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AMINOACIDOS y PROTEINAS
LAS PROTEÍNAS
1.¿QUE SON PROTEÍNAS ?
Las proteínas son biomóleculas formadas
básicamente por carbono, hidrógeno, oxígeno
y nitrógeno.
Conservan su actividad biológica solamente
en un intervalo relativamente limitado de pH y
de temperatura.
Las unidades monoméricas son los
aminoácidos y el tipo de unión que se
establece entre ellos se conoce como enlace
peptídico.
El nombre proteína deriva del griego
“PROTEIOS”

 Compuesto nitrogenado natural de carácter
orgánico complejo.

Alimentos ricos en proteínas son la
carne, las aves, el pescado, los huevos, la
leche y el queso .
   Todas las proteínas contiene C, H, O y N, y casi
    todas poseen además S.

   El contenido de N representa ~ el 16 % de la
    masa total de la molécula → c / 6,25 g proteína
    hay 1 g de N. Este factor de 6,25 se utiliza para
    estimar la cantidad de proteína existente en una
    muestra a partir de la medición del N de la
    misma.

   Son polímeros de alto peso molecular. Están
    formadas por unidades estructurales básicas
    llamadas aminoácidos (aa).
DATOS SOBRE ALGUNAS PROTEINAS
                                    número
                     número de
                                 de cadenas
               PM   aminoácidos polipeptídicas
FORMULA GENERAL DE LOS AMINOACIDOS



                             grupo
     grupo a-amino          carboxilo




             Ca

Son a-amino ácidos
ESTEREOISOMERIA




       L-alanina              D-alanina


Las proteínas están formadas por L-aminoácidos
Estereoisómeros de los α-aminoácidos
ALIFÁTICOS


      NO POLARES


                         AROMÁTICOS


     POLARES SIN CARGA

aa                         CON GRUPOS ÁCIDOS


     POLARES CON CARGA
                                CON N BÁSICO




                           11
NATURALEZA DE LOS RADICALES O CADENAS

    LATERALES DE LOS AMINOACIDOS
R sin carga, alifáticos



GLICINA   ALANINA   PROLINA**   VALINA




          LEUCINA      ISO
                                METIONINA
                     LEUCINA
R sin carga, polares




SERINA    TREONINA       CISTEINA




         ASPARRAGINA   GLUTAMINA
R aromáticos




FENILALANINA     TIROSINA     TRIPTOFANO
ABSORCIÓN DE LUZ UV.
R con carga (-) a pH celular




  ASPARTATO           GLUTAMATO
(ácido aspártico)   (ácido glutámico)
R con carga (+) a pH celular




                               H+




LISINA     ARGININA     HISTIDINA
El código de una letra en orden alfabético:
     A = Ala    G = Gly    M = Met    S = Ser
     C = Cys    H = His    N = Asn    T = Thr
     D = Asp     I = Ile   P = Pro    V = Val
     E = Glu    K = Lys    Q = Gln    W = Trp
     F = Phe    L = Leu    R = Arg    Y = Tyr
AMINOACIDOS POCO COMUNES

                    En el colágeno




                     En el colágeno




                       En miosina




                      En protrombina
En la elastina




En algunas proteínas.




En el ciclo de la urea



 En el ciclo de la urea
PROPIEDADES ÁCIDO BÁSICAS
   DE LOS AMINOÁCIDOS
ANFOLITOS
La carga de la
cadena lateral de
un aminoácido
depende del pH
VALORACIÓN DE UN AMINOÁCIDO
   A pH ácido: prevalece la especie con carga +
   A pH básico: prevalece la especie con carga –
   Hay un valor de pH para el cuál la carga de la
    especie es cero. (zwitterión)

             pI = pK1 + pK2      para un aa neutro
                      2
   Punto isoeléctrico: valor de pH al cuál la carga
    neta del aminoácido es cero.


                                      31
REACCIONES QUÍMICAS MAS COMUNES DE LOS
              AMINOÁCIDOS


Reacción de la ninhidrina
Reacción del Biuret
Reacción xantoproteíca
Reacción de Millon
Reconocimiento de arginina

  a) Reacción de Hopkins-Cole
  b) Reacción del ácido glioxílico
Reacción de ninhidrina           Hidratode triceto hidrindeno
Los aminoácidos dan color azul-violeta con la ninhidrina
           O                       O

                  OH
                                        O       + H2N CH COOH
                  OH                                      R
           O                       O
                       CO                                     Cualquier
          O                         O
                  O
              H        CH                                     aminoácido
                  N     R               N       CH COOH       al
                                                R             reaccionar
          O                         O
                                                              origina el
                       CO                   O         O
          O                                                   mismo
                  O                             H
              H        CH   H2O                        CH     producto de
                  N     R                           NH2 R
                                                              reducción
          O                                 O
                                                              de la
                                                              ninhidrina
Cualquier aminoácido da el
      O                         O   aducto azul violeta, a
          H                         excepción de la prolina que
              NH2         + O       da amarillo.
      O                         O



                           O                   H
              O                            O       O
                  H
                      N                        N


              O            O               O       O



Se utiliza para determinar y cuantificar aminoácidos
libres. Se mide la absorción de luz a 540 nm.
   Se usa para reconocer enlaces peptídicos y
    cuantificar proteínas. Basado en la formación
    de un complejo coloreado entre el Cu++ y los
    nitrógenos de los enlaces peptídicos.
   Permite descubrir en la molécula de proteína
    la presencia de aminoácidos aromáticos
    (fenilalanina, tirosina, triptófano).
   El reactivo de Millon es una mezcla de nitrato y nitrito
    mercúrico disueltos en ácido nítrico concentrado. La
    presencia, en la molécula de proteína, de la tirosina
    produce una coloración roja que se debe a la formación
    de nitrotirosina que, por adición de mercurio en el
    curso del calentamiento, se transforma en una sal
    mercúrica de color rojo.
   El reactivo que se utiliza contiene α-naftol e
    hipoclorito sódico, en medio alcalino. La
    aparición de una coloración roja es indicativo
    de una reacción positiva.
PROTEINAS
                 Funciones:
 Estructural
Catalítica
Movimiento
Digestivas
De transporte
De la sangre
 Regulación del metabolismo. hormonales
 de transferencia de electrones
 Inmunidad
 del ADN
De cromosoma
Receptoras
Ribosomicas
De la visión
CLASIFICACIÓN
POR SU COMPOSICIÓN:

CONJUGADAS. Tienen además un componente
no peptídico. Llamado
Grupo Prostético.
          Glicoproteínas
          Hemoproteínas
          metaloproteínas
          flavoproteínas
          lipoproteínas
          Nucleoproteínas


NO CONJUGADAS: Solamente están formadas
por aminoácidos.
CLASIFICACIÓN
POR SUS FORMAS

FIBROSAS. Tienen formas moleculares
alargadas. Generalmente forman un haz.
Generalmente insolubles en agua.
               Colágeno
               Elastina
               Fibroína
               Queratina
GLOBULARES: De estructura más
compacta, con dobleces y curvaturas. Pueden
ser casi esféricas o tener formas ovaladas. Son
más solubles en agua que las fibrosas y son
más delicadas.
•   Según el Número de subunidades:

    • Monoméricas → Mioglobina




    • Oligoméricas→ Hemoglobina
El enlacé peptídico
en plano




  Longitudes de
  enlace
Estructura del Enlace Peptídico

                             Tiene carácter parcial de doble
                            enlace, por lo que es muy rígido.
                            Se comporta como un híbrido de
                                       resonancia.




                            La configuración trans está mas
                            favorecida; la cis esta impedida
                                    estéricamente.




      -                       El Oxígeno carbonílico tiene
                               carga parcial negativa y el
                             Nitrógeno amida carga parcial
                            positiva, por tanto el enlace tiene
               +                      carácter polar
En la forma Cis existen impedimentos
estéricos




Algunas veces en ambos isómeros hay impedimentos
estéricos
Rotación de los enlaces en un
polipéptido




La rotación de los enlaces fi (Φ) y Psi (ψ) permite a
las proteínas plegarse de forma muy diversa.


       Los ángulos fi (Φ) y Psi (ψ)
       determinan la estructura de la cadena
       polipeptídica
G.N. RAMACHANDRÁN. Diagramas
¾ de las combinaciones fi (Φ) y Psi (ψ) están
 prohibidos debidos a los choques estéricos
Resumen de Características
• Es un enlace covalente

• Es un enlace amida

• Tiene carácter parcial de doble
enlace

• Predomina la configuración
trans

• Tiene carácter polar

• Tiene limitada capacidad de
rotación
ESTRUCTURA SECUNDARIA
Estructura beta Laminar

                                    A. lámina
                                       antiparalela


 vista
desde
arriba                             Los radicales de los
                                    aminoácidos van
                                      sobre y bajo el
                                    plano medio de la
                                    lámina, en forma
                                        alternada.
                                   Es más estable con
      vista                            aminoácidos
     lateral                         con R pequeños.
B. paralela




 vista
 desde
 arriba




     vista
     lateral
Lámina plegada entre
     segmentos
de una misma cadena
     ( en verde )
Colágeno
COLAGENO


                triple hélice

       cada hélice posee la secuencia
(glicina-aminoácidox-prolina/hidroxiprolina)n


                3 aa / vuelta

        las hélices NO son a-hélices
ESTRUCTURA TERCIARIA


        La ESTRUCTURA TERCIARIA
corresponde a plegamientos tridimensionales.
    La proteína se pliega sobre sí misma y
        tiende a una forma “globular”


   En su mantención participan los grupos
        radicales de los aminoácidos.
ESTRUCTURA TERCIARIA




Mioglobina    Proteína ligante de ac. grasos
ESTRUCTURA
 TERCIARIA




   segmentos con a-hélice y otros con estructura b
PUENTE DE   INTERACCION      ENLACE IONICO
HIDROGENO    HIDROFOBICA




                      PUENTE DISULFURO


  INTERACCIONES Y ENLACES DE LA
       ESTRUCTURA TERCIARIA
FORMACION DE PUENTES DISULFURO
Los radicales hidrofóbicos se alejan del agua
En las proteínas en un medio acuoso, los aminoácidos
  apolares (amarillos) se localizan preferentemente
             hacia el interior de la proteína




        mioglobina          sección transversal de
                                la mioglobina
ESTRUCTURA CUATERNARIA

    La ESTRUCTURA CUATERNARIA
corresponde a la asociacion de cadenas
    polipeptídicas o SUBUNIDADES,
   cada una de ella con su estructura
                terciaria.

    Se mantiene por enlaces entre los
     radicales de cadenas diferentes.
 Son los mismos enlaces que mantienen
la estructura terciaria, pero intercadenas.
      Se excluye el puente disulfuro.
HEMOGLOBINA   dímero


              TBP




 tetrámero




HEMOGLOBINA
DESNATURALIZACION


      PERDIDA DE LAS
 ESTRUCTURAS CUATERNARIA,
  TERCIARIA Y SECUNDARIA
     DE UNA PROTEINA

¡NO SE ALTERA LA ESTRUCTURA
          PRIMARIA!
DESNATURALIZACION


       PUEDE SER

REVERSIBLE O IRREVERSIBLE



            PUEDE SER
          TOTAL O PARCIAL
puentes disulfuro




DENATURACIÓN
   urea + b-
 mercaptoetanol
                    PLEGAMIENTO
                                (se retiran los
                                  agentes
                                denaturantes)



      cisteínas     puentes disulfuro
DESNATURALIZACION

IRREVERSIBLE

1. CALOR:
    ROMPE TODAS LAS
    INTERACCIONES DEBILES.

2. pH EXTREMOS:
   CAMBIA LA CARGA DE LOS
   RADICALES DE AMINOACIDOS
   IONIZABLES, ALTERANDOSE LOS
   ENLACES EN QUE PARTICIPAN.

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Aminoacidos y proteínas

  • 3. 1.¿QUE SON PROTEÍNAS ? Las proteínas son biomóleculas formadas básicamente por carbono, hidrógeno, oxígeno y nitrógeno. Conservan su actividad biológica solamente en un intervalo relativamente limitado de pH y de temperatura. Las unidades monoméricas son los aminoácidos y el tipo de unión que se establece entre ellos se conoce como enlace peptídico.
  • 4. El nombre proteína deriva del griego “PROTEIOS”  Compuesto nitrogenado natural de carácter orgánico complejo. Alimentos ricos en proteínas son la carne, las aves, el pescado, los huevos, la leche y el queso .
  • 5. Todas las proteínas contiene C, H, O y N, y casi todas poseen además S.  El contenido de N representa ~ el 16 % de la masa total de la molécula → c / 6,25 g proteína hay 1 g de N. Este factor de 6,25 se utiliza para estimar la cantidad de proteína existente en una muestra a partir de la medición del N de la misma.  Son polímeros de alto peso molecular. Están formadas por unidades estructurales básicas llamadas aminoácidos (aa).
  • 6. DATOS SOBRE ALGUNAS PROTEINAS número número de de cadenas PM aminoácidos polipeptídicas
  • 7. FORMULA GENERAL DE LOS AMINOACIDOS grupo grupo a-amino carboxilo Ca Son a-amino ácidos
  • 8. ESTEREOISOMERIA L-alanina D-alanina Las proteínas están formadas por L-aminoácidos
  • 9. Estereoisómeros de los α-aminoácidos
  • 10.
  • 11. ALIFÁTICOS NO POLARES AROMÁTICOS POLARES SIN CARGA aa CON GRUPOS ÁCIDOS POLARES CON CARGA CON N BÁSICO 11
  • 12. NATURALEZA DE LOS RADICALES O CADENAS LATERALES DE LOS AMINOACIDOS
  • 13. R sin carga, alifáticos GLICINA ALANINA PROLINA** VALINA LEUCINA ISO METIONINA LEUCINA
  • 14. R sin carga, polares SERINA TREONINA CISTEINA ASPARRAGINA GLUTAMINA
  • 15. R aromáticos FENILALANINA TIROSINA TRIPTOFANO
  • 17. R con carga (-) a pH celular ASPARTATO GLUTAMATO (ácido aspártico) (ácido glutámico)
  • 18. R con carga (+) a pH celular H+ LISINA ARGININA HISTIDINA
  • 19. El código de una letra en orden alfabético: A = Ala G = Gly M = Met S = Ser C = Cys H = His N = Asn T = Thr D = Asp I = Ile P = Pro V = Val E = Glu K = Lys Q = Gln W = Trp F = Phe L = Leu R = Arg Y = Tyr
  • 20. AMINOACIDOS POCO COMUNES En el colágeno En el colágeno En miosina En protrombina
  • 21. En la elastina En algunas proteínas. En el ciclo de la urea En el ciclo de la urea
  • 22.
  • 23. PROPIEDADES ÁCIDO BÁSICAS DE LOS AMINOÁCIDOS
  • 24.
  • 25.
  • 27. La carga de la cadena lateral de un aminoácido depende del pH
  • 28. VALORACIÓN DE UN AMINOÁCIDO
  • 29.
  • 30.
  • 31. A pH ácido: prevalece la especie con carga +  A pH básico: prevalece la especie con carga –  Hay un valor de pH para el cuál la carga de la especie es cero. (zwitterión) pI = pK1 + pK2 para un aa neutro 2  Punto isoeléctrico: valor de pH al cuál la carga neta del aminoácido es cero. 31
  • 32.
  • 33. REACCIONES QUÍMICAS MAS COMUNES DE LOS AMINOÁCIDOS Reacción de la ninhidrina Reacción del Biuret Reacción xantoproteíca Reacción de Millon Reconocimiento de arginina a) Reacción de Hopkins-Cole b) Reacción del ácido glioxílico
  • 34. Reacción de ninhidrina Hidratode triceto hidrindeno Los aminoácidos dan color azul-violeta con la ninhidrina O O OH O + H2N CH COOH OH R O O CO Cualquier O O O H CH aminoácido N R N CH COOH al R reaccionar O O origina el CO O O O mismo O H H CH H2O CH producto de N R NH2 R reducción O O de la ninhidrina
  • 35. Cualquier aminoácido da el O O aducto azul violeta, a H excepción de la prolina que NH2 + O da amarillo. O O O H O O O H N N O O O O Se utiliza para determinar y cuantificar aminoácidos libres. Se mide la absorción de luz a 540 nm.
  • 36. Se usa para reconocer enlaces peptídicos y cuantificar proteínas. Basado en la formación de un complejo coloreado entre el Cu++ y los nitrógenos de los enlaces peptídicos.
  • 37. Permite descubrir en la molécula de proteína la presencia de aminoácidos aromáticos (fenilalanina, tirosina, triptófano).
  • 38. El reactivo de Millon es una mezcla de nitrato y nitrito mercúrico disueltos en ácido nítrico concentrado. La presencia, en la molécula de proteína, de la tirosina produce una coloración roja que se debe a la formación de nitrotirosina que, por adición de mercurio en el curso del calentamiento, se transforma en una sal mercúrica de color rojo.
  • 39. El reactivo que se utiliza contiene α-naftol e hipoclorito sódico, en medio alcalino. La aparición de una coloración roja es indicativo de una reacción positiva.
  • 40. PROTEINAS Funciones:  Estructural Catalítica Movimiento Digestivas De transporte De la sangre  Regulación del metabolismo. hormonales  de transferencia de electrones  Inmunidad  del ADN De cromosoma Receptoras Ribosomicas De la visión
  • 41. CLASIFICACIÓN POR SU COMPOSICIÓN: CONJUGADAS. Tienen además un componente no peptídico. Llamado Grupo Prostético. Glicoproteínas Hemoproteínas metaloproteínas flavoproteínas lipoproteínas Nucleoproteínas NO CONJUGADAS: Solamente están formadas por aminoácidos.
  • 42. CLASIFICACIÓN POR SUS FORMAS FIBROSAS. Tienen formas moleculares alargadas. Generalmente forman un haz. Generalmente insolubles en agua. Colágeno Elastina Fibroína Queratina GLOBULARES: De estructura más compacta, con dobleces y curvaturas. Pueden ser casi esféricas o tener formas ovaladas. Son más solubles en agua que las fibrosas y son más delicadas.
  • 43. Según el Número de subunidades: • Monoméricas → Mioglobina • Oligoméricas→ Hemoglobina
  • 44.
  • 45.
  • 46. El enlacé peptídico en plano Longitudes de enlace
  • 47. Estructura del Enlace Peptídico Tiene carácter parcial de doble enlace, por lo que es muy rígido. Se comporta como un híbrido de resonancia. La configuración trans está mas favorecida; la cis esta impedida estéricamente. - El Oxígeno carbonílico tiene carga parcial negativa y el Nitrógeno amida carga parcial positiva, por tanto el enlace tiene + carácter polar
  • 48.
  • 49. En la forma Cis existen impedimentos estéricos Algunas veces en ambos isómeros hay impedimentos estéricos
  • 50. Rotación de los enlaces en un polipéptido La rotación de los enlaces fi (Φ) y Psi (ψ) permite a las proteínas plegarse de forma muy diversa. Los ángulos fi (Φ) y Psi (ψ) determinan la estructura de la cadena polipeptídica
  • 51. G.N. RAMACHANDRÁN. Diagramas ¾ de las combinaciones fi (Φ) y Psi (ψ) están prohibidos debidos a los choques estéricos
  • 52. Resumen de Características • Es un enlace covalente • Es un enlace amida • Tiene carácter parcial de doble enlace • Predomina la configuración trans • Tiene carácter polar • Tiene limitada capacidad de rotación
  • 53.
  • 54.
  • 55.
  • 56.
  • 58.
  • 59. Estructura beta Laminar A. lámina antiparalela vista desde arriba Los radicales de los aminoácidos van sobre y bajo el plano medio de la lámina, en forma alternada. Es más estable con vista aminoácidos lateral con R pequeños.
  • 60. B. paralela vista desde arriba vista lateral
  • 61. Lámina plegada entre segmentos de una misma cadena ( en verde )
  • 63. COLAGENO triple hélice cada hélice posee la secuencia (glicina-aminoácidox-prolina/hidroxiprolina)n 3 aa / vuelta las hélices NO son a-hélices
  • 64. ESTRUCTURA TERCIARIA La ESTRUCTURA TERCIARIA corresponde a plegamientos tridimensionales. La proteína se pliega sobre sí misma y tiende a una forma “globular” En su mantención participan los grupos radicales de los aminoácidos.
  • 65. ESTRUCTURA TERCIARIA Mioglobina Proteína ligante de ac. grasos
  • 66. ESTRUCTURA TERCIARIA segmentos con a-hélice y otros con estructura b
  • 67. PUENTE DE INTERACCION ENLACE IONICO HIDROGENO HIDROFOBICA PUENTE DISULFURO INTERACCIONES Y ENLACES DE LA ESTRUCTURA TERCIARIA
  • 68. FORMACION DE PUENTES DISULFURO
  • 69. Los radicales hidrofóbicos se alejan del agua
  • 70. En las proteínas en un medio acuoso, los aminoácidos apolares (amarillos) se localizan preferentemente hacia el interior de la proteína mioglobina sección transversal de la mioglobina
  • 71.
  • 72. ESTRUCTURA CUATERNARIA La ESTRUCTURA CUATERNARIA corresponde a la asociacion de cadenas polipeptídicas o SUBUNIDADES, cada una de ella con su estructura terciaria. Se mantiene por enlaces entre los radicales de cadenas diferentes. Son los mismos enlaces que mantienen la estructura terciaria, pero intercadenas. Se excluye el puente disulfuro.
  • 73. HEMOGLOBINA dímero TBP tetrámero HEMOGLOBINA
  • 74.
  • 75. DESNATURALIZACION PERDIDA DE LAS ESTRUCTURAS CUATERNARIA, TERCIARIA Y SECUNDARIA DE UNA PROTEINA ¡NO SE ALTERA LA ESTRUCTURA PRIMARIA!
  • 76. DESNATURALIZACION PUEDE SER REVERSIBLE O IRREVERSIBLE PUEDE SER TOTAL O PARCIAL
  • 77. puentes disulfuro DENATURACIÓN urea + b- mercaptoetanol PLEGAMIENTO (se retiran los agentes denaturantes) cisteínas puentes disulfuro
  • 78. DESNATURALIZACION IRREVERSIBLE 1. CALOR: ROMPE TODAS LAS INTERACCIONES DEBILES. 2. pH EXTREMOS: CAMBIA LA CARGA DE LOS RADICALES DE AMINOACIDOS IONIZABLES, ALTERANDOSE LOS ENLACES EN QUE PARTICIPAN.