Los derechos de los estudiantes del IDEP incluyen: (1) recibir una formación integral y en valores para la convivencia social, (2) ser tratados con respeto por parte de padres y educadores, y (3) recibir atención y orientación cuando tengan dificultades académicas o disciplinarias. También tienen derecho a (4) ser protegidos contra sustancias dañinas y (5) que se respete su vida privada, dignidad y creencias.