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Presentación de artículos
Mecanismos de detección de nutrientes a lo largo de la evolución
Universidad de Guadalajara
Doctorado en Ciencias en Procesos Biotecnológicos
Centro Universitario de Ciencias Exactas e Ingenierías
Guadalajara, Jalisco. a 24 de agosto del 2021
BIOQUIMICA GENERAL AVANZADA
DR. Viveros Juan Manuel
Presenta
Mtra. Ginna Alejandra Villalobos Guzmán
TABLA DE CONTENIDO
• Procariotas ……………………………………………………………………………………………………….
• Quimiorreceptores: Acoplan las concentraciones de nutrientes extracelular a la
motilidad celular…………………………………………………………………………………………………
• Proteínas PII: controladores de la asimilación de Nitrógeno………………………………..
• Eucariotas: sistema de detección de nutrientes exclusivos de la levadura
……………………………………………………………………………………………………………………………
• MEP2: un sensor de amonio extracelular putativo………………………………………………
• Detección de aminoácidos extracelulares: la vía SPS…………………………………………..
• SNF3 Y Rgt2: Sensores de glucosa extracelular…………………………………………...........
• Vías de detección de nutrientes conservadas desdela levadura hasta los
mamíferos………………………………………………………………………………………………………….
• AMPK: un indicador de combustible eucariota…………………………………………………..
• GCN2: un sensor de privación de aminoácidos ………………………………………………….
• TOR/mTOR: Reguladores maestros del crecimiento…………………………………………….
Procariotas
Mecanismos para detectar
diversos nutrientes
Adaptarse a vivir en ambientes, donde
varían las [ ] y los nutrientes pueden ser
impredecibles.
Otros mecanismos
Enzimas o
receptores
Detecciones
indirectamente
Quimiorreceptores: Acoplan las [ ] de nutrientes extracelular a la
motilidad celular
Quimiorreceptores: Acoplan las [ ] de nutrientes extracelular a la
motilidad celular
Proteínas PII: Controladores de la asimilación de nitrógeno
Las proteínas PII
detectan la
deficiencia del N
Aunque varíen
en estructura y
funciones
Aumentan la asimilación
del N
Dos formas:
1. No modificadas
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Se unen y activan la
enzima
adeniltransferasa
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PII
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Uridila
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Uridila
Eucariotas
Sistemas de detección de nutrientes exclusivos de la levadura
MEP2: Sensor de amonio extracelular putativo
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Amonio
glutamina
Reprime la transcripción de genes
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2. Metabolización Proteínas MEP (Metilamina permeasa)
MEP1 MEP3
MEP2
Detección de aminoácidos extracelulares: la vía SPS
Coordina varias vías
Detecta
aminoácidos
Altera la expresión génica
y decisiones del desarrollo
Rutas:
GCN2 y
TOR
1. la transcripción de genes
2. Metabolismo de aminoácidos
Actúa como sensor
directo
Ruta: Ssy-Ptr3-Ssy5
(SPS)
Snf3 y Rgt2: Sensores de glucosa extracelulares
Represión de catabolitos de carbono,
glucosa y fructosa
Fuentes de C
menos preferidas
Nivel transcripcional
Regula (Rgt1)
Se unen a 2
tipos de
sensores:
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HXT expresión
Snf3 Rgt2
Factor de
transcripción
Recluta:
Mth1 y Std1
Vías de detección de nutrientes conservados desde la levadura hasta los mamíferos
Vías AMPK, GCN2 y TOR
Regulan la
conducta
alimentaria
Detección de
nutrientes esenciales
Conservan
• Aminoácidos
• Glucosa
AMPK: Un indicador de combustible eucariota
Sensor de
energía clave
Balance
energético
Homeostasis
Proteína
quinasa
activada por
AMP
Dirigida por serina/treonina
(AMPK)
• Captación de
glucosa
• Glucolisis
• Inhibe la síntesis
del glucógeno
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1. Acetil-CoA
2. ACC
3. HMG-CoA
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4. Enzimas limitantes
5. Síntesis de ácidos
grasos, colesterol
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cargados
GCN2
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Respuesta estricta
Atenúa la
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privación de
aminoácidos
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ribosomas
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nucleótidos
impares
Promueven la
supervivencia
Genes implicados
en la biosíntesis de
aminoácidos
Regular al
laza la
transcripción
ATF4 Cascada de
reguladores
transcripcional • Apoptosis
• Autofagia
• Metabolismo de
aminoácidos
• Regulaciones
positivas de
sintetasas
• Transportadores
de aminoácidos
TOR/mTOR: Reguladores maestros del crecimiento
Conclusiones
• Los sensores de nutrientes tienen estructuras y funciones similares, como
las transceptores que atraviesan la membrana como MEP2 y Ssy1 y hasta las
quinasas citosólicas AMPK Y GCN2.
• Pueden detectar nutrientes de interés, como el amonio por MEP2, o
indirectamente a través de un metabolito como lo es 2-OG por las proteínas
PII.
• Si bien la detección directa de nutrientes da un buen reflejo de vías
generales, mientras que en la detección indirecta puede permitir que el
sensor detecte cada nutriente, como se pudo observar en las vías GS/GOGAT.
• Las células eucariotas, la vacuola/lisosoma emergió como un
compartimiento de almacenamiento de nutrientes; y dando como función la
mTORC1 para detectar el contenido y/o función lisosomal. También, se sabe
que la ausencia de leucina y arginina inhibe la señalización de Mtorc1.
Referencias
Chantranupong, L., Wolfson, R. L., & Sabatini, D. M. (2015). Nutrient
Sensing Mechanisms Across Evolution. Cell, 161(1): 67–83.
Plataforma de BioRender. https://app.biorender.com/
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Articulo 3-mecanismos de detección de nutrientes a lo largo de la evolu

  • 1. Presentación de artículos Mecanismos de detección de nutrientes a lo largo de la evolución Universidad de Guadalajara Doctorado en Ciencias en Procesos Biotecnológicos Centro Universitario de Ciencias Exactas e Ingenierías Guadalajara, Jalisco. a 24 de agosto del 2021 BIOQUIMICA GENERAL AVANZADA DR. Viveros Juan Manuel Presenta Mtra. Ginna Alejandra Villalobos Guzmán
  • 2. TABLA DE CONTENIDO • Procariotas ………………………………………………………………………………………………………. • Quimiorreceptores: Acoplan las concentraciones de nutrientes extracelular a la motilidad celular………………………………………………………………………………………………… • Proteínas PII: controladores de la asimilación de Nitrógeno……………………………….. • Eucariotas: sistema de detección de nutrientes exclusivos de la levadura …………………………………………………………………………………………………………………………… • MEP2: un sensor de amonio extracelular putativo……………………………………………… • Detección de aminoácidos extracelulares: la vía SPS………………………………………….. • SNF3 Y Rgt2: Sensores de glucosa extracelular…………………………………………........... • Vías de detección de nutrientes conservadas desdela levadura hasta los mamíferos…………………………………………………………………………………………………………. • AMPK: un indicador de combustible eucariota………………………………………………….. • GCN2: un sensor de privación de aminoácidos …………………………………………………. • TOR/mTOR: Reguladores maestros del crecimiento…………………………………………….
  • 3. Procariotas Mecanismos para detectar diversos nutrientes Adaptarse a vivir en ambientes, donde varían las [ ] y los nutrientes pueden ser impredecibles. Otros mecanismos Enzimas o receptores Detecciones indirectamente
  • 4. Quimiorreceptores: Acoplan las [ ] de nutrientes extracelular a la motilidad celular
  • 5. Quimiorreceptores: Acoplan las [ ] de nutrientes extracelular a la motilidad celular
  • 6.
  • 7.
  • 8. Proteínas PII: Controladores de la asimilación de nitrógeno Las proteínas PII detectan la deficiencia del N Aunque varíen en estructura y funciones Aumentan la asimilación del N Dos formas: 1. No modificadas 2. Uridiladas Se unen y activan la enzima adeniltransferasa (ATasa) codificada por el glnE para adenilar el GS Estimula la actividad de desadenilación de ATasa GlnB y GlnK Relacionadas E. Coli La adenilación de GS Al inhibir reduce la asimilación de N.
  • 9. La detección del Nitrógeno Enzima uridililtransferasa (UTasa) Proteínas PII codificada por el glnD Uridila Inhibida por glutamina No puede uridilar GlnB
  • 10. Uridila Eucariotas Sistemas de detección de nutrientes exclusivos de la levadura
  • 11. MEP2: Sensor de amonio extracelular putativo Conjunto de diversos compuestos que contienen Amonio (NH4) Reacciones bioquímicas se obtiene el nitrógeno Presencia de fuentes deseadas Catabólito Amonio glutamina Reprime la transcripción de genes 1. Eliminación 2. Metabolización Proteínas MEP (Metilamina permeasa) MEP1 MEP3 MEP2
  • 12. Detección de aminoácidos extracelulares: la vía SPS Coordina varias vías Detecta aminoácidos Altera la expresión génica y decisiones del desarrollo Rutas: GCN2 y TOR 1. la transcripción de genes 2. Metabolismo de aminoácidos Actúa como sensor directo Ruta: Ssy-Ptr3-Ssy5 (SPS)
  • 13. Snf3 y Rgt2: Sensores de glucosa extracelulares Represión de catabolitos de carbono, glucosa y fructosa Fuentes de C menos preferidas Nivel transcripcional Regula (Rgt1) Se unen a 2 tipos de sensores: Son necesarios para activar HXT expresión Snf3 Rgt2 Factor de transcripción Recluta: Mth1 y Std1
  • 14. Vías de detección de nutrientes conservados desde la levadura hasta los mamíferos Vías AMPK, GCN2 y TOR Regulan la conducta alimentaria Detección de nutrientes esenciales Conservan • Aminoácidos • Glucosa
  • 15. AMPK: Un indicador de combustible eucariota Sensor de energía clave Balance energético Homeostasis Proteína quinasa activada por AMP Dirigida por serina/treonina (AMPK) • Captación de glucosa • Glucolisis • Inhibe la síntesis del glucógeno Fosforila e inactiva: 1. Acetil-CoA 2. ACC 3. HMG-CoA Reductasa 4. Enzimas limitantes 5. Síntesis de ácidos grasos, colesterol
  • 16. GCN2: Sensor de privación de aminoácidos Detecta los ARNt no cargados GCN2 Vía control general de aminoácidos no reprimible Vía paralela en los niveles intracelulares Respuesta estricta Atenúa la traducción Acumula la privación de aminoácidos Se une directamente a los ribosomas Producen nucleótidos impares Promueven la supervivencia Genes implicados en la biosíntesis de aminoácidos Regular al laza la transcripción ATF4 Cascada de reguladores transcripcional • Apoptosis • Autofagia • Metabolismo de aminoácidos • Regulaciones positivas de sintetasas • Transportadores de aminoácidos
  • 18. Conclusiones • Los sensores de nutrientes tienen estructuras y funciones similares, como las transceptores que atraviesan la membrana como MEP2 y Ssy1 y hasta las quinasas citosólicas AMPK Y GCN2. • Pueden detectar nutrientes de interés, como el amonio por MEP2, o indirectamente a través de un metabolito como lo es 2-OG por las proteínas PII. • Si bien la detección directa de nutrientes da un buen reflejo de vías generales, mientras que en la detección indirecta puede permitir que el sensor detecte cada nutriente, como se pudo observar en las vías GS/GOGAT. • Las células eucariotas, la vacuola/lisosoma emergió como un compartimiento de almacenamiento de nutrientes; y dando como función la mTORC1 para detectar el contenido y/o función lisosomal. También, se sabe que la ausencia de leucina y arginina inhibe la señalización de Mtorc1.
  • 19. Referencias Chantranupong, L., Wolfson, R. L., & Sabatini, D. M. (2015). Nutrient Sensing Mechanisms Across Evolution. Cell, 161(1): 67–83. Plataforma de BioRender. https://app.biorender.com/