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AMINOACIDOS

Lorena Goetschel




 AMINOÁCIDOS Y PROTEINAS L.GOETSCHEL   1
AMINO ACIDOS
Son compuestos que tienen un R(radical) que puede ser desde un átomo de H
   hasta una molécula aromática, unido a un Carbono que tiene un grupo
   amino (NH2) y un ácido carboxílico (COOH)
   Fórmula general




    EJEMPLOS :




                             PROTEINAS L.GOETSCHEL                      2
• Conformación D y L




      La mayoría de aa en la
      naturaleza tienen
      conformación L
PROTEINAS L.GOETSCHEL   4
Nomenclatura de los C de los AA




            PROTEINAS L.GOETSCHEL   5
Amino ácidos
       ESENCIALES DESDE EL PUNTO DE VISTA NUTRICIONAL (9)
       (el ser humano NO los puede sintetizar)
        Son : Leucina, Isoleucina, Valina, Treonina, Triptófano,
       Metionina, Fenilalanina, Lisina, Histidina . (Arginina :
 AA    semiesencial ya que se sintetiza a índices inadecuados durante
(20)   el crecimiento de los niños

       NO ESENCIALES (11) : El ser humano los puede sintetizar
       Son : Alanina, Arginina, Asparagina, Acido aspartico, Cisteína ,
       Acido Glutámico, Glutamina, Glicina, Prolina, Serina, Tirosina.
       (Además se encuentra la Hidroxiprolina e hidroxilisina que no se requieren
       para la formación de proteínas peros se forma durante el procesamiento
       postraduccional de colàgeno).

                                PROTEINAS L.GOETSCHEL                               6
Enlace peptídico
•   Los aminoácidos se unen mediante un enlace peptídico para formar los péptidos y
    proteína
•   El enlace peptídico se produce entre el grupo amino (NH2) y el grupo carboxilo
    (COOH)




                                   PROTEINAS L.GOETSCHEL                       7
PROTEINAS L.GOETSCHEL   8
PROTEÍNAS
                           - monoamino monocarboxílicos (gli, ala, val, leu, ile)
                           - monoamino dicarboxílicos : ácidos glutámico , aspártico
                           - diamino monocarboxílicos : lis, arg, his
  Aminoácidos               - aromáticos : fenilalanina, tirosina, triptofano
                            - iminoácidos : prolina, hidroxiprolina(gelatina)
                           - sulfurados : cisteina, metionina
                           - Contienen grupo OH : serina , treonina



   Péptidos (1,2-100)



                            - Holoproteínas -SIMPLES - (solo aa)


Proteínas (más de 100aa)    - Heteroproteínas - CONJUGADAS- (aa y otros
                              compuestos)

                           PROTEINAS L.GOETSCHEL                                    9
MONOAMINO MONOCARBOXILICOS
           (CON GRUPOS ALIFÁTICOS) pKa 1 : COOH
                                              pKa 2 : NH3+
                                                  pKa 1 : 2,4
    1                                             pKa 2 : 9,8
                                                  pKa 1 : 2,34
2                                                 pKa 2 : 9,69

                                                  pKa 1 : 2,2
3                                             E   pKa 2 : 9,7


4                                             E pKa 1 :: 2,3
                                                pKa 2 9,7


5                                             E   pKa 1 : 2,3
                                                  pKa 2 : 9,8


                      PROTEINAS L.GOETSCHEL             10
MONOAMINO DICARBOXILICOS (ACIDOS) Y SUS
                  AMINAS

                                          pKa 1 : 2,1
6                                         pKa 2 : 9,9
                                          pKa3 : 3,9

                                          pKa 1 : 2,1
7
                                          pKa 2 : 8,8

                                          pKa 1 : 2,1
8                                         pKa 2 : 9,5
                                          pKa3 : 4,1

9
                                          pKa 1 : 2,2
                                          pKa 2 : 9,1



                  PROTEINAS L.GOETSCHEL          11
DIAMINO MONOCARBOXILICOS (BASICOS)
                                              pKa 1 : 1,8
 10                                           pKa 2 : 9,0
                                              pKa3 : 12,5
                                              pKa 1 : 2,2
11
                                          E   pKa 2 : 9,2
                                              pKa3 : 10,8
                                              pKa 1 : 1,8
12                                        E   pKa 2 : 9,3
                                              pKa3 : 6,0




                  PROTEINAS L.GOETSCHEL             12
AA CON R - OH
13



14
                                        E

     NO AROMÁTICOS CON R - AZUFRADO
15



16                                          E
                PROTEINAS L.GOETSCHEL           13
AROMÁTICOS
17
                               E

18



19
                               E

     IMINOÁCIDOS
20

       PROTEINAS L.GOETSCHEL       14
FORMACIÓN DE CISTINA




       PROTEINAS L.GOETSCHEL   15
Propiedades
                        tampón de la
                        histidina




PROTEINAS L.GOETSCHEL                  16
PROPIEDADES DE LOS AMINOACIDOS



                                   Capacidad
                                   tampón de la
                                   alanina




           PROTEINAS L.GOETSCHEL                  17
PROTEÍNAS




 PROTEINAS L.GOETSCHEL   18
Las PROTEÍNAS Son compuestos orgánicos
compuestos por Carbono, Hidrógeno , Oxígeno y
Nitrógeno además contienen otros elementos como
Azufre (metionina y cisteína), Fe (Hb), Fósforo
(ADN, ATP)

Su nombre viene de la palabra “Protos” (primero)
por su importancia en la composición de los tejidos.

La unidad principal son los aa (aminoácidos)

En los alimentos las proteínas provienen de las
plantas (que las sintetizan a través del proceso de
fotosíntesis) y de los animales
                   PROTEINAS L.GOETSCHEL               19
Clases de Proteínas
1. SIMPLES
Globulares
-Prolaminas:Zeína (maíz),gliadina (trigo), hordeína (cebada)
- Gluteninas:Glutenina (trigo), orizanina (arroz).
- Albúminas:Seroalbúmina (sangre), ovoalbúmina (huevo),
lactoalbúmina (leche)
- Hormonas: Insulina, hormona del crecimiento, prolactina,
tirotropina
- Enzimas: Hidrolasas, Oxidasas, Ligasas, Liasas, Transferasas...etc.

-Fibrosas
-Colágenos: en tejidos conjuntivos, cartilaginosos
- Queratinas: En formaciones epidérmicas: pelos, uñas, plumas,
cuernos.
- Elastinas: En tendones y vasos sanguíneos
- Fibroínas: En hilos de seda, (arañas, insectos)
                             PROTEINAS L.GOETSCHEL                      20
Clases de Proteínas
2.   CONJUGADAS (Proteídos) :

- Glucoproteínas : Ribonucleasa , Mucoproteínas, Anticuerpos , Hormona
luteinizante
- Lipoproteínas : De alta, baja y muy baja densidad, que transportan lípidos
en la sangre.
- Nucleoproteínas : Nucleosomas de la cromatina, Ribosomas
- Cromoproteínas : Hemoglobina, hemocianina, mioglobina, que transportan
oxígeno
Citocromos, que transportan electrones




                                PROTEINAS L.GOETSCHEL                          21
PROTEINAS L.GOETSCHEL   22
Estructura de las Proteínas
Primaria      Secundaria Terciaria          Cuaternaria en
    tres formas :
-    Primaria (lineal)
-    Secundaria (resorte)
-   Terciaria(madeja)
-   Cuaternaria (com



                    PROTEINAS L.GOETSCHEL              23
ESTRUCTURA PRIMARIA
• La estructura primaria de péptidos y de proteínas
  se refiere al número lineal y al orden de los
  aminoácidos presentes. La convención para la
  designación del orden de los aminoácidos es que
  el extremo N-terminal (es decir, el extremo que
  lleva el residuo con el grupo α-amino libre) está al
  extremo izquierdo (y es el aminoácido número 1)
  y el extremo C-terminal (es decir, el extremo con
  el residuo que contiene al grupo α-carboxilo libre)
  está a la derecha

                     PROTEINAS L.GOETSCHEL           24
ENLACES PEPTÍDICOS
26
ESTRUCTURA SECUNDARIA
• arreglo ordenado de aminoácidos en
  una proteína le confiere formas de
  conformación                                     Enlaces de H
                                                   intramoleculares
• En general se doblan en dos amplias
  clases de estructuras: globulares
  (compactas) y fibrosas (filamentosas
  o alargadas)
• α-Hélice :se compone de un solo
  arreglo lineal helicoidal de
  aminoácidos
• Hojas-β : se componen de 2 o más
  diferentes regiones de secuencias de
  por lo menos 5-10 aminoácidos



                           PROTEINAS L.GOETSCHEL              27
ESTRUCTURA TERCIARIA
• Estructura tridimensional completa de
  las unidades del polipéptido de una
  proteína dada. Se incluye en esta
  descripción la relación espacial de
  diferentes estructuras secundarias
  dentro de una cadena polipeptídica y
  cómo estas estructuras secundarias
  por ellas mismas se doblan en formas
  tridimensionales de la proteína
                  PROTEINAS L.GOETSCHEL   28
ESTRUCTURA CUATERNARIA
Muchas proteínas contienen 2 o más
  cadenas diferentes de polipéptidos
  sostenidas en asociación por las
  mismas fuerzas no covalentes que
  estabilizan       las     estructuras
  terciarias de las proteínas.
Las     proteínas       con     cadenas
  polipeptídicas       múltiples    son
  proteínas        oligoméricas.     La
  estructura      formada      por    la
  interacción monómero-monómero
  en una proteína oligomérica se
  conoce         como        estructura
  cuaternaria.
                        PROTEINAS L.GOETSCHEL   29
PROTEINAS L.GOETSCHEL   30
• CONFORMACIÓN DE LA ESTRUCTURA PROTEÍCA
Propiedades de las Proteínas
• Especificidad : sus propiedades dependen de la estructura
  tridimensional . Un pequeño cambio provoca cambios en la
  estructura primaria, secundaria, terciaria, y por tanto pérdida de la
  actividad biológica.

• Solubilidad : Las proteínas globulares son solubles en agua, porque
  sus radicales polares o hidrófilos se sitúan hacia el exterior,
  formando puentes de hidrógeno con el agua .
  La solubilidad varía dependiendo del tamaño, de la forma, de la
  disposición de los radicales y del pH.

• Desnaturalización : Pérdida de la estructura tridimensional o
  conformación, y por tanto también de la actividad biológica. Se
  produce al variar la temperatura, presión, pH, electronegatividad,
  etc. Esto provoca la rotura de los puentes de hidrógeno que
  mantienen las estructuras secundaria y terciaria.
   Si las condiciones son suaves, el proceso es reversible, y si el
  cambio es más drástico, es irreversible
                             PROTEINAS L.GOETSCHEL                        32
PROPIEDADES IÓNICAS DE LOS AA
Los aa son compuestos anfóteros y pueden
  separarse mediante electroforesis a pH6, que
  permite que se desplacen sobre un medio
  (papel/gel) impulsados por un campo
  eléctrico.




                  PROTEINAS L.GOETSCHEL          33
CROMATOGRAFÍA DE INTERCAMBIO IÓNICO
• Para determinar la proporción y la clase de los aa
  presentes en líquidos biológicos como suero o líquido
  céfalo raquídeo se puede utilizar resinas de
  intercambio iónico (catiónico o aniónico)




                      PROTEINAS L.GOETSCHEL               34
PURIFICACIÓN DE LAS PROTEÍNAS
• Pureza : Es difícil conseguir una proteína pura,
  ya que normalmente está contaminada con
  otras proteínas, virus, etc.
• Para purificarla se utiliza métodos basados en
  las propiedades de las proteínas : solubilidad
  diferencial en sulfato amónico, cromatografía
  de exclusión en gel, intercambio iónico


                    PROTEINAS L.GOETSCHEL        35
MÈTODOS DE PURIFICACIÓN
• Cromatografía de exclusión en gel : Técnica
  basada en una matriz de dextrano (Sephadex)
  , que actúa como un tamiz por el que pasan
  las moléculas según su tamaño, esta matriz se
  encuentra empaquetada en una columna
• Cromatografía de afinidad : Basada en la
  capacidad de las proteínas para unirse a
  específicamente a otras moléculas (sustratos
  enzimáticos o anticuerpos)

                   PROTEINAS L.GOETSCHEL      36
SEPARACIÒN DE MOLÉCULAS A GRAN
            ESCALA
- Crioprecipitación : basada en la insolubilidad
  de algunas proteínas a bajas temperaturas.
- Intercambio iónico
- Adsorción con Sephadex , Aerosil, Filtración
- Cromatografía
- Ultrafiltración
- Filtración en gel
  - Ver figura 2,18 pag 14
                     PROTEINAS L.GOETSCHEL         37
TAMAÑO DE LAS PROTEÍNAS
• Antiguamente se utilizaba el peso molecular,
  pero ahora se prefiere la masa molecular (Mt)
  y se expresan :
• La masa molecular de X proteína es 10 5 Da o
   El péptido de 16.000 Da
El Dalton es una unidad de masa que equivale a
   la duodécima parte de la masa de un átomo
   de Carbono 12. El kilodalton = 1000 Da
                   PROTEINAS L.GOETSCHEL         38
PROTEINAS L.GOETSCHEL   39
DETERMINACIÓN DE LA SECUENCIA DE
              AA
• Cada proteína se caracteriza por poseer una secuencia
  de aa bien definida, para determinarlo se puede:
• Determinar la estructura del gen que codifica la
  proteína y deducir la secuencia de aa
• Determinación del extremo amino y luego una
  degradación de Edman (estructuras hasta 50aa)
  mediante la reacción con fenilisotiocianato
• Espectrometría de masas : se digiere la proteína con
  tripsina y luego se analizan los péptidos y se comparan
  con las masas de referencia (técnica computarizada)


                       PROTEINAS L.GOETSCHEL            40
DESNATURALIZACIÓN Y
      RENATURALIZACIÓN PROTEÍCA
• Proteína nativa : posee todas sus propiedades
• Proteína denaturalizada : ha perdido algunas
  propiedades por alteración en la estructura
  tridimensional
• DN irreversible : ej. Clara de huevo – los alimentos se
  vuelven más susceptibles a los efectos de las enzimas
  proteolíticas (cocción)
• DN reversible : mediante uso de reactivos como la urea
  (reduce la intensidad de los enlaces hidrofóbicos) y el
  mercaptoetanol (reduce los enlaces disulfuro) y al
  eliminarlo se renaturaliza la proteína.

                       PROTEINAS L.GOETSCHEL            41
ESTRUCTURA Y ACTIVIDAD BIOLÓGICA

Dentro de los péptidos (3-231 aa) se encuentran
  algunos con alta especificidad y funciones
  como:
• Mediadores locales
• Antibióticos
• Hormonas
Otras hormonas de mayor tamaño como la
  somatotropina y la prolactina
                   PROTEINAS L.GOETSCHEL      42
Bibliografía
•   Murray, Bender, Botham, Kennelly, Rodwell, Weil .- Harper Bioquímica
    ilustrada .- 28 Edición, Ed. McGraw Hill 2010
•   Campbell P, Smith A, Peters T .- Bioquimica ilustrada , 5ª edición,
    Barcelona España 2006
•   Bioquímica médica
    http://themedicalbiochemistrypage.org/spanish/spanish-index.html
•   Presentaciones Power Point del libro de Bioquímica de Lehninger
    Principios de Bioquímica
    David L. Nelson y Michael M. Cox http://laguna.fmedic.unam.mx/lenpres/

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Bq 2 3 - aa y proteínas

  • 1. AMINOACIDOS Lorena Goetschel AMINOÁCIDOS Y PROTEINAS L.GOETSCHEL 1
  • 2. AMINO ACIDOS Son compuestos que tienen un R(radical) que puede ser desde un átomo de H hasta una molécula aromática, unido a un Carbono que tiene un grupo amino (NH2) y un ácido carboxílico (COOH) Fórmula general EJEMPLOS : PROTEINAS L.GOETSCHEL 2
  • 3. • Conformación D y L La mayoría de aa en la naturaleza tienen conformación L
  • 5. Nomenclatura de los C de los AA PROTEINAS L.GOETSCHEL 5
  • 6. Amino ácidos ESENCIALES DESDE EL PUNTO DE VISTA NUTRICIONAL (9) (el ser humano NO los puede sintetizar) Son : Leucina, Isoleucina, Valina, Treonina, Triptófano, Metionina, Fenilalanina, Lisina, Histidina . (Arginina : AA semiesencial ya que se sintetiza a índices inadecuados durante (20) el crecimiento de los niños NO ESENCIALES (11) : El ser humano los puede sintetizar Son : Alanina, Arginina, Asparagina, Acido aspartico, Cisteína , Acido Glutámico, Glutamina, Glicina, Prolina, Serina, Tirosina. (Además se encuentra la Hidroxiprolina e hidroxilisina que no se requieren para la formación de proteínas peros se forma durante el procesamiento postraduccional de colàgeno). PROTEINAS L.GOETSCHEL 6
  • 7. Enlace peptídico • Los aminoácidos se unen mediante un enlace peptídico para formar los péptidos y proteína • El enlace peptídico se produce entre el grupo amino (NH2) y el grupo carboxilo (COOH) PROTEINAS L.GOETSCHEL 7
  • 9. PROTEÍNAS - monoamino monocarboxílicos (gli, ala, val, leu, ile) - monoamino dicarboxílicos : ácidos glutámico , aspártico - diamino monocarboxílicos : lis, arg, his Aminoácidos - aromáticos : fenilalanina, tirosina, triptofano - iminoácidos : prolina, hidroxiprolina(gelatina) - sulfurados : cisteina, metionina - Contienen grupo OH : serina , treonina Péptidos (1,2-100) - Holoproteínas -SIMPLES - (solo aa) Proteínas (más de 100aa) - Heteroproteínas - CONJUGADAS- (aa y otros compuestos) PROTEINAS L.GOETSCHEL 9
  • 10. MONOAMINO MONOCARBOXILICOS (CON GRUPOS ALIFÁTICOS) pKa 1 : COOH pKa 2 : NH3+ pKa 1 : 2,4 1 pKa 2 : 9,8 pKa 1 : 2,34 2 pKa 2 : 9,69 pKa 1 : 2,2 3 E pKa 2 : 9,7 4 E pKa 1 :: 2,3 pKa 2 9,7 5 E pKa 1 : 2,3 pKa 2 : 9,8 PROTEINAS L.GOETSCHEL 10
  • 11. MONOAMINO DICARBOXILICOS (ACIDOS) Y SUS AMINAS pKa 1 : 2,1 6 pKa 2 : 9,9 pKa3 : 3,9 pKa 1 : 2,1 7 pKa 2 : 8,8 pKa 1 : 2,1 8 pKa 2 : 9,5 pKa3 : 4,1 9 pKa 1 : 2,2 pKa 2 : 9,1 PROTEINAS L.GOETSCHEL 11
  • 12. DIAMINO MONOCARBOXILICOS (BASICOS) pKa 1 : 1,8 10 pKa 2 : 9,0 pKa3 : 12,5 pKa 1 : 2,2 11 E pKa 2 : 9,2 pKa3 : 10,8 pKa 1 : 1,8 12 E pKa 2 : 9,3 pKa3 : 6,0 PROTEINAS L.GOETSCHEL 12
  • 13. AA CON R - OH 13 14 E NO AROMÁTICOS CON R - AZUFRADO 15 16 E PROTEINAS L.GOETSCHEL 13
  • 14. AROMÁTICOS 17 E 18 19 E IMINOÁCIDOS 20 PROTEINAS L.GOETSCHEL 14
  • 15. FORMACIÓN DE CISTINA PROTEINAS L.GOETSCHEL 15
  • 16. Propiedades tampón de la histidina PROTEINAS L.GOETSCHEL 16
  • 17. PROPIEDADES DE LOS AMINOACIDOS Capacidad tampón de la alanina PROTEINAS L.GOETSCHEL 17
  • 19. Las PROTEÍNAS Son compuestos orgánicos compuestos por Carbono, Hidrógeno , Oxígeno y Nitrógeno además contienen otros elementos como Azufre (metionina y cisteína), Fe (Hb), Fósforo (ADN, ATP) Su nombre viene de la palabra “Protos” (primero) por su importancia en la composición de los tejidos. La unidad principal son los aa (aminoácidos) En los alimentos las proteínas provienen de las plantas (que las sintetizan a través del proceso de fotosíntesis) y de los animales PROTEINAS L.GOETSCHEL 19
  • 20. Clases de Proteínas 1. SIMPLES Globulares -Prolaminas:Zeína (maíz),gliadina (trigo), hordeína (cebada) - Gluteninas:Glutenina (trigo), orizanina (arroz). - Albúminas:Seroalbúmina (sangre), ovoalbúmina (huevo), lactoalbúmina (leche) - Hormonas: Insulina, hormona del crecimiento, prolactina, tirotropina - Enzimas: Hidrolasas, Oxidasas, Ligasas, Liasas, Transferasas...etc. -Fibrosas -Colágenos: en tejidos conjuntivos, cartilaginosos - Queratinas: En formaciones epidérmicas: pelos, uñas, plumas, cuernos. - Elastinas: En tendones y vasos sanguíneos - Fibroínas: En hilos de seda, (arañas, insectos) PROTEINAS L.GOETSCHEL 20
  • 21. Clases de Proteínas 2. CONJUGADAS (Proteídos) : - Glucoproteínas : Ribonucleasa , Mucoproteínas, Anticuerpos , Hormona luteinizante - Lipoproteínas : De alta, baja y muy baja densidad, que transportan lípidos en la sangre. - Nucleoproteínas : Nucleosomas de la cromatina, Ribosomas - Cromoproteínas : Hemoglobina, hemocianina, mioglobina, que transportan oxígeno Citocromos, que transportan electrones PROTEINAS L.GOETSCHEL 21
  • 23. Estructura de las Proteínas Primaria Secundaria Terciaria Cuaternaria en tres formas : - Primaria (lineal) - Secundaria (resorte) - Terciaria(madeja) - Cuaternaria (com PROTEINAS L.GOETSCHEL 23
  • 24. ESTRUCTURA PRIMARIA • La estructura primaria de péptidos y de proteínas se refiere al número lineal y al orden de los aminoácidos presentes. La convención para la designación del orden de los aminoácidos es que el extremo N-terminal (es decir, el extremo que lleva el residuo con el grupo α-amino libre) está al extremo izquierdo (y es el aminoácido número 1) y el extremo C-terminal (es decir, el extremo con el residuo que contiene al grupo α-carboxilo libre) está a la derecha PROTEINAS L.GOETSCHEL 24
  • 26. 26
  • 27. ESTRUCTURA SECUNDARIA • arreglo ordenado de aminoácidos en una proteína le confiere formas de conformación Enlaces de H intramoleculares • En general se doblan en dos amplias clases de estructuras: globulares (compactas) y fibrosas (filamentosas o alargadas) • α-Hélice :se compone de un solo arreglo lineal helicoidal de aminoácidos • Hojas-β : se componen de 2 o más diferentes regiones de secuencias de por lo menos 5-10 aminoácidos PROTEINAS L.GOETSCHEL 27
  • 28. ESTRUCTURA TERCIARIA • Estructura tridimensional completa de las unidades del polipéptido de una proteína dada. Se incluye en esta descripción la relación espacial de diferentes estructuras secundarias dentro de una cadena polipeptídica y cómo estas estructuras secundarias por ellas mismas se doblan en formas tridimensionales de la proteína PROTEINAS L.GOETSCHEL 28
  • 29. ESTRUCTURA CUATERNARIA Muchas proteínas contienen 2 o más cadenas diferentes de polipéptidos sostenidas en asociación por las mismas fuerzas no covalentes que estabilizan las estructuras terciarias de las proteínas. Las proteínas con cadenas polipeptídicas múltiples son proteínas oligoméricas. La estructura formada por la interacción monómero-monómero en una proteína oligomérica se conoce como estructura cuaternaria. PROTEINAS L.GOETSCHEL 29
  • 31. • CONFORMACIÓN DE LA ESTRUCTURA PROTEÍCA
  • 32. Propiedades de las Proteínas • Especificidad : sus propiedades dependen de la estructura tridimensional . Un pequeño cambio provoca cambios en la estructura primaria, secundaria, terciaria, y por tanto pérdida de la actividad biológica. • Solubilidad : Las proteínas globulares son solubles en agua, porque sus radicales polares o hidrófilos se sitúan hacia el exterior, formando puentes de hidrógeno con el agua . La solubilidad varía dependiendo del tamaño, de la forma, de la disposición de los radicales y del pH. • Desnaturalización : Pérdida de la estructura tridimensional o conformación, y por tanto también de la actividad biológica. Se produce al variar la temperatura, presión, pH, electronegatividad, etc. Esto provoca la rotura de los puentes de hidrógeno que mantienen las estructuras secundaria y terciaria. Si las condiciones son suaves, el proceso es reversible, y si el cambio es más drástico, es irreversible PROTEINAS L.GOETSCHEL 32
  • 33. PROPIEDADES IÓNICAS DE LOS AA Los aa son compuestos anfóteros y pueden separarse mediante electroforesis a pH6, que permite que se desplacen sobre un medio (papel/gel) impulsados por un campo eléctrico. PROTEINAS L.GOETSCHEL 33
  • 34. CROMATOGRAFÍA DE INTERCAMBIO IÓNICO • Para determinar la proporción y la clase de los aa presentes en líquidos biológicos como suero o líquido céfalo raquídeo se puede utilizar resinas de intercambio iónico (catiónico o aniónico) PROTEINAS L.GOETSCHEL 34
  • 35. PURIFICACIÓN DE LAS PROTEÍNAS • Pureza : Es difícil conseguir una proteína pura, ya que normalmente está contaminada con otras proteínas, virus, etc. • Para purificarla se utiliza métodos basados en las propiedades de las proteínas : solubilidad diferencial en sulfato amónico, cromatografía de exclusión en gel, intercambio iónico PROTEINAS L.GOETSCHEL 35
  • 36. MÈTODOS DE PURIFICACIÓN • Cromatografía de exclusión en gel : Técnica basada en una matriz de dextrano (Sephadex) , que actúa como un tamiz por el que pasan las moléculas según su tamaño, esta matriz se encuentra empaquetada en una columna • Cromatografía de afinidad : Basada en la capacidad de las proteínas para unirse a específicamente a otras moléculas (sustratos enzimáticos o anticuerpos) PROTEINAS L.GOETSCHEL 36
  • 37. SEPARACIÒN DE MOLÉCULAS A GRAN ESCALA - Crioprecipitación : basada en la insolubilidad de algunas proteínas a bajas temperaturas. - Intercambio iónico - Adsorción con Sephadex , Aerosil, Filtración - Cromatografía - Ultrafiltración - Filtración en gel - Ver figura 2,18 pag 14 PROTEINAS L.GOETSCHEL 37
  • 38. TAMAÑO DE LAS PROTEÍNAS • Antiguamente se utilizaba el peso molecular, pero ahora se prefiere la masa molecular (Mt) y se expresan : • La masa molecular de X proteína es 10 5 Da o El péptido de 16.000 Da El Dalton es una unidad de masa que equivale a la duodécima parte de la masa de un átomo de Carbono 12. El kilodalton = 1000 Da PROTEINAS L.GOETSCHEL 38
  • 40. DETERMINACIÓN DE LA SECUENCIA DE AA • Cada proteína se caracteriza por poseer una secuencia de aa bien definida, para determinarlo se puede: • Determinar la estructura del gen que codifica la proteína y deducir la secuencia de aa • Determinación del extremo amino y luego una degradación de Edman (estructuras hasta 50aa) mediante la reacción con fenilisotiocianato • Espectrometría de masas : se digiere la proteína con tripsina y luego se analizan los péptidos y se comparan con las masas de referencia (técnica computarizada) PROTEINAS L.GOETSCHEL 40
  • 41. DESNATURALIZACIÓN Y RENATURALIZACIÓN PROTEÍCA • Proteína nativa : posee todas sus propiedades • Proteína denaturalizada : ha perdido algunas propiedades por alteración en la estructura tridimensional • DN irreversible : ej. Clara de huevo – los alimentos se vuelven más susceptibles a los efectos de las enzimas proteolíticas (cocción) • DN reversible : mediante uso de reactivos como la urea (reduce la intensidad de los enlaces hidrofóbicos) y el mercaptoetanol (reduce los enlaces disulfuro) y al eliminarlo se renaturaliza la proteína. PROTEINAS L.GOETSCHEL 41
  • 42. ESTRUCTURA Y ACTIVIDAD BIOLÓGICA Dentro de los péptidos (3-231 aa) se encuentran algunos con alta especificidad y funciones como: • Mediadores locales • Antibióticos • Hormonas Otras hormonas de mayor tamaño como la somatotropina y la prolactina PROTEINAS L.GOETSCHEL 42
  • 43. Bibliografía • Murray, Bender, Botham, Kennelly, Rodwell, Weil .- Harper Bioquímica ilustrada .- 28 Edición, Ed. McGraw Hill 2010 • Campbell P, Smith A, Peters T .- Bioquimica ilustrada , 5ª edición, Barcelona España 2006 • Bioquímica médica http://themedicalbiochemistrypage.org/spanish/spanish-index.html • Presentaciones Power Point del libro de Bioquímica de Lehninger Principios de Bioquímica David L. Nelson y Michael M. Cox http://laguna.fmedic.unam.mx/lenpres/