El documento describe la biosíntesis de nucleótidos a través de dos vías: la vía de novo y la vía de salvamento. Explica los pasos de la síntesis de las bases pirimidínicas y púricas, incluyendo las enzimas y reacciones involucradas. También cubre la replicación del ADN, describiendo su mecanismo semiconservador y los procesos de iniciación, progresión y terminación de la replicación.
- Definición y clasificación de carbohidratos.
- Representación de la fórmula molecular general.
- Definición de monosacáridos.
- Clasificación de monosacáridos
- Ejemplos de estructuras lineales de monosacáridos.
- Derivados de monosacáridos
- Enantiómeros.
- Quiralidad
- Carbono anomérico.
- Proyecciones de los carbohidratos
- Isomería óptica
- Oligosacáridos
- Polisacáridos
- Oligosacáridos de importancia biológica
- Polisacáridos: clasificación y funciones
- Definición y clasificación de carbohidratos.
- Representación de la fórmula molecular general.
- Definición de monosacáridos.
- Clasificación de monosacáridos
- Ejemplos de estructuras lineales de monosacáridos.
- Derivados de monosacáridos
- Enantiómeros.
- Quiralidad
- Carbono anomérico.
- Proyecciones de los carbohidratos
- Isomería óptica
- Oligosacáridos
- Polisacáridos
- Oligosacáridos de importancia biológica
- Polisacáridos: clasificación y funciones
La mycoplasmosis aviar es una enfermedad contagiosa de las aves causada por bacterias del género Mycoplasma. Esencialmente, afecta a aves como pollos, pavos y otras aves de corral, causando importantes pérdidas económicas en la industria avícola debido a la disminución en la producción de huevos y carne, así como a la mortalidad.
7. hidrólisis
La hidrólisis de la glutamina se lleva a cabo en la cadena mas pequeña: el
catalizador de esta hidrólisis es un segundo componente polipeptídico de la
propia enzima carbamilfosfato sintetasa (CPS).
8. PRIMERA
FOSFORILACION
La fosforilación se lleva a cabo en la cadena mas grande ; dentro de la cual
existen 2 dominios de sujeción del ATP. Esta primera reacción acurre en el
centro activo del primer tercio de la cadena mas grande.
9. SEGUNDA
FOSFORILACION
El centro activo de esta reacción tiene lugar en un segundo dominio de
sujeción del ATP.
10. Los intermediarios se mueven entre los diferentes
centros o sitios activos mediante la canalización
evitando así la difusión y la hidrólisis.
Carbamilfosfa
to
sintetasa
11. Esta canalizacion cumple un doble pael:
1. los intermediaros que se generan en un centro activo se utilizan sin que
haya perdidas por difusion.
2. los intermediarios inestables como el carboxifosfato y el acido carabamico
(que a ph 7 se descomponen en menos de 1s) se protegen de la hidrólisis.
REACCION
2
Reacción catalizada por la aspartato transcarbamilasa
12. REACCION
3
Reacción catalizada por la dihidroorotasa, quien cicla la carbamilaspartato
formando un anillo de dihidroorotato.
13. REACCION
4
Reacción catalizada por la dihidroorotato deshidrogenasa; proceso de
oxidación a causa del
14. REACCION
5
En este punto, el orato se acopla a la ribosa
, en forma de 5 fosforribosil-1-pirofosfato
(PRPP); un forma activada de la ribosa que
acepta bases de nucleótidos. La enzima que
cataliza esta reacción es la fosforribosil
transferasa de pririmidinas.
15. REACCION
6
Orotidina monofosfato (OMP) Uridina monofosfato (UMP)
Proceso de descarboxilacion ; reacción catalizada por la orotidilato
descarboxilasa; sin esta enzima 1 reacción tendría lugar cada 78 millones de
año, por lo tanto su velocidad de reacción es veces mas rápida.
16. Los Nucleótidos Mono, Di Y Trifosfato Son Interconvertibles
Recordemos que los difosfatos y trifosfatos son
las únicas formas activas de los nucleótidos.
Primero: los nucleósidos monofosfato se
convierten en difosfato por medio de nucleósido
monofosfato quinasas específicas que utilizan
ATP COMO DADOR DE GRUPOS FOSFORILO.
Los nucleósidos difosfato y trifosfato son
interconvertibles gracias a la nucleosido
quinasa poco especifica a diferencia de las
monofosfato quinasas
17. La CTP Se Forma Mediante La Aminación Del UTP (CASO EXCEPCIONAL)
Una Vez Formada La
Uridina Trifosfato UTP
PROCESO DE
AMINACION
Citidina trifosfato
(CTP)
18. •A diferencia de las purinas,
las pirimidinas no se
sintetizan como nucleótidos.
•Primero se sintetiza el anillo
a partir de bicarbonato,
aspartato y amonio.
•Luego se une el PRPP.
•En primero lugar se sintetiza
el UTP, de derivan los otros
19. REDES DE CONTROL
Para la biosíntesis de
pirimidinas en (a) e.Coli y
(b) en animales. Los
octágonos rojos y círculos
verdes indican los puntos
de control . la inhibición por
retroalimentación se
representa mediante
flechas rojas discontinuas
y la activación con flechas
verdes discontinuas.
22. EL ANILLO DE PURINA SE ENSAMBLA MEDIANTE ETAPAS SUCESIVAS EN
LAS QUE LA ACTIVACION POR FOSFORILACION VA SEGUIDA DE UNA
FOSFORILACION
Y
SUSTITUCION
SUSTITUCION
Son 9 los pasos para biosintetizar el anillo de purina, los seis primeros son
homólogos a las reacciones de la carbamilfosfato sintetaza. Cada etapa
consiste en la activación por fosforilación de un átomo de oxigeno unido a
carbono (carbonilo) seguida de la sustitución del grupo fosforilo por amoniaco o
por un amino que actúa como un nucleofilo.
23. REACCION 1
(DESFOSFORILACION)
La glicina se activa por fosforilación y luego se une al amino de la
fosforribosilamina.
24. REACCION
2
El formiato se activa y se une al grupo amino para formar un formoglicinamida
ribonucleotido. La enzima Formiltetrahidrofolato transfiere el grupo formilo al
grupo amino del residuo de lisina.
25. REACCION
3
El grupo amida interno se activa por fosforilación y a continuación, se convierte en
una amidina mediante la adición de amoniaco procedente de la glutamina.
26. REACCION
4
La formilglicinamidina ribonucleotido,
experimenta una reacción intramolecular en la
que se forma un anillo imidazol de cinco
átomos de carbono.
27. REACCION
5
El bicarbonato se activa por fosforilación y a continuación, recibe el ataque del
grupo amino. El producto final se obtiene transfiriendo el grupo carboxilato al
anillo de imidazol.
28. REACCION
6
El grupo carboxilato del imidazol se fosforila
de nuevo y el grupo fosfato se reemplaza por
el grupo amino del aspartato.
30. LA ADICION DE UN
GRUPO FORMILO
Al atomo de nitrogeno unido al anillo imidazol se le añade el grupo formilo
procedente del
formiltetrahidrofolato.
31. PERDIDA DE AGUA
Reacción intramolecular en la que se pierde una molécula de agua; que genera al
inosinato (IMP).
32. Formación del
adenilato (AMP)
Adición de aspartato en carbono 6; y el
dador de grupos fosforilo es el GTP , La
enzima catalizadora es adenil succinato
sintasa
Eliminación de fumarato; que proporciona el
grupo amino. La enzima catalizadora es la
misma
Formación del
guanilato (GMP)
Proceso de oxidacion de inosinato a
xantilato, en presencia de NAD que actua
como receptor de H .
Incorporación del grupo amino al xantilato;
el xantilato se activa por el AMP del ATP.
Posteriormente el NH3 formado por
hidrólisis de la glutamina reemplaza al AMP.
33.
34. Las bases de purina liberadas durante la
degradación hidrolÍtica de ácidos nucleicos y
nucleótidos, pueden ser recuperadas y
recicladas
las vías de recuperación de purinas
disminuyen el gasto de energía.
la ausencia del procesos de
recuperación causa notables
efectos.
Las bases de purina libres, procedentes de
la degradacion de nucleotidos o de la dieta
se pueden unir al PRPP, Para formar
nucleosidos de purina monofosfato.
35. Las bases de purina se recuperan mediante 2
enzimas re recuperacion; primero:
La adenina fosforribosil transferasa cataliza la
formacion del adenilato:
Mientras que la hipoxantina-guanina fosforribosil
transferasa (HGPRT) cataliza la formación tanto del
guanilato (GMP), como del inosinato (IMP). UN
PRECURSOR DEL GUANILATO Y DEL ADENILATO.
36.
37. ENZIMA
RIBONUCLEOT
IDOREDUCTAS
A
R1: Formada por dos cadenas alfa . Esta
subunidad contiene el sitio activo;
formado por tres residuos de cisteína y
uno de glutamato, dos centros de control
alostérico y un par adicional de grupos
tiol activos redox, que interaccionan con
un cofactor reductor externo.
R2: Formada por dos cadenas beta.
Contiene un radical libre en un residuo
de tirosina que interviene en la
reacción, y un átomo de oxígeno que
forma un puente entre dos iones
férricos. Este centro de hierro dinuclear
estabiliza el radical libre.
TIENE 2
SUBUNIDADE
S
38. Reaccion1: comienza con la
transferencia de un electrón procedente
del residuo de cisteína de R1 al radical
tirosilo de R2. generando un radical
cisteintioilo muy reactivo.
Reaccion2: este radical sustrae un
átomo de H del C3 de la ribosa.
39. Reaccion3: el radical en
posición 3 provoca la liberación
del OH del C3 de la ribosa y del
H del residuo del 2do cisteína .
40. Reacción 4: luego se transfiere un ion hidruro
(con 2 electrones) desde el tercer residuo de
cisteína para completar la reducción del C2.
este residuo forma un puente disulfuro,
generando un radical en el C3.
Reacción 5: Este átomo del C3 recupera el H
que le fue sustraído por el 1er residuo de
cisteína. El ribonucleotido ya esta listo para
abandonar la enzima.
41. La R2 aporta 1e –
para reducir al
radical tioilo.
42.
43. • La timidilato
sintasa
cataliza la
adición de un
grupo metilo
al dUMP.
• La timilidato
sintasa promueve
la metilacion
añadiendo al anillo
de Dump un tiolato,
generando una
especie
nucleófilica.
• Seguidamen
te esta
especie
activada
forma un
enlace C-C .
44.
45.
46. El DNA es la biomolecula que es responsable del
almacenamiento y la transferencia de
información genética.
La estructura de la molécula de DNA se puede
describir como una doble hélice de dos hebras
de polidesoxirribonucleotidos que se forma por
apareamiento de bases complementarias.
47. La replicación de
DNA es
semiconservadora
Es decir cada
hebra del DNA
original se utiliza
como molde para
la sintesis de una
nueva hebra.
El nuevo DNA es
un hibrido; cada
nueva hebra
duplex esta
compuesta de una
hebra original y
otra de nueva
síntesis.
El mecanismo de la
replicación
semiconservadora
es universal.
49. El proceso de replicación no siempre es perfecto.
Compuestos químicos ajenos a la célula y
condiciones ambientales extremas pueden
ocasionar cambios químicos del DNA y su
secuencia.
En la célula existen enzimas especializadas en
reconocer los errores de la secuencia de bases
de DNA y catalizan la reparación de estas fallas.
Si se permitieran que se transcriban estas fallas
y se traduzca al RNA los productos tendrían
cambios en su secuencia de aminoácidos y
alteran las propiedades funcionales
50. En una molécula
de DNA circular ,
la replicación
comienza en un
punto discreto , el
origen,
Y procede en
ambas
direcciones, por lo
tanto, se copia
cada hebra de
polinucleotido.
En cada molécula
de DNA están
presentes dos
horquillas de
replicación.
Las horquillas
avanzan en
direcciones
contrarias y
terminan por
encontrarse al otro
lado de DNA
circular.
52. Existen varios lugares
de iniciación , esto da
lugar a varias burbujas
de replicación que
eventualmente forman
dos moléculas
separadas de DNA de
doble hebra.
53. Esta enzima fue aislada y
purificada en E. Coli. La reacción
general que cataliza esta enzima
es:
풅푵푻푷 + (풅푵푴푷)풏→ (풅푵푴푷)풏 + 푷푷풊
Para que la reacción proceda se
requiere de iones magnesio
( 푀푔2+ ), que forman complejos
con el nucleótido.
Figura 11.6
54. La presencia del «DNA preformado»,
que sirve para dos fines:
El DNA se utiliza como
molde del mensaje
que va ser copiado.
El DNA preformado
debe tener un
segmento cebador con
un grupo con un grupo
3´-hidroxilo libre.
55. El cebador proporciona el acceso para la unión
covalente del nucleótido entrante.
La DNA polimerasa I no puede comenzar a sintetizar
una nueva cadena de polinucleótido si no existiera el
cebador.
La reacción procede con un ataque nuclefilico del grupo
3´-hidroxilo libre del cebador sobre el nucleótido
entrante.
La elongación de la cadena se lleva a cabo en el
extremo 3´y la síntesis de DNA procede en
dirección 5´→ 3´
56. Estas enzimas tienen muchos de los requerimientos
de reacción de la DNA polimerasa I.
Actualmente se cree que la DNA polimerasa III es la
principal enzima de replicación por sus propiedades
como su mayor velocidad de polimerización.
Las DNA polimerasas I y II realizan funciones
corrigiendo y reparando errores en la replicación
La DNA polimerasa I es una 3´→5´ exonucleasa.
Además puede catalizar la hidrolisis de DNA
comenzando del extremo 5´ es decir es también una
5´→ 3´ exonucleasa.
57. DNA POLIMERASA I
Es una DNA
polimerasa
Es una 3´→5´
exonucleasa
Es una 5´→ 3´
exonucleasa
Tiene una sola cadena
de polipéptido. Tiene
tres funciones.
Figura
11.7
58. La DNA polimerasa solo cataliza la incorporación
continua de nucleótidos de la hebra de DNA
progenitora 3´→5´. La hebra que comienza a
crecer en la misma dirección que se desplaza la
horquilla se llama hebra conductora.
La hebra progenitora 5´→ 3´ se replica en cortos
fragmentos discontinuos(Fragmentos de
Okazaki). La hebra que comienza a crecer se
llama hebra retardada.
Estas dos hebras se elongan en direcciones
opuestas. Los fragmentos discontinuos de
Okazaki se une covalentemente en etapas
posteriores de la replicación.
61. La Helicasa reconoce y se
une al origen de replicación y
cataliza la separación de las
dos hebras de DNA
rompiendo los enlaces de
hidrogeno entre los pares de
bases.
La DNA girasa, una
topoisomerasa, ayuda a
desenrollar las hebras de
DNA induciendo el
superenrollamiento.
Las hebras únicas de DNA
quedan expuestas y son
estabilizadas y protegidas de
la ruptura hidrolitica de los
enlaces fosfodiester por las
proteínas de unión a hebra
sencilla (proteínas SSB)
las hebras del polinucleotido
ya separadas se utilizan
como moldes para la síntesis
de las hebras
complementarias
62. Para que actúen la DNA
polimerasa III y las otras
polimerasas se necesita un
cebador con un extremo 3´-
hidroxilo libre.
Como este no se encuentra en
la horquilla de replicación, la
síntesis de DNA no comienza
de inmediato. Necesita de un
cebador
Se sintetiza un fragmento corto
de RNA complementario al
DNA molde. La síntesis de RNA
es catalizada por la enzima
Primasa. Esta enzima también
inicia la síntesis de cada
fragmento de Okazaki.
Se sintetiza un fragmento corto
de RNA complementario al
DNA molde. La síntesis de RNA
es catalizada por la enzima
Primasa. Esta enzima también
inicia la síntesis de cada
fragmento de Okazaki.
63. Tras ser incorporados algunos
ribonucletidos, se procede a la
síntesis de DNA catalizada por DNA
polimerasa III desde el grupo 3´-
hidroxilo
En etapas posteriores el RNA
cebador es eliminado del DNA por
la accion de la 5´→ 3´ nucleasa de
la DNA polimerasa I.
Los pequeños huecos que quedan
se rellenan por la accion de la DNA
polimerasa I. esta puede meter
todas las bases de
desoxirribonucleotido que sean
necesarias para llenar los huecos.
Sin embargo el enlace fosfoester
final para cerrar lo dbe formar la
enzima DNA ligasa. Esta enzima
cataliza la formacion de un enlace
fosfoester , dependiente de ATP
entre en grupo hidroxilo libre de
extremo 3´de un fragmento y un
grupo fosfato del extremo 5´de otro
66. Estructura del ARN
El ARN está formado por una sola cadena de
nucleótidos.
Tiene la función de sintetizar proteínas a partir de
las instrucciones del ADN.
Hay 3 tipos de ARN: ARN mensajero (ARNm), ARN ribosomal
(ARNr), ARN de transferencia (ARNt)
67. Transcripción = síntesis de RNA.
En las bacterias
la transcripción y
la traducción
tienen lugar en el
citoplasma
bacteriano y al
mismo tiempo,
son simultáneas
En ambos casos
necesita:
- Una cadena de
DNA que actúe como
molde.
- Ribonucleótidos
trifosfato de A, G, C y
U.
- Cofactores y
reguladores
Proceso, se
realiza en
tres fases:
Iniciación,
elongación y
Terminación.
68. SINTESIS DE RNA-DNA DIRIGIDA
Este proceso constituye un evento central en la expresión de la
información genética.
Consiste en el copiado de la secuencia de la hebra con sentido de un gen
para formar un transcrito de RNA complementario que transcriba con
exactitud la información genética contenida en el DNA.
El proceso es catalizado por la RNA-Polimerasa dependiente de DNA,
enzima que se encuentra presente en todos los tipos celulares.
La bioquímica del proceso de transcripción es relativamente sencilla, pero
los mecanismos regulatorios que han sido desarrollados para el control de
la transcripción son complejos y muestran grandes variaciones.
69. En bacterias, existe solamente una RNA polimerasa
que es capaz de sintetizar todos los tipos de RNA, el
ribosomal, el de transferencia y los mensajeros.
En bacterias, con mucha frecuencia, los RNAm son
poligénicos o policistrónicos, de manera que un solo
RNAm contiene información para la síntesis de varios
polipéptidos distintos.
En eucariontes hay diferentes polimerasas
encargadas de sintetizar distintos tipos de RNA y el
RNAm es usualmente monogénico, solo transcribe la
información para un solo polipétido.
70. RNA Polimerasa este proceso constituye un evento central
en la expresión de la información genética.
Consiste en el copiado de la secuencia de la hebra con sentido de un
gene para formar un transcrito de RNA complementario que transcriba
con exactitud la información genética contenida en el DNA.
El proceso es catalizado por la RNA-Polimerasa dependiente de DNA,
enzima que se encuentra presente en todos los tipos celulares.
La bioquímica del proceso de transcripción es relativamente sencilla,
pero los mecanismos regulatorios que han sido desarrollados para el
control de la transcripción son complejos y muestran grandes
variaciones.
La enzima une entre sí los ribonucleótidostrifosfato ATP, CTP, GTP y UTP, utilizando
como molde secuencias específicas de DNA las cuales transcribe siguiendo el
principio de complementaridad: la A del DNA empareja con U del RNA, la G con C, la C
con G y la T con A
71. La RNA
polimerasa de
E. coli
• cataliza la síntesis de todas las clases de RNA y es un complejo polipeptídico
• La holoenzima (enzima completa) se compone de varias subunidades diferentes: α2,
β, β’, ω y σ.
• Después de que la polimerasa transcribe ~10 pares de bases, la subunidad σ es
liberada.
• La enzima activa o enzima central (α2, β, β’ y ω ) es la estructura que realmente lleva
a cabo el proceso de polimerización del RNA.
• Las subunidades β y β’ constituyen el sitio activo para polimerizar los ribonucleótidos
trifosfato (NTPs) de acuerdo a la hebra molde del DNA.
•
73. La fijación del factor σ a la parte central activa de la enzima es
transitoria y su presencia la hace capaz de seleccionar y unirse
tanto a la hebra correcta, como al molde correcto en la estructura
del DNA para iniciar la síntesis de RNA. Después de que la
polimerasa transcribe ~10 pares de bases, la subunidad σ es
liberada
74. tipos de secuencias génicas
El promotor: es la región
más próxima al inicio de
la transcripción y esta
formada por la secuencia
-25 TATA, -80CAAT y -
120 GC.
Los factores proteicos
de transcripción que se
unen al promotor,
conocidos como factores
basales, ayudan a la
RNA polimerasa a
colocarse en el sitio de
iniciación del gen.
Las secuencias
potenciadoras (enhancers):
situadas mucho más lejos,
entre -200 y -10000, a ellas
se unen los factores
activadores de la
transcripción, que cumplen
dos funciones:
Desempaquetar la
cromatina al disgregar los
nucleosomas, y consiguen
desenrollar la doble vuelta
del ADN.
Incrementar la velocidad de
transcripción.
Las secuencias
silenciadoras
(silencers): se
encuentran intercaladas
entre las activadoras y
a ellas se unen los
represores,
disminuyendo la
velocidad de
transcripción.
75.
76.
77.
78. La RNA polimerasa se desliza a lo largo del DNA hasta que encuentra la secuencia del
promotor.
Una vez que la enzima encuentra al promotor se produce, cerca de la caja de Pribnow,
el desenrollamiento de una corta región del DNA.
La transcripción empieza con la fijación del primer nucleótido trifosfato (usualmente
ATP o GTP) al complejo de la RNA polimerasa.
Entonces se produce un ataque nucleofílico del grupo 3'-OH del primer nucleótido
trifosfato sobre el segundo nucleótido trifosfato (posicionado por enlaces de hidrógeno
de acuerdo a la complementariedad con el DNA que sirve de molde) y se produce el
primer enlace fosfodiéster.
Cuando la secuencia de transcripción alcanza unos 10 nucleótidos, la conformación de
la RNA polimerasa cambia, el factor σ es liberado y la fase de iniciación termina.
RNA polimerasa ha iniciado la transcripción y ha dejado libre el sitio del promotor
79. Para iniciar la transcripción la RNA polimerasa se fija sobre el
DNA y se desliza sobre él buscando una secuencia de bases que
funcione como un promotor adecuado e indique el extremo 5’ de
una secuencia de bases del DNA donde debe iniciarse la
transcripción: a.El factor σ se fija a la secuencia 5’-TATAAT-3’,
llamada caja TATA, uniendo la holoenzima a tal sitio,
b.La actividad de la RNA pol desenrolla 17 pares de bases (pb)
del DNA para formar el Complejo de Preiniciación
c.La RNA Pol forma el primer enlace fosfodiéster entre los dos
primeros ribonucleótidos que se aparean satisfactoriamente,
iniciando la nueva cadena, sin la necesidad de un iniciador
d.Una vez que se han formado los primeros enlaces fosfodiéster
el factor σ se disocia, lo cual disminuye la afinidad de la
polimerasa por el promotor y facilita el progreso de la RNA Pol a
lo largo de la cadena del DNA sintetizando la cadena de RNA
80. Elongación
El alargamiento de la cadena de RNA se realiza mediante la
incorporación de nuevos ribonucleótidos complementarios a
la secuencia de bases del DNA.
La RNA pol, la porción de DNA cuyas hebras se han separado y la cadena
naciente de RNA forman la Burbuja de Transcripción que se desliza a lo
largo del DNA durante el proceso
b.Los ribonucleótidos son unidos a la cadena naciente de acuerdo a la ley
de complementariedad, con la excepción de que el uracilo se aparea con
la adenina del DNA en lugar de la timina
c.La enzima Topoisomerasa previene la ocurrencia de super-enrollamiento
tanto por delante, como por detrás del avance de la burbuja de
transcripción
d.La RNA pol no tiene actividad de nucleasa y por lo tanto no posee la
posibilidad de corregir los errores que se produzcan durante la
transcripción. De esto depende que la transcripción sea un proceso
mucho más sujeto a errores que la replicación.
81. Una vez que se libera el factor σ y la afinidad del complejo de la
polimerasa por el promotor disminuye, se inicia la fase de
elongación.
La RNA polimerasa fija algunas proteínas accesorias y se
convierte en un activo complejo de transcripción.
Según la síntesis procede en la dirección 5' —> 3‘
(downstream), el DNA se va desenrollando por delante de la
llamada “burbuja de transcripción” (el segmento en el cual el
DNA permanece desenrollado transitoriamente mientras
progresa el avance del Complejo Enzima-DNA-RNA transcrito)
La actividad desenrolladora de la RNA polimerasa produce
superenrollamiento por delante de la burbuja de transcripción y
subenrollamiento por detrás, que serán resueltos por la actividad
de la Toposiomerasa.
La incorporación de nucleótidos continuará hasta que la
actividad de la enzima encuentre una señal de final de la
transcripción.
82. Según la RNA polimerasa avanza, mantiene separadas
las dos hebras del DNA formando una “burbuja” de
transcripción característica que progresa al mismo
tiempo que la doble hélice del DNA se desenrolla
enfrente de ella y se vuelve a enrollar atrás.
Al mismo tiempo que avanza, la polimerasa proteje un
espacio, o huella, de cerca de 30 pb en la secuencia
del DNA contra el ataque por endonucleasas. Este
espacio, o huella, comprende tanto la burbuja de
transcripción como algo de la doble hélice del DNA en
ambos extrremos de la burbuja.
Dentro de la burbuja de transcripción una hebra del
DNA sirve como molde para la síntesis de RNA
complementario por apareamiento de bases.
83. El sitio catalítico de la polimerasa tiene un subsitio
fijador de sustratos en donde los nucleótidos trifosfato
entrantes (NTP) son fijados por la enzima y
seleccionados por su apareamiento complementario
con los nucleótidos en la hebra molde del DNA.
También tiene un subsitio fijador del producto, en el
cual está localizado el extremo 3’-OH del RNA en
crecimiento.
84. Durante la reacción de
crecimiento, se remueve un
pirofosfato del NTP sustrato y
se forma un enlace fosfodiéster
con el extremo 3’-OH del último
nucleótido incorporado a la
cadena de RNA. La
transcripción, como la
duplicación del DNA, procede
invariablemente en la dirección
5’ – 3’.
85. La adición de cada uno de los nuevos
nucleótido trifosfatos se acompaña de un
cambio en la posición del sitio activo de
la polimerasa que avanza una posición a
lo largo del molde de DNA.
La adición de cada uno de los
nuevos nucleótido trifosfatos se
acompaña de un cambio en la
posición del sitio activo de la
polimerasa que avanza una
posición a lo largo del molde de
DNA.
86. Este ciclo de aumento en la cadena de RNA
continúa de una manera progresiva de
manera que se forme una cadena de RNA
que responda fielmente a la regla de
complementariedad de bases con la hebra
molde del DNA.
El RNA transcrito en una señal palindrómica del DNA
produce un segmento inestable en forma de orquilla.
Aparentemente esta estructura produce que la
actividad de la polimerasa se interrumpa o se retarde
y se rompa parcialmente el híbrido RNA-DNA.
87. En este tipo, varios residuos de uridina (~6)
continúan la estructura de la orquilla. Puesto que
las interacciones U-A son débiles, estas cortas
secuencias de U-A en el híbrido promueven la
disociación del RNA recientemente transcrito de
su molde de DNA.
Terminación
independiente
de ρ (rho).
El factor ρ (una enzima que cataliza el
desenrollamiento de las dobles hélices RNA-DNA,
mediante la utilización de ATP) promueve
la disociación del complejo de la RNA polimerasa
y la separación del híbrido RNA-DNA.
Terminación
dependiente
de ρ
88. • El factor ρ se fija directamente al RNA y no a la RNA
polimerasa
TERMINACION
• La finalización del proceso de transcripción de una región
específica del DNA, se realiza cuando la RNA pol atraviesa
por donde existe una señal de terminación de la transcripción
Este proceso requiere con frecuencia de la actividad de
algunos factores llamados factores ρ (rho)
89.
90. RIFAMPICINA
INHIBIDORES DE UNA
TRANSCRIPCIÓN
• SE UNE CON LA SUBUNIDAD B DE LA
SUBUNIDAD RNA
POLIMERASABACTERIANA
ACTINOMICINAD
• INHIBE LA ELONGACION AL
INTERCALARSE EN EL DNA
ALFA AMINITINA
• ES UNA TOXINA DE SETAS VENENOSA
QUE INHIBE LA FORMACION DEL mRNA