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Por: 
Juan Diego Senior Betancur. 
Ana Cristina Toro Moreno.
INTRODUCTION 
Parkinson`s disease (PD) 
affects most of the 65 or 
more year old individuals. 
Genes involved in this 
disease are on the eye of 
many researchers. 
PTEN-induced putative kinase 1 (PINK 1), 
parkin, and DJ-1, are genes that have being 
identified to be associated wtih PD. 
In order to analyze the distribution of PINK1 
gene T313M polymorphisms in the Uygur and 
Han populations of China, patients with PD 
and healty individuals were investigated.
Enfermedad de Parkinson 
Enfermedad de Parkinson 
Afecta las células 
nerviosas 
progresivamente 
Dopamina 
Coordinar sus 
movimientos 
Nadie conoce el 
origen del daño de 
estas células
Gen PINK1 
• Nombre oficial: PTEN-induced putative kinase 1. 
• Contiene instrucciones para la producción de la 
proteína llamada PTEN-induced putative kinase 1. 
• Se cree que esta serina/treonina proteína 
mitocondrial kinasa, protege la mitocondria del mal 
funcionamiento durante periodos de estrés celular.
Polimorfismo T313M 
• Es la presencia de diferentes formas de un mismo 
gen(alelos) en una población. 
• Son variantes de una posición de la secuencia del 
DNA que coexisten simultáneamente. 
• Este polimorfismo se da por el intercambio de 
metionina por treonina en la posición 313 de la 
secuencia del DNA.
GENERAL OBJECTIVE 
• To investigate the association between T313M 
polymorphism at exon 4 of PINK1 gene and Parkinson´s 
disease in the Uygur and Han populations of Xinjiang, 
China.
MATERIALES Y MÉTODOS 
Se realizó de acuerdo con los 
criterios de diagnóstico del Banco 
Británico del cerebro . 
Los criterios de diagnóstico para la 
aparición temprana y de aparición 
tardía de PD se han definido por 
resonancia magnética y los 
exámenes de tomografía 
computarizada. 
Se excluyó a los pacientes con 
PD secundaria, síndromes de 
Parkinson-plus, las 
enfermedades del sistema 
nervioso, hipertiroidismo y otras 
enfermedades genéticas 
Criterios diagnósticos
Datos del paciente 
364 pacientes con 
enfermedad de Parkinson 
175 pacientes de la 
población Uygur 
99 hombres 
189 pacientes de la 
población Han 
76 mujeres 
107 hombres 
346 individuos sanos 
sin PD 
163 individuos de la 
población Uygur 
82 mujeres 
92 hombres 
183 individuos de la 
población Han 
71 mujeres 
101 hombres 
82 mujeres
Extracción de ADN 
se extrajo 2 ml de sangre 
venosa de cada paciente 
EDTA se utilizo como el anti-coagulante 
kit de extracción de sangre (Tiangen 
Biotech Co., Ltd., Beijing, China) 
Cebadores 
Software Primer3 se utilizó 
para diseñar las secuencias de 
los cebadores necesarios para 
el análisis de la PCR 
Las secuencias primer del 
exón 4 del gen PINK1 
fueron 
5'-GAATGTCAGTGC CAGTGTTGG-3 
'(continua) 
5'-AGATATGTTCCCTTT GCATGGC-3’ 
(inverso) 
429 
pb
PCR 
“Técnica de laboratorio que se utiliza para la 
amplificación in vitro, directa de un gen o un fragmento 
de DNA, o indirecta de un RNA” 
 Desnaturalización del DNA para 
dar hebras sencillas. 
 Hibridación especifica de la 
hebra sencilla con un 
oligonucleótido . 
 Replicación de la hebra sencilla 
por una DNA polimerasa a partir 
del oligonucleótido anterior que 
actúa como cebador. 
• DNA plantilla. 
• Primer`s: Fragmentos de DNA cortos 
(10-25pb) que hibridan con 
regionesespecificas conocidas del 
DNA. 
• DNTp`s: deoxinucleotidos (dATP, 
dGTP, dCTP, dTTP). 
• Buffer. 
• MgCl2. 
• DNA polimerasa.
RFLP 
RF corresponde a Restriction 
Fragments (fragmentos de restricción). Son los 
fragmentos de ADN resultantes del corte 
mediante enzimas de restricción. 
L corresponde a Length (longitud), y se refiere 
a la longitud de los fragmentos de restricción. 
P corresponde 
a Polymorphism (polimorfismo), palabra de 
origen griego que significa literalmente 
"muchas formas". La longitud de algunos de 
los fragmentos de restricción difiere en buena 
medida entre individuos, por lo cual son 
posibles muchas formas, o longitudes, de ADN.
RESULTADOS 
• Prueba de equilibrio Hardy-Weinberg: 
Mostro frecuencias genotipicas del PINK1 
iguales en los dos grupos . 
• Distribución de la frecuencia alélica del 
T313M
Figure 1. Genotypes of the PINK1 gene T313M polymorphism. Lanes 3 and 5 show 
homozygous mutant sequences which cannot be digested and remain as 429 bp 
fragments; type T/T. Lanes 1,2,4,6 and 7 show wild-type homozygous sequences that 
were digested into three fragments of 429, 265 and 164 bp; type C/T. M, 2,000 bp 
marker; PINK1, PTEN-induced putative kinase 1.
Figure 2. Sequencing of the fourth exon of the PINK1 gene in 
Parkinson's disease shows a mutation from C to T at the 938 site. The 
sequence around the mutation site is shown, with the arrow pointing 
to the substitution. PINK1, PTEN-induced putative kinase 1.
Researchers Observations Agree or disagree 
Klein et al In Italy, patients with 
sporadic early-on set 
disease have been 
reported to have relatively 
high mutation rates. 
Disagree 
Guo et al In patients with PD, the 
distribution of T313M 
polymorphisms was 
significantly different 
between patients from the 
Uygur and Han 
populations, and all were 
homozygous mutants. 
Disagree 
DISCUSSION
DISCUSSION 
Researchers Observations Agree or disagree 
Guo et al In Uygur, allele frecuencies in 
the PD group were not 
significantly different from the 
control group. While in Han 
population, allele frecuencies 
were signicantly different. 
Disagree 
Fung HC et al The mutation frecuency is wide. 
PINK1 gene mutation has not 
been observed in patients with 
sporadic PD in the USA. 
Disagree
PERSONALCONCLUSIONS 
• We think this investigation is a great step for the medical 
comunity, because it allows us to know better the influences 
that has the different polymorphisms of the genes in the 
parkinson´s disease. 
• This investigation not only shows us the mechanism of action 
of the genes in our body, but the different variables, such like 
age, gender, ethnicity and genetics that have an important 
influence in the parkinson’s disease. Giving us a bigger 
perspective for the future investigations.
PERSONALCONCLUSIONS 
• We think it´s impresive and very interesting how a 
factor like environment can affect in a mayor scale 
the polymorphisms of the genes in this disease. 
• Finally, like the cause of this disease is still 
unknown, we think this investigation gives a little bit 
of reference for more researchers to keep looking 
for answers, but we continue thinking this is just the 
begining for a long investigation.
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Seminario de biologia molecular 2014 UPB

  • 1. Por: Juan Diego Senior Betancur. Ana Cristina Toro Moreno.
  • 2. INTRODUCTION Parkinson`s disease (PD) affects most of the 65 or more year old individuals. Genes involved in this disease are on the eye of many researchers. PTEN-induced putative kinase 1 (PINK 1), parkin, and DJ-1, are genes that have being identified to be associated wtih PD. In order to analyze the distribution of PINK1 gene T313M polymorphisms in the Uygur and Han populations of China, patients with PD and healty individuals were investigated.
  • 3. Enfermedad de Parkinson Enfermedad de Parkinson Afecta las células nerviosas progresivamente Dopamina Coordinar sus movimientos Nadie conoce el origen del daño de estas células
  • 4. Gen PINK1 • Nombre oficial: PTEN-induced putative kinase 1. • Contiene instrucciones para la producción de la proteína llamada PTEN-induced putative kinase 1. • Se cree que esta serina/treonina proteína mitocondrial kinasa, protege la mitocondria del mal funcionamiento durante periodos de estrés celular.
  • 5. Polimorfismo T313M • Es la presencia de diferentes formas de un mismo gen(alelos) en una población. • Son variantes de una posición de la secuencia del DNA que coexisten simultáneamente. • Este polimorfismo se da por el intercambio de metionina por treonina en la posición 313 de la secuencia del DNA.
  • 6. GENERAL OBJECTIVE • To investigate the association between T313M polymorphism at exon 4 of PINK1 gene and Parkinson´s disease in the Uygur and Han populations of Xinjiang, China.
  • 7. MATERIALES Y MÉTODOS Se realizó de acuerdo con los criterios de diagnóstico del Banco Británico del cerebro . Los criterios de diagnóstico para la aparición temprana y de aparición tardía de PD se han definido por resonancia magnética y los exámenes de tomografía computarizada. Se excluyó a los pacientes con PD secundaria, síndromes de Parkinson-plus, las enfermedades del sistema nervioso, hipertiroidismo y otras enfermedades genéticas Criterios diagnósticos
  • 8. Datos del paciente 364 pacientes con enfermedad de Parkinson 175 pacientes de la población Uygur 99 hombres 189 pacientes de la población Han 76 mujeres 107 hombres 346 individuos sanos sin PD 163 individuos de la población Uygur 82 mujeres 92 hombres 183 individuos de la población Han 71 mujeres 101 hombres 82 mujeres
  • 9. Extracción de ADN se extrajo 2 ml de sangre venosa de cada paciente EDTA se utilizo como el anti-coagulante kit de extracción de sangre (Tiangen Biotech Co., Ltd., Beijing, China) Cebadores Software Primer3 se utilizó para diseñar las secuencias de los cebadores necesarios para el análisis de la PCR Las secuencias primer del exón 4 del gen PINK1 fueron 5'-GAATGTCAGTGC CAGTGTTGG-3 '(continua) 5'-AGATATGTTCCCTTT GCATGGC-3’ (inverso) 429 pb
  • 10. PCR “Técnica de laboratorio que se utiliza para la amplificación in vitro, directa de un gen o un fragmento de DNA, o indirecta de un RNA”  Desnaturalización del DNA para dar hebras sencillas.  Hibridación especifica de la hebra sencilla con un oligonucleótido .  Replicación de la hebra sencilla por una DNA polimerasa a partir del oligonucleótido anterior que actúa como cebador. • DNA plantilla. • Primer`s: Fragmentos de DNA cortos (10-25pb) que hibridan con regionesespecificas conocidas del DNA. • DNTp`s: deoxinucleotidos (dATP, dGTP, dCTP, dTTP). • Buffer. • MgCl2. • DNA polimerasa.
  • 11. RFLP RF corresponde a Restriction Fragments (fragmentos de restricción). Son los fragmentos de ADN resultantes del corte mediante enzimas de restricción. L corresponde a Length (longitud), y se refiere a la longitud de los fragmentos de restricción. P corresponde a Polymorphism (polimorfismo), palabra de origen griego que significa literalmente "muchas formas". La longitud de algunos de los fragmentos de restricción difiere en buena medida entre individuos, por lo cual son posibles muchas formas, o longitudes, de ADN.
  • 12. RESULTADOS • Prueba de equilibrio Hardy-Weinberg: Mostro frecuencias genotipicas del PINK1 iguales en los dos grupos . • Distribución de la frecuencia alélica del T313M
  • 13. Figure 1. Genotypes of the PINK1 gene T313M polymorphism. Lanes 3 and 5 show homozygous mutant sequences which cannot be digested and remain as 429 bp fragments; type T/T. Lanes 1,2,4,6 and 7 show wild-type homozygous sequences that were digested into three fragments of 429, 265 and 164 bp; type C/T. M, 2,000 bp marker; PINK1, PTEN-induced putative kinase 1.
  • 14. Figure 2. Sequencing of the fourth exon of the PINK1 gene in Parkinson's disease shows a mutation from C to T at the 938 site. The sequence around the mutation site is shown, with the arrow pointing to the substitution. PINK1, PTEN-induced putative kinase 1.
  • 15. Researchers Observations Agree or disagree Klein et al In Italy, patients with sporadic early-on set disease have been reported to have relatively high mutation rates. Disagree Guo et al In patients with PD, the distribution of T313M polymorphisms was significantly different between patients from the Uygur and Han populations, and all were homozygous mutants. Disagree DISCUSSION
  • 16. DISCUSSION Researchers Observations Agree or disagree Guo et al In Uygur, allele frecuencies in the PD group were not significantly different from the control group. While in Han population, allele frecuencies were signicantly different. Disagree Fung HC et al The mutation frecuency is wide. PINK1 gene mutation has not been observed in patients with sporadic PD in the USA. Disagree
  • 17. PERSONALCONCLUSIONS • We think this investigation is a great step for the medical comunity, because it allows us to know better the influences that has the different polymorphisms of the genes in the parkinson´s disease. • This investigation not only shows us the mechanism of action of the genes in our body, but the different variables, such like age, gender, ethnicity and genetics that have an important influence in the parkinson’s disease. Giving us a bigger perspective for the future investigations.
  • 18. PERSONALCONCLUSIONS • We think it´s impresive and very interesting how a factor like environment can affect in a mayor scale the polymorphisms of the genes in this disease. • Finally, like the cause of this disease is still unknown, we think this investigation gives a little bit of reference for more researchers to keep looking for answers, but we continue thinking this is just the begining for a long investigation.