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SNOMED CT
DR. H. MANDIROLA
06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 1
Sistematic NOmenclature of MEDicine – Clinical Terms
•Terminología clínica de referencia completa cuyo contenido y
expresividad facilitan el diseño de documentación clínica y el
proceso de información en el ámbito de la salud.
•Permite que médicos, investigadores y pacientes compartan datos
comparables.
•Es esencial para la recolección, recuperación, agregación y
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06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 2
¿Cómo se obtiene SNOMED?
•Health Terminology Standards Development Organisation
(IHTSDO)
•Hay una Edición en español
•Edición nacional distribuida por el Ministerio de Sanidad
(ed. Argentina)
•Se requiere certificado digital Petición
•La actualización de Snomed es de 2 veces al año (enero y julio)
06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 3
COMPONENTES DE SNOMED CT
•“Core” Components
•Código Concepto – Concept codes
•Descripciones o términos
•Sus Relaciones
•Otros Componentes
•Set de Referencias (RefSets) ReSet Members
•CrossMap Sets, Cross Maps, Cross Map Targets
06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 4
Concept codes
•Hay un código por significado, o un significado por
código
•Es una cadena de 6 a 18 dígitos lo mas común son de
8 a 9 dígitos
•22298006 Infarto de Miocardio MI
•399211009 Antecedente de Infarto de Miocardio
•Códigos vs Conceptos vs Cosas Reales
06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 5
Términos y descripciones
•Un termino es una cadena de caracteres leíble por ejemplo
inmunosupresión
•una descripción es un termino unido a un concepto
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• Inmunosupresión -> Terapia Inmunosupresora
• (procedimiento) ID = 507152014
• Inmunosupresión -> Inmunosupresión Hallazgo Clínico
• ID = 63394015
06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 6
Relaciones
Definitoria
Calificadas
Históricas
Adicional
06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 7
Estructura de datos Componentes de Snomed CT
06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 8
Documentación
•Guía de Usuario: Dirigido a personal de área
médicas.
•Guía Técnica de Implementación: Dirigido a
desarrolladores de software
•Guía de Referencia Técnica: Dirigido a cualquier
particular u organización
06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 9
Contenido SNOMED CT Basic tables
<Tipo de Archivo>_<Tipo de Contenido>_<Subtipo de
contenido>_<País|Espacio de Nombres>_<fecha de
versión>.<Extensión>
1. sct1_Concepts_Core_INT_20100131.txt
2. sct1_Descriptions_es_INT_20100430.txt
3. sct1_Relationships_Core_INT_20100131.txt
06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 10
Contenido SNOMED CT Language subset table
•der1_Subsets_es_INT_20100430.txt
• Cada fila de la tabla describe una publicación de un subconjunto
• Incluye los subconjuntos de Snomed CT que se agrupan en la tabla
de miembros
•der1_SubsetMembers_es_INT_20100430.txt:
• Cada fila representa un miembro de un subconjunto
• El miembro puede ser un concepto o una descripción.
• Se pueden agrupar uno o más subconjuntos.
06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 11
Contenido SNOMED CT Tabla de Conceptos
06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 12
0: Activo
1: Retirado
2: Duplicado
3: Desactualizado
4: Ambiguo
5: Erróneo
6: Limitado
10: Trasladado a otra parte(extensión o al núcleo)
11: Traslado pendiente
Contenido SNOMED CT Tabla de Descripciones
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4: Ambiguo
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6: Limitado
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0: Relación Definitoria: “ES UN/UNA [IS_A]”
1: Relación Calificadora: “ES UNA CALIFICACIÓN POSIBLE”
2: Relación Histórica: “IGUAL QUE”
3: Relación Adicional: “ES UNA CARACTERÍSTICA DEL CONCEPTO”
06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 15
Gracias por su atención
06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA
Dr. Humberto Fernán Mandirola Brieux
Email hmandirola@biocom.com
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Referencias
www.nlm.nih.gov/snomed/
Free SNOMED CT Browser www.snoflake.co.uk/
http://www.ihtsdo.org/
https://www.youtube.com/watch?v=CrZ46eXunzo
http://www.slideshare.net/JessCceresTello/introduccin-a-snomed-ct?qid=48fb1041-9c25-446d-93ea-
7837ee81a8e8&v=qf1&b=&from_search=3
http://www.nehta.gov.au/our-work/clinical-terminology/snomed-clinical-terms/educational-resources
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  • 1. SNOMED CT DR. H. MANDIROLA 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 1
  • 2. Sistematic NOmenclature of MEDicine – Clinical Terms •Terminología clínica de referencia completa cuyo contenido y expresividad facilitan el diseño de documentación clínica y el proceso de información en el ámbito de la salud. •Permite que médicos, investigadores y pacientes compartan datos comparables. •Es esencial para la recolección, recuperación, agregación y reutilización de datos médicos así como favorecer el intercambio de información. 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 2
  • 3. ¿Cómo se obtiene SNOMED? •Health Terminology Standards Development Organisation (IHTSDO) •Hay una Edición en español •Edición nacional distribuida por el Ministerio de Sanidad (ed. Argentina) •Se requiere certificado digital Petición •La actualización de Snomed es de 2 veces al año (enero y julio) 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 3
  • 4. COMPONENTES DE SNOMED CT •“Core” Components •Código Concepto – Concept codes •Descripciones o términos •Sus Relaciones •Otros Componentes •Set de Referencias (RefSets) ReSet Members •CrossMap Sets, Cross Maps, Cross Map Targets 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 4
  • 5. Concept codes •Hay un código por significado, o un significado por código •Es una cadena de 6 a 18 dígitos lo mas común son de 8 a 9 dígitos •22298006 Infarto de Miocardio MI •399211009 Antecedente de Infarto de Miocardio •Códigos vs Conceptos vs Cosas Reales 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 5
  • 6. Términos y descripciones •Un termino es una cadena de caracteres leíble por ejemplo inmunosupresión •una descripción es un termino unido a un concepto •Ejemplo dos diferentes descripciones que tienen el mismo termino • Inmunosupresión -> Terapia Inmunosupresora • (procedimiento) ID = 507152014 • Inmunosupresión -> Inmunosupresión Hallazgo Clínico • ID = 63394015 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 6
  • 8. Estructura de datos Componentes de Snomed CT 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 8
  • 9. Documentación •Guía de Usuario: Dirigido a personal de área médicas. •Guía Técnica de Implementación: Dirigido a desarrolladores de software •Guía de Referencia Técnica: Dirigido a cualquier particular u organización 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 9
  • 10. Contenido SNOMED CT Basic tables <Tipo de Archivo>_<Tipo de Contenido>_<Subtipo de contenido>_<País|Espacio de Nombres>_<fecha de versión>.<Extensión> 1. sct1_Concepts_Core_INT_20100131.txt 2. sct1_Descriptions_es_INT_20100430.txt 3. sct1_Relationships_Core_INT_20100131.txt 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 10
  • 11. Contenido SNOMED CT Language subset table •der1_Subsets_es_INT_20100430.txt • Cada fila de la tabla describe una publicación de un subconjunto • Incluye los subconjuntos de Snomed CT que se agrupan en la tabla de miembros •der1_SubsetMembers_es_INT_20100430.txt: • Cada fila representa un miembro de un subconjunto • El miembro puede ser un concepto o una descripción. • Se pueden agrupar uno o más subconjuntos. 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 11
  • 12. Contenido SNOMED CT Tabla de Conceptos 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 12 0: Activo 1: Retirado 2: Duplicado 3: Desactualizado 4: Ambiguo 5: Erróneo 6: Limitado 10: Trasladado a otra parte(extensión o al núcleo) 11: Traslado pendiente
  • 13. Contenido SNOMED CT Tabla de Descripciones 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 13 0: Activo 1: Retirado 2: Duplicado 3: Desactualizado 4: Ambiguo 5: Erróneo 6: Limitado 10: Trasladado a otra parte(extensión o al núcleo) 11: Traslado pendiente 0: No especificado 1: Preferido 2: Sinónimo 3: FullSpecifiedName 0: Falso; 1: Verdadero
  • 14. Contenido SNOMED CT Tabla de Relaciones 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 14 0: Relación Definitoria: “ES UN/UNA [IS_A]” 1: Relación Calificadora: “ES UNA CALIFICACIÓN POSIBLE” 2: Relación Histórica: “IGUAL QUE” 3: Relación Adicional: “ES UNA CARACTERÍSTICA DEL CONCEPTO”
  • 15. 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 15
  • 16. Gracias por su atención 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA Dr. Humberto Fernán Mandirola Brieux Email hmandirola@biocom.com 16
  • 17. Referencias www.nlm.nih.gov/snomed/ Free SNOMED CT Browser www.snoflake.co.uk/ http://www.ihtsdo.org/ https://www.youtube.com/watch?v=CrZ46eXunzo http://www.slideshare.net/JessCceresTello/introduccin-a-snomed-ct?qid=48fb1041-9c25-446d-93ea- 7837ee81a8e8&v=qf1&b=&from_search=3 http://www.nehta.gov.au/our-work/clinical-terminology/snomed-clinical-terms/educational-resources 06/04/2015 INTRODUCCIÓN AL XML Y FHIR ING. F PORTILLA Y DR. MANDIROLA 17