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UNIVERSIDAD NACIONAL DEL ALTIPLANO
MÉTODOS EXTRACCIÓN DE
ARN DE Candida albicans.
PRESENTADO POR:
MEDINA HUMPIRI EDUARDO
JEANPIERO
PINO RAMOS RENATO ANTONIO
QUISPE PAMPA MARIA PAOLA
DOCENTE:
Los patógenos fúngicos son una causa importante de
enfermedades invasivas fatales en pacientes
inmunocomprometidos.
Limitaciones en terapias antifúngicas: Toxicidad,
espectro cerrado y emergencia de patógenos
resistentes.
INTRODUCCION
Género
CANDIDA
El género CANDIDA pertenece a la familia Cryptococcaceae dentro del
orden Deuteromycota.
Forman parte de la flora normal de la piel, tracto gastrointestinal,
genitourinario y respiratorio.
Levadura comensal del Tracto vaginal, gastrointestinal y bucal en los
humanos.
Agente patógeno oportunista generando lesiones leves hasta infeccion
invasiva y rápidamente fatal en pacientes con inmunidad deprimida
razón de la extracción de
arn de candida
Obtener una muestra de ARN de Candida albicans en
cantidad y calidad adecuada que permite realizar
estudios en biología molecular de este microorganismo
que nos ayudará a determinar los niveles de expresión
de los genes o cambios que presentan con relación a las
condiciones de crecimiento, que puedan favorecer a los
factores de virulencia de esta levadura.
Incubación
• 5 minutos
• - 80° C
Baño María
• 10 minutos
• 60° C
METODOLOGÍA
Candida albicans lISIS DE LA PARED CELULAR
• Choque térmico:
lISIS DE LA PARED CELULAR
METODOLOGÍA
Candida albicans
2. Sonicación
• 1 minutos
• 30 Hertz
METODOLOGÍA
Candida albicans lISIS DE LA PARED CELULAR
3. Lisis Enzimática
• EDTA
• Enzima liticasa
Incubación
• 4 horas
• 37° C
Reactivo Trizol
METODOLOGÍA
Es un reactivo a base de ácido-
guanidinio-fenol idealmente diseñado
para la extracción de ARN
EXTRACCIÓN DE ARN TOTAL
• FENOL CLOROFORMO
• ISOTIOCIANATO DE GUANIDINA
METODOLOGÍA
EXTRACCIÓN DE ARN TOTAL
Reactivo Trizol
Agua tratada
con DEPC
Agua libre de
ARNasas
• Homogenización
• Separación de fases
• Precipitación de ARN
• Lavado de ARN
• Redisolución de ARN
EXTRACCIÓN DE ARN TOTAL
Reactivo Trizol
METODOLOGÍA
Reactivo Trizol
750µl
15 - 30°C
Incubación
15 - 30°C
2 min
Glucógeno
3µl
30 min
2 a 8°C
9OOµl
Trisol
75Oµl
12000 rpm
30 min a 4°C
Incubación
10 min
55 - 60°C
CUANTIFICACION
DEL ARN TOTAL
La cuantificacion del ARN se realiza por
espectrofotometria. para lo cual se utilizan cubetas
donde se deposita la muestra, se hidrata con agua DECP
y se determina al absorbancia a 230, 260 y 280nm
Purificacion del
arn total
Se incuba los estractos con DNAsas por 10min a 30°C se
centrifuga a 13000 rpm por 2 min
Descartar sobrenadante y suspender en 500ul de
isopropanol y formamida
Visualizacion del arn
mediante gel de agarosa
Gracias
por su
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MÉTODOS EXTRACCIÓN DE ARN DE Candida albicans.

  • 1. UNIVERSIDAD NACIONAL DEL ALTIPLANO MÉTODOS EXTRACCIÓN DE ARN DE Candida albicans. PRESENTADO POR: MEDINA HUMPIRI EDUARDO JEANPIERO PINO RAMOS RENATO ANTONIO QUISPE PAMPA MARIA PAOLA DOCENTE:
  • 2. Los patógenos fúngicos son una causa importante de enfermedades invasivas fatales en pacientes inmunocomprometidos. Limitaciones en terapias antifúngicas: Toxicidad, espectro cerrado y emergencia de patógenos resistentes. INTRODUCCION
  • 3. Género CANDIDA El género CANDIDA pertenece a la familia Cryptococcaceae dentro del orden Deuteromycota. Forman parte de la flora normal de la piel, tracto gastrointestinal, genitourinario y respiratorio.
  • 4. Levadura comensal del Tracto vaginal, gastrointestinal y bucal en los humanos. Agente patógeno oportunista generando lesiones leves hasta infeccion invasiva y rápidamente fatal en pacientes con inmunidad deprimida
  • 5. razón de la extracción de arn de candida Obtener una muestra de ARN de Candida albicans en cantidad y calidad adecuada que permite realizar estudios en biología molecular de este microorganismo que nos ayudará a determinar los niveles de expresión de los genes o cambios que presentan con relación a las condiciones de crecimiento, que puedan favorecer a los factores de virulencia de esta levadura.
  • 6. Incubación • 5 minutos • - 80° C Baño María • 10 minutos • 60° C METODOLOGÍA Candida albicans lISIS DE LA PARED CELULAR • Choque térmico:
  • 7. lISIS DE LA PARED CELULAR METODOLOGÍA Candida albicans 2. Sonicación • 1 minutos • 30 Hertz
  • 8. METODOLOGÍA Candida albicans lISIS DE LA PARED CELULAR 3. Lisis Enzimática • EDTA • Enzima liticasa Incubación • 4 horas • 37° C
  • 9. Reactivo Trizol METODOLOGÍA Es un reactivo a base de ácido- guanidinio-fenol idealmente diseñado para la extracción de ARN EXTRACCIÓN DE ARN TOTAL • FENOL CLOROFORMO • ISOTIOCIANATO DE GUANIDINA
  • 10. METODOLOGÍA EXTRACCIÓN DE ARN TOTAL Reactivo Trizol Agua tratada con DEPC Agua libre de ARNasas
  • 11. • Homogenización • Separación de fases • Precipitación de ARN • Lavado de ARN • Redisolución de ARN EXTRACCIÓN DE ARN TOTAL Reactivo Trizol METODOLOGÍA
  • 12. Reactivo Trizol 750µl 15 - 30°C Incubación 15 - 30°C 2 min Glucógeno 3µl 30 min 2 a 8°C 9OOµl Trisol 75Oµl 12000 rpm 30 min a 4°C Incubación 10 min 55 - 60°C
  • 13. CUANTIFICACION DEL ARN TOTAL La cuantificacion del ARN se realiza por espectrofotometria. para lo cual se utilizan cubetas donde se deposita la muestra, se hidrata con agua DECP y se determina al absorbancia a 230, 260 y 280nm
  • 14.
  • 15. Purificacion del arn total Se incuba los estractos con DNAsas por 10min a 30°C se centrifuga a 13000 rpm por 2 min Descartar sobrenadante y suspender en 500ul de isopropanol y formamida

Notas del editor

  1. 1.7.2013
  2. 1.7.2013
  3. 1.7.2013
  4. 1.7.2013
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