El documento presenta un protocolo experimental para estudiar la herencia de un carácter mutante en Drosophila. Se determinará si el carácter es dominante o recesivo, autosómico o ligado al sexo, y monogénico o poligénico. Se realizarán cruces genéticos F1 y se analizará la progenie para localizar el gen en el cromosoma y zona cromosómica. Se utilizará el simulador CGS para diseñar los cruces necesarios y analizar los resultados.
Proceso de admisiones en escuelas infantiles de Pamplona
Classic Genetics Simulator
1. Departament de Genética,
Microbiología y Estadística
Prácticas de Análisis
Genética
José
F.
Sanchez
Herrero
-‐
jfsanchezherrero@ub.edu
Joan
Ferrer
Obiol
-‐
jfo@;net.cat
3. Estudiar
la
herencia
de
una
caracterís;ca
mutante
en
Drosophila.
Determinar:
-‐ Si
el
carácter
es
dominante
o
recesivo
-‐ Autosómico
o
ligado
al
sexo
-‐ Monogénico
o
Poligénico
-‐ Si
monogénico:
-‐ En
qué
cromosoma?
-‐ En
qué
zona
cromosómica?
-‐ Estaba
previamente
descrito
este
gen?
Nuestro
carácter
de
interés
es:
Feno;po
su
(“sense
ulls”)
P2: Cruzamientos F1
4. Localización
1. ♀♀
esu
x
♂♂
vg
2. ♀♀
vg
x
♂♂
esu
Iden;ficación
1. ♀♀
esu
x
♂♂
Del
Pseudodominancia
2. ♀♀
esu
x
♂♂
su2
Complementación
cruzamiento
recíproco
P2: Cruzamientos F1
7. P3: Classic Genetics Simulator (CGS)
Objetivos:
- Diseñar los cruzamientos necesarios para estudiar la herencia de una o varios caracteres
- Interpretar los resultados de los cruzamientos
- Sintetizar y exponer los experimentos realizados y las conclusiones
www.cgslab.com
10. P3: Classic Genetics Simulator (CGS)
Población salvaje ratones:
- Dos caracteres: Pelaje/Tamaño
Objetivos:
- Determinar modo de herencia
- Determinar si se heredan de forma independiente
15. Línea
salvaje
Línea Pura:
Carácter 1
“n” cruces
“n” cruces
Línea Pura:
Carácter 2
Análisis Independiente
Dominante/Recesivo
Ligado a sexo o autosómico
Monogénico/Poligénico
Ligamiento
16. Línea
salvaje
Línea Pura:
Carácter 1
“n” cruces
“n” cruces
Línea Pura:
Carácter 2
Análisis Independiente
Dominante/Recesivo
Ligado a sexo o autosómico
Monogénico/Poligénico
Ligamiento
Dominante/Recesivo
Ligado a sexo o autosómico
Monogénico/Poligénico
Ligamiento
17. Línea
salvaje
Línea Pura:
Carácter 1
“n” cruces
“n” cruces
Línea Pura:
Carácter 2
Análisis Independiente
Dominante/Recesivo
Ligado a sexo o autosómico
Monogénico/Poligénico
Ligamiento
Dominante/Recesivo
Ligado a sexo o autosómico
Monogénico/Poligénico
Ligamiento
Análisis
Ligamiento
22. Análisis
Estadís;co
• Queremos
saber
si
nuestra
distribución
propuesta
es
correcta.
• Dos
opciones:
–
Distribución
Chi2
–
p-‐valor
23. Análisis
Estadís;co
• Distribución
Chi2
En
estadís;ca,
la
distribución
de
Pearson,
llamada
también
ji
cuadrada(o)
o
chi
cuadrado(a)
(χ²),
es
una
distribución
de
probabilidad
con;nua
con
un
parámetro
“k”
que
representa
los
grados
de
libertad
de
la
variable
aleatoria
Grados libertad == Caracteres (color pelo; tamaño; etc…)
30. Análisis
Estadís;co
• Distribución
Chi2
• Si:
X2
calc.
>
X2
tabla
::
Rechazamos
H0;
Aceptamos
H1
Valor X2 tabla: 3,841 Valor X2 calculado: 0,14
31. Análisis
Estadís;co
• Distribución
Chi2
• Si:
X2
calc.
>
X2
tabla
::
Rechazamos
H0;
Aceptamos
H1
X2
calc.
<
X2
tabla
::
Rechazamos
H1;
Aceptamos
H0
Valor X2 tabla: 3,841 Valor X2 calculado: 0,14
32. Análisis
Estadís;co
Valor X2 tabla: 3,841Valor X2 calculado: 0,14
H0: Los valores observados son iguales a los esperados
H1: H0 es falsa.
<
33. Análisis
Estadís;co
Valor X2 tabla: 3,841Valor X2 calculado: 0,14
H0: Los valores observados son iguales a los esperados
H1: H0 es falsa.
< à Aceptamos H0
34. Análisis
Estadís;co
Valor X2 tabla: 3,841Valor X2 calculado: 0,14
H0: Los valores observados son iguales a los esperados
H1: H0 es falsa.
< à Aceptamos H0
35. Análisis
Estadís;co
Valor X2 tabla: 3,841Valor X2 calculado: 0,14
H0: Los valores observados son iguales a los esperados
H1: H0 es falsa.
< à Aceptamos H0
Carácter Tamaño:
Alelo Dominante: Grande
Alelo Recesivo: Pequeño
36. Análisis
Estadís;co
• P-‐valor
Se
define
como
la
probabilidad
de
obtener
un
resultado
al
menos
tan
extremo
como
el
que
realmente
se
ha
obtenido
suponiendo
que
la
hipótesis
nula
es
cierta,
en
términos
de
probabilidad
condicional.
Rechazaremos
la
H0
si
el
valor
p
es
igual
o
menor
que
el
nivel
de
significación
establecido.
Convencionalmente
0,05
ó
0,01.
pvalor
<
nivel
significación
::
Rechazamos
H0
pvalor
>
nivel
significación
::
Aceptamos
H0
45. Ejercicio
• Determinar
modo
herencia:
Color
pelaje
• Determinar
si
existe
ligamiento
AaBb
x
AaBb
H0: Los valores observados son iguales a los esperados. No hay ligamiento
H1: H0 es falsa.
49. Asignación
Problemas
• Ejercicios
1-‐8
• Grupos
3-‐4
personas
• 10
minutos:
9-‐10
diaposi;vas
• Estructura:
– Introducción
– Material
y
métodos
– Resultados
y
discusión
Mas
información
en
el
guión
(Pág.
22-‐27)
50. Asignación
Problemas
• Presentación:
10
Mayo
2017
(Aula
19)
– Enviar
diaposi;vas
email:
8
Mayo
– Dudas:
contacto
via
email
o
en
clase
• Launch
CGS:
– ID:
barcelona
– Password:
grup_tc
– Modo:
Group