BLOQUE III. MICROORGANISMOS PROCARIOTICOS



III.C. GENÉTICA BACTERIANA



Tema 14. Principios de Genética Bacteriana.
Variaciones Bacterianas. Mutaciones.

Tema 15. Recombinación.

Tema 16. Transferencia de material genético en bacterias:
Transformación. Conjugación. Transducción.

Tema 17. Ingeniería genética. Técnicas y Aplicaciones.
Tema 16. Conjugación.
  1. CONCEPTO Y APROXIMACION HISTORICA
            -Experiencia de Lederberg y Tatum
            -Experiencia de Davis
            -Experiencia de Lederberg y Hayes

  2. DESCRIPCION DEL PLASMIDO F Y DE SUS FUNCIONES BÁSICAS
      Estructura física
      Organización genética y funcional
      Procesos de integración y escisión del plásmido F

  3. FASES DE LA CONJUGACIÓN
             -Contactos entre las células
             -Transferencia del DNA
                      F+ x F- ----- F+, Hfr
                      Hfr x F- ----- F-
                      F' x F- ----- F', Hfr
             -Estado del DNA donador en la célula receptora

  4. APLICACIÓN DE LA CONJUGACIÓN EN EL LABORATORIO
1. CONCEPTO Y APROXIMACIÓN HISTÓRICA
Conjugación: Transferencia de material genético
entre dos bacterias vivas, donadora y aceptora,
a través de un contacto físico

                             Transferencia de ADN plasmídico
Donador




                             Transferencia de ADN cromosómico

               Receptor
1.Experimento de Lederberg             Mutantes auxotrofos

y Tatum (1946)        A                             B




 - Escherichia coli K12

 •Aparición de
 colonias con
 frecuencia muy
 superior a la de
 doble reversión                  Prototrofos


RECOMBINACIÓN
                          Medios mínimos sin metionina,
                          biotina, treonina, leucina
2. Experimento de Davis
  E. coli K12




     A        A                B      B
Bio- met- thr+ leu+       Bio+ met+ thr- leu-




                          4h



                                   No crecimiento
2. Experimento de Davis
  E. coli K12




     A        A                                       B    B
Bio- met- thr+ leu+                              Bio+ met+ thr- leu-



   Las células necesitan contactar físicamente
                                                 4h



                                                      Bio+ met+ thr+ leu+
                               Sin filtro                  Prototrofas
3. Experimento de Lederberg y Hages

  La conjugación es un FENÓMENO POLAR

    Célula donadora        Célula receptora
      fértil F+               no fértil F-

      Factor sexual F+               Receptores pili
   Plásmido F                 OmpA
   (genes para los pili)
3. Experimento de Lederberg y Hages

  La conjugación es un FENÓMENO POLAR

   Célula donadora      Célula receptora
     fértil F+             no fértil F-
     Factor sexual F+




                            OmpA

                               Receptores pili
3. Experimento de Lederberg y Hages

     La conjugación es un FENÓMENO POLAR

      Célula donadora        Célula receptora
        fértil F+               no fértil F-

       Factor sexual F+
F+     F-                                            F+            F+




                                                  F+ ~ (100%)
                          Frecuencia recombinación (10-5)
                            (la auxotrofía desaparecía rara vez)
Estructura física, organización genética y funcional
                    del plásmido F

   25 genes
   (33Kb)

 Región tra

      -biosíntesisPlásmido F
                   y ensamblaje de pelos sexuales
      -estabilización de los agregados de conjugación
                    100 Kb
      -regulación genética de la transferencia
      -proteínas que tapan las porinas ompA
             (fenómeno de exclusión de superficie)
Estructura física, organización genética y funcional
                    del plásmido F




  Región tra

                       Plásmido F
                         100 Kb




                Región de replicación:
                ori V y ori T
Organización genética y funcional del plásmido F




Región tra


               Región de integración del plásmido en
               el cromosoma y de su escisión.



             Región de replicación:
             ori V y ori T
Integración del plásmido F en el cromosoma

   F+                                  Hfr




 autónomo      F+            Hfr
                                     integrado
            Recombinación homóloga
                    (RecA)
Recombinación homóloga
(RecA)




      Hfr
Escisión del Plásmido F
Hfr                                F’

           Separación del
           plásmido F llevándose
           parte del cromosoma
           bacteriano



          Gen cromosómico

          Plásmido F
Posibles situaciones del plásmido F
                              F’
  F+           Hfr




autónomo    integrado
                          Autónomo
                          (con un fragmento
                          cromosoma)
3. Fases de la conjugación
1. Contactos entre células fértiles y células infértiles

       Célula F+



                                       Célula F-

1-10 pelos sexuales

    F+                              OmpA

   Hfr
    F’
1. Contactos entre células fértiles y células infértiles
   Cromosoma
   bacteriano   Plásmido F
                              Pili


                                     OmpA
Célula F+        El pelo se despolimeriza
                                            Célula F-


                   El pili se retrae



                     oriT
                                              Genes tra

                  Puente conjugativo
2.Transferencia y procesamiento del DNA conjugativo
    a) Transferencia entre células F+ y F-
                                  Genes tra
             oriT

  Endonucleasa      Inicio síntesis de la
  helicasa          cadena complementaria
                    en célula receptora




                    Final transferencia DNA
                    Separación células




                                              TODA LA POBLACIÓN F+
a) Transferencia entre células F+ y F-
F+       F-                                                    F+    F+

                          oriT




                                                  TODA LA POBLACIÓN F+


b) Transferencia entre células Hfr y F-
Hfr       F-                                                   Hfr   F-
                           Ori T




               tiene un fragmento del DNA plasmídico y cromosómico
               con el cual puede recombinar o degradar
c) Transferencia entre células F’ y F-

F’           F-                           F’          F’
                      oriT




                                      TODA LA POBLACIÓN F’
Cruces posibles

  •F+ X F-→ F+

  •Hfr X F-→ Hfr + F-

  •F’ X F- → F’

Cruces no viables (exclusión superficial)

F+ X F+     F+ X Hfr       F+ X F’

F’ X F’     F’ X Hfr

Hfr X Hfr
FASES DE LA CONJUGACIÓN
  1.- Contactos entre las células
  2.- Transferencia del DNA
4. Aplicación de la conjugación en el laboratorio

Construcción de mapas cromosómicos
 (actualmente por secuenciación)




                                   Ingeniería genética
Tema 16. Transducción.
1. Concepto y aproximación histórica

2. Tipos de bacteriófagos implicados en la transducción

3. Tipos de transducción
       Transducción generalizada
             -características
             -mecanismo
       Transducción especializada
             -características
             -mecanismo

  4. La transducción en la naturaleza y en el laboratorio
1. Concepto y aproximación histórica
Transducción: Transferencia de material genético
en la que el DNA exogenote es vehiculizado desde
la célula donadora a la aceptora a través de un
bacteriófago
Norton Zinder y Joshua Lederberg
 Salmonella typhimurium
 Células A ++ -- x   Células B -- ++
 Células A ++ -- x   Filtrado del cultivo de las células B -- ++
 Células A ++ -- separadas por filtro         Células B -- ++




                 Medio de cultivo deficiente en
                 bio, met, tre, leu, etc.



   + DNAsas
                                   Prototrofos
En todos los casos hubo crecimiento de colonias recombinantes
Proceso de transferencia genética
Transducción                  mediada por un virus
               1. No se requiere contacto célula-célula
               2. No se afecta por la DNAasa
               3. Agente de transferencia atraviesa el
                  material poroso (bacteriófago)
               4. La recombinación solo ocurre con
                  células receptoras que tengan sitios
                  receptores para el virus


      Medio de cultivo deficiente en
      bio, met, tre, leu, etc.


+ DNAsas                        Prototrofos
2. Tipos de bacteriófagos implicados en la transducción
2. Tipos de bacteriófagos implicados en la transducción

Fagos virulentos               Fagos atemperados o moderados

Ciclo lítico                          Ciclo lisogénico

                   Adsorción
                      Penetración

                                 inducción




Lisis


Ensamblaje Síntesis de ácidos
           nucleicos y proteínas
Fagos virulentos
1.Transducción generalizada


Fagos atemperados o moderados
2.Transducción especializada
1.Transducción generalizada
                                                Fagos virulentos



                      Ciclo lítico




                            Empaquetamiento inespecífico
 Partículas virales



   Partículas
transductantes
La transducción no siempre va seguida de
   recombinación del DNA exogenote en la
              célula receptora




 Recombinación                  DNA no se recombina
 homóloga o
 generalizada       Supervivencia
                                             a)Transducción abortiva
DNA se recombina    DNA donador



                     Degradación

Transferencia
génica estable
                                    b)DNA transductante muy diferente
                                    (sistemas modificación-restricción)
2.Transducción especializada
Recombinación específica de sitio

                                       Ciclo lisogénico

                   Adsorción
                       Penetración




 Lisis                               Integración del DNA fago




 Ensamblaje Síntesis de o
 Fagos atemperados ácidos                Profago                Bacteria lisogénica
            nucleicos y proteínas
 moderados
2.Transducción especializada                         Fago lambda

Recombinación específica de sitio
 - Entre secuencias idénticas
 (sitios de fijación “att”)

 - No interviene RecA



                                                Escherichia coli



                                    Integrasa
                                       (int)




 Fagos atemperados o
 moderados
Recombinación específica de sitio

         ATAT
  λ                                 A     TAT
         TATA
                                    TAT    A
                       integrasa


         ATAT                        A    TAT
E.coli
         TATA                       TAT     A




                ATAT         ATAT
                TATA         TATA
Recombinación específica de sitio




-proceso reversible   el DNA del fago se escinde (escisionasa)

                                    Ciclo lítico
Escisión normal   Escisión defectuosa



                                                   Fagos defectivos

                                                        gal+



                                             gal+




Infección célula receptora
Transducción generalizada                   gal+
(igual fagos virulentos)
Escisión defectuosa


                         a) Entrecruzamiento para integrar
                         genes bacterianos
                         Cromosoma bacteriano que contiene DNA del dador
                                                                  gal+
      Fagos defectivos
                         b) Integración como profago
                         Cromosoma bacteriano que contiene DNA viral y del
                         dador
                                   Bacteriofago + gal+




              Infección célula
              receptora                No dan ciclos líticos
TIPOS DE TRANSDUCCIÓN
1. TRANSDUCCIÓN                  2. TRANSDUCCIÓN
   GENERALIZADA                     ESPECIALIZADA

a) Fagos con ciclo lítico        a) Fagos con ciclo lisogénico
   (virulentos)                     (atemperados)

b) Se transfiere con igual       b) Se transfieren zonas concretas
   probabilidad cualquier           del cromosoma
   región del cromosoma
                                 c) Se produce por escisión del
c) La eficiencia de la              profago y consiguiente entrada a
   transducción para cualquier      fase lítica
   marcador cromosómico es
   muy baja                      d) El DNA genómico de la bacteria
                                    va unido al DNA del fago
d) El DNA transferido puede
   sufrir recombinación
   generalizada
Transducción en la naturaleza y en el laboratorio
 En la Naturaleza: tiene importancia como
 mecanismo de intercambio genético

 En el Laboratorio: clonaje de genes,
 construcción de mapas genéticos y librerías
 genómicas

Tema 16 conjugacion transduccion

  • 1.
    BLOQUE III. MICROORGANISMOSPROCARIOTICOS III.C. GENÉTICA BACTERIANA Tema 14. Principios de Genética Bacteriana. Variaciones Bacterianas. Mutaciones. Tema 15. Recombinación. Tema 16. Transferencia de material genético en bacterias: Transformación. Conjugación. Transducción. Tema 17. Ingeniería genética. Técnicas y Aplicaciones.
  • 2.
    Tema 16. Conjugación. 1. CONCEPTO Y APROXIMACION HISTORICA -Experiencia de Lederberg y Tatum -Experiencia de Davis -Experiencia de Lederberg y Hayes 2. DESCRIPCION DEL PLASMIDO F Y DE SUS FUNCIONES BÁSICAS Estructura física Organización genética y funcional Procesos de integración y escisión del plásmido F 3. FASES DE LA CONJUGACIÓN -Contactos entre las células -Transferencia del DNA F+ x F- ----- F+, Hfr Hfr x F- ----- F- F' x F- ----- F', Hfr -Estado del DNA donador en la célula receptora 4. APLICACIÓN DE LA CONJUGACIÓN EN EL LABORATORIO
  • 3.
    1. CONCEPTO YAPROXIMACIÓN HISTÓRICA Conjugación: Transferencia de material genético entre dos bacterias vivas, donadora y aceptora, a través de un contacto físico Transferencia de ADN plasmídico Donador Transferencia de ADN cromosómico Receptor
  • 4.
    1.Experimento de Lederberg Mutantes auxotrofos y Tatum (1946) A B - Escherichia coli K12 •Aparición de colonias con frecuencia muy superior a la de doble reversión Prototrofos RECOMBINACIÓN Medios mínimos sin metionina, biotina, treonina, leucina
  • 5.
    2. Experimento deDavis E. coli K12 A A B B Bio- met- thr+ leu+ Bio+ met+ thr- leu- 4h No crecimiento
  • 6.
    2. Experimento deDavis E. coli K12 A A B B Bio- met- thr+ leu+ Bio+ met+ thr- leu- Las células necesitan contactar físicamente 4h Bio+ met+ thr+ leu+ Sin filtro Prototrofas
  • 7.
    3. Experimento deLederberg y Hages La conjugación es un FENÓMENO POLAR Célula donadora Célula receptora fértil F+ no fértil F- Factor sexual F+ Receptores pili Plásmido F OmpA (genes para los pili)
  • 8.
    3. Experimento deLederberg y Hages La conjugación es un FENÓMENO POLAR Célula donadora Célula receptora fértil F+ no fértil F- Factor sexual F+ OmpA Receptores pili
  • 9.
    3. Experimento deLederberg y Hages La conjugación es un FENÓMENO POLAR Célula donadora Célula receptora fértil F+ no fértil F- Factor sexual F+ F+ F- F+ F+ F+ ~ (100%) Frecuencia recombinación (10-5) (la auxotrofía desaparecía rara vez)
  • 10.
    Estructura física, organizacióngenética y funcional del plásmido F 25 genes (33Kb) Región tra -biosíntesisPlásmido F y ensamblaje de pelos sexuales -estabilización de los agregados de conjugación 100 Kb -regulación genética de la transferencia -proteínas que tapan las porinas ompA (fenómeno de exclusión de superficie)
  • 11.
    Estructura física, organizacióngenética y funcional del plásmido F Región tra Plásmido F 100 Kb Región de replicación: ori V y ori T
  • 12.
    Organización genética yfuncional del plásmido F Región tra Región de integración del plásmido en el cromosoma y de su escisión. Región de replicación: ori V y ori T
  • 13.
    Integración del plásmidoF en el cromosoma F+ Hfr autónomo F+ Hfr integrado Recombinación homóloga (RecA)
  • 14.
  • 15.
    Escisión del PlásmidoF Hfr F’ Separación del plásmido F llevándose parte del cromosoma bacteriano Gen cromosómico Plásmido F
  • 16.
    Posibles situaciones delplásmido F F’ F+ Hfr autónomo integrado Autónomo (con un fragmento cromosoma)
  • 17.
    3. Fases dela conjugación 1. Contactos entre células fértiles y células infértiles Célula F+ Célula F- 1-10 pelos sexuales F+ OmpA Hfr F’
  • 18.
    1. Contactos entrecélulas fértiles y células infértiles Cromosoma bacteriano Plásmido F Pili OmpA Célula F+ El pelo se despolimeriza Célula F- El pili se retrae oriT Genes tra Puente conjugativo
  • 19.
    2.Transferencia y procesamientodel DNA conjugativo a) Transferencia entre células F+ y F- Genes tra oriT Endonucleasa Inicio síntesis de la helicasa cadena complementaria en célula receptora Final transferencia DNA Separación células TODA LA POBLACIÓN F+
  • 20.
    a) Transferencia entrecélulas F+ y F- F+ F- F+ F+ oriT TODA LA POBLACIÓN F+ b) Transferencia entre células Hfr y F- Hfr F- Hfr F- Ori T tiene un fragmento del DNA plasmídico y cromosómico con el cual puede recombinar o degradar
  • 21.
    c) Transferencia entrecélulas F’ y F- F’ F- F’ F’ oriT TODA LA POBLACIÓN F’
  • 22.
    Cruces posibles •F+ X F-→ F+ •Hfr X F-→ Hfr + F- •F’ X F- → F’ Cruces no viables (exclusión superficial) F+ X F+ F+ X Hfr F+ X F’ F’ X F’ F’ X Hfr Hfr X Hfr
  • 23.
    FASES DE LACONJUGACIÓN 1.- Contactos entre las células 2.- Transferencia del DNA
  • 24.
    4. Aplicación dela conjugación en el laboratorio Construcción de mapas cromosómicos (actualmente por secuenciación) Ingeniería genética
  • 26.
    Tema 16. Transducción. 1.Concepto y aproximación histórica 2. Tipos de bacteriófagos implicados en la transducción 3. Tipos de transducción Transducción generalizada -características -mecanismo Transducción especializada -características -mecanismo 4. La transducción en la naturaleza y en el laboratorio
  • 27.
    1. Concepto yaproximación histórica Transducción: Transferencia de material genético en la que el DNA exogenote es vehiculizado desde la célula donadora a la aceptora a través de un bacteriófago
  • 28.
    Norton Zinder yJoshua Lederberg Salmonella typhimurium Células A ++ -- x Células B -- ++ Células A ++ -- x Filtrado del cultivo de las células B -- ++ Células A ++ -- separadas por filtro Células B -- ++ Medio de cultivo deficiente en bio, met, tre, leu, etc. + DNAsas Prototrofos En todos los casos hubo crecimiento de colonias recombinantes
  • 29.
    Proceso de transferenciagenética Transducción mediada por un virus 1. No se requiere contacto célula-célula 2. No se afecta por la DNAasa 3. Agente de transferencia atraviesa el material poroso (bacteriófago) 4. La recombinación solo ocurre con células receptoras que tengan sitios receptores para el virus Medio de cultivo deficiente en bio, met, tre, leu, etc. + DNAsas Prototrofos
  • 30.
    2. Tipos debacteriófagos implicados en la transducción
  • 31.
    2. Tipos debacteriófagos implicados en la transducción Fagos virulentos Fagos atemperados o moderados Ciclo lítico Ciclo lisogénico Adsorción Penetración inducción Lisis Ensamblaje Síntesis de ácidos nucleicos y proteínas
  • 32.
    Fagos virulentos 1.Transducción generalizada Fagosatemperados o moderados 2.Transducción especializada
  • 33.
    1.Transducción generalizada Fagos virulentos Ciclo lítico Empaquetamiento inespecífico Partículas virales Partículas transductantes
  • 34.
    La transducción nosiempre va seguida de recombinación del DNA exogenote en la célula receptora Recombinación DNA no se recombina homóloga o generalizada Supervivencia a)Transducción abortiva DNA se recombina DNA donador Degradación Transferencia génica estable b)DNA transductante muy diferente (sistemas modificación-restricción)
  • 35.
    2.Transducción especializada Recombinación específicade sitio Ciclo lisogénico Adsorción Penetración Lisis Integración del DNA fago Ensamblaje Síntesis de o Fagos atemperados ácidos Profago Bacteria lisogénica nucleicos y proteínas moderados
  • 36.
    2.Transducción especializada Fago lambda Recombinación específica de sitio - Entre secuencias idénticas (sitios de fijación “att”) - No interviene RecA Escherichia coli Integrasa (int) Fagos atemperados o moderados
  • 37.
    Recombinación específica desitio ATAT λ A TAT TATA TAT A integrasa ATAT A TAT E.coli TATA TAT A ATAT ATAT TATA TATA
  • 38.
    Recombinación específica desitio -proceso reversible el DNA del fago se escinde (escisionasa) Ciclo lítico
  • 39.
    Escisión normal Escisión defectuosa Fagos defectivos gal+ gal+ Infección célula receptora Transducción generalizada gal+ (igual fagos virulentos)
  • 40.
    Escisión defectuosa a) Entrecruzamiento para integrar genes bacterianos Cromosoma bacteriano que contiene DNA del dador gal+ Fagos defectivos b) Integración como profago Cromosoma bacteriano que contiene DNA viral y del dador Bacteriofago + gal+ Infección célula receptora No dan ciclos líticos
  • 41.
    TIPOS DE TRANSDUCCIÓN 1.TRANSDUCCIÓN 2. TRANSDUCCIÓN GENERALIZADA ESPECIALIZADA a) Fagos con ciclo lítico a) Fagos con ciclo lisogénico (virulentos) (atemperados) b) Se transfiere con igual b) Se transfieren zonas concretas probabilidad cualquier del cromosoma región del cromosoma c) Se produce por escisión del c) La eficiencia de la profago y consiguiente entrada a transducción para cualquier fase lítica marcador cromosómico es muy baja d) El DNA genómico de la bacteria va unido al DNA del fago d) El DNA transferido puede sufrir recombinación generalizada
  • 42.
    Transducción en lanaturaleza y en el laboratorio En la Naturaleza: tiene importancia como mecanismo de intercambio genético En el Laboratorio: clonaje de genes, construcción de mapas genéticos y librerías genómicas