ESTRUCTURA DE
  PROTEINAS
ALFONSO BETTIN, B.Sc, M.Sc.
        DOCENTE
  UNIVERSIDAD DEL SINU
LOS AMINOÁCIDOS
LOS AMINOÁCIDOS
 ESTRUCTURA TETRAÉDICA
AA
PRESENTES
  EN LAS
PROTEINAS
AMINOACIDOS ALIFATICOS


aa mas
pequeño
flexibilidad
estérica


                                        Hidrofobicidad
                                        Interior de la proteína
AMINOACIDOS AROMATICOS




HIDROFOBO        LIGERAMENTE POLARES
            •PUENTES DE H+
            •ACTIVIDAD ENZIMATICA
AMINOACIDOS POLARES NO CARGADOS



                                         PUENTES
                                         DISULFUROS
                                            HIDROFOBOS




MODERADAMENTE
POLAR
RIGIDES ESTERICA




                          HIDROFILICOS
AMINOACIDOS BASICOS                   AMINOACIDOS ACIDOS




                    EL MENOS BASICO
                    CAT. ENZIMAT. (H+)

CARGA + A pH FISIOLOGICO                 CARGA NETA (-) A pH FISIOLOGICO
MUY PLARES, SUPERFICE DE PROTEINAS       HIDRFILO S SUPERFICE DE PRTEIN
AMINOACIDOS MODIFICADOS

                    COLAGENO
                    MEMBRANA DE PLANTAS




                    ELASTINA
ESTRUCTURA PRIMARIA
               PÉPTIDOS Y ENLACE PEPTÍDICO
Los péptidos se forman por al unión de los aminoácidos (aa) mediante
enlaces covalentes de tipo amida llamados enlaces peptídico




                                                OLIGOPEPTIDOS ≤ 20 aa
                                                Polipeptidos > 20 aa




CELULA:
HIDRÓLISIS DE ATP (Aminoacil-tRNA)
ESTRUCTURA DEL ENLACE PEPTIDICO




  •CARÁCTER PARCIAL DE DOBLE ENLACE
  •RIGIDO (no hay rotación C – N )
  •PLANAR
CONFORMACIONES POSIBLES
ESTUDIO DE LA SECUENCIA PEPTIDICA
ESTUDIO DE LA SECUENCIA PEPTIDICA
ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DE LAS
          PROTEINAS




    PLEGAMIENTO LOCAL   PLEGAMIENTO DISTAL
    EN LA SECUCENCIA    EN LA SECUENCIA
ESTRUCTURAS SECUNDARIAS REGULARES




                            3,6 RESIDUOS /
                            VUELTA

                            1,5 Å ENTRE VUELTA
                            Y VUELTA
ESTABILIZACION DE LA HELICE α

ENLACES DE HIDROGENO PARALELOS
ENTRE EL O (C=O) Y EL H DE LA AMIDA
DEL 4° RESIDUO DELANTE DE A HELICE


INTERACCIONES ENTRE CADENAS LATERALES

• aa aromáticos próximos (3-4)
• aa pequeños o sin carga (Ala, Leu)
DISPOSICION EN LAMINA PLEGADA β U HOJA β

El esqueleto de la cadena polipeptídica se encuentra extendido Y
dispuesto en zig - zag
LAMINA β ANTIPARALELA
GIROS β




FORMAN UN GIRO CERRADO (180°)
SUPERFICIE DE LA PROTEINA
Función de proteínas

•Función estructural

•Funciones de transporte

•Función enzimática

•Fundón de protección

•Funciones de señalización
MODIFICACIONES DE PROTEINAS


•MODIFICACIONES POSTRADUCCIONALES
•MODIFICACIONES ANOMALAS
Enfermedad prionica
Enfermedad de Alzheimer (amieloide beta)
Anemia de células falciformes
PURIFICACION Y AISLAMIENTO DE PROTEINAS

                                                       homogenado
  Suspensión de cell
                       Ultrasonidos

                       Detergntes

                       Embolos rostorios




Fraccionamiento del homogenado por centrifugación diferencial
SEPARACION DE PROTEINAS
         1. CROMATOGRAFÍA EN COLUMNA
Las diferentes proteínas se retrasan según sus interacciones con la matriz de acuerdo
a su carga, hidrofobicidad, tamaño u unión a grupos Químicos
CROMATOGRAFÍA DE INTERCAMBIO IONICO
Las proteínas se separan de acuerdo a su
carga a un pH determinado
CROMATOGRAFÍA DE FILTRACION O EXCLUSION
                MOLECULAR

Las proteínas se separan de
acuerdo a su tamaño
CROMATOGRAFÍA DE
           AFINIDAD
Las proteínas se separan en función de la
especificidad de unión a un ligando.
Ligando: glucosa – proteína de unión.
Se eluyen agregando exceso de ligando libre
SEPARACION DE PROTEINAS
2. MÉTODOS ELECTROFORÉTICOS

                   ELECTROFORESIS SDS - PAGE
Separación de proteínas por electroforesis en
       Geles de poliacrilamida - SDS
ISOELECTROENFOQUE
Tipo de electroforesis en gel con anfolitos que crean un gradiente de ph.
Cada proteína migra hasta su punto isoeléctrico.
ELECTROFORESIS BIDIMENSIONAL

Clasae 1 estruct_ proteínas-2011-2

Notas del editor

  • #3 Los aminoácidos se caracterizan por poseer un grupo carboxilo (-COOH) y un grupo amino (-NH2). Las otras dos valencias del carbono se saturan con un átomo de H y con un grupo variable denominado radical R. Según éste se distinguen 20 tipos de aminoácidos.
  • #6 Interacciones hidrofobicas Matinina uno de los aa q tiene sulfuro tiene u grupo tioetser en su cadena lateral
  • #7 GRUPO FUNCINAL EN ALGUNAS ENZIMAS ABSORBEN LUZ UV A 280
  • #9 CADENA ALIFATIACA DE LA LISINA TIENE UN GRUPO AMINPO EN LA POSOICION EXILOM ARGININA _ TIENE UN GRUPO GUADININO CARGADO + HISTIDINA TIRNR U GRUPO IMIDAZOL
  • #11 El grupo alfha amio funciona como nuclefilo disociando elk grupo hydroxilo de l alfha caarboxi del otro aa por una clasica rx de condensacion
  • #14 1 FLURO 2, 4 DINITRO BENCENO
  • #17 LA INFORMACION Q CONTIENE LA SECUENCIS A DE AA DICTA EL MODO EN LA PROTEINA DSE PLIEGE EN SU ESTRCUTUA TRI DIMENSION LA CUAL A SU VE Z DETERMINA SU FUNCION
  • #21 Los grupos r sobresalen del uno y del otro lado