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Tema 18. Principios de Taxonomía Bacteriana

 I. Conceptos Generales. Taxonomía, Clasificación,
      Nomenclatura e Identificación.

 II. Caracteres utilizados en taxonomía procariota.
 II C             ili d              í        i

 III.
 III Sistemas de clasificación
                 clasificación.

 IV. Rangos taxonómicos

 V.   La descripción de un nuevo microorganismo.

 VI. Sistemática de los procariotas. El Manual de Bergey
I.   Conceptos Generales. Taxonomía, Clasificación,
     Nomenclatura e Identificación.
     N      l t     Id tifi    ió



     Taxonomía (taxis: estructuración; nomos: ley)



      Clasificación: Ordena los seres en grupos

      Nomenclatura: Asigna nombres a los grupos

      Identificación: Sitú a un microorganismo en un t ó ya
      Id tifi     ió Sitúa       i        i          taxón
      establecido



          Comunicación entre los microbiólogos
Tema 18. Principios de Taxonomía Bacteriana

 I. Conceptos Generales. Taxonomía, Clasificación,
      Nomenclatura e Identificación.

 II. Caracteres utilizados en taxonomía procariota.
 II C             ili d              í        i

 III.
 III Sistemas de clasificación
                 clasificación.

 IV. Rangos taxonómicos

 V.   La descripción de un nuevo microorganismo.

 VI. Sistemática de los procariotas. El Manual de Bergey
II. Caracteres utilizados en taxonomía procariota.

    •Morfológicas
    •Fisiológicas y metabólicas
    •Ecológicas
    •Serológicas
     Serológicas
    •Susceptibilidad a antimicrobianos
    •Sensibilidad a bacteriófagos



    •Moleculares
          - lípidos (ácidos grasos)
          - proteínas
          - ácidos nucleicos
Características morfológicas
Características morfológicas
Características fisiológicas y metabólicas




- fuentes de carbono y
nitrógeno y energía.
     g           g

- tipo general de
metabolismo.

- productos de
fermentación

- enzimas
extracelulares
   t   l l
Características ecológicas


Requerimientos de

•Oxígeno
•Temperatura
•pH
•NaCl




                              Salinas de Marchamalo (Murcia)
Características serológicas

Susceptibilidad a los antimicrobianos

Sensibilidad a bacteriófagos
Características Moleculares




- Lípidos (ácidos grasos)




                              Secuencia de aminoácidos
 - Proteínas
                              Movilidad electroforética



                              Contenido en G+C (mol %)
   - Ácidos nucleicos
                              Hibridación DNA-DNA

                              Secuencia del DNAr 16S
Tema 18. Principios de Taxonomía Bacteriana

 I. Conceptos Generales. Taxonomía, Clasificación,
      Nomenclatura e Identificación.

 II. Caracteres utilizados en taxonomía procariota.
 II C             ili d              í        i

 III.
 III Sistemas de clasificación
                 clasificación.

 IV. Rangos taxonómicos

 V.   La descripción de un nuevo microorganismo.

 VI. Sistemática de los procariotas. El Manual de Bergey
III. Sistemas de clasificación



  • Clasificación artificial: características fenotípicas
  • Clasificación natural: características genotípicas y filogenéticas




  • Clasificación monotética: caracteres clave
  • Clasificación politética: numerosos caracteres con igual valor

                               •Taxonomía numérica
Tema 18. Principios de Taxonomía Bacteriana

 I. Conceptos Generales. Taxonomía, Clasificación,
      Nomenclatura e Identificación.

 II. Caracteres utilizados en taxonomía procariota.
 II C             ili d              í        i

 III.
 III Sistemas de clasificación
                 clasificación.

 IV. Rangos taxonómicos

 V.   La descripción de un nuevo microorganismo.

 VI. Sistemática de los procariotas. El Manual de Bergey
IV. Rangos taxonómicos


  ESPECIE, GÉNERO, FAMILIA, ORDEN, CLASE, PHILUM,
  ESPECIE GÉNERO FAMILIA ORDEN CLASE PHILUM DOMINIO




                        Dominio: Bacteria
                        Philum: Proteobacteria
                        Clase: Gamma Proteobacteria
Escherichia coli K-30   Orden: Enterobacteriales
                        Familia: E t
                        F   ili Enterobacteriaceae
                                      b t i
                        Género: Escherichia
Jerarquía en Taxonomía
ESPECIE PROCARIOTA

Grupo que comparte un número elevado de
propiedades fenotípicas y genotípicas que difieren
de forma significativa de las de otros grupos



Grupo con un contenido en G+C similar y que
G                t id      G C i il
presenta valores de hibridación DNA-DNA
superior al 70%


Grupo que presenta más del 97% de homología en
la secuencia del RNAr 16S
Especie
   p
bacteriana
               Cepa tipo   Escherichia coli ATCC 1172T




             -Biotipo
  Cepa       -Serotipo
             -Fagotipo
                g p
             -Ecotipo
Tema 18. Principios de Taxonomía Bacteriana

 I. Conceptos Generales. Taxonomía, Clasificación,
      Nomenclatura e Identificación.

 II. Caracteres utilizados en taxonomía procariota.
 II C             ili d              í        i

 III.
 III Sistemas de clasificación
                 clasificación.

 IV. Rangos taxonómicos

 V.   La descripción de un nuevo microorganismo.

 VI. Sistemática de los procariotas. El Manual de Bergey
V. La descripción de un nuevo microorganismo.


1. Asignación de un nombre científico.
2. Publicación científica
3. Depósito en colecciones de cultivo
V. La descripción de un nuevo microorganismo.
1. Asignación de un nombre científico.




The international Code of Nomenclature of Bacteria




        Escherichia coli
        Escherichia coli
        E.
        E coli
1. Asignación de un nombre científico en base a:


-Características morfológicas, fisiológicas y ecológicas
 C       í i        f ló i     fi i ló i         ló i
                                       Bacillus subtilis
                                       Bacillus cereus
                                       B. stearothermophilus
                                       B. acidocaldarius

-Lugar de procedencia
                       Helicobacter l i
                       H li b t pylori

                       Pseudomonas atlantica


-Honor a científicos
                   Palleronia marisminoris
1. Asignación de un nombre científico en base a:




         Pseudomonas hispanica


          Alteromonas hispanica
V. La descripción de un nuevo
                 p
       microorganismo.

     1. A i
     1 Asignación de un nombre cientifico.
               ió d             b i tifi
     2. Publicación científica.

Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM

  International Committee on Systematics of Prokaryotes

        Subcommittee on Halomonadaceae




                Manual de Bergey
V. La descripción de un nuevo microorganismo.


   1. Asignación de un nombre cientifico.
   2. Publicación científica
   3. Depósito en colecciones de cultivo



   -Americana (ATCC): American Type of Culture Colection

   -Española (CECT): Colección española de cultivos tipo

    -Alemana (DSM): colección alemana de microorganismos y
cultivos celulares
Tema 18. Principios de Taxonomía Bacteriana

 I. Conceptos Generales. Taxonomía, Clasificación,
      Nomenclatura e Identificación.

 II. Caracteres utilizados en taxonomía procariota.
 II C             ili d              í        i

 III.
 III Sistemas de clasificación
                 clasificación.

 IV. Rangos taxonómicos

 V.   La descripción de un nuevo microorganismo.

 VI. Sistemática de los procariotas. El Manual de Bergey
Carl Woese, 1977
El Manual de Bergey
     David Bergey, Universidad de Pensilvania, 1923


                                                Bergey s
                                                Bergey´s
                                               Manual of
                                              Determinati
                                                   ve
                                              Bacteriologg
                                            Características
                                                   y
                                             fenotípicas


-Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology
(
(Características fenotípicas)
                       p    )
       -Reino Prokaryotae (4 divisiones)

-Bergey's Manual of Systematic Bacteriology
 Bergey s
       - 2º edición (Características filogenéticas):
       Dominios Archaea y Bacteria
Arbol filogenético universal (3 dominios)

          Bacteria   Archaea         Eucarya




                                      Comparación rRNA
Los Dominios Bacteria y Archaea.
2001 - 2ª Edición
Procariotas agrupados en base
a sus relaciones filogenéticas




5 volúmenes
1. Arqueas, bacterias fototróficas y las bacterias evolutivamente
  más antiguas
2. Proteobacterias
3.
3 Bacterias Gram positivas con bajo contenido en G+C
4. Bacterias Gram positivas con alto contenido en G+C
5. Planctomycetes, Spirochaetes, Fibrobacteres, Bacteroidetes y
  Fusobacteria

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Tema%2018.%20 principios%20de%20taxonomia%20bacteriana blanco

  • 1. Tema 18. Principios de Taxonomía Bacteriana I. Conceptos Generales. Taxonomía, Clasificación, Nomenclatura e Identificación. II. Caracteres utilizados en taxonomía procariota. II C ili d í i III. III Sistemas de clasificación clasificación. IV. Rangos taxonómicos V. La descripción de un nuevo microorganismo. VI. Sistemática de los procariotas. El Manual de Bergey
  • 2. I. Conceptos Generales. Taxonomía, Clasificación, Nomenclatura e Identificación. N l t Id tifi ió Taxonomía (taxis: estructuración; nomos: ley) Clasificación: Ordena los seres en grupos Nomenclatura: Asigna nombres a los grupos Identificación: Sitú a un microorganismo en un t ó ya Id tifi ió Sitúa i i taxón establecido Comunicación entre los microbiólogos
  • 3. Tema 18. Principios de Taxonomía Bacteriana I. Conceptos Generales. Taxonomía, Clasificación, Nomenclatura e Identificación. II. Caracteres utilizados en taxonomía procariota. II C ili d í i III. III Sistemas de clasificación clasificación. IV. Rangos taxonómicos V. La descripción de un nuevo microorganismo. VI. Sistemática de los procariotas. El Manual de Bergey
  • 4. II. Caracteres utilizados en taxonomía procariota. •Morfológicas •Fisiológicas y metabólicas •Ecológicas •Serológicas Serológicas •Susceptibilidad a antimicrobianos •Sensibilidad a bacteriófagos •Moleculares - lípidos (ácidos grasos) - proteínas - ácidos nucleicos
  • 7. Características fisiológicas y metabólicas - fuentes de carbono y nitrógeno y energía. g g - tipo general de metabolismo. - productos de fermentación - enzimas extracelulares t l l
  • 9. Características serológicas Susceptibilidad a los antimicrobianos Sensibilidad a bacteriófagos
  • 10. Características Moleculares - Lípidos (ácidos grasos) Secuencia de aminoácidos - Proteínas Movilidad electroforética Contenido en G+C (mol %) - Ácidos nucleicos Hibridación DNA-DNA Secuencia del DNAr 16S
  • 11. Tema 18. Principios de Taxonomía Bacteriana I. Conceptos Generales. Taxonomía, Clasificación, Nomenclatura e Identificación. II. Caracteres utilizados en taxonomía procariota. II C ili d í i III. III Sistemas de clasificación clasificación. IV. Rangos taxonómicos V. La descripción de un nuevo microorganismo. VI. Sistemática de los procariotas. El Manual de Bergey
  • 12. III. Sistemas de clasificación • Clasificación artificial: características fenotípicas • Clasificación natural: características genotípicas y filogenéticas • Clasificación monotética: caracteres clave • Clasificación politética: numerosos caracteres con igual valor •Taxonomía numérica
  • 13. Tema 18. Principios de Taxonomía Bacteriana I. Conceptos Generales. Taxonomía, Clasificación, Nomenclatura e Identificación. II. Caracteres utilizados en taxonomía procariota. II C ili d í i III. III Sistemas de clasificación clasificación. IV. Rangos taxonómicos V. La descripción de un nuevo microorganismo. VI. Sistemática de los procariotas. El Manual de Bergey
  • 14. IV. Rangos taxonómicos ESPECIE, GÉNERO, FAMILIA, ORDEN, CLASE, PHILUM, ESPECIE GÉNERO FAMILIA ORDEN CLASE PHILUM DOMINIO Dominio: Bacteria Philum: Proteobacteria Clase: Gamma Proteobacteria Escherichia coli K-30 Orden: Enterobacteriales Familia: E t F ili Enterobacteriaceae b t i Género: Escherichia
  • 16. ESPECIE PROCARIOTA Grupo que comparte un número elevado de propiedades fenotípicas y genotípicas que difieren de forma significativa de las de otros grupos Grupo con un contenido en G+C similar y que G t id G C i il presenta valores de hibridación DNA-DNA superior al 70% Grupo que presenta más del 97% de homología en la secuencia del RNAr 16S
  • 17. Especie p bacteriana Cepa tipo Escherichia coli ATCC 1172T -Biotipo Cepa -Serotipo -Fagotipo g p -Ecotipo
  • 18. Tema 18. Principios de Taxonomía Bacteriana I. Conceptos Generales. Taxonomía, Clasificación, Nomenclatura e Identificación. II. Caracteres utilizados en taxonomía procariota. II C ili d í i III. III Sistemas de clasificación clasificación. IV. Rangos taxonómicos V. La descripción de un nuevo microorganismo. VI. Sistemática de los procariotas. El Manual de Bergey
  • 19. V. La descripción de un nuevo microorganismo. 1. Asignación de un nombre científico. 2. Publicación científica 3. Depósito en colecciones de cultivo
  • 20. V. La descripción de un nuevo microorganismo. 1. Asignación de un nombre científico. The international Code of Nomenclature of Bacteria Escherichia coli Escherichia coli E. E coli
  • 21. 1. Asignación de un nombre científico en base a: -Características morfológicas, fisiológicas y ecológicas C í i f ló i fi i ló i ló i Bacillus subtilis Bacillus cereus B. stearothermophilus B. acidocaldarius -Lugar de procedencia Helicobacter l i H li b t pylori Pseudomonas atlantica -Honor a científicos Palleronia marisminoris
  • 22. 1. Asignación de un nombre científico en base a: Pseudomonas hispanica Alteromonas hispanica
  • 23. V. La descripción de un nuevo p microorganismo. 1. A i 1 Asignación de un nombre cientifico. ió d b i tifi 2. Publicación científica. Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM International Committee on Systematics of Prokaryotes Subcommittee on Halomonadaceae Manual de Bergey
  • 24. V. La descripción de un nuevo microorganismo. 1. Asignación de un nombre cientifico. 2. Publicación científica 3. Depósito en colecciones de cultivo -Americana (ATCC): American Type of Culture Colection -Española (CECT): Colección española de cultivos tipo -Alemana (DSM): colección alemana de microorganismos y cultivos celulares
  • 25. Tema 18. Principios de Taxonomía Bacteriana I. Conceptos Generales. Taxonomía, Clasificación, Nomenclatura e Identificación. II. Caracteres utilizados en taxonomía procariota. II C ili d í i III. III Sistemas de clasificación clasificación. IV. Rangos taxonómicos V. La descripción de un nuevo microorganismo. VI. Sistemática de los procariotas. El Manual de Bergey
  • 27. El Manual de Bergey David Bergey, Universidad de Pensilvania, 1923 Bergey s Bergey´s Manual of Determinati ve Bacteriologg Características y fenotípicas -Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology ( (Características fenotípicas) p ) -Reino Prokaryotae (4 divisiones) -Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Bergey s - 2º edición (Características filogenéticas): Dominios Archaea y Bacteria
  • 28. Arbol filogenético universal (3 dominios) Bacteria Archaea Eucarya Comparación rRNA
  • 29. Los Dominios Bacteria y Archaea.
  • 30.
  • 31. 2001 - 2ª Edición Procariotas agrupados en base a sus relaciones filogenéticas 5 volúmenes 1. Arqueas, bacterias fototróficas y las bacterias evolutivamente más antiguas 2. Proteobacterias 3. 3 Bacterias Gram positivas con bajo contenido en G+C 4. Bacterias Gram positivas con alto contenido en G+C 5. Planctomycetes, Spirochaetes, Fibrobacteres, Bacteroidetes y Fusobacteria