1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA
AMBIENTAL
ASIGNATURA
TEMA : “USO DEL SOFTWARE MEGA DNA ”
CURSO : BIOTECNOLOGIA
DOCENTE : DR. HEBERT HERNAN SOTO GONZALES
ALUMNO : AYRTON CESAR SOTO PAREDES
ILO - PERÚ
2021
2. 1. INTRODUCCIÓN
La secuenciación de genomas revela la secuencia de los nucleótidos en un gen, al
igual que las letras del alfabeto en las palabras. Los nucleótidos son moléculas
orgánicas que forman el bloque estructural de los ácidos nucleicos, como ARN o
ADN. Todos los virus de la influenza constan del ARN de cadena simple a
diferencia del ADN de cadena doble. Los genes del ARN de los virus de la
influenza están constituidos por cadenas de nucleótidos que están unidas entre sí
y cifradas por las letras A, C, G y U (adenina, citosina, guanina y uracilo,
respectivamente). La comparación de la composición de nucleótidos en el gen de
un virus con el orden de los nucleótidos de otro gen puede demostrar ciertas
variaciones entre los dos virus.
MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis) es una herramienta utilizada
para analizar secuencias evolutivas de ADN y proteínas. La aplicación está
disponible como una edición de interfaz GUI y una edición de línea de comandos.
MEGA está diseñado para que los biólogos lo utilicen en la investigación de
laboratorio para reconstruir las historias evolutivas de los genes y las especies. Es
compatible con varios formatos populares de secuencias de ADN y proteínas, al
tiempo que le ofrece herramientas para examinar los datos y realizar una variedad
de pruebas. MEGA es una herramienta necesaria para aquellos que realizan
investigaciones con secuencias de ADN y proteínas.
3. 2. MARCO TEÓRICO
• ALINEACIÓN DE SECUENCIAS
Un alineamiento de secuencias en bioinformática es una forma de
representar y comparar dos o más secuencias o cadenas de ADN, ARN, o
estructuras primarias proteicas para resaltar sus zonas de similitud, que
podrían indicar relaciones funcionales o evolutivas entre los genes o
proteínas consultados.
• INFERENCIA DE ÁRBOLES FILOGENÉTICOS
Un árbol filogenético es un diagrama que representa las relaciones
evolutivas entre organismos. Los árboles filogenéticos son hipótesis, no
hechos definitivos.
3. PROCEDIMIENTO
El primer paso es abrir el programa MEGA y debemos hacer el alineamiento le
damo click en el banco de genes y se nos abrira una venta.
4. Trabajamos en este caso con el gen 16s y tenemos una variedad de
microorganismos en la cual trabajaremos con el que queremos en este caso solo
10.
Le damos click en el microorganismo como podemos observar en la imagen y
nuevamente nos mandar a otra ventana
5. Le damos click en añadir alineamiento.
Y se nos abrira una ventana de las secuencias del microorganismo coloridos.
Al esconger 10 microorganismos nos mostrara las secuencias y nos quedara como
se muestra en la imagen.
6. Nos quedara algunas secuencias con espacios en blanco en la cual debemos
borrarlos, pero primero el muscle nos ayudara alinear de forma ordenada no debe
pasar el 50%
Exportamos y guardamos los alineamientos de todos modos Nexus, Mega y
Fasta.
Una ves obtenido todos los alineamientos, le damos click en PHYLOGENY y
abrimos el archivo que guardamos
7. Se nos abrira una ventana, pero no cambiamos nada y solo le damos en “OK”
Y finalmente se nos abrira y obtendremos nuestra estructura arbol filogenético.
4. BIBLIOGRAFIA
• https://www.megasoftware.net/web_help_10/index.htm#t=First_Time_U
ser.htm
