Nahulingo significa "lugar de los cuatro movimientos" en náhuat. Fue fundado antes de la conquista española y habitado por indígenas yaquis e izalcos. Durante la colonia perteneció a la provincia de los Izalcos y tenía alrededor de 364 habitantes. En 1901 se extinguió como municipio y se agregó a Sonsonate, pero fue reestablecido como municipio en 1904.