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Conferencia No. 9
Ácidos Nucleicos:
Síntesis de ácidos nucleicos: DNA y
RNA. Polimerasas y sus
requerimientos. Maduración del RNA.
CDr.Armando Guerra Espinosa
Objetivo:
• Describir los mecanismos generales de la
expresión genética en los seres vivos, el papel
de los ácidos nucleicos y su relación con los
fenómenos de la herencia, transgénesis y
clonación.
ANTECEDENTES
•1953. - Sanger estableció la estructura completa de
una proteína: la Insulina.
- Crick y Watson demostraron que el DNA tenía
una estructura de doble hélice.
•1963. Nirenberg descifró la clave genética cuya
generalidad se aplicaba desde la bacteria hasta el
hombre.
•1967. Edman y Begg establecieron métodos de
degradación de proteínas. (Estructura primaria).
•1978. Dayhoff y Eck establecieron las estructuras
primarias de más de 500 proteínas (Atlas de proteínas).
•1976-1981. Gilbert y Maxan elaboraron un método
rápido de análisis del DNA.
•1981. Gilbert determinó la secuencia de más de 1 000
nucleótidos/semana y con un solo operador.
•1981. Alvarado-Urbina y otros, lograron sintetizar en
solo tres días un gen con una máquina.
•Se pudo conocer el papel que desempeña una
secuencia particular de nucleótidos en la regulación de
la síntesis del RNA y por lo tanto de una proteína.
ANTECEDENTES
Dogma central de la genética molecular
DNA
RNA
PROTEÍNAS
Transcripción
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Replicación
Enlaces
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ESTRUCTURA DEL ADN (Polinucleótido)
(Consultar libro electrónico de Acidos nucleicos)
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Pares de base
complementarias
REPLICACIÓN
Este proceso se divide en tres fases:
inicio, elongación y terminación.
El DNA presente en los cromosomas de los
organismos vivos debe ser duplicado durante la
división celular para asegurar que cada núcleo
descendiente reciba la información genética
completa.
La síntesis de las moléculas de DNA se
conoce como proceso de replicación.
Las fases se distinguen por las reacciones
que tienen lugar y por las enzimas que se
requieren.
Cada cadena de DNA en la doble hélice actúa
como un patrón (molde) sobre el cual nuevas
cadenas complementarias son sintetizadas.
La replicación del DNA da lugar a dos moléculas
"hijas" idénticas a la molécula progenitora del
DNA pero cada una de ellas contiene una cadena
intacta de su molécula progenitora y una
nuevamente sintetizada.
Este proceso se denomina entonces replicación
semiconservadora.
REPLICACIÓN
Después de iniciada la replicación en un
punto del DNA, ¿transcurrirá en una
dirección o en ambas?.
¿Se desenrrollarán totalmente las cadenas del
original (DNA) parental antes de que sea
replicada?.
¿Empezará la replicación en sitios al azar
o en punto único?.
La reacción empieza en una secuencia del DNA denominada origen, a partir
del cual se comienzan a separar las cadenas de la doble hélice formándose lo
que se denominan horquillas de replicación que es donde se desenrolla el
DNA parental y las cadenas separadas comienzan a replicarse rápidamente y
generalmente en forma bidireccional.
Origen de replicación
Origen de replicación
Cadenas hijas
formadas
ADN parental o madre
Las cadenas de DNA separadas son estabilizadas por
interacción con algunas proteínas denominadas de fijación
al DNA monohebra (SSBP) (single stranded DNA binding‑
proteins), conocidas como factor de replicación (RF).
DNA helicasa: Se trasladan a lo largo del DNA y van
separando las dos cadenas utilizando la energía
química del ATP (la separación de cada par de bases
involucra un gasto de dos moléculas de ATP).
La separación de las cadenas crea una tensión
topológica en la estructura helicoidal del DNA que se
elimina por la acción de las topoisomerasas, enzimas
que aumentan o disminuyen el grado de enrrollamiento
del DNA haciendo variar el número de enlace.
DNA polimerasas: Cataliza la formación de una nueva
cadena de DNA bajo la dirección de una cadena simple
que sirve como molde e incluye la unión de
desoxiribonucleótidos.
La ecuación general de la reacción catalizada por la DNA
polimerasa será:
             (dNMP)n
+ dNTP ‑‑‑‑‑‑> (dNMP)n+1
+ PPi
DNA molde DNA alargado
donde dNMP = desoxinucleósido 5' monofosfato‑
dNTP = desoxinucleósido 5 trifosfato.‑
REPLICACIÓN
DNA Polimerasa
Requiere de un molde Requiere de un cebador
Posee actividad exonucleasa 5’ 3’
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Cataliza la síntesis en dirección 5’ 3’
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Ácidos Nucleicos:
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Formación de moléculas de RNA a partir de la
información contenida permanentemente en el DNA.
En este proceso, un sistema enzimático convierte la
información genética de un segmento de DNA en una
cadena de RNA, con una secuencia de bases
complementaria a una de las cadenas de DNA.
Es muy similar a la replicación en términos de
mecanismo químico, polaridad (dirección de la síntesis)
y utilización de un molde.
El inicio de la síntesis tiene lugar en secuencias
específicas llamadas promotores que dirigen la
transcripción de segmentos adyacentes de DNA (genes).
Requiere los cuatro ribonucleósidos 5' trifosfatos (ATP,‑
GTP, UTP y CTP) como precursores de las unidades
nucleotídicas del RNA, así como Mg2+
y también
contiene Zn2+
.
La enzima capaz de formar un polímero de RNA a partir
de ribonucleósido 5' trifosfatos, la‑ RNA polimerasa
dirigida por DNA, fue aislada a partir de extractos
bacterianos en 1959.
La ecuación general de la reacción catalizada por la DNA
polimerasa será:
            (NMP)n
+ NTP ‑‑‑‑‑‑> (NMP)n+1
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RNA RNA alargado
 
donde NMP = nucleósido 5' monofosfato‑
TRANSCRIPCIÓN
RNA Polimerasa
Requiere de un molde
No se copia el cromosoma entero
NO requiere
cebador
SOLO UNA DE LAS CADENAS ACTUA COMO MOLDE
Cataliza la síntesis en dirección 5’ 3’
NO posee actividad exonucleasa 3’ 5’
Actividad correctora de pruebas
NO posee actividad exonucleasa 5’ 3’
Actividad de reparación del DNA
Una de las dos hebras de la doble cadena del DNA, se desenrolla
en una corta distancia formando una "burbuja" de transcripción.
En estos casos también actúan las topoisomerasas aliviando los
problemas topológicos causados por la transcripción.
Una de las dos cadenas sirve de molde para la síntesis del RNA,
la otra es la llamada hebra complementaria al molde.
La síntesis del RNA empieza normalmente con un residuo GTP o ATP,
cuyo grupo 5' trifosfato no es cortado para liberar pirofosfato (PPi)‑
sino que se mantiene intacto durante toda la transcripción.
La nueva cadena de RNA forma temporalmente apareamiento de bases
con el DNA molde formando una doble hélice de un híbrido RNA DNA‑
corto que es esencial para la lectura correcta de la hebra de DNA.
Sitio de terminación
de la transcripción
Sitio de inicio de
la transcripción
RNA polimerasa
….. Transcripción …..
• En el proceso de Transcripción, el primer producto de un gen es
una larga molécula de ácido ribonucleico (ARNm). Este ARNm está
formado por una simple cadena azúcar-fosfato. El azúcar en este
caso es la ribosa. Las bases nitrogenadas presentes son Adenina,
Uracilo, Guanina y Citosina.
• Respecto al ADN, el ARN tiene el azúcar ribosa en lugar del azúcar
desoxirribosa, y la base nitrogenada Uracilo en lugar de la base
nitrogenada Timina.
• Las instrucciones contenidas en el ADN son transferidas o pasadas
a la molécula de ARN, que será el mensajero de la información
(ARNm).
• Para formar la cadena de ARN a partir del ADN la molécula
helicoidal de ADN se desenrolla y deja presentada la cadena
paralela, y se inicia la síntesis de la cadena de ARN. Los
nucleótidos se unen uno por uno en orden complementario.
….. Transcripción …..
• De esta manera la Adenina del ADN se combina con el Uracilo del
ARN (A-U), la Timina se aparea con la Adenina (T-A) y la Citosina
se combina con la Guanina y viceversa (C-G, G-C). El principio de
complementariedad de las bases nitrogenadas está presente
también en este proceso.
• Ej. Hebra patrón de ADN: A-T-T-A-C-G-G-C-G-A-A-A
Hebra ARNm transcripta: U-A-A-U-G-C-C-G-C-U-U-U
El ARNm formado pasa a ser el portador de las instrucciones del
ADN que determinarán la secuencia de aminoácidos de una
proteína particular.

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  • 1. Conferencia No. 9 Ácidos Nucleicos: Síntesis de ácidos nucleicos: DNA y RNA. Polimerasas y sus requerimientos. Maduración del RNA. CDr.Armando Guerra Espinosa
  • 2. Objetivo: • Describir los mecanismos generales de la expresión genética en los seres vivos, el papel de los ácidos nucleicos y su relación con los fenómenos de la herencia, transgénesis y clonación.
  • 3. ANTECEDENTES •1953. - Sanger estableció la estructura completa de una proteína: la Insulina. - Crick y Watson demostraron que el DNA tenía una estructura de doble hélice. •1963. Nirenberg descifró la clave genética cuya generalidad se aplicaba desde la bacteria hasta el hombre. •1967. Edman y Begg establecieron métodos de degradación de proteínas. (Estructura primaria). •1978. Dayhoff y Eck establecieron las estructuras primarias de más de 500 proteínas (Atlas de proteínas).
  • 4. •1976-1981. Gilbert y Maxan elaboraron un método rápido de análisis del DNA. •1981. Gilbert determinó la secuencia de más de 1 000 nucleótidos/semana y con un solo operador. •1981. Alvarado-Urbina y otros, lograron sintetizar en solo tres días un gen con una máquina. •Se pudo conocer el papel que desempeña una secuencia particular de nucleótidos en la regulación de la síntesis del RNA y por lo tanto de una proteína. ANTECEDENTES
  • 5. Dogma central de la genética molecular DNA RNA PROTEÍNAS Transcripción Traducción Replicación
  • 6. Enlaces fosfodiésteres ESTRUCTURA DEL ADN (Polinucleótido) (Consultar libro electrónico de Acidos nucleicos)
  • 7. ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DEL ADN Pares de base complementarias
  • 8. REPLICACIÓN Este proceso se divide en tres fases: inicio, elongación y terminación. El DNA presente en los cromosomas de los organismos vivos debe ser duplicado durante la división celular para asegurar que cada núcleo descendiente reciba la información genética completa. La síntesis de las moléculas de DNA se conoce como proceso de replicación.
  • 9. Las fases se distinguen por las reacciones que tienen lugar y por las enzimas que se requieren. Cada cadena de DNA en la doble hélice actúa como un patrón (molde) sobre el cual nuevas cadenas complementarias son sintetizadas. La replicación del DNA da lugar a dos moléculas "hijas" idénticas a la molécula progenitora del DNA pero cada una de ellas contiene una cadena intacta de su molécula progenitora y una nuevamente sintetizada. Este proceso se denomina entonces replicación semiconservadora. REPLICACIÓN
  • 10. Después de iniciada la replicación en un punto del DNA, ¿transcurrirá en una dirección o en ambas?. ¿Se desenrrollarán totalmente las cadenas del original (DNA) parental antes de que sea replicada?. ¿Empezará la replicación en sitios al azar o en punto único?.
  • 11. La reacción empieza en una secuencia del DNA denominada origen, a partir del cual se comienzan a separar las cadenas de la doble hélice formándose lo que se denominan horquillas de replicación que es donde se desenrolla el DNA parental y las cadenas separadas comienzan a replicarse rápidamente y generalmente en forma bidireccional. Origen de replicación Origen de replicación Cadenas hijas formadas ADN parental o madre
  • 12. Las cadenas de DNA separadas son estabilizadas por interacción con algunas proteínas denominadas de fijación al DNA monohebra (SSBP) (single stranded DNA binding‑ proteins), conocidas como factor de replicación (RF). DNA helicasa: Se trasladan a lo largo del DNA y van separando las dos cadenas utilizando la energía química del ATP (la separación de cada par de bases involucra un gasto de dos moléculas de ATP). La separación de las cadenas crea una tensión topológica en la estructura helicoidal del DNA que se elimina por la acción de las topoisomerasas, enzimas que aumentan o disminuyen el grado de enrrollamiento del DNA haciendo variar el número de enlace.
  • 13. DNA polimerasas: Cataliza la formación de una nueva cadena de DNA bajo la dirección de una cadena simple que sirve como molde e incluye la unión de desoxiribonucleótidos. La ecuación general de la reacción catalizada por la DNA polimerasa será:              (dNMP)n + dNTP ‑‑‑‑‑‑> (dNMP)n+1 + PPi DNA molde DNA alargado donde dNMP = desoxinucleósido 5' monofosfato‑ dNTP = desoxinucleósido 5 trifosfato.‑
  • 14. REPLICACIÓN DNA Polimerasa Requiere de un molde Requiere de un cebador Posee actividad exonucleasa 5’ 3’ Actividad de reparación del DNA Cataliza la síntesis en dirección 5’ 3’ Posee actividad exonucleasa 3’ 5’ Actividad correctora de pruebas
  • 15. Cadena nueva Acople DNA polimerasa Molde de la cadena continua Helicasa Horquilla de replicación DNA parental Replicación del ADN LIgasa Polimerasa I Fragmento de Okasaki Primasa ARN primer Proteínas ligadas a ADN de cadena simple Molde de la cadena rezagada
  • 17. TRANSCRIPCIÓN Formación de moléculas de RNA a partir de la información contenida permanentemente en el DNA. En este proceso, un sistema enzimático convierte la información genética de un segmento de DNA en una cadena de RNA, con una secuencia de bases complementaria a una de las cadenas de DNA. Es muy similar a la replicación en términos de mecanismo químico, polaridad (dirección de la síntesis) y utilización de un molde. El inicio de la síntesis tiene lugar en secuencias específicas llamadas promotores que dirigen la transcripción de segmentos adyacentes de DNA (genes).
  • 18. Requiere los cuatro ribonucleósidos 5' trifosfatos (ATP,‑ GTP, UTP y CTP) como precursores de las unidades nucleotídicas del RNA, así como Mg2+ y también contiene Zn2+ . La enzima capaz de formar un polímero de RNA a partir de ribonucleósido 5' trifosfatos, la‑ RNA polimerasa dirigida por DNA, fue aislada a partir de extractos bacterianos en 1959. La ecuación general de la reacción catalizada por la DNA polimerasa será:             (NMP)n + NTP ‑‑‑‑‑‑> (NMP)n+1 + PPi RNA RNA alargado   donde NMP = nucleósido 5' monofosfato‑
  • 19. TRANSCRIPCIÓN RNA Polimerasa Requiere de un molde No se copia el cromosoma entero NO requiere cebador SOLO UNA DE LAS CADENAS ACTUA COMO MOLDE Cataliza la síntesis en dirección 5’ 3’ NO posee actividad exonucleasa 3’ 5’ Actividad correctora de pruebas NO posee actividad exonucleasa 5’ 3’ Actividad de reparación del DNA
  • 20. Una de las dos hebras de la doble cadena del DNA, se desenrolla en una corta distancia formando una "burbuja" de transcripción. En estos casos también actúan las topoisomerasas aliviando los problemas topológicos causados por la transcripción. Una de las dos cadenas sirve de molde para la síntesis del RNA, la otra es la llamada hebra complementaria al molde. La síntesis del RNA empieza normalmente con un residuo GTP o ATP, cuyo grupo 5' trifosfato no es cortado para liberar pirofosfato (PPi)‑ sino que se mantiene intacto durante toda la transcripción. La nueva cadena de RNA forma temporalmente apareamiento de bases con el DNA molde formando una doble hélice de un híbrido RNA DNA‑ corto que es esencial para la lectura correcta de la hebra de DNA.
  • 21. Sitio de terminación de la transcripción Sitio de inicio de la transcripción RNA polimerasa
  • 22.
  • 23. ….. Transcripción ….. • En el proceso de Transcripción, el primer producto de un gen es una larga molécula de ácido ribonucleico (ARNm). Este ARNm está formado por una simple cadena azúcar-fosfato. El azúcar en este caso es la ribosa. Las bases nitrogenadas presentes son Adenina, Uracilo, Guanina y Citosina. • Respecto al ADN, el ARN tiene el azúcar ribosa en lugar del azúcar desoxirribosa, y la base nitrogenada Uracilo en lugar de la base nitrogenada Timina. • Las instrucciones contenidas en el ADN son transferidas o pasadas a la molécula de ARN, que será el mensajero de la información (ARNm). • Para formar la cadena de ARN a partir del ADN la molécula helicoidal de ADN se desenrolla y deja presentada la cadena paralela, y se inicia la síntesis de la cadena de ARN. Los nucleótidos se unen uno por uno en orden complementario.
  • 24. ….. Transcripción ….. • De esta manera la Adenina del ADN se combina con el Uracilo del ARN (A-U), la Timina se aparea con la Adenina (T-A) y la Citosina se combina con la Guanina y viceversa (C-G, G-C). El principio de complementariedad de las bases nitrogenadas está presente también en este proceso. • Ej. Hebra patrón de ADN: A-T-T-A-C-G-G-C-G-A-A-A Hebra ARNm transcripta: U-A-A-U-G-C-C-G-C-U-U-U El ARNm formado pasa a ser el portador de las instrucciones del ADN que determinarán la secuencia de aminoácidos de una proteína particular.