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CAPITULO 7
CONDENSACIÓN DEL DNA Y CROMOSOMAS
SUPERENROLLAMIENTO DEL DNA
Es parte de la condensación del DNA en general,es importante en lo que se trata su parte
estructural. Esto nos ayuda a comprender cómo el DNA de gran magnitud puede alojarse
en el interior de la célula (procariotas) o del núcleo (eucariotas), las medidas del mismo son
muy inferiores a la longitud teórica del DNA en doble hélice.
El superenrollamiento DNA sufre la doble hélice,mientras las dos hebras solo sucede el
enrollamiento
Superenrollamiento del DNA circular
afecta tanto procariotas como eucariotas ,el superenrollamiento de comprensión mas
simple y es fácil apreciar fenómenos de superenrollamiento en el DNA de plásmidos
procarióticos y el de cromosomas mitocondriales y cloroplásticos de eucariotas
Conformación relajada
Es un estado estableo cuando el eje de la doble hélice se puede disponer por completo sobre
un plano(aproximadamente 10,5 pb/vuelta)
Conformaciones superenrolladas
Estado compacto superenrollado y no relajado. Éste lo producen topoisomerasas por el
corte transitorio de una o de las dos aumentan o disminuyen el numero de vueltas
dehelice,en ambas tensión estructural, si se reduce el número de vueltas de hélice, la
tensión se libera formando una superhélice a la que se le asigna un valor negativo de
superenrollamiento.
Si aumenta el numero de vueltas de hélice,la tensión se libera por una superhelice de
sentido opuesto u superenrollamiento positivo.
Análisis teórico del superenrollamiento
El signo y magnitud del superenrollamiento se asignan a gracias topologia , del cual sólo se
comentan aquí los aspectos más fundamentales
índice o número de enlace topológico.- el número de veces que una hebra cruza el plano
definido por la otra. Se le asigna valor positivo cuando el cruce se produce girando hacia la
derecha.
L al del estado relajado
L≠no se pueden separar
L=solo podrían separarse
El superenrollamiento puede, ser positivo o negativo y coincide con el número de vueltas
de superhélice formadas para que la molécula libere la tensión y alcance de nuevo
localmente la conformación más estable de doble hélice B.
Superenrollamiento del DNA lineal
En eucariotas esto es no tan evidente además de no ser estable .la unión de la proteína de
NDA lineal es que permite estado super enrollamiento puesto que contribuye a la
condesacion de genoma nuclear eucariotico
CONDENSACIÓN DEL DNA EN EUCARIOTAS
La condensación del DNA desde la doble hélice extendida hasta cromatina y luego
cromosoma tiene lugar de forma gradual durante la fase G2 del ciclo celular
Descondensación del DNA, comienza después de la división celular (fase M) y continúa
durante la fase G1 hasta alcanzar de nuevo la condición difusa que permite la replicación
(fase S).
Proteínas componentes de la cromatina
Las histonas.-proteina principal del material genético de eucariotas fundamentalmente
estabiliza y compacta la estructura DNA esta proteína es relativamente pequeña y contenido
elevado aminoácidos básicos de naturaleza policationica a pH fisiológico se asocian por
interacciones electrostáticas , con los grupos fosfato del esqueleto polianiónico del DNA.
Cinco histinas principales cumplen una funcion estructural en organización del
nucleosoma y cromatina H1 se presenta en tejidos y algunas especies las otras cuatro están
altamente conservadas.
El grado de condensación del DNA se regula en parte mediante la acetilación, fosforilación
y metilación de las histonas,estas también se ven implicadas en mecanismos de control de
expresión genética.
PROTEÍNAS NO HISTÓNICAS
En la cromatina se encuentran distintas proteínas mas variables
a) Con función estructural
CONDENSACION DEL DNA
SUPERENROLLAMIENTO
Doble Helicedextrorsa de tipo B
EMPAQUETAMIENTO
Plegamiento o compactacion de
la molecula DNA debido a la
asociacion con proteinas,paradar
lugar a nucleoproteinas
Proteínas básicas
Protaminas: función equivalente a las histonas en tipos celulares concretos,en menor
tamaño permite la compactación del DNA en el espacio mínimo disponible en el
espermatozoide
. • Proteínas ácidas:
HMG: un 5% (high mobility group), proteínas de alta movilidad electroforética debido a su
carácter ácido,algunas se asocian al nucleosoma en cambio otras interaccionan con el DNA
espaciador este incluye también factores de transcripción .
Proteínas del esqueleto o matriz nuclear: Esta estructura, que sirve de soporte o guía en el
empaquetamiento de la cromatina
b) Con otras funciones asociadas con cromatina en cantidad pequeña y sin función
estructural.
Niveles de condensación del DNA nuclear eucariótico
condensación del DNA se describe aquí en cuatro niveles esto se define como el cociente
entre la longitud del B-DNA bicatenario y el tamaño del mismo una vez condensado esto
sirve para los distintos grados de conpactacion . Es importante indicar que la condensación
y la descondensación a través de esos niveles están estrechamente asociadas a la progresión
por las distintas fases del ciclo celular
Disposición en nucleosomas y fibra de 10 nm
se considera la unidad elemental constituyente de la cromatina y de los cromosomas, siendo
así responsable de la organización estructural del material genético en todos los organismos
eucarióticos.. Cada nucleosoma está formado por 9 moléculas de histonas y un tramo de la
molécula de DNA con aproximadamente 200 pb
‘estructura en cuentas de rosario’ .Es una estructura de nucleosomas espaciados a lo largo
de la molécula de DNA, pues su grosor corresponde al diámetro del nucleosoma. El grado
de empaquetamiento alcanzado es unas 6 veces superior al de la doble hélice del DNA
extendida.
Formación de la fibra de 30 nm
La fibra mas condesada en la preparaciones in vitro y da un empaquetamiento de 40 veces
mas doble hélice original . La fibra de 30 nm es probablemente la forma fisiológica más
descondensada de la cromatina, adoptada por la mayor parte del DNA durante la interfase.
Cromatina o cromosoma interfásico
Este nivel de condensación supone la presencia de lazos y superenrollamientos de la
estructura anterior. Los bucles o asas radiales que emergen de un armazón de proteínas no
histónicas denominado andamiaje, matriz o esqueleto nuclear
Esta diversidad local en la densidad de condensación se observa en forma de la presencia
simultánea de eucromatina y heterocromatina en una célula en interfase
EL CROMOSOMA METAFÁSICO
Morfología de los cromosomas
Se llama centrómero, a la región más estrecha del cromosoma metafásico, por donde
permanecen unidas las dos cromátidas este delimita además los brazos cromosómicos .Los
cromosomas se clasifican atendiendo a la posición del centrómero y, por tanto, según el
tamaño relativo de los brazos
Cariotipo y su análisisconstitucion cromosómica de un individuo ,es un rasgo carecteristico
de cada especie de conjunto de cromosomas
Su análisis se realiza habitualmente enprofase o en metafase se emplean en análisis de
anomalía cromosómica
Bandeado
La organización estructural del genoma mostranso asi la composición de las bases grado de
condensación, conformación de la cromatina, secuencias repetitivas y no transcritas con
tinciones especiales se pueden observar en los cromosomas bandas pálidas y oscuras
alternativamente, que definen grandes regiones cromosómicas llamadas isocoros
a) Bandeo G
desnaturalización controlada de las proteínas cromosómicas y la mas usada seguida de
giemsa
b) Bandeo Q
Tinción fluorescente, como mostaza de quinacrina (hidrocloruro de quinacrina), que se
intercalan en el DNA bicatenario aquí necesariamente se utiliza microosscopia
gluoresente
c) Bandeo R
Utilización de calor (para desnaturalizar el DNA rico en AT), antes de la tinción con
Giemsa.
d) Bandeo T
las de tinción más intensa, y se visualizan empleando un tratamiento térmico
particularmente severo antes de teñir los cromosomas con Giemsa o una combinación
de tinciones y fluorocromos
Métodos especiales
bandeo C, para regiones heterocromáticas; tinción NOR, para la región organizadora
del nucléolo, que contiene los genes de rRNA 18S y 28S; bandeo de profase y
prometafase, o de alta resolución y finalmente a citogenética molecular emplea sondas
de DNA clonado (preparadas por técnicas de DNA recombinante, pág. 180) para
examinar cromosomas, de forma similar a los ensayos de hibridación molecular pero
sobre preparaciones de cromosomas completos. Ésta es la técnica denominada
hibridación in situ con fluorescencia (FISH, fluorescence in situ hybridization)
Regiones con significado funcional
Tres elementos eseciales para funcionamiento correcto ciclo celular
el centrómero (lugar de unión del cromosoma a las fibras del huso acromático) además
los cinetocoros, estructuras proteicas en las que se anclan las fibras que constituyen el
huso acromático o huso mitótico. . La ausencia de centrómero impide que el
cromosoma se una al huso mitótico y con ello que se reparta de manera correcta entre
las células hijas.
, los telómeros (regiones que constituyen los extremos de los cromosomas)
Funciones importantes
estabilización y mantenimiento de la integridad estructural del cromosoma: en ausencia
de telómeros
permiten a las enzimas encargadas de la reparación del DNA diferenciar entre el
extremo natural del cromosoma asegura la replicación completa de los extremos del
cromosoma.
la arquitectura tridimensional del núcleo o la del emparejamiento cromosómico
y los orígenes de replicación (puntos numerosos en cada cromosoma donde se inicia la
copia de las dos hebras de DNA).
Capitulo 7

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Capitulo 7

  • 1. CAPITULO 7 CONDENSACIÓN DEL DNA Y CROMOSOMAS SUPERENROLLAMIENTO DEL DNA Es parte de la condensación del DNA en general,es importante en lo que se trata su parte estructural. Esto nos ayuda a comprender cómo el DNA de gran magnitud puede alojarse en el interior de la célula (procariotas) o del núcleo (eucariotas), las medidas del mismo son muy inferiores a la longitud teórica del DNA en doble hélice. El superenrollamiento DNA sufre la doble hélice,mientras las dos hebras solo sucede el enrollamiento Superenrollamiento del DNA circular afecta tanto procariotas como eucariotas ,el superenrollamiento de comprensión mas simple y es fácil apreciar fenómenos de superenrollamiento en el DNA de plásmidos procarióticos y el de cromosomas mitocondriales y cloroplásticos de eucariotas Conformación relajada Es un estado estableo cuando el eje de la doble hélice se puede disponer por completo sobre un plano(aproximadamente 10,5 pb/vuelta) Conformaciones superenrolladas Estado compacto superenrollado y no relajado. Éste lo producen topoisomerasas por el corte transitorio de una o de las dos aumentan o disminuyen el numero de vueltas dehelice,en ambas tensión estructural, si se reduce el número de vueltas de hélice, la tensión se libera formando una superhélice a la que se le asigna un valor negativo de superenrollamiento.
  • 2. Si aumenta el numero de vueltas de hélice,la tensión se libera por una superhelice de sentido opuesto u superenrollamiento positivo. Análisis teórico del superenrollamiento El signo y magnitud del superenrollamiento se asignan a gracias topologia , del cual sólo se comentan aquí los aspectos más fundamentales índice o número de enlace topológico.- el número de veces que una hebra cruza el plano definido por la otra. Se le asigna valor positivo cuando el cruce se produce girando hacia la derecha. L al del estado relajado L≠no se pueden separar L=solo podrían separarse El superenrollamiento puede, ser positivo o negativo y coincide con el número de vueltas de superhélice formadas para que la molécula libere la tensión y alcance de nuevo localmente la conformación más estable de doble hélice B. Superenrollamiento del DNA lineal En eucariotas esto es no tan evidente además de no ser estable .la unión de la proteína de NDA lineal es que permite estado super enrollamiento puesto que contribuye a la condesacion de genoma nuclear eucariotico CONDENSACIÓN DEL DNA EN EUCARIOTAS La condensación del DNA desde la doble hélice extendida hasta cromatina y luego cromosoma tiene lugar de forma gradual durante la fase G2 del ciclo celular
  • 3. Descondensación del DNA, comienza después de la división celular (fase M) y continúa durante la fase G1 hasta alcanzar de nuevo la condición difusa que permite la replicación (fase S). Proteínas componentes de la cromatina Las histonas.-proteina principal del material genético de eucariotas fundamentalmente estabiliza y compacta la estructura DNA esta proteína es relativamente pequeña y contenido elevado aminoácidos básicos de naturaleza policationica a pH fisiológico se asocian por interacciones electrostáticas , con los grupos fosfato del esqueleto polianiónico del DNA. Cinco histinas principales cumplen una funcion estructural en organización del nucleosoma y cromatina H1 se presenta en tejidos y algunas especies las otras cuatro están altamente conservadas. El grado de condensación del DNA se regula en parte mediante la acetilación, fosforilación y metilación de las histonas,estas también se ven implicadas en mecanismos de control de expresión genética. PROTEÍNAS NO HISTÓNICAS En la cromatina se encuentran distintas proteínas mas variables a) Con función estructural CONDENSACION DEL DNA SUPERENROLLAMIENTO Doble Helicedextrorsa de tipo B EMPAQUETAMIENTO Plegamiento o compactacion de la molecula DNA debido a la asociacion con proteinas,paradar lugar a nucleoproteinas
  • 4. Proteínas básicas Protaminas: función equivalente a las histonas en tipos celulares concretos,en menor tamaño permite la compactación del DNA en el espacio mínimo disponible en el espermatozoide . • Proteínas ácidas: HMG: un 5% (high mobility group), proteínas de alta movilidad electroforética debido a su carácter ácido,algunas se asocian al nucleosoma en cambio otras interaccionan con el DNA espaciador este incluye también factores de transcripción . Proteínas del esqueleto o matriz nuclear: Esta estructura, que sirve de soporte o guía en el empaquetamiento de la cromatina b) Con otras funciones asociadas con cromatina en cantidad pequeña y sin función estructural. Niveles de condensación del DNA nuclear eucariótico condensación del DNA se describe aquí en cuatro niveles esto se define como el cociente entre la longitud del B-DNA bicatenario y el tamaño del mismo una vez condensado esto sirve para los distintos grados de conpactacion . Es importante indicar que la condensación y la descondensación a través de esos niveles están estrechamente asociadas a la progresión por las distintas fases del ciclo celular Disposición en nucleosomas y fibra de 10 nm
  • 5. se considera la unidad elemental constituyente de la cromatina y de los cromosomas, siendo así responsable de la organización estructural del material genético en todos los organismos eucarióticos.. Cada nucleosoma está formado por 9 moléculas de histonas y un tramo de la molécula de DNA con aproximadamente 200 pb ‘estructura en cuentas de rosario’ .Es una estructura de nucleosomas espaciados a lo largo de la molécula de DNA, pues su grosor corresponde al diámetro del nucleosoma. El grado de empaquetamiento alcanzado es unas 6 veces superior al de la doble hélice del DNA extendida. Formación de la fibra de 30 nm La fibra mas condesada en la preparaciones in vitro y da un empaquetamiento de 40 veces mas doble hélice original . La fibra de 30 nm es probablemente la forma fisiológica más descondensada de la cromatina, adoptada por la mayor parte del DNA durante la interfase. Cromatina o cromosoma interfásico Este nivel de condensación supone la presencia de lazos y superenrollamientos de la estructura anterior. Los bucles o asas radiales que emergen de un armazón de proteínas no histónicas denominado andamiaje, matriz o esqueleto nuclear Esta diversidad local en la densidad de condensación se observa en forma de la presencia simultánea de eucromatina y heterocromatina en una célula en interfase
  • 6. EL CROMOSOMA METAFÁSICO Morfología de los cromosomas Se llama centrómero, a la región más estrecha del cromosoma metafásico, por donde permanecen unidas las dos cromátidas este delimita además los brazos cromosómicos .Los cromosomas se clasifican atendiendo a la posición del centrómero y, por tanto, según el tamaño relativo de los brazos Cariotipo y su análisisconstitucion cromosómica de un individuo ,es un rasgo carecteristico de cada especie de conjunto de cromosomas Su análisis se realiza habitualmente enprofase o en metafase se emplean en análisis de anomalía cromosómica
  • 7. Bandeado La organización estructural del genoma mostranso asi la composición de las bases grado de condensación, conformación de la cromatina, secuencias repetitivas y no transcritas con tinciones especiales se pueden observar en los cromosomas bandas pálidas y oscuras alternativamente, que definen grandes regiones cromosómicas llamadas isocoros a) Bandeo G desnaturalización controlada de las proteínas cromosómicas y la mas usada seguida de giemsa b) Bandeo Q Tinción fluorescente, como mostaza de quinacrina (hidrocloruro de quinacrina), que se intercalan en el DNA bicatenario aquí necesariamente se utiliza microosscopia gluoresente
  • 8. c) Bandeo R Utilización de calor (para desnaturalizar el DNA rico en AT), antes de la tinción con Giemsa. d) Bandeo T las de tinción más intensa, y se visualizan empleando un tratamiento térmico particularmente severo antes de teñir los cromosomas con Giemsa o una combinación de tinciones y fluorocromos Métodos especiales bandeo C, para regiones heterocromáticas; tinción NOR, para la región organizadora del nucléolo, que contiene los genes de rRNA 18S y 28S; bandeo de profase y prometafase, o de alta resolución y finalmente a citogenética molecular emplea sondas de DNA clonado (preparadas por técnicas de DNA recombinante, pág. 180) para examinar cromosomas, de forma similar a los ensayos de hibridación molecular pero sobre preparaciones de cromosomas completos. Ésta es la técnica denominada hibridación in situ con fluorescencia (FISH, fluorescence in situ hybridization) Regiones con significado funcional Tres elementos eseciales para funcionamiento correcto ciclo celular el centrómero (lugar de unión del cromosoma a las fibras del huso acromático) además los cinetocoros, estructuras proteicas en las que se anclan las fibras que constituyen el huso acromático o huso mitótico. . La ausencia de centrómero impide que el cromosoma se una al huso mitótico y con ello que se reparta de manera correcta entre las células hijas. , los telómeros (regiones que constituyen los extremos de los cromosomas) Funciones importantes estabilización y mantenimiento de la integridad estructural del cromosoma: en ausencia de telómeros permiten a las enzimas encargadas de la reparación del DNA diferenciar entre el extremo natural del cromosoma asegura la replicación completa de los extremos del cromosoma. la arquitectura tridimensional del núcleo o la del emparejamiento cromosómico y los orígenes de replicación (puntos numerosos en cada cromosoma donde se inicia la copia de las dos hebras de DNA).