Este documento proporciona una guía de 30 minutos sobre el uso avanzado de PubMed. Explica las funciones básicas de búsqueda en PubMed como la búsqueda simple, con límites y avanzada. También describe el uso de descriptores MeSH para realizar búsquedas más rigurosas, y las funciones de My NCBI como guardar búsquedas y colecciones de artículos. Por último, explica cómo capturar y exportar resultados de búsquedas.

1. Guía de uso avanzadoGuía de uso avanzado
Duración del tutorial: 30’
22/11/2010

2. ¿Qué es?
PUBMEDPUBMED permite el acceso gratuito a bases de
dades bibliográficas de ciencias de la salud como
MEDLINEMEDLINE, de la National Library of Medicine de los
Estados Unidos.
MEDLINEMEDLINE está formado por unos 17 millones de17 millones de
referenciasreferencias de artículos de revistas publicadas
desde 1948desde 1948 hasta la actualidad, el 92% en inglés.el 92% en inglés.
My NCBIMy NCBI Permite personalizar el uso de PUBMED
grabando perfiles de interés y agregar alertasalertas a
nuestro correo-e para seguir temas actuales.

3. Búsqueda simpleBúsqueda simple

4. Autocompletado
Cuando escribimos en el cuadro de
búsqueda el sistema nos sugiere
múltiples propostas de autoescritura.autoescritura.
Elegimos la que más se ajusta con el
puntero.

5. Búsqueda simple de un tema / 1
Introducimos el térrmino o la frase en el cuadro de búsqueda y
presionamos SEARCHSEARCH

6. Búsqueda simple de un tema / 2
PubMed traducirá de forma automáticatraducirá de forma automática nuestro planteamiento en los
descriptores por los cuales se indizaría formalmente el artículo y en
otras etiquetas, en todos los sinónimos asociados (Entry term
mappings), los autores, los títulos de las revistas, etc.

7. Búsqueda simple de un tema / 3
El botón URL nos permite generar un localizadorlocalizador
de internet para poder guardarlo y reproducir
una búsqueda idéntica en el futuro:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%28%22silicosis%22[MeSH%20Terms]%20OR%20%22silicosis
%22[All%20Fields]%29%20AND%20%28%22lung%20neoplasms%22[MeSH%20Terms]%20OR
%20%28%22lung%22[All%20Fields]%20AND%20%22neoplasms%22[All%20Fields]%29%20OR%20%22lung
%20neoplasms%22[All%20Fields]%20OR%20%28%22lung%22[All%20Fields]%20AND%20%22cancer
%22[All%20Fields]%29%20OR%20%22lung%20cancer%22[All%20Fields]%29&cmd=DetailsSearch

8. Búsqueda simple de un tema / 4
Podemos usar operadores lógicos (AND, OR, NOT),operadores lógicos (AND, OR, NOT), en
mayúscules siempre, para orientar la búsqueda:
percutaneous transluminal angioplasty AND (renal OR kidney)

9. Búsqueda con límites / 1
PubMed prevé la
búsqueda de artículos
usando límiteslímites que son
muy habituales.habituales.

10. Búsqueda con límites / 2
La búsqueda de artículos
puede limitarselimitarse a un
género, una lengua, una
franja de edat, un sector
de publicaciones, una
especie, etc.
En esta búsqueda con
límites buscamos el
término gonarthrosis en
las revistas CoreCore (son
120 revistas del total,
unas 5.500)

11. Búsqueda avanzadaBúsqueda avanzada

12. Campos de Pubmed
Campos
característicos
de PubMed
Los registros de Pubmed están formados porLos registros de Pubmed están formados por
unosunos campos característicos que sonque son
directamente interrogables.directamente interrogables.

13. Búsqueda avanzada
• Búsqueda por autores, revistas,
etc. (campos concretoscampos concretos)
• Búsqueda a través de los
descriptores MeSHMeSH (MeMedical
SSubject HHeadings)

14. Search Builder / 1
En la ventana de Search builderSearch builder
podemos obtener con el
desplegable todos los nombres
de los campos y consultar el
IndexIndex de cada campo.

15. Search Builder / 2
El IndexIndex se abre por la palabra o
frase más aproximada a la frase
que escribimos en el SearchSearch
BuilderBuilder

16. Search Builder / 3
Tal y como vamos encontrando etiquetas con el Search
Builder y el índice las podemos ir incorporando con el
botón en la ventana de búsqueda
(Search Box), donde se combinan:

17. Resultados

18. MeMedical SSubject HHeadings (MeSHMeSH) / 1
Una búsqueda a través de los descriptores MeSHdescriptores MeSH
nos permite capturar información de manera:
a) más consistente,
b) más metódica; y,
c) más rigurosa.

19. MeMedical SSubject HHeadings (MeSHMeSH) / 2
1) Introducimos el término pathologic fracture en el
cuadro de interrogación,
2) MeSH traduce automáticamente pathologic
fracture al descriptor Fractures,
spontaneous,
3) Nos permite limitar la búsqueda p.e. a los artícules
enfocados en la rehabilitación, i
4) Ambos elementos se combinan en el menú
desplegable por la opción “Search Box with AND”

20. Resultados

21. VisualizaciónVisualización
de resultadosde resultados

22. Visualización de resultados / 1
Artículos del
dominio públic (2)

23. Visualización de resultats / 2
El Hospital está
subscrito
Se obtiene el
texto
completo
clicando el
logo del
Hospital

24. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?holding=ieshvadhlib
Este enlaceEste enlace para acceder a
Pubmed nos identifica como
usuarios de la Bibliotecausuarios de la Biblioteca.
Cuando vemos un registro de
Pubmed nos indica si tenemos
acceso mostrando el logo dellogo del
Hospital.Hospital.

25. Visualización de resultados / 3
Vista “Abstract”
Texto complet
Captura de
registros

26. My NCBIMy NCBI

27. ¿Qué es My NCBIMy NCBI?
El instrumentoEl instrumento My NCBIMy NCBI enen
PubMed permite registrarse yPubMed permite registrarse y
asíasí retenerretener la informaciónla información
recogida por un usuario y susrecogida por un usuario y sus
preferencias.preferencias.

28. Registro en My NCBIRegistro en My NCBI
Podemos abrir gratuitamente una cuenta en
My NCBIMy NCBI o bien usar p.e. la de Google o
Gmail

29. FunciónFunción CollectionsCollections / 1/ 1
Cuando queremos guardar un conjunto de registrosguardar un conjunto de registros
bibliográficos en PubMed podemos hacerlo con la
función Clipboard,función Clipboard, que solo nos deja retener hasta
500 registros i solo se conservan si no estamos
inactivos 8 horas seguidas.
La función Collectionsfunción Collections es por el contrario para
usuarios que se han registrado a My NCBI y
permite conservar hasta 5000 registros
indefinidamente, y además compartirlos.

30. FunciónFunción CollectionsCollections / 2/ 2
Podemos compartir una coleccióncompartir una colección de
registros configurándola como “pública” y
proporcionando la URLla URL o enlace directo a
colaboradores nuestros.

31. FunciónFunción Save search / 1Save search / 1
Tener una cuenta en My NCBIMy NCBI también nos permite
grabar una búsqueda (su estrategia) para poderla
ejecutar en el futuro.

32. FunciónFunción Save search / 2Save search / 2
La función Save SearchSave Search genera un
formulario donde podemos inscribir nuestras
preferencias para recibir continuadamente
los resultados que se vayan incorporando a
PubMed sobre nuestro tema en un correu-ecorreu-e
personal.personal.

33. FunciónFunción My Bibliography /1My Bibliography /1
Por último, otra función de My NCBIMy NCBI útil es MyMy
BibliographyBibliography, diseñada específicamente para
guardar registros de un autor y editarlos en listas

34. FunciónFunción My Bibliography /2My Bibliography /2
Botones de edición de My BibliographyMy Bibliography

35. CapturaCaptura
de registrosde registros

36. Podemos capturar los resultados de la búsqueda,
sea a partir de la lista total, sea haciendo una
selección de la lista marcando los botones de
selección

37. Cuando enviamos registros a una dirección
de correu-e no podemos enviar más de
200 registros por mensaje, pero se pueden
enviar fraccionados.

38. Importar registrosImportar registros
aa

39. Podemos importar un archivo extraído de Pubmed
Con el registro o registros seleccionados desplegamos
SEND TOSEND TO, escogemos la opción FILEFILE y el formato MEDLINEMEDLINE

40. Desde el submenú IMPORT REFERENCESIMPORT REFERENCES de EndNoteWeb
podemos subir el archivo generado por la búsqueda
anterior (pubmed_result.txt) aplicando el filtre PUBMEDfiltre PUBMED
(NLM)(NLM)

41. Registro en detalle
Registro en la lista

42. Guia d’us completa de EndnoteWebEndnoteWeb

43. Importar registrosImportar registros
aa

44. El icono de documento en la barra de las direcciones nos
indica que ZoteroZotero ha detectado los “metadatos” de un
artículo en PubmedPubmed

45. 1) Abrimos Zotero activando su botón en la barra.
2) En la columna izquierda activamos la carpeta donde queremos grabar un registro.
3) Clicamos el icono que aparece en la barra de direcciones para incorporarlo. 1
2
3

46. Guía de uso completa de Zotero

47. Otras funcionesOtras funciones

48. Enlace permanente a un artículoEnlace permanente a un artículo
Una forma de crear un enlace permanente a un
registro es con un URL que contenga la expresión
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ y el número
PMID. P.e.:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19010894

49. FunciónFunción ImagesImages
En octubre de 2010
PubMed ha incorporado
imágenes en los
artículos que pertenecen
a las publicaciones de
Pubmed Central, de libre
acceso

50. Agregadores RSSAgregadores RSS
PubMed ofrece diversos canales RSS para obtener
fácilmente informació continuada sobre un tema, etc.
Más información en la
Guía de uso de RSS

51. Elaborado por: Marta-R. Domínguez Senra (mrdoming@vhebron.net)