El documento presenta los resultados de un análisis de secuencia del gen 16S utilizando diferentes programas como BIOEDIT, BLAST y Excel. Se analizaron 71 muestras de cromatogramas y se identificaron diversas bacterias. La mayoría de las secuencias (60.6%) tuvieron una calidad regular. El análisis permitió identificar diferentes organismos bacterianos y sus porcentajes de identidad.
Practica 1 analisis de secuencias del gen 16 sjuancarlos74381
El documento presenta un análisis de secuencias del gen 16S utilizando el programa BioEdit. Se describen las herramientas BioEdit y NCBI que permiten editar alineamientos y analizar secuencias. Los resultados muestran que la mayoría de las secuencias analizadas correspondían a bacterias como Klebsiella, Enterobacter y Pseudomonas, determinadas mediante comparación con la base de datos de NCBI utilizando un porcentaje de identidad mayor al 70%.
Alineamiento de secuencias de adn y generación deMariaArrazola3
Este documento describe el proceso de alineamiento de secuencias de ADN y generación de un árbol filogenético utilizando el programa MEGA. Se alinearon 15 secuencias del gen nifH utilizando MUSCLE y se construyó un árbol filogenético que muestra dos grupos principales, uno formado por Mesorhizobium albiziae y Mesorhizobium septentrionale con una cercanía del 100% y otro formado por Azospirillum brasilense y Azospirillum formosense también con una cercanía del 100%.
Practica n°03 de simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el...RuthApaza8
PRÁCTICA DE SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA UTILIZANDO EL PROGRAMA SNAP GENECON DATOS DEL ARTICULO CIENTIFICO "AISLAMIENTO DE BACTERIAS CON POTENCIAL BIORREMEDIADOR Y ANALISIS DE COMUNIDADES BACTERIANAS DE ZONA IMPACTADA POR PETROLEO EN CONDORCANQUI - AMAZONAS - PERÚ.
Práctica de simulación de electroforesis en gel de agarosaEmilyCusilayme
Este documento describe una práctica de simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene con datos de un artículo científico. El objetivo era identificar las secuencias de bacterias en agua y suelo contaminados por petróleo. Se copiaron códigos de acceso de NCBI, se guardaron las secuencias en formato FASTA y se abrieron en SnapGene para visualizar los mapas genéticos lineales y circulares. Finalmente, se concluyó que la metagenómica es una herramienta útil
Bioinformatica calidad y alineamiento de secuencia de adn y generacion de a...leticiamorales38
Este documento describe un análisis bioinformático de 11 secuencias de ADN utilizando el programa BioEdit. Primero, se evalúa la calidad de las secuencias mediante la observación de los picos cromatográficos y la presencia de nucleótidos desconocidos. Luego, se usa la herramienta BLAST en la página NCBI para determinar a qué ser vivo pertenece cada secuencia comparándolas con las bases de datos. Finalmente, se genera un árbol filogenético utilizando el programa MEGA X para mostrar las rel
Informe de practica de analisis del gen 16 sGustavoSanti3
Este documento presenta los resultados de un análisis de secuencias del gen 16S utilizando los programas BIOEDIT y BLAST. Se analizaron varias secuencias y la mayoría tuvieron una calidad regular, aunque algunas fueron de buena o mala calidad. Usando estas herramientas, se pudo determinar de qué organismo provenía cada secuencia en base a su tamaño, porcentaje de identidad y organismos similares encontrados. El documento concluye que estas herramientas son útiles para el análisis de secuencias y que esta pr
Este documento describe el uso de los programas Mega X y NCBI para analizar 30 muestras de ADN. Se realizó la secuenciación de ADN usando Mega X, se alinearon las secuencias y se creó un árbol genealógico que mostró la relación entre las bacterias muestreadas. El documento explica los objetivos, marco teórico, materiales, métodos y conclusiones del análisis de ADN llevado a cabo.
Practica 1 analisis de secuencias del gen 16 sjuancarlos74381
El documento presenta un análisis de secuencias del gen 16S utilizando el programa BioEdit. Se describen las herramientas BioEdit y NCBI que permiten editar alineamientos y analizar secuencias. Los resultados muestran que la mayoría de las secuencias analizadas correspondían a bacterias como Klebsiella, Enterobacter y Pseudomonas, determinadas mediante comparación con la base de datos de NCBI utilizando un porcentaje de identidad mayor al 70%.
Alineamiento de secuencias de adn y generación deMariaArrazola3
Este documento describe el proceso de alineamiento de secuencias de ADN y generación de un árbol filogenético utilizando el programa MEGA. Se alinearon 15 secuencias del gen nifH utilizando MUSCLE y se construyó un árbol filogenético que muestra dos grupos principales, uno formado por Mesorhizobium albiziae y Mesorhizobium septentrionale con una cercanía del 100% y otro formado por Azospirillum brasilense y Azospirillum formosense también con una cercanía del 100%.
Practica n°03 de simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el...RuthApaza8
PRÁCTICA DE SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA UTILIZANDO EL PROGRAMA SNAP GENECON DATOS DEL ARTICULO CIENTIFICO "AISLAMIENTO DE BACTERIAS CON POTENCIAL BIORREMEDIADOR Y ANALISIS DE COMUNIDADES BACTERIANAS DE ZONA IMPACTADA POR PETROLEO EN CONDORCANQUI - AMAZONAS - PERÚ.
Práctica de simulación de electroforesis en gel de agarosaEmilyCusilayme
Este documento describe una práctica de simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene con datos de un artículo científico. El objetivo era identificar las secuencias de bacterias en agua y suelo contaminados por petróleo. Se copiaron códigos de acceso de NCBI, se guardaron las secuencias en formato FASTA y se abrieron en SnapGene para visualizar los mapas genéticos lineales y circulares. Finalmente, se concluyó que la metagenómica es una herramienta útil
Bioinformatica calidad y alineamiento de secuencia de adn y generacion de a...leticiamorales38
Este documento describe un análisis bioinformático de 11 secuencias de ADN utilizando el programa BioEdit. Primero, se evalúa la calidad de las secuencias mediante la observación de los picos cromatográficos y la presencia de nucleótidos desconocidos. Luego, se usa la herramienta BLAST en la página NCBI para determinar a qué ser vivo pertenece cada secuencia comparándolas con las bases de datos. Finalmente, se genera un árbol filogenético utilizando el programa MEGA X para mostrar las rel
Informe de practica de analisis del gen 16 sGustavoSanti3
Este documento presenta los resultados de un análisis de secuencias del gen 16S utilizando los programas BIOEDIT y BLAST. Se analizaron varias secuencias y la mayoría tuvieron una calidad regular, aunque algunas fueron de buena o mala calidad. Usando estas herramientas, se pudo determinar de qué organismo provenía cada secuencia en base a su tamaño, porcentaje de identidad y organismos similares encontrados. El documento concluye que estas herramientas son útiles para el análisis de secuencias y que esta pr
Este documento describe el uso de los programas Mega X y NCBI para analizar 30 muestras de ADN. Se realizó la secuenciación de ADN usando Mega X, se alinearon las secuencias y se creó un árbol genealógico que mostró la relación entre las bacterias muestreadas. El documento explica los objetivos, marco teórico, materiales, métodos y conclusiones del análisis de ADN llevado a cabo.
La biotecnología moderna implica la manipulación del ADN mediante ingeniería genética. Esta permite insertar genes de un organismo en otro y crear organismos transgénicos. Técnicas como la tecnología del ADN recombinante, la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y la secuenciación han permitido aplicaciones como la terapia génica y el diagnóstico molecular de enfermedades.
Este documento describe el uso del software MEGA X para generar un árbol filogenético de 15 secuencias de ADN del gen niFH. Se explica el procedimiento de alineamiento de las secuencias y construcción del árbol, el cual muestra las relaciones evolutivas entre las especies. El resultado proporciona información sobre las similitudes y diferencias entre los genes analizados.
El documento presenta los resultados de un análisis de secuencia del gen 16S utilizando los programas BioEdit, BLAST y Excel. Se analizaron 3 muestras de ADN y se identificó el tamaño de la secuencia, el organismo y el porcentaje de identidad para cada muestra utilizando las herramientas BioEdit, BLAST y una tabla en Excel.
El Instituto de Biotecnología e Ingeniería Genética (IBIG) de la UNCP está desarrollando un proyecto con el Fondo Internacional de Ciencia y Tecnología (FINCyT) para caracterizar bacterias benéficas en suelos agrícolas utilizando marcadores moleculares de ADN como la electroforesis de geles en gradientes de denaturalización (DGGE). El proyecto busca mejorar la calidad de los suelos y la producción de cultivos como la papa y el maíz en la región.
El documento describe las tecnologías computacionales utilizadas para el análisis de secuencias de ADN. Explica que los grandes volúmenes de datos de ADN requieren métodos avanzados de modelado de datos y procesamiento. Describe algunas técnicas como las bases de datos biológicas, la minería de datos y las máquinas de aprendizaje que pueden utilizarse para optimizar el análisis de secuencias de ADN. Finalmente, discute cómo estas tecnologías pueden servir como base para el desarrollo de her
Este documento describe la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene con datos de un artículo científico sobre el aislamiento de bacterias con potencial biorremediador. El objetivo general fue realizar la simulación, mientras que los objetivos específicos fueron analizar las secuencias de 13 bandas de nucleótidos y identificar el gel de agarosa. La metodología incluyó descargar las secuencias del NCBI, abrir SnapGene, simular el gel de agarosa al 1% y visualizar el comportamiento de los 13
Conferencia de Jesús Pla, del departamento de Microbiología de la Facultad de Farmacia de la Universidad Complutense de Madrid en el marco del ATENEO ALPAJÉS del IES ALPAJÉS de Aranjuez
Este documento discute la biología sintética y sus implicaciones para la salud ambiental. La biología sintética involucra "reprogramar" células usando circuitos genéticos y maquinaria biomolecular creada en el laboratorio. Esto podría usarse para producir biocombustibles u otros productos, pero también plantea riesgos si los organismos modificados escapan o son usados con fines dañinos. El documento explora temas como los biocombustibles, biorremediación, bioseguridad y la necesidad de sistemas
El documento presenta información sobre biología molecular y biotecnología. Explica conceptos como ingeniería genética, genómica, proteómica, clonación y sus aplicaciones en medicina, agricultura y la industria. También discute el potencial y desafíos de los organismos genéticamente modificados.
El documento presenta información sobre biología molecular y biotecnología. Explica conceptos como ingeniería genética, genómica, proteómica, clonación y sus aplicaciones en medicina, agricultura y la industria. También discute el potencial y desafíos de los organismos genéticamente modificados.
Trabajo sobre Ingeniería Genética realizado por Antonio Gámez. Todos los derechos reservados. Prohibida su reproducción total o parcial sin la previa autorización.
“Biología Sintética:Diseñando Sistemas Biológicos con Piezas Genéticas”.
Daniel Aguilar-salvador, Isabel ángeles-Santander, Mauricio a. Trujillo-roldán, norma a. Valdez-cruz.
Presentación del diplomado de Biotecnología Avanzada en el tema de Biología Sintética.
La Biología Sintética como una rama emergente de la Biotecnología dedicada al diseño y la construcción de organismos genéticamente modificados para realizar funciones y procesos a la medida de las necesidades del ser humano.
Fundamentos de la Biología Sintética: Estandarización, Abstracción, Modularidad y Modelado Matemático/Cuantificación.
¿Para qué nos sirve la Biología Sintética?
1.- Regulación genética
2.- Mecanismos de Bioseguridad
3.- Simplificar metodologías y acercamientos
4.- Predicción y análisis de resultados
5.- Múltiples aplicaciones
El documento presenta información sobre herramientas de manipulación genética como ADN recombinante, vectores, enzimas de restricción y PCR. Explica que la manipulación genética permite transferir genes entre organismos para obtener plantas y animales transgénicos con características deseadas como resistencia a plagas o producción de proteínas humanas.
El documento describe los conceptos clave de la ingeniería genética. Explica que la ingeniería genética involucra la manipulación genética de organismos con un propósito específico. Luego describe los principales organismos utilizados como bacterias, levaduras, plantas y animales. También cubre las herramientas y técnicas clave como enzimas, vectores, transformación genética, amplificación de ADN y secuenciación. Finalmente, discute aplicaciones como la terapia genética, clonación y organismos transgénic
Este documento describe el método de secuenciación de Sanger y sus aplicaciones. Explica que el método de Sanger utiliza didesoxinucleótidos que terminan la elongación de las cadenas de ADN durante la reacción en cadena de la polimerasa, dando como resultado fragmentos de diferentes tamaños marcados con fluoróforos que pueden ser separados por electroforesis capilar para determinar la secuencia de nucleótidos. También detalla algunas aplicaciones como el análisis de ecosistemas antiguos, la interacción planta-poliniz
Este documento describe los conceptos clave de la biotecnología y la ingeniería genética. La biotecnología combina principios de biología, química e ingeniería para modificar organismos vivos. La ingeniería genética involucra técnicas para manipular ADN como el corte y pegado de ADN y la PCR. Algunas aplicaciones incluyen organismos genéticamente modificados, terapia génica y la producción de sustancias como insulina.
Este documento discute las técnicas moleculares utilizadas para la trazabilidad alimentaria de alimentos derivados de organismos genéticamente modificados (OGM). Explica que la trazabilidad permite rastrear un alimento a lo largo de toda la cadena de producción para identificar sus ingredientes mediante técnicas como la PCR y Southern blot. Además, destaca que estas técnicas moleculares son útiles para detectar la presencia de ADN o proteínas recombinantes en los alimentos derivados de OGM.
Este documento resume los conceptos básicos de biología molecular y microbiología aplicados a la endodoncia. Explica brevemente qué es la biología molecular y la microbiología, así como la estructura del ADN y los procesos de replicación, transcripción y traducción. También describe los métodos moleculares como la PCR, sus componentes y técnica, así como la electroforesis en gel para la detección de microorganismos en muestras de conductos radiculares.
Este documento describe una práctica virtual sobre el análisis de secuencias del gen 16S utilizando herramientas bioinformáticas. Se utilizó el software Bioedit para analizar 71 muestras de secuencias de ADN, luego se realizó una búsqueda BLAST de las secuencias. La mayoría de las muestras tenían mala calidad y 11 no arrojaron resultados. Las muestras identificadas correspondieron principalmente a bacterias no cultivadas y del género Enterobacter.
Informe nro.01 análisis de secuencias del gen 16 sMariansSnairamLC
En el presente trabajo se analiza el estudio del gen ribosomal 16S, mediante la secuenciación de Sanger, el cual se basa en la polimerización del ADN y la utilización de dideoxinucleótidos que sirven como terminadores de la reacción.
Además, cabe señalar que en el Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI) se depositan algunos de los cromatogramas obtenidos en los proyectos de secuenciación. Es así como a partir de los cromatogramas se obtiene la secuencia de nucleótidos.
La biotecnología moderna implica la manipulación del ADN mediante ingeniería genética. Esta permite insertar genes de un organismo en otro y crear organismos transgénicos. Técnicas como la tecnología del ADN recombinante, la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y la secuenciación han permitido aplicaciones como la terapia génica y el diagnóstico molecular de enfermedades.
Este documento describe el uso del software MEGA X para generar un árbol filogenético de 15 secuencias de ADN del gen niFH. Se explica el procedimiento de alineamiento de las secuencias y construcción del árbol, el cual muestra las relaciones evolutivas entre las especies. El resultado proporciona información sobre las similitudes y diferencias entre los genes analizados.
El documento presenta los resultados de un análisis de secuencia del gen 16S utilizando los programas BioEdit, BLAST y Excel. Se analizaron 3 muestras de ADN y se identificó el tamaño de la secuencia, el organismo y el porcentaje de identidad para cada muestra utilizando las herramientas BioEdit, BLAST y una tabla en Excel.
El Instituto de Biotecnología e Ingeniería Genética (IBIG) de la UNCP está desarrollando un proyecto con el Fondo Internacional de Ciencia y Tecnología (FINCyT) para caracterizar bacterias benéficas en suelos agrícolas utilizando marcadores moleculares de ADN como la electroforesis de geles en gradientes de denaturalización (DGGE). El proyecto busca mejorar la calidad de los suelos y la producción de cultivos como la papa y el maíz en la región.
El documento describe las tecnologías computacionales utilizadas para el análisis de secuencias de ADN. Explica que los grandes volúmenes de datos de ADN requieren métodos avanzados de modelado de datos y procesamiento. Describe algunas técnicas como las bases de datos biológicas, la minería de datos y las máquinas de aprendizaje que pueden utilizarse para optimizar el análisis de secuencias de ADN. Finalmente, discute cómo estas tecnologías pueden servir como base para el desarrollo de her
Este documento describe la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene con datos de un artículo científico sobre el aislamiento de bacterias con potencial biorremediador. El objetivo general fue realizar la simulación, mientras que los objetivos específicos fueron analizar las secuencias de 13 bandas de nucleótidos y identificar el gel de agarosa. La metodología incluyó descargar las secuencias del NCBI, abrir SnapGene, simular el gel de agarosa al 1% y visualizar el comportamiento de los 13
Conferencia de Jesús Pla, del departamento de Microbiología de la Facultad de Farmacia de la Universidad Complutense de Madrid en el marco del ATENEO ALPAJÉS del IES ALPAJÉS de Aranjuez
Este documento discute la biología sintética y sus implicaciones para la salud ambiental. La biología sintética involucra "reprogramar" células usando circuitos genéticos y maquinaria biomolecular creada en el laboratorio. Esto podría usarse para producir biocombustibles u otros productos, pero también plantea riesgos si los organismos modificados escapan o son usados con fines dañinos. El documento explora temas como los biocombustibles, biorremediación, bioseguridad y la necesidad de sistemas
El documento presenta información sobre biología molecular y biotecnología. Explica conceptos como ingeniería genética, genómica, proteómica, clonación y sus aplicaciones en medicina, agricultura y la industria. También discute el potencial y desafíos de los organismos genéticamente modificados.
El documento presenta información sobre biología molecular y biotecnología. Explica conceptos como ingeniería genética, genómica, proteómica, clonación y sus aplicaciones en medicina, agricultura y la industria. También discute el potencial y desafíos de los organismos genéticamente modificados.
Trabajo sobre Ingeniería Genética realizado por Antonio Gámez. Todos los derechos reservados. Prohibida su reproducción total o parcial sin la previa autorización.
“Biología Sintética:Diseñando Sistemas Biológicos con Piezas Genéticas”.
Daniel Aguilar-salvador, Isabel ángeles-Santander, Mauricio a. Trujillo-roldán, norma a. Valdez-cruz.
Presentación del diplomado de Biotecnología Avanzada en el tema de Biología Sintética.
La Biología Sintética como una rama emergente de la Biotecnología dedicada al diseño y la construcción de organismos genéticamente modificados para realizar funciones y procesos a la medida de las necesidades del ser humano.
Fundamentos de la Biología Sintética: Estandarización, Abstracción, Modularidad y Modelado Matemático/Cuantificación.
¿Para qué nos sirve la Biología Sintética?
1.- Regulación genética
2.- Mecanismos de Bioseguridad
3.- Simplificar metodologías y acercamientos
4.- Predicción y análisis de resultados
5.- Múltiples aplicaciones
El documento presenta información sobre herramientas de manipulación genética como ADN recombinante, vectores, enzimas de restricción y PCR. Explica que la manipulación genética permite transferir genes entre organismos para obtener plantas y animales transgénicos con características deseadas como resistencia a plagas o producción de proteínas humanas.
El documento describe los conceptos clave de la ingeniería genética. Explica que la ingeniería genética involucra la manipulación genética de organismos con un propósito específico. Luego describe los principales organismos utilizados como bacterias, levaduras, plantas y animales. También cubre las herramientas y técnicas clave como enzimas, vectores, transformación genética, amplificación de ADN y secuenciación. Finalmente, discute aplicaciones como la terapia genética, clonación y organismos transgénic
Este documento describe el método de secuenciación de Sanger y sus aplicaciones. Explica que el método de Sanger utiliza didesoxinucleótidos que terminan la elongación de las cadenas de ADN durante la reacción en cadena de la polimerasa, dando como resultado fragmentos de diferentes tamaños marcados con fluoróforos que pueden ser separados por electroforesis capilar para determinar la secuencia de nucleótidos. También detalla algunas aplicaciones como el análisis de ecosistemas antiguos, la interacción planta-poliniz
Este documento describe los conceptos clave de la biotecnología y la ingeniería genética. La biotecnología combina principios de biología, química e ingeniería para modificar organismos vivos. La ingeniería genética involucra técnicas para manipular ADN como el corte y pegado de ADN y la PCR. Algunas aplicaciones incluyen organismos genéticamente modificados, terapia génica y la producción de sustancias como insulina.
Este documento discute las técnicas moleculares utilizadas para la trazabilidad alimentaria de alimentos derivados de organismos genéticamente modificados (OGM). Explica que la trazabilidad permite rastrear un alimento a lo largo de toda la cadena de producción para identificar sus ingredientes mediante técnicas como la PCR y Southern blot. Además, destaca que estas técnicas moleculares son útiles para detectar la presencia de ADN o proteínas recombinantes en los alimentos derivados de OGM.
Este documento resume los conceptos básicos de biología molecular y microbiología aplicados a la endodoncia. Explica brevemente qué es la biología molecular y la microbiología, así como la estructura del ADN y los procesos de replicación, transcripción y traducción. También describe los métodos moleculares como la PCR, sus componentes y técnica, así como la electroforesis en gel para la detección de microorganismos en muestras de conductos radiculares.
Este documento describe una práctica virtual sobre el análisis de secuencias del gen 16S utilizando herramientas bioinformáticas. Se utilizó el software Bioedit para analizar 71 muestras de secuencias de ADN, luego se realizó una búsqueda BLAST de las secuencias. La mayoría de las muestras tenían mala calidad y 11 no arrojaron resultados. Las muestras identificadas correspondieron principalmente a bacterias no cultivadas y del género Enterobacter.
Informe nro.01 análisis de secuencias del gen 16 sMariansSnairamLC
En el presente trabajo se analiza el estudio del gen ribosomal 16S, mediante la secuenciación de Sanger, el cual se basa en la polimerización del ADN y la utilización de dideoxinucleótidos que sirven como terminadores de la reacción.
Además, cabe señalar que en el Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI) se depositan algunos de los cromatogramas obtenidos en los proyectos de secuenciación. Es así como a partir de los cromatogramas se obtiene la secuencia de nucleótidos.
Informe n°01 analisis de secuencias 16 s- bqBrendaQuirper
El documento presenta los resultados del análisis de 71 secuencias de ADN mediante el uso de herramientas bioinformáticas. La mayoría de las secuencias tuvieron una calidad regular y fueron identificadas como enterobacterias por el programa NCBI BLAST. Los resultados incluyen tablas con la identidad de organismos, tamaños de secuencias y porcentajes de identidad para cada muestra.
Informe nº 1 practica virtual analisis de secuencias del gen 16 s (alina ve...AlinaVelasqueGutierr
Este documento presenta los resultados del análisis de secuencias del gen 16S de muestras de diversos organismos. Se analizaron las secuencias obtenidas de varios archivos utilizando los programas BioEdit y BLAST. Los resultados incluyen la calidad de la secuencia, el tamaño, el organismo más similar encontrado y el porcentaje de identidad. Muchas de las secuencias no pudieron ser identificadas y se clasificaron como "negativas". Las secuencias que se identificaron correspondieron principalmente a géneros como Enterobacter, Klebsiel
Este documento presenta los resultados de un análisis de secuencias del gen 16S utilizando el programa BioEdit. Se analizaron muestras de diversos organismos y se identificaron los organismos más similares encontrados en la base de datos NCBI, así como el tamaño de las secuencias y el porcentaje de identidad. Los resultados muestran una variedad de bacterias, incluidos géneros como Enterobacter, Klebsiella y Pseudomonas. El documento concluye que herramientas como BioEdit y NCBI son útiles para el anális
El documento presenta los resultados del análisis de secuencias del gen 16S utilizando los programas BioEdit y BLAST. Se analizaron 32 secuencias divididas en 3 grupos. La mayoría de las secuencias coincidieron con bacterias de los géneros Enterobacter, Klebsiella y Pseudomonas. Solo algunas secuencias no arrojaron resultados significativos o coincidieron con bacterias no cultivadas.
1) El documento introduce la técnica de PCR-ITS para la caracterización molecular de organismos fúngicos mediante la amplificación de las regiones ITS1 e ITS2 de los genes ribosomales rRNA, lo que permite la identificación de especies fúngicas. 2) Explica detalladamente los pasos para realizar esta técnica, incluyendo la extracción de ADN, PCR, secuenciación, análisis de secuencias y filogenéticos. 3) También proporciona ejemplos y referencias de aplicaciones de esta técnica molecular
1) El documento introduce la técnica de PCR-ITS para la caracterización molecular de organismos fúngicos mediante la amplificación de las regiones ITS1 e ITS2 de los genes ribosomales rRNA, lo que permite la identificación de especies fúngicas. 2) Explica detalladamente los pasos para realizar esta técnica, incluyendo la extracción de ADN, PCR, secuenciación, análisis de secuencias y análisis filogenéticos. 3) También proporciona ejemplos y referencias de bases de datos mole
Informe n°03 simulacion de electroforesis en gel de agarosa- brenda quirper...BrendaQuirper
Este documento presenta un informe sobre la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene. Se recopilaron datos de secuencias de ADN de un artículo científico y se analizaron en SnapGene, donde se pudieron visualizar las bandas simuladas y enzimas de restricción. El documento concluye que SnapGene es una herramienta útil para este tipo de análisis.
INFORME - “SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA CON EL SOFTWARE SNA...DayanaHerrera55
En la actualidad la historia de la Biotecnología ha ido evolucionando, hace siglos atrás descubrimos las enzimas y como poder verlas con ayuda del microscopio, sin embargo, en nuestra época desarrollamos instrumentos más motorizados, con más exactitud, mejor imagen y diagnóstico, lo que nos ayuda a tener una investigación a más a detalle sobre el ADN, siendo una de esas el software SnapGene.
Simulacion de electroforesis en gel agarosa juan carlos bustinza coilajuancarlos74381
Algunas diferencias principales entre ADN y ARN son:
- Composición: El ADN contiene desoxirribosa mientras que el ARN contiene ribosa como azúcar pentosa en su estructura.
- Ubicación: El ADN se encuentra principalmente en el núcleo celular, mientras que el ARN se encuentra tanto en el núcleo como en el citoplasma de la célula.
- Estructura: El ADN tiene forma de doble hélice, mientras que el ARN puede adoptar diferentes estructuras como simple hélice o bucles.
PRÁCTICA Nº 4: “Análisis de secuencias del ADN con el software BioEdit y uso ...dramosbrise1403
Es muy importante aprender a usar el programa BioEdit, ya que, nos ayuda a poder identificar el alineamiento de las secuencias y también nos permite editar alineamientos múltiples.
Práctica de simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el prog...brendacahuanasillo
Este documento describe una simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el programa SnapGene con datos de un artículo científico. Se identificaron 13 cepas bacterianas aisladas y se obtuvieron sus secuencias del NCBI. Luego, se cargaron las secuencias en SnapGene y se simuló la electroforesis para visualizar el comportamiento de los fragmentos de ADN. El resultado mostró la migración de las 13 especies en el gel de acuerdo a su tamaño.
El documento presenta el análisis de secuencias del gen 16S realizado mediante el software BioEdit. Se utilizaron tres archivos de secuencias y se identificaron las secuencias a nivel de género y especie mediante BLAST en NCBI. La mayoría de las secuencias correspondían a géneros como Klebsiella, Enterobacter y Pseudomonas. Se presentan tablas con los resultados del análisis incluyendo el código de la secuencia, calidad, tamaño, organismo identificado y porcentaje de identidad.
Este documento describe un experimento de bioinformática que involucra el análisis de una secuencia de ADN de la bacteria Lactobacillus sakei utilizando la herramienta BLAST. Se seleccionó una parte de la secuencia de L. sakei y se cargó en BLAST para identificar de qué organismo proviene y obtener información relevante sobre cómo fue obtenida y para qué propósito. Los resultados muestran que la secuencia corresponde efectivamente a L. sakei y proporcionan detalles sobre su diversidad genética y uso de cebadores de PCR.
CISIPA 2017: 03. Aplicación de las "omicas" para el estudio de las bacteriosi...Sanipes Perú
Este documento presenta los resultados del estudio de las bacteriosis en cultivos de la concha negra Anadara tuberculosa utilizando técnicas "ómicas". Se identificaron dos bacterias patógenas mediante secuenciación masiva y se detectaron genes de toxicidad. La metagenómica reveló una pérdida de diversidad bacteriana y dominancia de Vibrio spp. en animales enfermos. La metabolómica identificó exotoxinas secretadas por Pseudomonas aeruginosa. La proteómica obtuvo huellas peptídicas espec
simulacion de electroforesis en Gel Agarosa mediante Software SnapGenekatlheen ale espinoza
La electroforesis puede separar fragmentos de ADN y ARN en función de su tamaño, poder visualizarlos mediante una sencilla tinción, y de esta forma determinar el contenido de ácidos nucleicos que se encuentra en una muestra, teniendo una estimación de su concentración y grado de entereza. Podemos además extraer del gel los fragmentos de ADN que sean de interés, para posteriormente utilizarlos en diferentes aplicaciones. Existen programas como el SnapGene que ayudan a simular estos procesos, para poder conocer anticipadamente los resultados de la manipulación que se realicen.
El SnapGene proporciona una forma sencilla y segura de planificar, visualizar y documentar los procedimientos diarios de biología molecular.
Este documento describe el uso del software SnapGene para simular un gel de electroforesis de ADN. Se utilizaron las secuencias de 13 microorganismos obtenidas del NCBI y se cargaron en SnapGene. Luego, se simuló un gel de agarosa que separó las moléculas de ADN según su tamaño, visualizando las secuencias de los 13 microorganismos. El procedimiento permitió familiarizarse con las funciones básicas de SnapGene para la visualización y edición de secuencias de ADN.
F004 p006-gfpi guia de aprendizaje monitorieo, limpieza, desinfección esteril...David Felipe
Esta guía de aprendizaje describe los procedimientos para monitorear la contaminación microbiana en un laboratorio de biotecnología a través de técnicas de muestreo de aire y superficies. Incluye instrucciones para la desinfección del laboratorio usando diferentes desinfectantes y para evaluar la efectividad del proceso mediante el recuento de colonias antes y después de la desinfección. El objetivo es enseñar al aprendiz sobre conceptos clave como limpieza, desinfección, esterilización y el uso a
Avances recientes en el desarrollo de biosensores basados en nanotecnología p...DiegoFlores666837
La contminación por metales pesados, especialmente varias formas de arsénico, plomo, mercurio y cadmio, es significativa en la mayoría de los países del mundo y en los Estados Unidos
Este documento describe un estudio sobre la producción de biocompuestos a partir de harina de yuca mediante termo-compresión y el efecto de las condiciones del proceso, incluyendo la presión de compresión, humedad relativa y contenido de agente de expansión. Los resultados mostraron que estos factores afectaron significativamente la densidad, propiedades mecánicas y absorción de vapor de agua de los biocompuestos. Se concluyó que futuras investigaciones deben enfocarse en reducir la densidad y absorción de humedad de
La biomasa de microalgas presenta una gran variedad de productos con valor económico, que al asociarse a la ficorremediación, pueden reducir los costos del cultivo.
Este documento describe el potencial de las microalgas como fuente de biodiésel y los avances en las técnicas biotecnológicas para su producción. Las microalgas acumulan ácidos grasos y triglicéridos que pueden ser extraídos para producir biodiésel, aunque los métodos de extracción a gran escala aún no son viables industrialmente. También se discuten estrategias como mejorar la biomasa y lípidos de las microalgas mediante ingeniería genética, y obtener otros subproductos con valor añadido de
El ADN es conocido como la molécula de la herencia y contiene la información necesaria para la generación de todos los organismos eucariontes. Su descubrimiento, estudios y aplicaciones resultaron en el salto a una nueva era, la era del ADN o Genómica.
Este documento describe un estudio sobre el uso de microorganismos eficientes para tratar aguas contaminadas. El estudio evaluó las características físicas, químicas y microbiológicas de las aguas en varios puntos de muestreo en una zona de Cuba. Los resultados mostraron que el producto Versaklin redujo efectivamente los parámetros de DBO, DQO, nitrógeno amoniacal, fosforo y coliformes fecales en la mayoría de los puntos de muestreo. Las conclusiones fueron que el Versaklin es
Este documento describe un estudio sobre la letalidad de tres cepas de hongos (Beauveria sp, Acremonium sp, y Scopulariopsis sp) sobre el insecto Dysdercus peruvianus. Se aislan e identifican las cepas de hongos y se caracterizan fisiológicamente midiendo la producción de esporas y germinación. Luego se realizan bioensayos exponiendo los insectos a los hongos y midiendo el tiempo de mortalidad al 50% y 80% de la población, así como la tasa de infección
Es un software de clonación que ayudas en planear y simulando manipulaciones de ADN.
Nos serviría para la aplicación de diversos puntos que tratemos referente a la ingeniería ambiental, como por ejemplo el ADN, ARN, NUCLEOTIDOS, entre otros.
Las cepas se cultivaron en medio de agar nutritivo
(OXOID) y se incubaron a 30 °C por 24 h. Una vez
transcurrido el tiempo, se prepararon
suspensiones bacterianas en agua estéril a una
concentración de 9X108 UFC ml-1 (unidades
formadoras de colonias), comparada con un
patrón de turbidez McFarland número tres
(McFarland, 1907).
El software de análisis de genética evolutiva molecular (MEGA) implementa muchos métodos y herramientas analíticos para
filogenómica y filomedicina. Aquí, informamos una transformación de MEGA para permitir el uso multiplataforma en
Sistemas operativos Microsoft Windows y Linux. MEGA X no requiere software de virtualización o emulación y
proporciona una experiencia de usuario uniforme en todas las plataformas. MEGA X también se ha actualizado para utilizar múltiples sistemas informáticos.
núcleos para muchos análisis evolutivos moleculares. MEGA X está disponible en dos interfaces (gráfica y línea de comandos) y
se puede descargar de www.megasoftware.net de forma gratuita
Este documento evalúa la producción de enzimas ligninolíticas por dos hongos basidiomicetos (Phanerochaete chrysosporium y Bjerkandera adusta) cultivados en tres sistemas de fermentación: 1) tres materiales lignocelulósicos diferentes (carozo de maíz, viruta de madera y compost), 2) suelo forestal, y 3) una mezcla de suelo y carozo de maíz. Los resultados mostraron que P. chrysosporium produjo mayormente MnP en viruta de madera y carozo de maí
Los hongos de podredumbre blanca de la madera tienen la capacidad de producir un complejo enzimático con actividad oxidativa contra una amplia variedad de sustancias tóxicas recalcitrantes como plaguicidas, tintes, hidrocarburos poliaromáticos, explosivos, etc.,
Este documento presenta una tabla que describe diferentes tipos de microorganismos (bacterias, hongos y cianobacterias), sus metabolitos primarios y secundarios, su fuente de carbono y cómo podrían aplicarse en biotecnología e ingeniería ambiental. Para cada microorganismo, se enumeran los metabolitos que produce a nivel primario y secundario, así como su fuente de carbono común. Luego, se proporciona un breve resumen de cómo podría usarse cada microorganismo, como en la remediación de suelos y aguas contamin
Interacción de microorganismos benéficos en plantasDiegoFlores666837
El documento presenta un artículo escrito por 5 estudiantes de la Escuela Profesional de Ingeniería Ambiental de la Universidad Nacional de Moquegua para su curso de Biotecnología. El artículo trata sobre la interacción benéfica entre micorrizas, Trichoderma spp. y Pseudomonas spp. con las plantas y fue supervisado por el profesor Hebert Soto Gonzales en septiembre de 2021 en Ilo, Perú.
El documento presenta una sinopsis cronológica de la biotecnología ambiental. Comienza con los primeros usos de procesos de fermentación por los sumerios y babilonios hace miles de años. Luego describe hitos clave en el desarrollo de la biotecnología como el descubrimiento de microorganismos por Antonie van Leeuwenhoek en el siglo XVII y las contribuciones de Pasteur, Mendel y otros en los siglos XIX y XX. Finalmente, resume avances recientes como el proyecto del genoma humano y
Catalogo Buzones BTV Amado Salvador Distribuidor Oficial ValenciaAMADO SALVADOR
Descubra el catálogo completo de buzones BTV, una marca líder en la fabricación de buzones y cajas fuertes para los sectores de ferretería, bricolaje y seguridad. Como distribuidor oficial de BTV, Amado Salvador se enorgullece de presentar esta amplia selección de productos diseñados para satisfacer las necesidades de seguridad y funcionalidad en cualquier entorno.
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Catalogo Cajas Fuertes BTV Amado Salvador Distribuidor OficialAMADO SALVADOR
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Amado Salvador, distribuidor oficial BTV, asegura que cada producto cumpla con los más estrictos estándares de calidad y seguridad. Al adquirir una caja fuerte a través de Amado Salvador, distribuidor oficial BTV, los clientes pueden tener la tranquilidad de que están obteniendo una solución confiable y duradera para la protección de sus pertenencias.
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KAWARU CONSULTING presenta el projecte amb l'objectiu de permetre als ciutadans realitzar tràmits administratius de manera telemàtica, des de qualsevol lloc i dispositiu, amb seguretat jurídica. Aquesta plataforma redueix els desplaçaments físics i el temps invertit en tràmits, ja que es pot fer tot en línia. A més, proporciona evidències de la correcta realització dels tràmits, garantint-ne la validesa davant d'un jutge si cal. Inicialment concebuda per al Ministeri de Justícia, la plataforma s'ha expandit per adaptar-se a diverses organitzacions i països, oferint una solució flexible i fàcil de desplegar.
Manual de Soporte y mantenimiento de equipo de cómputos
Analisis de Secuencia en Gen 16 S
1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL
PRACTICA CALIFICADA
“ANALISIS DE SECUENCIA DEL GEN 16S”
CURSO: BIOTECNOLOGIA
Estudiante:
FLORES FLORES, Diego Hernan
Docente:
SOTO GONZALES, HEBERT HERNAN
SETIEMBRE – 2021
ILO – PERÚ
2. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
INTRODUCCION
CROMATOGRAMA:El cromatograma esun registrográficobidimensional obtenidoen
un medioabsorbente,que muestralaseparaciónde sustanciasmedianteuna
cromatografía.En el cromatogramase formaun patrónvisible,picosomanchas,que
reflejanlaseparaciónfísicade loscomponentesde unamezcla.
Constituye el registrofinal de todoel procesode lacromatografía.De él se obtienen
parámetrosque sonde interésanalítico.Este puede obtenerse comounarchivo
electrónico,unhistogramaimpresooenel soporte del proceso;enpapel.
BLAST: (BasicLocal AlignmentSearchTool) esunprogramainformáticode
alineamientode secuenciasde tipolocal,yaseade ADN,ARN o de proteínas.El
programa escapaz de comparar una secuenciaproblema(tambiéndenominadaenla
literaturasecuenciaquery)contraunagran cantidadde secuenciasque se encuentren
enuna base de datos.El algoritmoencuentralassecuenciasde labase de datosque
tienenmayorparecidoala secuenciaproblema.Esimportante mencionarque BLAST
usa un algoritmoheurísticoporloque nonos puede garantizarque haencontradola
solucióncorrecta.Sinembargo,BLASTescapaz de calcularla significaciónde sus
resultados,porloque nosprovee de unparámetropara juzgarlosresultadosque se
obtienen.
BIOEDIT: Bioeditesunprogramagratuitopara ediciónde alineamientosyanálisisde
secuenciasque funcionaúnicamentesobre ambiente MS/Windows.Es,sinlugara
duda, uno de losprogramas másconocidospara ediciónde secuenciasparadicho
sistemaoperativo.
SECUENCIA:Se denominasecuenciaaundeterminadoconjuntode elementosque se
ordenanenuna determinadasucesión,estoes,unodetrásde otroso unosdelante de
otros.Un claroejemplode secuenciapuede mostrarloel alfabeto,que contiene una
listade las distintasletrasque se usanenmuchosidiomasyque se presentade un
modoordenado.Otroejemplopuede ofrecerloel modoenque se estudiael ADN;así,
éste esen general presentadocomounconjuntode informaciónque se presenta
ordenada.En algunoscasos,esnecesarioel establecimientode unasecuenciapara
que loselementospresentadostengansentido;unclaroejemplode estacircunstancia
loevidenciael lenguaje,endonde losmorfemasdebenpresentase enunasecuencia
temporal ycumpliendodeterminadasreglas.
3. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
OBJETIVOS
Reservarlos fundamentosde lastécnicasde secuenciaciónde ácidosnucleicos
Efectuarel análisisyla selecciónde electroferogramasautomatizadosde
secuenciaciónmediantelaaplicaciónde softwarelibre BIOEDITen específico el
estudiodel genribosomal 16S.
MATERIALES Y METODOS
Materiales
Programa “BIOEDIT”
PaginaNCBI - BLAST
Programa “EXCEL”
Programa “WORD”
Programa “PDF”
Una Laptop
Un escritorio
Una extensión
Un celular
Un modemde Internet
Un cuaderno
Lapiceros(rojo,azul,negro)
Métodos
Para poderhacer un análisis de loscromatogramasentregados,tuvimosque
utilizarel programao software “BIOEDIT”, se hizousode Bioeditutilizandoun
archivo,guardándoloenformatoFASTA,paraun mejoranálisisse recomienda
copiardirectamente lasecuenciade lainformacióndel taxón.
Una vez exportadastodas lassecuenciasde interés, se procedióabrirel archivo
guardadoen formatoFASTA,por el programa BLOCKDE NOTAS,para hacerun
análisis yprocederahacer una correcciónde la secuencia.Estose realizoconla
finalidadde podertenerunasecuenciamenosdañada,ypoderhacerun análisis
más claro.
Al terminarlacorrección,procedimosacopiar lassecuencias,ycolocarlos enla
páginaNCBI,formatoBLAST, para podertenerunresultado,de lassimilitudes,tipo
de bacteria,porcentajes,calidad,entreotros.
Despuésse procedióarealizaruncuadro de cromatogramas,identificandosu
calidad,sutamaño,su origen,ysu númerode identidad,pasando losdatos
brindadosde lapáginaNCBI formatoBLAST.
4. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
RESULTADOS (cuadroen Excel,detallar)
Se hizoel análisisaSetentayun, muestrasencromatogramas,utilizandoel programaBIOEDIT,paraluegohaceruna correcciónde lassecuencias,enel programa
BLOCK DE NOTAS,y para finalizarhacerunanálisisenel programaNCBI – BLAST, obteniendolossiguientesresultados:
Utilizamosde “CODIGO”esmismonombre del elemento, conlafinalidadde poderidentificarlosmásrápido.
En la calidadde secuenciaobservamosque unporcentajede 23.9%es de “BUENA” calidadde secuencia,que un15.5% esde “MALA” calidadde secuencia,yque un
60.6% esde “REGULAR” calidad.
Teniendocomoresultado,predominalaREGULAR calidadde secuencia.
Observamosentodosloscromatogramas,tienenunorganismo“BACTERIA”de diferentestipos,identificadosporel programaNCBI,formatoBLAST.
Por último,tenemosun“N°DE ENTIDAD” enporcentaje identificadosporel formatoNCBI – BLAST,observandoque lamayoríatiene unporcentaje regular.
CODIGO
CALIDAD DE LA SECUENCIA TAMAÑO DE LA
SECUENCIA
ORGANISMO N° DE ENTIDAD
BUENA MALA REGULAR
DIVERSOS-_A07_1H_01 X 437 NEGATIVO
DIVERSOS-_A08_9H_02 X 725 Bacteria - Herbaspirillum seropedica 94%
DIVERSOS-_A09_1_01 X 600 Bacteria - Pseudomonas putida 83.21%
DIVERSOS-_A10_9_02 X 524 Bacteria - bacteria nocultivada 88.82%
DIVERSOS-_A11_17_01 X 544 NEGATIVO
DIVERSOS-_B07_2H_03 X 586
Bacteria - Stenotrophomonassp.
UYSB32 75.99%
DIVERSOS-_B08_10H_04 X 636 Bacteria - Leclercia adecarboxilat 85.95%
DIVERSOS-_B09_2_03 X 550 Bacteria - Klebsiella grimontii 84.24%
DIVERSOS-_B10_10_04 X 562 Bacteria - Enterobacter soli 71.76%
DIVERSOS-_B11_18_03 X 573 Bacteria - Pseudomonas sp. 72.62%
DIVERSOS-_C07_3H_05 X 576 Bacteria - Leclercia adecarboxilata 93.32%
5. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
DIVERSOS-_C08_11H_06 X 630 Bacteria - Enterobacter sp. NA10140 94.48%
DIVERSOS-_C09_3_05 X 580 Bacteria - Phytobacter diazotrophicus 87.88%
DIVERSOS-_C10_11_06 X 583 Bacteria -Pseudomonas plecoglossicida 70.65%
DIVERSOS-_C11_19_05 X 550 Bacteria - Klebsiella aerogenes 65.62%
DIVERSOS-_D07_4H_07 X 614 Bacteria - Staphylococcus epidermidis 91.88%
DIVERSOS-_D08_12H_08 X 519 Bacteria - Staphylococcus sp. US-13 87.58%
DIVERSOS-_D09_4_07 X 614 Bacteria - Phytobacter diazotrophicus 89.98%
DIVERSOS-_D10_12_08 X 632 Bacteria - Pseudomonas sp. ERO06 82.84%
DIVERSOS-_E07_5H_09 X 533 NEGATIVO
DIVERSOS-_E08_13H_10 X 634 Bacteria - Paraburkholderia silvatlantica 79.97%
DIVERSOS-_E09_5_09 X 559
Bacteria - Enterobacter hormaechei
subsp 85.02%
DIVERSOS-_E10_13_10 X 581 Bacteria - bacteria nocultivada 67.48%
DIVERSOS-_F07_6H_11 X 619 Bacteria - Enterobacter ludwigii 95.89%
DIVERSOS-_F09_6_11 X 658 Bacteria - Klebsiella sp. 81.75%
DIVERSOS-_F10_14_12 X 648 NEGATIVO
DIVERSOS-_G07_7H_13 X 567 Bacteria - Enterobacter sp. ICBR189 93.18%
DIVERSOS-_G09_7_13 X 498 Bacteria - Enterobacter sp. 73.68%
DIVERSOS-_G10_15_14 X 643 Bacteria - Enterobacter cloacae 96.28%
DIVERSOS-_H07_8H_15 X 623 NEGATIVO
DIVERSOS-_H09_8_15 X 563 NEGATIVO
DIVERSOS-_H10_16_16 X 583 Bacteria - Enterobacter sp. IICDBZ9 84.77%
USER_04set2007_01-419NZ_A01_01 X 713 Bacteria - Klebsiella michiganensis 78.96%
USER_04set2007_02-526NZ_B01_03 X 612
Bacteria - Klebsiella sp. cultivo de
enriquecimiento 88.15%
USER_04set2007_03-419AZ_C01_05 X 745 Bacteria - Klebsiella sp. MPUS7 97.35%
USER_04SET2007_04_88NZ_D01_07 X 597 Bacteria - Klebsiella pneumo 95.46%
USER_04SET2007_05_88AZ_E01_09 X 519 Bacteria - Klebsiella pneumoniae 96.91%
USER_04SET2007_06_526Y1_F01_11 X 333 Bacteria - Klebsiella pneumoniae 95.91%
USER_04SET2007_07_419Y1_G01_13 X 293 Bacteria - Enterobacter sp. WF14-6 98.61%
6. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
USER_04SET2007_08_375H_H01_15 X 486 Bacteria - Klebsiella oxytoca 73.75%
USER_04SET2007_09_419YZ_A02_02 X 357 Bacteria - Enterobacter sp. CB7 95.81%
USER_04SET2007_10_88H_B02_04 X 662
Bacteria - endosimbiontes de
Sphenophorus levis 72.46%
USER_04SET2007_11_375NZ_C02_06 X 624 Bacteria - bacteria nocultivado 75.43%
USER_04SET2007_12_526YZ_D02_08 X 430 Bacteria - Klebsiella sp. BR3357 95.25%
USER_04SET2007_13_483NZ_E02_10 X 729 Bacteria - Enterobacter sp. 88.89%
USER_04SET2007_14_483H_F02_12 X 602 Bacteria - Enterobacter hormaechei 88.47%
USER_04SET2007_15_456NZ_G02_14 X 728 Bacteria - parcial Bacillus cereus 92.27%
USER_12SET2007_01_A03_01 X 461 Bacteria - Kosakonia arachidis 81.90%
USER_12SET2007_02_B03_03 X 806
Bacteria - ecuenciaparcial bacteria del
suelonocultivado 71.52%
USER_12SET2007_03_C03_05 X 654 Bacteria - Klebsiella variicola 74.50%
USER_12SET2007_04_D03_07 X 617 Bacteria - Kosakoniaoryzae 81.47%
USER_12SET2007_05_E03_09 X 728 Bacteria - Enterobacter sp. 89.57%
USER_12SET2007_06_F03_11 X 657 NEGATIVO
USER_12SET2007_07_G03_13 X 785 NEGATIVO
USER_12SET2007_08_H03_15 X 738
Bacteria - secuencia parcialbacteria no
cultivado 72.17%
USER_12SET2007_09_A04_02 X 769 NEGATIVO
USER_12SET2007_10_B04_04 X 762 Bacteria - Achromobacter sp. 76.67%
USER_12SET2007_11_C04_06 X 725 Bacteria - Enterobacter cloacae 72.58%
USER_12SET2007_12_D04_08 X 779 Bacteria - Enterobacteriaceae HGH0104 85.71%
USER_12SET2007_13_E04_10 X 557 Bacteria - Erwiniaamylovora 72.26%
USER_12SET2007_14_F04_12 X 824 Bacteria - Pantoea deleyi 75.82%
USER_12SET2007_15_G04_14 X 645 Bacteria - Klebsiella sp. 90.84%
USER_12SET2007_16_H04_16 707 Bacteria - Kosakonia sacchari 77.42%
USER_12SET2007_1Y2_F04_12 X 657 Bacteria - Kosakoniaradic 79.20%
USER_12SET2007_2Y2_G04_14 X 557 Bacteria - Herbaspirillum sp. 86.75%
USER_12SET2007_3Y2_H04_16 X 531 NEGATIVO 79.04%
7. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
USER_12SET2007_17_A04_02 X 819 Bacteria - Rhizobiumlusita 71.09%
USER_12SET2007_18_B04_04 X 857 Bacteria - Enterobacter sp. 81%
USER_12SET2007_19_C04_06 X 762 Bacteria - Pseudomonasjessenii 68.31%
USER_12SET2007_20_D04_08 X 630 Bacteria - Klebsiella pneumoniae 73.08%
USER_12SET2007_21_E04_10 X 21 Bacteria - bacteria nocultivado 74.24%
8. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
CONCLUSIONES
El programa BIOEDIT,esutilizadoparael alineamiento múltiple,que esunade las
técnicasbioinformáticasmásusadas,yaque por mediode ellapodemosrealizar
diversosanálisis.Se realizólasecuenciaparanoperder informaciónnucleotídicade
importanciayasí obtenerunamayorcantidadde basesen la secuencia,loque
posteriormente nosayudóaelevarel porcentaje de coberturaenla comparacióncon
lasbasesde datosonline.
El NCBI-BLASTesel programaque realizabúsquedasde secuenciasensusbasesde
datos.En esta seccióntrabajaremoscondichaimplementación. Existendiversas
formasde ingresarnuestrasecuenciapararealizarbúsquedasBLAST.Unade ellases
digitandounidentificadorconocidoporel NCBI.Otra manerade hacerloesingresando
directamente lasecuenciaenestamismacasillaenformatoFASTA.
Se pudo identificarel tipobacteriasque se utilizaroneneste trabajo,porlocual
pudimostenerunconocimientomasadecuadoyde mayor informaciónde este.
Se obtuvocomo calidadde frecuencia,unresultadode “REGULAR”que tomo un
porcentaje de 60.6% enla secuencia.
El trabajorealizadonospermitió realizarunanálisiscondiferentesprogramas
mencionados,aprenderautilizarlos,ypoderidentificarlostiposde bacterias
existentes.
9. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ANEXOS
DIVERSOS-_A07_1H_01
DIVERSOS-_A08_9H_02
DIVERSOS-_A09_1_01
10. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
DIVERSOS-_A10_9_02
DIVERSOS-_A11_17_01
DIVERSOS-_B07_2H_03
DIVERSOS-_B08_10H_04
11. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
DIVERSOS-_B09_2_03
DIVERSOS-_B10_10_04
DIVERSOS-_B11_18_03
DIVERSOS-_C07_3H_05
12. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
DIVERSOS-_C08_11H_06
DIVERSOS-_C09_3_05
DIVERSOS-_C10_11_06
DIVERSOS-_C11_19_05
13. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
DIVERSOS-_D07_4H_07
DIVERSOS-_D08_12H_08
DIVERSOS-_D09_4_07
DIVERSOS-_D10_12_08
14. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
DIVERSOS-_E07_5H_09
DIVERSOS-_E08_13H_10
DIVERSOS-_E09_5_09
DIVERSOS-_E10_13_10
15. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
DIVERSOS-_F07_6H_11
DIVERSOS-_F09_6_11
DIVERSOS-_F10_14_12
DIVERSOS-_G07_7H_13
16. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
DIVERSOS-_G09_7_13
DIVERSOS-_G10_15_14
DIVERSOS-_H07_8H_15
DIVERSOS-_H09_8_15
17. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
DIVERSOS-_H10_16_16
USER_04set2007_01-419NZ_A01_01
USER_04set2007_02-526NZ_B01_03
USER_04set2007_03-419AZ_C01_05
18. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
USER_04SET2007_04_88NZ_D01_07
USER_04SET2007_05_88AZ_E01_09
USER_04SET2007_06_526Y1_F01_11
USER_04SET2007_07_419Y1_G01_13
19. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
USER_04SET2007_08_375H_H01_15
USER_04SET2007_09_419YZ_A02_02
USER_04SET2007_10_88H_B02_04
USER_04SET2007_11_375NZ_C02_06
20. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
USER_04SET2007_12_526YZ_D02_08
USER_04SET2007_13_483NZ_E02_10
USER_04SET2007_14_483H_F02_12
USER_04SET2007_15_456NZ_G02_14
21. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
USER_12SET2007_01_A03_01
USER_12SET2007_02_B03_03
USER_12SET2007_03_C03_05
USER_12SET2007_04_D03_07
22. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
USER_12SET2007_05_E03_09
USER_12SET2007_06_F03_11
USER_12SET2007_07_G03_13
USER_12SET2007_08_H03_15
23. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
USER_12SET2007_09_A04_02
USER_12SET2007_10_B04_04
USER_12SET2007_11_C04_06
USER_12SET2007_12_D04_08
24. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
USER_12SET2007_13_E04_10
USER_12SET2007_14_F04_12
USER_12SET2007_15_G04_14
USER_12SET2007_16_H04_16
25. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
USER_12SET2007_1Y2_F04_12
USER_12SET2007_2Y2_G04_14
USER_12SET2007_3Y2_H04_16
USER_12SET2007_17_A04_02
26. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
USER_12SET2007_18_B04_04
USER_12SET2007_19_C04_06
USER_12SET2007_20_D04_08
USER_12SET2007_21_E04_10
27. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
BIBLIOGRAFIAS
BLAST - Wikipedia,laenciclopedialibre
seqretrieveCBIB.pdf (unal.edu.co)
BioEditDownload - Researchsoftware utilityforcreatingandeditingbiological sequences
(informer.com)
BLAST: BasicLocal AlignmentSearchTool (nih.gov)