La microbiología estudia los microorganismos como bacterias y hongos. En 1676, Anton van Leeuwenhoek observó pequeñas criaturas llamadas animáculos usando un microscopio primitivo. Louis Pasteur estableció que los microorganismos no se generan espontáneamente sino que se reproducen. Robert Koch perfeccionó métodos como frotis de bacterias teñidas y usó el microscopio de Abbe, estableciendo también los Postulados de Koch para vincular microbios a enfermedades.