Esta película histórica narra la vida de Hipatia de Alejandría, una matemática y filósofa del siglo V d.C. que enseñaba en el Museo de Alejandría. La película describe el aumento de las tensiones religiosas en Alejandría entre cristianos, judíos y paganos que culminaron en el asesinato de Hipatia ordenado por el obispo Cirilo de Alejandría.