Este documento presenta los resultados de dos proyectos en el Hospital Clínic de Barcelona que aplican la terminología SNOMED CT para codificar variables relacionadas con el cáncer de mama y medicamentos. En el registro de cáncer de mama, el 61% de las variables se codificaron exactamente en SNOMED CT, mientras que el 24% no tuvieron códigos disponibles. Para los medicamentos, más del 95% de las características como concentración y forma farmacéutica se codificaron correctamente. Se identificaron algunas dificultades como la interpretación de
Col·legi d’Economistes de la Salut - OSI i Fòrum CIS
Aplicación de la terminología SNOMED CT en el registro de cáncer de mama y la codificación de medicamentos
1. ForumCIS
10ª Jornada
Aplicación de la terminología SNOMED
CT en el registro de cáncer de mama
y la codificación de medicamentos
José Rubio1, Silvia León1
Raimundo Lozano2, Carlos Codina2, Montserrat
Muñoz2, Xavier Pastor2, Artur Conesa2
(1) Institut Bonanova
(2) Hospital Clínic de Barcelona,
email: rlozano@clinic.ub.es
3. Introducción - SCT
• SNOMED CT es la terminología clínica integral, multilingüe y codificada de
mayor amplitud, precisión e importancia desarrollada en el mundo,
incluyendo más de 400.000 conceptos, 1.000.000 de descripciones y
1.500.000 de relaciones entre los conceptos.
• Por este motivo, desde hace varios años, se viene preconizando el uso de
SNOMED CT (SCT) para la codificación de la información clínica.
• No obstante, existen todavía pocos estudios relativos a su grado de
cobertura respecto a los conceptos clínicos manejados habitualmente en
nuestro entorno.
• El hospital Clínic de Barcelona ha puesto en marcha dos proyectos en los
cuales se aplica la terminología SCT en dos campos totalmente
diferenciados:
– Cáncer de mama
– Medicamentos
4. Objetivo
• Evaluar el grado de cobertura de SNOMED CT en:
– Cáncer de mama
– Medicamentos
• Representar correctamente cada variable dentro de su contexto
• Asignar un código SCT que represente cada una de las variables
• Realizar un análisis de las dificultades encontradas en la utilización de
SCT y de la herramienta CliniClue
• Evaluar si SCT es útil para representar información clínica detallada.
5. Metodología
• Definir las variables que deben ser codificadas:
– Mediante reuniones periódicas llevadas a cabo por los expertos del
dominio.
– Tomando como punto de partida:
– Catálogo de medicamentos HCB
– Registro de cáncer de mama
– Se deciden las variables a codificar:
– Registro de cáncer de mama:
216 variables
– Medicamentos:
Características generales: principio activo, concentración, forma
farmacéutica y vía de administración
Muestra representativa de 100 medicamentos del catálogo.
6. Metodología
• Codificación de las variables:
– Llevada a cabo por los técnicos en documentación sanitaria
– Mediante la herramienta de trabajo CliniClue a través del campo de
búsqueda, ejes y jerarquías.
– Se debe interpretar la variable dentro de su contexto para asignarle el
código adecuado.
• Revisión y validación de las variables codificadas:
– Mediante reuniones periódicas con los expertos
– Se determina si los códigos encontrados son representativos para cada
una de las variables
– Se buscan otros códigos alternativos para representar las variables.
7. Resultados Cáncer de mama
Resultados de códigos SCT en el registro de cáncer de mama
8%
7%
Códigos encontrados
Códigos no encontrados
24%
Códigos aproximados
61%
Códigos post coordinados
8. Resultados Cáncer de mama
• Códigos encontrados (61%):
– Son los códigos que representan adecuadamente a las variables a las que
hace referencia
– Ejemplos:
Sexo del paciente → 184100006 sexo del paciente (entidad observable)
Fecha de nacimiento →184099003 fecha de nacimiento (entidad observable)
Menarquia → 364314008 edad de inicio de la menstruación (entidad observable)
• Códigos no encontrados (24%):
– Son códigos que nos están incluidos en SCT
– Ejemplos:
1er Tratamiento
Estado hormonal
Tipo de menopausia
9. Resultados Cáncer de mama
• Códigos aproximados (7%):
– Son códigos que no representan de forma exacta las variables
– Esto es debido a 3 motivos:
– Bajo nivel de detalle
Ejemplos:
Edad del 1er hijo → 397669002 edad (calificador)
Palpación profesional →13607009 palpación de la mama (procedimiento)
– Excesivo nivel de detalle
Ejemplo:
Afectación focal → 384696009 margen de resección quirúrgica afectado por neoplasia
maligna, unifocal (hallazgo clínico)
– El código es próximo al concepto pero no lo define en su totalidad
Ejemplos:
Fecha de finalización → 413947000 fecha en la que se suspendió el tratamiento
(entidad observable)
Menopausia natural → 237123000 menopausia normal (hallazgo clínico)
10. Resultados Cáncer de mama
• Códigos postcoordinados (8%):
– Son los variables que necesitan ser representadas con más de un código
– Ejemplos:
Fecha 1º visita oncología → 406543005 fecha de la visita (entidad observable)
+
69399002 visita inicial del médico al hospital (procedimiento)
+
310022001 servicio de oncología clínica (calificador)
11. Resultados Farmacia
Resultados según características
Concentración Forma farmacéutica Vía administración
5% 6% 5%
95% 94% 95%
Código encontrado Código no encontrado
12. Resultados Farmacia
– Ejemplos:
Concentración
MG (Miligramos) 258684004 miligramo
UND (Unidad) No es una unidad de concentración
Forma farmacéutica
CAPS (Cápsula) 38549006 cápsula – forma farmacéutica
FRAS (Frasco) No es una forma farmacéutica
Via de administración
OFT (Oftálmica) 54485002 vía oftálmica
LOCAL Vía ambigua
13. Resultados Farmacia
Resultados según muestra medicamentos
4%
13%
36%
Término exacto
Término similar
Término aproximado
Término generico
No existe código 36%
11%
14. Resultados Farmacia
– Ejemplos:
Término exacto (36%): código SCT idéntico
AZATIOPRINA 50 MG VIAL → 327072003 azatioprina, 50 mg, vial
Término similar (11%): concepto parecido / validable
DESMOPRESINA, 10 MCG/DOSIS NEBUL NASAL →
25914009 acetato de desmopresina, 10 mcg, aerosol nasal
Término aproximado (36%): diferencia minima
GLUCOSA 5% VIAL 500 ML →
40628007 glucosa 5%, solución para infusión, bolsa de 250 ml.
Término genérico (13%): sólo recogen el producto genérico
FOSFOMICINA, 4G VIAL IV→ 108720006 fosfomicina
15. Resultados Farmacia
• Códigos no encontrados (4%):
– Corresponden a preparados propios del hospital o asociaciones de
varios fármacos.
– Ejemplos:
PCA ROVICAINA 0,16% + FENTANILO 1,05 mg / 500 ml
VASELINA APOSITO, 8,5 x 10 cm (unitul)
COCIMIENTO DE LLANTEN
16. Dificultades encontradas
• Herramienta CliniClue:
– Dificultad para encontrar algunos códigos
• Interpretación de las variables en:
– Snomed CT:
Dudas sobre el significado de algunos ejes y a qué hacen referencia
Dudas sobre la diferencia de mismo concepto representado en
distintos ejes
Inexistencia de algunos conceptos que no están incluidos en SCT
– Datos de origen:
Interpretación del significado de las variables
Falta de concreción conceptual del investigador
Contexto implícito
17. Dificultades encontradas
– Ejemplos:
Para el término “lactancia” existen diferentes interpretaciones:
405028006 establecimiento de la lactancia materna: madre (entidad observable)
405027001 establecimiento de la lactancia materna: niño (entidad observable)
413712001 amamantamiento (madre) (entidad observable)
18. Dificultades encontradas
– Ejemplos:
Para el término “glucosa” existen diferentes interpretaciones:
365657003 concentración de glucosa (hallazgo clínico)
36048009 medición de glucosa (procedimiento)
226341001 ingesta de glucosa (entidad observable)
67069006 glucosa (sustancia)
19. Dificultades encontradas
• Falta de ajuste entre el modelo conceptual de SCT y de las estructuras de
datos a codificar
– Ejemplos:
Para el término “multicéntrico” disponemos de un código SCT para la afirmación, pero no
para la pregunta o la negación:
No se encuentra Código SCT No se encuentra Código SCT
255206009 multicéntrico (calificador)
20. Dificultades encontradas
En cambio para el término “menopausia” disponemos de códigos SCT para la pregunta,
afirmación y negación:
161712005 menopausia (entidad observable)
289903006 menopausia presente (hallazgo clínico) 289904000 menopausia ausente (hallazgo clínico)
21. Dificultades encontradas
• La estructura organizativa de los medicamentos puede ser diferente
entre la usada y la de Snomed CT.
24. Conclusiones
• SCT es una terminología útil y detallada para la representación de variables, con una
cobertura de un 61% en el registro de cáncer de mama y pudiendo llegar a más de
un 95% en la codificación de medicamentos.
• Necesidad de crear nuevas extensiones para conceptos no representados en SCT.
• Es necesario llegar a un consenso por parte de los expertos y establecer unas
normas para llevar a cabo una codificación de calidad.
• Es necesario un proceso de aprendizaje de SCT y de la herramienta para la búsqueda
de códigos y adquirir conocimientos del lenguaje específico de cada dominio.
• Es importante ubicar cada variable dentro de su contexto, para interpretar los
conceptos de forma adecuada y realizar una codificación de calidad.
• Son necesarias revisiones posteriores con los expertos para determinar si los
códigos encontrados definen adecuadamente los conceptos deseados.
• Es útil para los propios expertos de los dominios para realizar actualizaciones en sus
clasificaciones y catálogos en uso actual.
25. GRACIAS POR SU ATENCIÓN
X Jornada: Envers una assistència sostenible centrada en el pacient
Fòrum Cis - Barcelona, 18-20 d’abril de 2012