en su totalidad Ejemplos: Fecha de finalización → 413947000 fecha en la que se suspendió el tratamiento (entidad observable) Menopausia natural → 237123000 menopausia normal (hallazgo clínico)
  • 10. Resultados Cáncer de mama • Códigos postcoordinados (8%): – Son los variables que necesitan ser representadas con más de un código – Ejemplos: Fecha 1º visita oncología → 406543005 fecha de la visita (entidad observable) + 69399002 visita inicial del médico al hospital (procedimiento) + 310022001 servicio de oncología clínica (calificador)
  • 11. Resultados Farmacia Resultados según características Concentración Forma farmacéutica Vía administración 5% 6% 5% 95% 94% 95% Código encontrado Código no encontrado
  • 12. Resultados Farmacia – Ejemplos:  Concentración MG (Miligramos)  258684004 miligramo UND (Unidad)  No es una unidad de concentración  Forma farmacéutica CAPS (Cápsula)  38549006 cápsula – forma farmacéutica FRAS (Frasco)  No es una forma farmacéutica  Via de administración OFT (Oftálmica)  54485002 vía oftálmica LOCAL  Vía ambigua
  • 13. Resultados Farmacia Resultados según muestra medicamentos 4% 13% 36% Término exacto Término similar Término aproximado Término generico No existe código 36% 11%
  • 14. Resultados Farmacia – Ejemplos:  Término exacto (36%): código SCT idéntico AZATIOPRINA 50 MG VIAL → 327072003 azatioprina, 50 mg, vial  Término similar (11%): concepto parecido / validable DESMOPRESINA, 10 MCG/DOSIS NEBUL NASAL → 25914009 acetato de desmopresina, 10 mcg, aerosol nasal  Término aproximado (36%): diferencia minima GLUCOSA 5% VIAL 500 ML → 40628007 glucosa 5%, solución para infusión, bolsa de 250 ml.  Término genérico (13%): sólo recogen el producto genérico FOSFOMICINA, 4G VIAL IV→ 108720006 fosfomicina
  • 15. Resultados Farmacia • Códigos no encontrados (4%): – Corresponden a preparados propios del hospital o asociaciones de varios fármacos. – Ejemplos: PCA ROVICAINA 0,16% + FENTANILO 1,05 mg / 500 ml VASELINA APOSITO, 8,5 x 10 cm (unitul) COCIMIENTO DE LLANTEN
  • 16. Dificultades encontradas • Herramienta CliniClue: – Dificultad para encontrar algunos códigos • Interpretación de las variables en: – Snomed CT:  Dudas sobre el significado de algunos ejes y a qué hacen referencia  Dudas sobre la diferencia de mismo concepto representado en distintos ejes  Inexistencia de algunos conceptos que no están incluidos en SCT – Datos de origen:  Interpretación del significado de las variables  Falta de concreción conceptual del investigador  Contexto implícito
  • 17. Dificultades encontradas – Ejemplos: Para el término “lactancia” existen diferentes interpretaciones:  405028006 establecimiento de la lactancia materna: madre (entidad observable)  405027001 establecimiento de la lactancia materna: niño (entidad observable)  413712001 amamantamiento (madre) (entidad observable)
  • 18. Dificultades encontradas – Ejemplos: Para el término “glucosa” existen diferentes interpretaciones:  365657003 concentración de glucosa (hallazgo clínico)  36048009 medición de glucosa (procedimiento)  226341001 ingesta de glucosa (entidad observable)  67069006 glucosa (sustancia)
  • 19. Dificultades encontradas • Falta de ajuste entre el modelo conceptual de SCT y de las estructuras de datos a codificar – Ejemplos: Para el término “multicéntrico” disponemos de un código SCT para la afirmación, pero no para la pregunta o la negación: No se encuentra Código SCT No se encuentra Código SCT 255206009 multicéntrico (calificador)
  • 20. Dificultades encontradas En cambio para el término “menopausia” disponemos de códigos SCT para la pregunta, afirmación y negación: 161712005 menopausia (entidad observable) 289903006 menopausia presente (hallazgo clínico) 289904000 menopausia ausente (hallazgo clínico)
  • 21. Dificultades encontradas • La estructura organizativa de los medicamentos puede ser diferente entre la usada y la de Snomed CT.
  • 22. Dificultades encontradas En Snomed CT la estructura organizativa es más amplia.
  • 23. Dificultades encontradas Un mismo medicamento puede estar en dos grupos relacionados entre si.
  • 24. Conclusiones • SCT es una terminología útil y detallada para la representación de variables, con una cobertura de un 61% en el registro de cáncer de mama y pudiendo llegar a más de un 95% en la codificación de medicamentos. • Necesidad de crear nuevas extensiones para conceptos no representados en SCT. • Es necesario llegar a un consenso por parte de los expertos y establecer unas normas para llevar a cabo una codificación de calidad. • Es necesario un proceso de aprendizaje de SCT y de la herramienta para la búsqueda de códigos y adquirir conocimientos del lenguaje específico de cada dominio. • Es importante ubicar cada variable dentro de su contexto, para interpretar los conceptos de forma adecuada y realizar una codificación de calidad. • Son necesarias revisiones posteriores con los expertos para determinar si los códigos encontrados definen adecuadamente los conceptos deseados. • Es útil para los propios expertos de los dominios para realizar actualizaciones en sus clasificaciones y catálogos en uso actual.
  • 25. GRACIAS POR SU ATENCIÓN X Jornada: Envers una assistència sostenible centrada en el pacient Fòrum Cis - Barcelona, 18-20 d’abril de 2012