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Bases de la biotecnología moderna
SEMINARIO - TALLER
EVALUACION Y GESTION DE RIESGO DE
ORGANISMOS GENETICAMENTE MODIFICADOS
Lima, 28 de Septiembre - 1° de Octubre, 2004
Jorge Benavides
Laboratorio de Biotecnología Aplicada
Centro Internacional de la Papa (CIP)
www.cipotato.org
www.potatoGENE.org
El rol de los cultivos transgénicos
La ingeniería genética o transgenesis en el
mejoramiento genético es una nueva técnica aplicada
a una antigua metodología: el movimiento de los
genes
• Agricultura empezó 10,000
• Mejoramiento genético clásico: >100 años desde
Mendel. Nuevas variedades son producidas por
selección en progenies obtenidas por cruzamientos
• Mejoramiento por ingeniería genética: >10 años.
Nuevas variedades son producidas por inserción de
genes seleccionados en variedades existentes pero
que carecen de la característica agregada
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por:
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convencional
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La ingeniería genética es:
Tecnología del ADN recombinante y otras que
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rasgos específicos mediante la modificación
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• Permite desarrollar más rápidamente
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Según la Ley 27104
“Tecnología del ADN recombinante, aplicada para modificar
deliberadamente propiedades genéticas de las células vivas
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vivo que posea una combinación nueva de material genético
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- técnicas in vitro de ácido nucleico, incluidos el ácido
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Aislamiento del gen Bt
Gen del Bt
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3’ CACGGCCAACTTAAGGCGCTAGCATTTG 5’
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5’ GTGCCGGTTGAATT
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Gen del Bt
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Se usa el proceso natural de transferencia de genes de
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vegetales.
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Patogenicidad en Agrobacterium
• T-DNA, es transferido al
genome de la planta
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(auxinas, citokininas)
– genes de síntesis de
Opinas
• tra – conjugación
bacteriana
• Catabolismo de Opine
• genes Vir
pTI
~200 kb
T-DNA
tra
catabolismo
Opine
genes vir
ori
Construcción del Vector
ori
T-DNA
Eliminar genes
catabolismo opinas
Eliminar tra
Eliminar genes
auxina y citokininas
vir genes
El gen
Secuencia
promotor ATG
Secuencia codificante
de la proteína
Secuencia
terminador
TAA
Humano (1n) :
3,342,501,213 pb 26,000 genes
Arroz (1n)
363,357,896 pb hasta 50,000 genes
Tienen muchos genes en común.
C
Construc
onstrucción
ción de
de Gen
Gen
Herramientas disponibles en el CIP:
• Vectores de transformación de plantas : pBI121, pBin19,
pMOG800
• Marcadores de selección de plantas transformadas
•Elementos geneticos para expresion de genes customize :
Coding sequence
Promoters
KmR
PNos 3’Nos
RB LB
Sm
Sm/Spec
/Spec
bla
bla ori
ori tet
tet
Terminator
Signal sequence
Ubi3 = constitutive (= 35s)
GBSS = tuber
β-amylase = root
grp1.8 = xylem
gst1, wun1, mas,
… = stress-specific
Kmr
NPTII
Gln 35-S
promoter
OCS pA
pA7
(3.49Kb)
Apr
35-S
Promoter
OCS pA
Gln Apr
pGln-3
(5.23Kb)
p1Ax1
(10.9Kb)
Apr
Gln
Apr
pUC19
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Subcloning of
PstI-SphI
Deletion of
HindIII fragment
Fragment
EcoRI-SphI
Fragment
SphI-MboI
Ligation with
pUC19 EcoRI-BamHI
Fragment
XbaI-PstI
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PstI-HindII
Ligation with pMOG800
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pCIP10
pCIP10
Construcción del gen de
Glutenina de trigo
Investigación en la
calidad de la hatina de
camote
Un ejemplo: la papa Bt
Plantas in vitro
ADN
genómico
vegetal
Agrobacterium tumefaciens
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plásmido con
el gen Bt
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Un ejemplo: la papa Bt
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vegetal con el gen
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Resistencia a plaga del
tubérculo (Polilla)
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Désirée
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bioseguridad,
Lima
Estudio en campo
aislado
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experimental
CIP San
Ramón
Métodos de tansformación
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Organogénesis directa
Testar OVM
• Pruebas de ELISA y PCR
estan disponibles
• Pruebas son sensibles y pueden
ser rápidas, fáciles de usar y
relativamente baratos
• Cada pocillo puede ser una
muestra
Polymerase
Polymerase Chain Reaction
Chain Reaction
SPECIMEN
PREP
AMPLIFICATION DETECTION
1 - 4 hours 1.5 - 3.5 hours 1 - 2 hours
Courtesy Cepheid, Inc
Reacción en Cadena de la Polimerasa o PCR
Extracción ADN
4 horas 2.5 – 3.5 horas 1-2 horas
AMPLIFICACION DETECCION
Caracterización molecular
del OVM vegetal (PCR)
PCR Inversa
clonación DNA
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del ADN
Localization
in plant genome
Ligación
Digestión
GenBank
Southern blotting
Amplificación PCR
Presencia del gen Bt en el genoma
de plantas transgénicas (Southern
blot)
Presencia del gen Bt en el genoma
de plantas transgénicas (Southern
blot)
C LT-8
1 to 19 Bt- LT-8
20 Control
• Cuantificación de Proteína
LT-8 /Bt-1 /DST 24-2 5.64
LT-8 /Bt-1 /DST 24-3 2.50
LT-8 /Bt-1 /DST 34-1 1.99
LT-8 /Bt-1 /DST 34-2 4.86
LT-8 /Bt-1 /DST 34-3 6.26
LT-8 /Bt-1 /DST 34-5 3.55
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Sangema /Bt-1 / DST 39-2 1.94
Sangema /Bt-1 / DST 39-3 4.71
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  • 1. Bases de la biotecnología moderna SEMINARIO - TALLER EVALUACION Y GESTION DE RIESGO DE ORGANISMOS GENETICAMENTE MODIFICADOS Lima, 28 de Septiembre - 1° de Octubre, 2004 Jorge Benavides Laboratorio de Biotecnología Aplicada Centro Internacional de la Papa (CIP) www.cipotato.org www.potatoGENE.org
  • 2. El rol de los cultivos transgénicos La ingeniería genética o transgenesis en el mejoramiento genético es una nueva técnica aplicada a una antigua metodología: el movimiento de los genes • Agricultura empezó 10,000 • Mejoramiento genético clásico: >100 años desde Mendel. Nuevas variedades son producidas por selección en progenies obtenidas por cruzamientos • Mejoramiento por ingeniería genética: >10 años. Nuevas variedades son producidas por inserción de genes seleccionados en variedades existentes pero que carecen de la característica agregada
  • 3. Domesticaci Domesticació ón del n del Maíz Maíz Número de mutaciones Efecto de las mutaciones refinamiento domesticación
  • 4. Resultados de cruzamiento natural • Domesticación del cultivo. • Mejorar las características para aumentar la producción y calidad del grano de maíz. • La modificación genética natural entre especie se da por: – Rearreglos de los genes dentro de una especie en forma natural o por polinization dirigida – Incorporación de genes a partir de especies silvestres o cercanas relacionadas por polinización
  • 5. Límites del mejoramiento convencional • Proceso lento para desarrollar nuevas variedades. – Por lo menos 10 años utilizando técnicas de mejoramiento convencional. • Característica deseada nueva y mejorada no siempre estan presentes en las especies. – Resistencia a insectos y enfermedades – Mejoramiento fisiológico – Tolerancia al Stress – Compuestos deseable en la planta
  • 7. La ingeniería genética es: Tecnología del ADN recombinante y otras que contribuyen a la modificación genética de los organismos y moléculas de ADN para obtener rasgos específicos mediante la modificación y/o la transferencia de los genes.
  • 8. Ingeniería Genética • Permite desarrollar más rápidamente variedades. – Cultivo de Tejidos, DNA recombinante, etc. • Permite transferir caracteres genéticos de una variedad no relacionada a otra. – e.g., resistencia a insect resistance originadas a partir de Bt bacteria.
  • 10. La ingeniería genética es: Según la Ley 27104 “Tecnología del ADN recombinante, aplicada para modificar deliberadamente propiedades genéticas de las células vivas con el fin de hacerlas producir nuevas sustancias o conferirles nuevas o superiores funciones. Proceso mediante el cual se transfiere el gen de un organismo a otro a través de la manipulación de la información genética (genes).”
  • 11. La ingeniería genética es: Según el Protocolo de Cartagena “ Por organismo vivo modificado se entiende cualquier organismo vivo que posea una combinación nueva de material genético que se haya obtenido mediante la aplicación de la biotecnología moderna. Por biotecnología moderna se entiende la aplicación de: - técnicas in vitro de ácido nucleico, incluidos el ácido desoxirribonucleico (ADN) recombinante y la inyección directa de ácido nucleico en células u orgánulos, o - la fusión de células mas allá de la familia taxonómica, que superan las barreras fisiológicas naturales de la reproducción o de la recombinación y que no son técnicas utilizadas en la reproducción y selección tradicional.”
  • 12. La ingeniería genética es: • La fusión somática no es una técnica derivada de la ingeniería genética. • Se puede modificar los genes sin introducir ADN foráneo (mutación, edición de los genes) • Todos los organismos vivos son modificados de alguna forma por el hombre (selección) y por el ambiente (mutaciones). El concepto de OVM en el marco del Convenio sobre la biodiversidad y el Protocolo de Cartagena refleja una percepción publica mas que un concepto científico.
  • 13. Transformación genética Cómo es que una planta transformada expresa un gen particular para ganar nuevas características?
  • 14. El ADN James Watson & Francis Crick 1953
  • 15. Transformación genética Tres pasos principales para transformar un organismo: 1. Aislar el pedazo de ADN de interés (gen) a partir de un genoma de un organismo 2. Ubicar el ADN aislado en un vector especial, produciendo un ADN recombinante 3. El Vector es luego usado para transferir el pedazo de ADN hacia el genoma de un segundo organismo (planta).
  • 16. Plásmido Bacteria -DNA extracromosómico -DNA circular, pequeño -Contiene pocos genes incluyendo los genes de resistencia a antibioticos Los plásmidos pueden replicarse por sí mismos y han sido modificados para servir como Vectores. Cromosoma bacteriano
  • 17. Transformación genética Uno de los varios sitios donde un gen foráneo puede ser insertado Gen para resistencia a antibioticos Un plásmido vector Origen de replicación - una secuencia particular de ADN que permite replicarse en una bacteria particular
  • 19. Aislamiento del gen Bt Gen del Bt Enzimas de Restricción DNA de Bacillus thuringiensis
  • 20. El ADN recombinante 5’ GTGCCGGTTGAATTCCGCGATCGTAAAC 3’ 3’ CACGGCCAACTTAAGGCGCTAGCATTTG 5’ EcoRI Corte con enzimas de restricciones ADN de plásmido CCGCGATCGTAAAC 3’ TTAAGGCGCTAGCATTTG 5’ 5’ GTGCCGGTTGAATT 3’ CACGGCCAAC Paul Berg 1972 ADN del virus SV40 5’ GTGCCGGTTGAATT 3’ CACGGCCAAC CCGCGATCGTAAAC 3’ TTAAGGCGCTAGCATTTG 5’ Re-unificación por enzima de ligación ADN recombinante 5’ GTGCCGGTTGAATTCCGCGATCGTAAAC 3’ 3’ CACGGCCAACTTAAGGCGCTAGCATTTG 5’
  • 21. Clonamiento en el plásmido vector Gen del Bt Plásmido
  • 22. Ligate the Bt-toxin gene into the plasmid DNA Plasmido Gen del Bt =DNA ligasa
  • 23. Transformación genética Un gen foráneo insertado Gen para resistencia a antibioticos Origen de replicación Un plásmido vector con un gen foraneo insertado (Un ADN recombinante) DNA Recombinante
  • 24. Move the plasmid + Bt-toxin DNA into E. coli Plásmido Gen del Bt E. Coli
  • 25. Inserción del gen en el genoma de la planta
  • 26. Tumor agalla de la corona
  • 27. Agrobacterium es: Š microorganism de suelo Š patogeno vegetal que causa la enfermedad agalla de la corona plantas leñosas
  • 28. Introducción de nuevos genes en plantas Se usa el proceso natural de transferencia de genes de una bacteria, Agrobacterium tumefaciens, a células vegetales.
  • 29. Plásmido Ti (pTi) Controla la Patogenicidad en Agrobacterium • T-DNA, es transferido al genome de la planta – genes inductor de Tumor (auxinas, citokininas) – genes de síntesis de Opinas • tra – conjugación bacteriana • Catabolismo de Opine • genes Vir pTI ~200 kb T-DNA tra catabolismo Opine genes vir ori
  • 30. Construcción del Vector ori T-DNA Eliminar genes catabolismo opinas Eliminar tra Eliminar genes auxina y citokininas vir genes
  • 31. El gen Secuencia promotor ATG Secuencia codificante de la proteína Secuencia terminador TAA Humano (1n) : 3,342,501,213 pb 26,000 genes Arroz (1n) 363,357,896 pb hasta 50,000 genes Tienen muchos genes en común.
  • 32. C Construc onstrucción ción de de Gen Gen Herramientas disponibles en el CIP: • Vectores de transformación de plantas : pBI121, pBin19, pMOG800 • Marcadores de selección de plantas transformadas •Elementos geneticos para expresion de genes customize : Coding sequence Promoters KmR PNos 3’Nos RB LB Sm Sm/Spec /Spec bla bla ori ori tet tet Terminator Signal sequence Ubi3 = constitutive (= 35s) GBSS = tuber β-amylase = root grp1.8 = xylem gst1, wun1, mas, … = stress-specific
  • 33. Kmr NPTII Gln 35-S promoter OCS pA pA7 (3.49Kb) Apr 35-S Promoter OCS pA Gln Apr pGln-3 (5.23Kb) p1Ax1 (10.9Kb) Apr Gln Apr pUC19 (2.68Kb) Apr Subcloning of PstI-SphI Deletion of HindIII fragment Fragment EcoRI-SphI Fragment SphI-MboI Ligation with pUC19 EcoRI-BamHI Fragment XbaI-PstI Fragments EcoRI-XbaI, and PstI-HindII Ligation with pMOG800 digested with EcoRI-HindII pGln-2 (6.5kb) pGln-1 (5.05kb) Apr pCIP10 pCIP10 Construcción del gen de Glutenina de trigo Investigación en la calidad de la hatina de camote
  • 34. Un ejemplo: la papa Bt Plantas in vitro ADN genómico vegetal Agrobacterium tumefaciens ADN de plásmido con el gen Bt
  • 35. Un ejemplo: la papa Bt Aislamiento de explantes de hojas Formación de heridas Infección del tejido herido por la bacteria
  • 36. Un ejemplo: la papa Bt
  • 37. Un ejemplo: la papa Bt
  • 38. Un ejemplo: la papa Bt Propagación de plántulas transgénicas ADN genómico vegetal con el gen Bt incorporado
  • 39. Un ejemplo: la papa Bt
  • 40. Un ejemplo: la papa Bt
  • 41. Un ejemplo: la papa Bt
  • 42. Un ejemplo: la papa Bt
  • 43. Un ejemplo: la papa Bt Resistencia a plaga del tubérculo (Polilla) Papa Bt Désirée Revolución Perricholi Y otras Estudio de la morfología Invernadero de bioseguridad, Lima Estudio en campo aislado Estación experimental CIP San Ramón
  • 44. Métodos de tansformación Embriogénesis somática Organogénesis directa
  • 45. Testar OVM • Pruebas de ELISA y PCR estan disponibles • Pruebas son sensibles y pueden ser rápidas, fáciles de usar y relativamente baratos • Cada pocillo puede ser una muestra
  • 46. Polymerase Polymerase Chain Reaction Chain Reaction SPECIMEN PREP AMPLIFICATION DETECTION 1 - 4 hours 1.5 - 3.5 hours 1 - 2 hours Courtesy Cepheid, Inc Reacción en Cadena de la Polimerasa o PCR Extracción ADN 4 horas 2.5 – 3.5 horas 1-2 horas AMPLIFICACION DETECCION
  • 48. PCR Inversa clonación DNA Secuenciamiento del ADN Localization in plant genome Ligación Digestión GenBank Southern blotting Amplificación PCR
  • 49. Presencia del gen Bt en el genoma de plantas transgénicas (Southern blot)
  • 50. Presencia del gen Bt en el genoma de plantas transgénicas (Southern blot)
  • 51. C LT-8 1 to 19 Bt- LT-8 20 Control • Cuantificación de Proteína LT-8 /Bt-1 /DST 24-2 5.64 LT-8 /Bt-1 /DST 24-3 2.50 LT-8 /Bt-1 /DST 34-1 1.99 LT-8 /Bt-1 /DST 34-2 4.86 LT-8 /Bt-1 /DST 34-3 6.26 LT-8 /Bt-1 /DST 34-5 3.55 Sangema /Bt-1 / DST 39-1 2.28 Sangema /Bt-1 / DST 39-2 1.94 Sangema /Bt-1 / DST 39-3 4.71 (2 rep. ng / mg soluble proteins) C 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 Presencia del gen Bt en el genoma de plantas transgénicas (Southern blot) y su expresion
  • 54. Transformación genética Métodos de transformación Biolística (21%)