Microbiota

1. Tema VI
Integración de los agentes
biológicos en la práctica médica.
Microbiota. Enfermedades emergentes y
reemergentes. Bioterrorismo.
Colectivo de autores Microbiología y Parasitología

2. Objetivos.
 Definir los conceptos de microbiota, enfermedades
emergentes, reemergentes y bioterrorismo.
 Mencionar los microorganismos más frecuentes que
forman parte de la microbiota del cuerpo humano.
 Mencionar los microorganismos más frecuentes como
causas de enfermedades infecciosas.
 Caracterizar el terrorismo con agentes biológicos.
 Ejemplificar las enfermedades emergentes y
reemergentes y el bioterrorismo.

3. Contenido:
 Microbiota del cuerpo humano: concepto,
clasificación, MO más frecuentes.
 Microorganismos más frecuentes en la comunidad:
IRA, EDA, ITS, SNI
 Enfermedades emergentes y reemergentes: conceptos,
ejemplos.
 Bioterrorismo: concepto, características, ejemplos.

4. Bibliografía:
 Presentación digital.
 Llop Hernández A, Valdés-Dapena Vivanco M,
Zuazo Silva JL. Microbiología y Parasitología
Médicas. Edit. Ciencias Médicas, Ciudad de La
Habana, Cuba, 2001.

5. MICROBIOTA DEL
CUERPO HUMANO

6. Microbiota normal: Especies microbianas que habitan de
manera natural en las superficies de la piel y las mucosas en
simbiosis con el hospedero.
Hay dos tipos:
-Microbiota residente: aquella que se encuentra
constantemente en una región anatómica dada.
-Microbiota transitoria: microorganismos del ambiente que
se instalan durante cierto tiempo en una región.

7. Bacteria patógena y bacteria saprófita:
-E. coli era considerada solo una bacteria saprófita de la
microbiota normal intestinal; sin embargo, es capaz de
producir infecciones a otros niveles, ej. ITU
-S. viridans es microbiota normal en la orofaringe, pero puede
causar endocarditis.
Patógeno oportunista o condicional:
-Un “patógeno clásico” (S. aureus) aislado sin relación con un
cuadro clínico, no tiene valor.
-Un saprófito(S. epidermidis) asociado a síntomas, sí hay que
darle valor.

8. BOCA, OROFARINGE Y NASOFARINGE:
-Fundamentalmente bacterias anaerobias.
-Bacterias aerobias más frecuentes: géneros Streptococcus,
Haemophilus y Neisseria.
Se asocian a enfermedad si se introducen en localizaciones
normalmente estériles (senos paranasales, oído medio, cerebro).
-Microorganismos potencialmente patógenos: Streptococcus
pyogenes, Streptococcus pneumoniae, S. aureus, Neisseria
meningitidis, Haemophilus influenzae, Branhamella catarrhalis y
Enterobacteriaceae.

9. OÍDO:
-Estafilococo coagulasa negativo.
-Se han aislado también otros microorganismos que
colonizan la piel, así como patógenos potenciales como
Streptococcus pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa y
especies de la familia Enterobacteriaceae.
OJOS:
Estafilococos coagulasa negativos, así como
microorganismos poco frecuentes que se asocian a la
nasofaringe (p. ej., Haemophilus spp., Neisseria spp.,
Streptococcus viridans).

10. VÍAS RESPIRATORIAS INFERIORES:
-Suelen ser estériles, aunque pueden tener una colonización
transitoria por secreciones de las vías respiratorias superiores.
-Por regla general, la enfermedad aguda de las vías
respiratorias inferiores se debe a bacterias orales más
virulentas (S. aureus, S. pneumoniae y enterobacterias como
Klebsiella).

11. ESÓFAGO:
-Levaduras y bacterias orofaríngeas, la mayoría
colonizadores temporales .
-Las bacterias rara vez causan enfermedad en el esófago. La
mayor parte de las infecciones son debidas a Candida spp. y a
virus como el herpes simple o el citomegalovirus.
ESTÓMAGO:
-Bacterias con tolerancia a los ácidos, como Helicobacter pylori.
INTESTINO DELGADO:
-Numerosas bacterias, hongos y parásitos generalmente
anaerobios.

12. INTESTINO GRUESO:
-Número más elevado de microorganismos que cualquier otra
localización corporal: más de 10n bacterias/g.
-Más frecuentes: Bacteroides, Enterococcus y Enterobacterias.
-Levaduras y parásitos no patógenos.
-La exposición a otros microorganismos patógenos intestinales,
como Shigella, ECEH y Entamoeba histolytica, puede alterar la
MB del colon y ocasionar la aparición de enfermedades
intestinales significativas.

13. URETRA ANTERIOR:
-Lactobacilos, estreptococos y estafilococos coagulasa negativos.
-Puede haber colonización transitoria por MO fecales, como
Enterococcus, Enterobacterias y Candida.
VAGINA:
-Recién nacidas: lactobacilos.
-A partir de 6 semanas cuando disminuyen estrógenos maternos:
estafilococos, estreptococos y enterobacterias.
-Pubertad se inicia la producción de estrógenos: lactobacilos
como MO predominantes, además, estafilococos, estreptococos,
Enterococcus, Gardnerella, Mycoplasma, Ureaplasma,
enterobacterias y diversas bacterias anaerobias.

14. Piel:
Microorganismos más frecuentes:
-Bacterias grampositivas (Estafilococo coagulasa negativo y,
menos a menudo, S. aureus, corinebacterias y
propionibacterias).
-Clostridium perfringens se aisla en la piel de
aproximadamente el 20% de las personas sanas.
-Los estreptococos son capaces de colonizar la piel de forma
transitoria.
-Hongos: Candida y Malassezia, pueden también localizarse
sobre las superficies cutáneas, en especial en las
localizaciones húmedas.

15. Factores que afectan el mantenimiento de
la microbiota
1. Nutrientes
2. pH
3. Temperatura
4. Humedad
5. Potencial redox
6. Resistencia a sustancias naturales
7. Presencia de receptores celulares
8. Interferencia bacteriana

16. Efectos beneficiosos de la microbiota
1. Activación del sistema inmune.
2. Interferencia bacteriana:
a. Bifidobacterias y lactancia materna
b. Lactobacilos y microbiota vaginal
c. Tto antimicrobiano y C. difficile
3. Producción de nutrientes esenciales.

17. Papel de la microbiota normal en la
infección: Patógenos Oportunistas
• E. coli puede producir ITU por vía ascendente.
• Perforación colónica y peritonitis.
• Endocarditis por Streptococcus viridans.
• Inmunodepresión e infección.

18. AGENTES BIOLÓGICOS MÁS
FRECUENTES
EN LA COMUNIDAD

19. Infecciones Respiratorias Agudas (IRA).
1-Concepto:
Enfermedades del aparato respiratorio causadas por agentes
biológicos, que suelen durar corto período de tiempo, con
incubación corta, evolución variable y se transmiten por vía
respiratoria.
2-Clasificación:
a) Según su localización anatómica:
-Altas (hasta la laringe): Faringitis, amigdalitis, epiglotitis y
laringitis.
-Bajas (desde tráquea en adelante): Traqueítis, bronquitis,
bronquiolitis y neumonía.
b) Según el agente: Bacterianas, virales y micóticas; poco
importante la causa parasitaria.

20. BACTERIAS VIRUS HONGOS
Streptococcus pneumoniae
(neumococo)
Influenza tipos A, B y C Candida albicans
Haemophilus influenzae Parainfluenza Histoplasma
capsulatum
Streptococcus pyogenes
(Estreptococo grupo A)
Sincitial Respiratorio
(VSR)
Aspergillus spp
Staphylococcus aureus Adenovirus
respiratorios
Cryptococcus
neoformans
Pseudomonas aeruginosa Coronavirus
Klebsiella pneumoniae Rinovirus
Mycoplasma pneumoniae
Corynebacterium
diphteriae
Legionella pneumophila
Bordetella pertusis
Agentes biológicos productores de IRA:

21. Enfermedades Diarréicas Agudas (EDA).
1-Concepto:
Enfermedades del aparato digestivo causadas por agentes
biológicos, que suelen tener corta duración, con incubación
corta, evolución variable y son transmitidas por vía oral.
2-Clasificación:
a) Según el tipo de agente etiológico se clasifican en:
bacterianas (23%), parasitarias (14%) y virales (13%).

22. BACTERIAS VIRUS PARÁSITOS
Salmonella enterica (y sus
serotipos)
Rotavirus Entamoeba histolytica
Shigella (diferentes especies) Adenovirus Giardia lamblia
Escherichia coli (EC)
enteropatógena
Astrovirus Cryptosporidium spp.
EC enterotoxigénica Calicivirus
EC enteroinvasiva Reovirus
EC enterohemorrágica
EC enteroagregativa
EC difusamente adherente
Campylobacter jejuni
Yersinia enterocolitica
Vibrio cholerae O1
Vibrio cholerae No-O1
Aeromonas (varias especies)
Plesiomonas shigeloides
Principales agentes biológicos causantes de EDA

23. Infecciones de Transmisión Sexual (ITS).
1-Concepto:
Infecciones causadas por gran diversidad de agentes
biológicos, transmitidas a través de relaciones sexuales y que
afectan principalmente a los órganos genitales.
2-Clasificación:
a) Según el tipo de agente biológico se clasifican en:
bacterianas, virales, parasitarias y micóticas.

24. AGENTES ETIOLOGICOS Enfermedades o SINDROMES
Bacterias:
Neisseria gonorrhoeae Blenorragia o gonorrea
Chlamydia trachomatis Hombre: uretritis
Mujer: cervicitis, inflamaciones pélvicas
Treponema pallidum Sífilis
Haemophilus ducreyi Chancro blando o chancroide
Klebsiella granulomatis Granuloma inguinal
Mycoplasma hominis Salpingitis, enfermedad inflamatoria pélvica
Ureaplasma urealyticum Uretritis
Gardnerella vaginalis en asociación con bacterias
anaeróbicas de la microbiota vaginal
Vaginosis bacteriana
Shigella, Salmonella, Campylobacter Infecciones entéricas
Virus:
Herpes simple tipo 2 ( y tipo1) Herpes genital y labial
Papiloma humano Condilomas, cáncer cérvico-uterino
Virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) Síndrome de inmunodeficiencia adquirida (Sida)
Virus Hepatitis B Hepatitis B
Parásitos:
Trichomonas vaginalis Vulvovaginitis, uretritis
Entamoeba histolytica, Giardia lamblia EDA
Hongos:
Candida sp Vulvovaginitis, balanopostitis
Infecciones de Transmisión Sexual (ITS).

25. OMS, 2016. REPORTE DE ITS A NIVEL MUNDIAL
(CAUSA BACTERIANA)
131 millones
78 millones
5,6 millones

26. Síndromes Neurológicos Infecciosos (SNI).
1-Concepto:
Son infecciones del sistema nervioso central producidas por
agentes biológicos.
La principal forma clínica es la meningoencefalitis, que cursa
de forma aguda y se presenta fundamentalmente en brotes.
2-Clasificación:
Según el tipo de agente etiológico se clasifican en: virales
(principal causa), bacterianas, micóticas y parasitarias (raras).

27. Agentes causantes de SNI:
VIRUS BACTERIAS HONGOS PARÁSITOS
Coxsackie A y
Coxsakie B
Streptococcus pneumonie
(neumococo)
Cryptococcus
neoformans
Amebas de vida
libre
Echovirus Haemophilus influenzae
tipo b
Angiostrongylus
cantonensis
Herpesvirus Neisseria meningitidis
(meningococo)
Estreptococos
Estafilococos
Mycobacterium tuberculosis
Listeria monocytogenes
Enterobacterias (en recién
nacidos)

28. ENFERMEDADES EMERGENTES
Y
RE-EMERGENTES

29. A partir de los años 70 del pasado siglo XX comienzan a
aparecer nuevas enfermedades transmisibles hasta entonces
desconocidas, o reaparecen otras que se pensaba habían
desaparecido. Surgieron entonces las llamadas enfermedades
emergentes y reemergentes.
Factores que favorecen su aparición:
-Malas condiciones sociales, económicas y políticas.
-Deterioro de los servicios de salud.
-Migraciones hacia las ciudades y hacia países desarrollados.
-Transmisión de enfermedades de países desarrollados a
países pobres.
-Relaciones sexuales precoces.
-Contaminación ambiental, tala de árboles, construcciones
(carreteras, etc) que irrumpen en los ecosistemas y los alteran.
-Calentamiento global.

30. Concepto de enfermedad emergente:
Se consideran dentro de las enfermedades emergentes:
1. Nuevas enfermedades no conocidas con anterioridad,
por ejemplo el síndrome de inmunodeficiencia adquirida
(Sida)
2. Enfermedades conocidas pero que resurgen con
síntomas y signos diferentes, como es la enfermedad
pulmonar por Hantavirus (que antes solo producían
fiebre hemorrágica).
3. Enfermedades ya conocidas que aparecen donde no
existían previamente, por ejemplo la fiebre por virus del
Nilo Occidental en los Estados Unidos.
La relación de enfermedades emergentes está en constante
incremento, a medida que aparecen nuevas enfermedades y
nuevos agentes.

31. ENFERMEDAD EMERGENTE AGENTE ETIOLÓGICO
Criptosporidiosis Protozoos del género Cryptosporidium
Enfermedad diarréica aguda (EDA) Campylobacter jejuni
EDA Escherichia coli O157 H7
EDA Rotavirus
Enfermedad de Lyme Borrelia burgdorferi
Legionelosis (Enfermedad de los
Legionarios y Fiebre de Pontiac)
Legionella pneumophila
Fiebre hemorrágica (FH) africana Virus Ebola-Marburg
FH Argentina, boliviana y venezolana Virus Junín, Machupo y Guanarito
Gastritis y úlcera gastroduodenal Helicobacter pylori
Eritema infeccioso Parvovirus B19
Hepatitis víricas C, D y E Virus hepatitis C, D y E
Síndrome de inmunodeficiencia adquirida Virus de inmunodeficiencia humana
Síndrome pulmonar Hantavirus
Enfermedad por Arañazo de Gato Bartonella henselae
Síndrome de shock tóxico Staphylococcus aureus
Síndrome respiratorio agudo severo Coronavirus
Fiebre del Nilo Occidental (en EE. UU) Virus del Nilo Occidental
Influenza Virus Influenza A (H5 N1) y A(H1N1)

32. Concepto de enfermedad reemergente:
Enfermedad que resurge después de haberse logrado un
control que proporcionó una considerable declinación de su
incidencia en la mayoría de los países y que actualmente
aumenta de forma significativa.

33. ENFERMEDAD REEMERGENTE AGENTE ETIOLÓGICO
Tuberculosis pulmonar Mycobacterium tuberculosis
Escabiosis Sarcoptes scabiei
Paludismo o malaria Esporozoarios del género
Plasmodium
Fascitis necrotizante Streptococcus pyogenes
Leptospirosis Leptospira interrogans
Fiebre amarilla Virus de la fiebre amarilla
Cólera Vibrio cholerae
Dengue Virus Dengue
Difteria Corynebacterium diphteriae
Peste Yersinia pestis

34. Al concepto de enfermedad reemergente se le une
actualmente el de las llamadas “enfermedades tropicales
olvidadas, descuidadas o abandonadas”. Son aquellas
enfermedades infecciosas que se presentan en los países
pobres o en grupos poblacionales de bajas condiciones
sanitarias dentro de países desarrollados, y que tienen como
causa el poco acceso a los medicamentos apropiados o
sistemas de salud inoperantes por falta de voluntad política,
además de falta de higiene y mala alimentación.

35. CDC, 2016: Enfermedades tropicales descuidadas (17):
BACTERIANAS: (4)
- Úlcera de Buruli (micobacteriosis)
- Lepra
- Pián (treponematosis)
- Tracoma (Chlamydia trachomatis)
VIRALES: (2)
- Dengue
- Rabia
PARASITARIAS: (11)
- Tripanosomiasis americana (Enfermedad de Chagas)
- Tripanosomiasis africana (Enfermedad del Sueño)
- Cisticercosis
- Dracunculosis
- Equinococosis
- Fasciolosis
- Leishmaniasis
- Filariasis linfática
- Oncocercosis
- Esquistosomiasis
- Geohelmintiasis (A. lumbricoides, T. trichiura, N. americanus, A. duodenales)

36. BIOTERRORISMO

37. El bioterrorismo se define como el uso de armas
biológicas potencialmente devastadoras de
asentamientos humanos, de animales, vegetación,
aguas y demás recursos naturales con fines
terroristas. Las bioarmas funcionan como “armas de
terror”, ya que son capaces de precipitar un
comportamiento masivo negativo como es el pánico
y el desorden civil, debido a que la reacción
psicológica de los afectados sin duda sobrepasa
sus posibilidades de adaptación psicoemotiva.

38. Historia de la guerra biológica
Siglo VI AC – Lo asirios envenenaron los pozos de sus
enemigos con cornezuelo de centeno.
Siglo VI AC – Solón de Atenas envenena los abastecimientos
de agua con eléboro (col de mofeta), una hierba purgante,
durante el sitio de Krissa.
184 AC – las fuerzas de Aníbal lanzan sobre el enemigo potes
de barro llenos de serpientes.
1346 – el ejército Tatar lanza sus cabalgaduras muertas por
peste sobre las paredes de la ciudad.
1422 – Batalla de Carolstein, cuerpos de monturas muertos por
peste más 2000 cargas de excremento son lanzadas sobre el
enemigo.

39. Cronología de las agresiones biológicas contra Cuba.
AÑO AGRESIÓN
1962 Enfermedad de Newcastle
1971 Fiebre porcina africana
1979-1981 Conjuntivitis hemorrágica, roya, moho azul
1981 (mayo) Epidemia de dengue hemorrágico
(virus dengue tipo 2)
1981 (agosto) Pseudodermatosis nodular bovina
1989 Mamilitis ulcerativa
1993 Enfermedad hemorrágica viral del conejo
1996 Varroasis. Thrips palmi. Broca. Acaro del arroz

40. Blanco de ataque de los agentes biológicos
introducidos en Cuba.
HUMANOS ANIMALES PLANTAS
Dengue
hemorrágico
Enfermedad de Newcastle
(aves)
Roya (caña de
azúcar)
Conjuntivitis
hemorrágica
Fiebre porcina africana
(cerdo)
Moho azul
(tabaco)
Pseudodermatosis
nodular bovina
Broca (café)
Mamilitis ulcerativa
(ganado vacuno)
Acaro del arroz
Enfermedad hemorrágica
del conejo
Thrips palmi
(papa)
Varroasis (abejas)

41. ¿Qué hace al uso de agentes biológicos
atractivos a los terroristas?
– Facilidad de adquisición
 Información fácilmente disponible en la Web
 Colección de cultivos tipo Americano, otras fuentes
– Producción fácil y económica
 Sólo se necesita equipo básico de microbiología
 Pequeños laboratorios no requieren licencias especiales
 Inversión causa 50% de víctimas por km2 :
Armas convencionales $2000, nuclear $800, ántrax $1
– Letalidad
 50 kg ántrax aerosolizado = 100,000 mortalidad
 Experiencia de Sverdlovsk, antigua URSS

42. – Estabilidad
– Infectividad
 Agentes como armas pueden ser fácilmente diseminados
 Síntomas clínicos días a semanas después del ataque
– Poca visibilidad
– Fácil y oculta liberación
 Liberación remota, retrasada, indetectable
 Difícil/imposible rastrear el origen del agente
¿Qué hace al uso de agentes biológicos
atractivos a los terroristas?

43. Rutas de liberación para agentes biológicos
- Aerosol es el método más probable para diseminación
Dispersión silenciosa, fácil
Número máximo de víctimas expuestas
Inhalación es más eficiente y contagiosa ruta de infección
- Dispersión a través de agua/alimentos es menos probable
Menos estable, no efectivo para algunos agentes
Ineficiente comparado con aerosol

44. Eventos sugerentes de liberación
de un arma biológica
 Múltiples personas enfermas al mismo tiempo (epidemia)
 Personas afectadas, previamente sanas
 Alta morbi-mortalidad entre los afectados
 Identificación de enfermedades y patógenos no usuales en
una región en particular
 Recientes demandas o actividad terrorista
 Epizootias o muertes de animales inexplicables

45. Eventos sugerentes de liberación
de arma biológica
 Enfermedad respiratoria severa en huésped sano
 Una curva epidémica creciendo y disminuyendo rápidamente
 Aumento de fiebre, síntomas respiratorios y GI
 Tasas de ataque bajas en personas trabajando en exteriores vs
en interiores
 Enfermedad estacional durante diferentes tiempos del año
 Patógeno conocido con modelo de resistencia antimicrobiana
no usual
 Patógenos genéticamente idénticos en diferentes áreas

46. ¿Qué podemos hacer como médicos profesionales?
 Mantener un alto índice de sospecha incluyendo agentes
biológicos en diagnóstico diferencial
 Aprender a reconocer hallazgos históricos y de examen físico
sugestivos de exposición a armas biológicas
 Mantenerse informado de tendencias epidemiológicas locales,
regionales y nacionales
 Conocer acerca del tratamiento y profilaxis de pacientes
expuestos a agentes biológicos
 Notificar exposiciones a agentes biológicos sospechosos y
enfermedades a las autoridades sanitarias.