Este documento describe el modelado tridimensional de la proteína P35 de Toxoplasma gondii y la predicción de sus epitopes. Los autores modelaron la estructura de P35 usando programas de modelado y evaluaron la calidad del modelo. Luego predijeron los epitopes lineales y estructurales de P35 usando programas de predicción de epitopes. La mayoría de las regiones antigénicas predichas se encuentran en la región media y N-terminal de la proteína. Actualmente están evaluando experimentalmente estas regiones como posibles antígenos
Cesar david puentes florez union de peptidos al complejo mayor de histocompat...CsarDavidPuentesFlre
Simulación del proceso de unión de péptidos al complejo mayor de histocompatibilidad clase II -DR (CMH-DR) usando métodos computacionales estructurales
Trabajo de grado para optar por el título de Biólogo
La unión de péptidos antigénicos (o epítopos) a las moléculas CMH y el reconocimiento de estos antígenos por parte de las células T es un paso esencial para la respuesta inmune. Si este proceso falla, no puede haber respuesta inmune viable. Por esta razón, la predicción de afinidades de unión en pCMH es central en el diseño de péptidos candidatos a vacuna, así como en el entendimiento del proceso de inmune de reconocimiento patógeno-hospedero.
Los métodos basados en secuencias usan algoritmos de inteligencia artificial, siendo eficientes para realizar predicciones de afinidad en pCMH, sin embargo, son muy dependientes en la disponibilidad y calidad de datos experimentales, los cuales pueden escasear debido a la dificultad para realizar los ensayos de unión pCMH experimentales. En cambio, los métodos estructurales no dependen directamente de datos experimentales para simular el proceso de unión, siendo ideales para estudiar la unión en alelos de pALH-DR que no tienen datos de unión experimentales (siendo este el caso de la mayoría de moléculas conocidas). En este trabajo se aplicaron métodos clásicos de química computacional para generar por homología estructuras de varios alelos ALH-DR con los programas UCSF Chimera y SCWRL 4.0, comparando la precisión de cada programa en la generación de estructuras con alta similitud geométrica a sus plantillas cristalográficas de proteínas homologas. Estas estructuras fueron refinadas con NAMD para corregir los defectos estructurales que son resultado del proceso de modelamiento homologo. La calidad de las estructuras resultantes fue evaluada con MolProbity, Qmean y Prosa-Web.
Cesar david puentes florez union de peptidos al complejo mayor de histocompat...CsarDavidPuentesFlre
Simulación del proceso de unión de péptidos al complejo mayor de histocompatibilidad clase II -DR (CMH-DR) usando métodos computacionales estructurales
Trabajo de grado para optar por el título de Biólogo
La unión de péptidos antigénicos (o epítopos) a las moléculas CMH y el reconocimiento de estos antígenos por parte de las células T es un paso esencial para la respuesta inmune. Si este proceso falla, no puede haber respuesta inmune viable. Por esta razón, la predicción de afinidades de unión en pCMH es central en el diseño de péptidos candidatos a vacuna, así como en el entendimiento del proceso de inmune de reconocimiento patógeno-hospedero.
Los métodos basados en secuencias usan algoritmos de inteligencia artificial, siendo eficientes para realizar predicciones de afinidad en pCMH, sin embargo, son muy dependientes en la disponibilidad y calidad de datos experimentales, los cuales pueden escasear debido a la dificultad para realizar los ensayos de unión pCMH experimentales. En cambio, los métodos estructurales no dependen directamente de datos experimentales para simular el proceso de unión, siendo ideales para estudiar la unión en alelos de pALH-DR que no tienen datos de unión experimentales (siendo este el caso de la mayoría de moléculas conocidas). En este trabajo se aplicaron métodos clásicos de química computacional para generar por homología estructuras de varios alelos ALH-DR con los programas UCSF Chimera y SCWRL 4.0, comparando la precisión de cada programa en la generación de estructuras con alta similitud geométrica a sus plantillas cristalográficas de proteínas homologas. Estas estructuras fueron refinadas con NAMD para corregir los defectos estructurales que son resultado del proceso de modelamiento homologo. La calidad de las estructuras resultantes fue evaluada con MolProbity, Qmean y Prosa-Web.
Presentación sobre Genómica hecha para la Facultad de Medicina en la Materia de Biología molecular por alumnos de la Maestría en Investigación Clinica.
Ciclo sars cov2-2021. Guía basada en la metodología POGIL.Hogar
Una guía sobre el ciclo del SARS-Cov2. Se han incluido 4 modelos. Los estudiantes deben trabajar en pequeños grupos usando esta guía, la cual presenta 4 modelos gráficos e información de textos, seguidos por preguntas orientadoras diseñadas para guiar a los estudiantes en la formulación de sus propias conclusiones. El docente actúa como líder, facilitador, evaluador, trabajando con los grupos de estudiantes cuando necesitan ayuda.
Presentación sobre Genómica hecha para la Facultad de Medicina en la Materia de Biología molecular por alumnos de la Maestría en Investigación Clinica.
Ciclo sars cov2-2021. Guía basada en la metodología POGIL.Hogar
Una guía sobre el ciclo del SARS-Cov2. Se han incluido 4 modelos. Los estudiantes deben trabajar en pequeños grupos usando esta guía, la cual presenta 4 modelos gráficos e información de textos, seguidos por preguntas orientadoras diseñadas para guiar a los estudiantes en la formulación de sus propias conclusiones. El docente actúa como líder, facilitador, evaluador, trabajando con los grupos de estudiantes cuando necesitan ayuda.
Catalogo General Electrodomesticos Teka Distribuidor Oficial Amado Salvador V...AMADO SALVADOR
El catálogo general de electrodomésticos Teka presenta una amplia gama de productos de alta calidad y diseño innovador. Como distribuidor oficial Teka, Amado Salvador ofrece soluciones en electrodomésticos Teka que destacan por su tecnología avanzada y durabilidad. Este catálogo incluye una selección exhaustiva de productos Teka que cumplen con los más altos estándares del mercado, consolidando a Amado Salvador como el distribuidor oficial Teka.
Explora las diversas categorías de electrodomésticos Teka en este catálogo, cada una diseñada para satisfacer las necesidades de cualquier hogar. Amado Salvador, como distribuidor oficial Teka, garantiza que cada producto de Teka se distingue por su excelente calidad y diseño moderno.
Amado Salvador, distribuidor oficial Teka en Valencia. La calidad y el diseño de los electrodomésticos Teka se reflejan en cada página del catálogo, ofreciendo opciones que van desde hornos, placas de cocina, campanas extractoras hasta frigoríficos y lavavajillas. Este catálogo es una herramienta esencial para inspirarse y encontrar electrodomésticos de alta calidad que se adaptan a cualquier proyecto de diseño.
En Amado Salvador somos distribuidor oficial Teka en Valencia y ponemos atu disposición acceso directo a los mejores productos de Teka. Explora este catálogo y encuentra la inspiración y los electrodomésticos necesarios para equipar tu hogar con la garantía y calidad que solo un distribuidor oficial Teka puede ofrecer.
HPE presenta una competició destinada a estudiants, que busca fomentar habilitats tecnològiques i promoure la innovació en un entorn STEAM (Ciència, Tecnologia, Enginyeria, Arts i Matemàtiques). A través de diverses fases, els equips han de resoldre reptes mensuals basats en àrees com algorísmica, desenvolupament de programari, infraestructures tecnològiques, intel·ligència artificial i altres tecnologies. Els millors equips tenen l'oportunitat de desenvolupar un projecte més gran en una fase presencial final, on han de crear una solució concreta per a un conflicte real relacionat amb la sostenibilitat. Aquesta competició promou la inclusió, la sostenibilitat i l'accessibilitat tecnològica, alineant-se amb els Objectius de Desenvolupament Sostenible de l'ONU.
Catalogo Refrigeracion Miele Distribuidor Oficial Amado Salvador ValenciaAMADO SALVADOR
Descubre el catálogo general de la gama de productos de refrigeración del fabricante de electrodomésticos Miele, presentado por Amado Salvador distribuidor oficial Miele en Valencia. Como distribuidor oficial de electrodomésticos Miele, Amado Salvador ofrece una amplia selección de refrigeradores, congeladores y soluciones de refrigeración de alta calidad, resistencia y diseño superior de esta marca.
La gama de productos de Miele se caracteriza por su innovación tecnológica y eficiencia energética, garantizando que cada electrodoméstico no solo cumpla con las expectativas, sino que las supere. Los refrigeradores Miele están diseñados para ofrecer un rendimiento óptimo y una conservación perfecta de los alimentos, con características avanzadas como la tecnología de enfriamiento Dynamic Cooling, sistemas de almacenamiento flexible y acabados premium.
En este catálogo, encontrarás detalles sobre los distintos modelos de refrigeradores y congeladores Miele, incluyendo sus especificaciones técnicas, características destacadas y beneficios para el usuario. Amado Salvador, como distribuidor oficial de electrodomésticos Miele, garantiza que todos los productos cumplen con los más altos estándares de calidad y durabilidad.
Explora el catálogo completo y encuentra el refrigerador Miele perfecto para tu hogar con Amado Salvador, el distribuidor oficial de electrodomésticos Miele.
Catalogo general Ariston Amado Salvador distribuidor oficial ValenciaAMADO SALVADOR
Distribuidor Oficial Ariston en Valencia: Amado Salvador distribuidor autorizado de Ariston, una marca líder en soluciones de calefacción y agua caliente sanitaria. Amado Salvador pone a tu disposición el catálogo completo de Ariston, encontrarás una amplia gama de productos diseñados para satisfacer las necesidades de hogares y empresas.
Calderas de condensación: Ofrecemos calderas de alta eficiencia energética que aprovechan al máximo el calor residual. Estas calderas Ariston son ideales para reducir el consumo de gas y minimizar las emisiones de CO2.
Bombas de calor: Las bombas de calor Ariston son una opción sostenible para la producción de agua caliente. Utilizan energía renovable del aire o el suelo para calentar el agua, lo que las convierte en una alternativa ecológica.
Termos eléctricos: Los termos eléctricos, como el modelo VELIS TECH DRY (sustito de los modelos Duo de Fleck), ofrecen diseño moderno y conectividad WIFI. Son ideales para hogares donde se necesita agua caliente de forma rápida y eficiente.
Aerotermia: Si buscas una solución aún más sostenible, considera la aerotermia. Esta tecnología extrae energía del aire exterior para calentar tu hogar y agua. Además, puede ser elegible para subvenciones locales.
Amado Salvador es el distribuidor oficial de Ariston en Valencia. Explora el catálogo y descubre cómo mejorar la comodidad y la eficiencia en tu hogar o negocio.
Catalogo general Ariston Amado Salvador distribuidor oficial Valencia
Modelado de la proteína p35 de toxoplasma gondii
1. Modelado de la Proteína P35 de Toxoplasma Gondii y Predicción de sus Epitopes Juan Gabriel Costa 1 , Claudia Marina Lagier 2 , Iván Sergio Marcipar 1 1 Labortorio de Tecnología Inmunológica, Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas, Universidad Nacional del Litoral, Santa Fe, Argentina 2 Departamente de Química, Facultad de Bioquímica y Farmacia, Universidad Nacional de Rosario, Rosario, Argentina e.mail: jcosta@fbcb.unl.edu.ar Fundamentación: El diagnóstico de la toxoplasmosis en la embarazada es de gran interés ya que si la infección es reciente puede afectar al feto, mientras que si es crónica no existe riesgo de transmisión transplacentaria. Para optimizar el diagnóstico de fase aguda nos propusimos utilizar antígenos que sean reconocidos específicamente por los anticuerpos en dicho estadío de la infección. Uno de ellos es la proteína transmembrana P35 (GRA8) de 267 aminoácidos (AA). El objetivo de este trabajo fue determinar cuales son las mínimas regiones de la proteína que pueden expresarse y ser reconocidas por los anticuerpos de fase aguda, para incorporarlos en un ensayo de diagnóstico. Para esto se modeló la estructura tridimensional de la proteína P35 y luego se predijo cuales son sus epitopes lineales y estructurales para linfocitos B (LB) mediante programas de predicción actualmente disponibles en la web. Materiales y Métodos: Búsqueda de patrones: Mediante el servidor Swiss-Model (http://swissmodel.expasy.org/) se buscaron proteínas con porcentaje de identidad mayor al 25 % con la P35, pero no se encontraron. Por lo tanto, se procedió a modelar por threading. Las proteínas homólogas fueron halladas mediante el servidor PSIPRED ( http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/), encontrándose la proteína de cápside del Parvovirus B19 y la Oncoproteína c-Myc1, de 5,4 % y 16,7 % de identidad de secuencia respectivamente. Generación de la estructura: Se empleó el programa Modeller9v3 para generar las estructuras tridimensionales. Se armaron cinco modelos por cada uno de los seis alineamientos generales de patrones, dando un total de 30 estructuras bases. Paralelamente se emplearon los programas online de modelado automático I-TASSER ( http://zhang.bioinformatics.ku.edu/I-TASSER) y ROBETTA (http://robetta.bakerlab.org/), cinco con cada uno. En ningún caso se cargaron proteínas patrón ni se definieron restricciones estructurales. Evaluación y refinado del modelo : De la mejor estructura obtenida se procedió a corregir el alineamiento y ajustar la hélice transmembrana mediante el programa PDBview. La calidad de cada modelo se analizó mediante los programas online ANOLEA (http://protein.bio.puc.cl/cardex/servers/anolea/index.html) y Verify3D (http://nihserver.mbi.ucla.edu/Verify_3D/). Finalmente se ajustaron los loops ubicados entre los AA 2 a 24, 107 a 117 y 247 a 266 mediante el programa online LOBO (http://protein.cribi.unipd.it/lobo/). También se empleó el programa UCSF Chimera para realizar una minimización de energía de 50 pasos luego del ajuste del alineamiento y otra de 100 pasos después del refinado de loops. Predicción de epitopes: Para encontrar los epitopes contra LB lineales y estructurales se emplearon los programas online ABCpred (http://www.imtech.res.in/raghava/abcpred/) y Discotope (http://www.cbs.dtu.dk/services/DiscoTope/), respectivamente. Resultados: Modelado : La estructura final se muestra en la gráfica 1. El modelo obtenido tiene un 70,04 % de los AA con un score interno de Verify3D superior a 0,1 y un 85,02 % de los aminoácidos con valor inferior a 5 E/kT en el ANOLEA. En la grafica 2 se muestra el Mapa de Ramachandran de dicha estructura. Los modelos obtenidos por los programas de modelado automático se descartaron por tener valores en el ANOLEA y estructuras finales poco satisfactorias. Predicción de epitopes contra LB: Aminoácidos que conforman epitopes lineales: 65 - 84, 113 - 131 y 151 – 170. Gráficas 3 y 5. Aminoácidos que conforman epitopes estructurales: 34 - 38, 41, 50, 57, 61, 62, 68 - 71, 73 - 79, 81 - 83, 88 - 98, 104 - 132, 135, 142 - 144, 150, 157, 158, 191 - 195 y 197 – 200. Gráficas 4 y 6. Conclusión: La predicción in silico podría permitir identificar en forma rápida y económica, epitopes útiles para desarrollar ensayos de inmunodiagnóstico altamente efectivos. En el caso de antígenos con estructuras aun no descriptas, la predicción de epitopes estructurales requiere de un modelado confiable de la proteína. En este trabajo mediante la utilización de programas libres se pudo obtener un modelo de la P35 de T. gondii y se predijo que la mayoría de las regiones antigénicas se encuentran en la región media y N terminal de la molécula. Actualmente, se están evaluado dichas regiones experimentalmente. Gráfica 1: Estructura solución de la proteína de Toxoplasma Gondii P35 Gráfica 2: Mapa de Ramachandran de la estructura final de la proteína P35. Gráfica 5: En rojo se muestran los epitopes lineales predichos para la proteína P35, Gráfica 6: En rojo se muestran los epitopes estructurales predichos para la proteína P35, Gráfica 3: Esquema de los epiitopes lineales predichos (en rojo) para la proteína P35. Gráfica 4: Esquema de los epiitopes estructurales predichos (en rojo) para la proteína P35. Referencias -. Kimberly L, Carolyn G, Gary E: Identification and molecular characterization of GRA8, a novel, proline-rich, dense granule protein of Toxoplasma gondii . Mol. and Bioch. Parasit 2000, 105 :25-37