R Commander es una interfaz gráfica que facilita el uso de R mediante menús desplegables para análisis estadísticos comunes. Aunque permite atajos, también escribe el código R subyacente para que el usuario pueda aprenderlo. La instalación requiere 4 pasos: 1) instalar paquetes, 2) seleccionar paquete Rcmdr, 3) cargar R Commander en R y 4) instalar complementos opcionales.