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Concepto de proteínas
•   La palabra proteína viene del griego protos que significa "lo más
    antiguo, lo primero”.
•   Las proteínas son biopolímeros (macromoléculas orgánicas) de
    elevado peso molecular; compuestos químicos muy complejos que
    se encuentran en todas las células vivas.
•   Hay ciertos elementos químicos que todas ellas poseen, pero los
    diversos tipos de proteínas los contienen en diferentes cantidades.
•   Están constituidas básicamente por carbono (C), hidrógeno (H),
    oxígeno (O) y nitrógeno (N); aunque pueden contener también
    azufre (S) y fósforo (P) y, en menor proporción, hierro (Fe), cobre
    (Cu), magnesio (Mg), yodo (Y).




                                                                      2
•   Las proteínas son las moléculas orgánicas más abundantes en las células;
    constituyen alrededor del 50% de su peso seco o más en algunos casos.
•   Una bacteria puede tener cerca de 1000 proteínas diferentes, pero en una
    célula humana puede haber 10.000 clases de proteínas distintas.
•   Químicamente, las proteínas están formadas por la unión de muchas
    moléculas relativamente sencillas y no hidrolizables, denominadas
    Aminoácidos (Aa).
•   Los aminoácidos se unen entre sí originando péptidos. Según su tamaño
    molecular, pueden ser oligopéptidos, formados por no más de 10 Aa y
    polipéptidos, constituidos por más de 10 Aa.
•   Cuando el número de Aa supera los 50 y el polipéptido tiene una
    estructura tridimensional específica, entonces se habla propiamente de
    proteínas.




                                                                               3
Clasificación de las proteínas

                               Proteínas filamentosas
             Holoproteínas
                               Proteínas globulares

                               Cromo proteínas


 PROTEÍNAS                     Glucoproteínas


             Heteroproteínas   Lipoproteínas

                               Nucleoproteínas

                               Fosfoproteínas




                                                        4
Aminoácidos: Unidades estructurales de las Proteínas



Los aminoácidos son compuestos orgánicos de bajo peso molecular.
Están compuestos siempre de C, H, O y N y además pueden
presentar otros elementos.
Se caracterizan por poseer un grupo carboxilo (—COOH) y un grupo
amino (—NH2) que se unen al mismo carbono (carbono α).


Las otras dos valencias del carbono se
saturan con un átomo de H y con un
grupo variable denominado radical R.
Este radical es el que determina las
propiedades químicas y biológicas de
cada aminoácido. Según éste se
distinguen 20 tipos de aminoácidos.


                                                                   5
Clasificación de aminoácidos




                               6
Clasificación de aminoácidos

•     Aminoácidos alifáticos. Son los aminoácidos en los que el radical R
      es una cadena hidrocarbonada abierta, que puede tener, además,
      grupos —COOH y —NH2. Los aminoácidos alifáticos se clasifican en
      neutros, ácidos y básicos.
           • Neutros. Si el radical R no posee grupos carboxilo ni amino.
           • Ácidos. Si el radical R presenta grupos carboxilo, pero no
               amino.
           • Básicos. Si el radical R tiene grupos amino, pero no grupos
               carboxilo
•     Aminoácidos aromáticos. Son aquellos cuyo radical R es una cadena
      cerrada, generalmente relacionada con el benceno.
•     Aminoácidos heterocíclicos. Aquellos cuyo radical R es una cadena
      cerrada, generalmente compleja y con algunos átomos distintos del
      carbono y del hidrógeno.




                                                                            7
8
Clasificación de aminoácidos

Existe otra clasificación basada en función de la carga del radical R
   (es la que viene en el libro de texto):
  1. Aminoácidos con R no polar, hidrófobo
  2. Aminoácidos con R polar sin carga, hidrófilos y por tanto más
     solubles que los anteriores.
  3. Aminoácidos ácidos. Presentan carboxilos en el radical R, que
     normalmente está ionizado.
  4. Aminoácidos básicos. Presentan un radical R que se carga
     positivamente a pH neutro.



De los 20 aminoácidos proteicos (hay otros 150 que no forman parte
de las proteínas), hay 8 que son esenciales para la especie humana y
que deben ser incorporados en la dieta. Sólo los vegetales y las
bacterias pueden sintetizarlos, aunque todos los seres vivos los
necesitan para fabricar sus proteínas.



                                                                        9
10
11
12
Aminoácidos Esenciales



•   Son      aquellos    que   los
    organismos heterótrofos deben    •   EN ADULTOS: 8
    tomar de su dieta ya que no          –   Fenilalanina
    pueden sintetizarlos en su           –   Isoleucina
    cuerpo (los autótrofos pueden        –   Leucina
    sintetizarlos todos)                 –   Lisina
                                         –   Metionina
•   Las rutas metabólicas para su        –   Treonina
    obtención suelen ser largas y        –   Triptófano
    energéticamente costosas, por        –   Valina
    lo que los vertebrados las han
    ido perdiendo a lo largo de la
    evolución    (resulta   menos    •   EN NIÑOS los anteriores y:
    costoso obtenerlos en los            – Arginina
    alimentos).                          – Histidina
Estructura de los aminoácidos



En un aminoácido, un carbono central (ɑ ) se une a:
    • Un grupo amino –NH2
    • Un grupo carboxilo –COOH
    • Un hidrógeno
    • Un cadena lateral R que difiere en los 20 aminoácidos existentes.



                                           H
            Monómero
        AMINOÁCIDO            H2N         C         COOH

                                            CH3
                                                                          14
Propiedades de los aminoácidos


1. Los aminoácidos son compuestos
   sólidos.
2. compuestos cristalinos
3. Presentan un elevado punto de
   fusión.
4. Son solubles en agua.
5. Tienen actividad óptica

•   Presentan un comportamiento químico anfótero. Esto se debe a que a
    pH=7 presentan una ionización dipolar, llamada zwitterion, que
    permanece en equilibrio con la forma no iónica. Este estado varía con
    el pH. A pH alcalino, el grupo carboxilo está ionizado (-COO-) y el
    grupo amino no. A pH ácido, el grupo amino está ionizado (NH3+) y el
    grupo carboxilo no.


                                                                            15
Actividad óptica de los aminoácidos


Todos los aminoácidos, salvo la glicocola o glicina, presentan el carbono α
asimétrico, ya que está enlazado a cuatro radicales diferentes: un grupo
amino, un grupo carboxilo. un radical R y un hidrógeno.

Debido a esta característica, los aminoácidos presentan actividad óptica, es
decir, son capaces de desviar el plano de luz polarizada que atraviesa una
disolución de aminoácidos.

Si un aminoácido desvía el plano de luz polarizada hacia la derecha, se
denomina dextrógiro (+), y si lo hace hacia la izquierda, levógiro (—).




                                                                               16
Estereoisomería de los aminoácidos

Debido a la presencia del carbono asimétrico, los aminoácidos pueden
presentar dos configuraciones espaciales.

Un aminoácido tendrá una configuración D si al disponerlo en el espacio, de
forma que el grupo carboxilo quede arriba, el grupo —NH2 queda situado a la
derecha, mientras que, si se encuentra a la izquierda, poseerá una
configuración L.

La disposición L o D es
independiente de la actividad
óptica. Por ello, un L-
aminoácido      podrá      ser
levógiro o dextrógiro, e igual
ocurrirá con la configuración
D.

 En la naturaleza, la forma L es la más
 abundante, y todas las proteínas están
 formadas por aminoácidos L                                            17
Comportamiento químico: propiedades ácido-básicas



En disolución acuosa, los aminoácidos
muestran un comportamiento anfótero,
es decir, pueden ionizarse, dependiendo
del pH, como un ácido (los grupos -COOH
liberan protones, quedando como -COO- ),
como una base (los grupos -NH2 captan
protones, quedando como -NH3+) o como
un ácido y una base a la vez.

En el último caso los aminoácidos se
ionizan doblemente, apareciendo una forma
dipolar iónica llamada zwitterion.




                                                       18
La forma dipolar, en un medio
ácido, capta protones y se
comporta como una base y en un
medio básico libera protones y se
comporta como un ácido.

El pH en el cual el aminoácido
tiende a adoptar una forma dipolar
neutra, con tantas cargas positivas
como negativas, se denomina
punto isoeléctrico.

El carácter anfótero de los
aminoácidos permite la regulación
del pH, ya que se comporta como
un ácido o como una base según le
convenga al organismo.



                                      19
El punto isoeléctrico es el valor de pH al
que el aminoácido presenta una carga neta
igual al cero


                                             20
Unión de los aminoácidos.


Los enlaces químicos entre aminoácidos se denominan enlaces
peptídicos y a las cadenas formadas, péptidos.
Si el número de aminoácidos que forma un péptido es dos, se
denomina dipéptido, si es tres, tripéptido. etc.
Si es inferior a 50 (10 según que textos) se habla de oligopéptido, y
si es superior a 50 se denomina polipéptido.
Sólo cuando un polipéptido se halla constituido por más de cincuenta
moléculas de aminoácidos o si el valor de su peso molecular excede de
5 000 se habla de proteína.




                                                                         21
Unión Peptídica entre Aminoácidos

                          Unión Peptídica
                   H                          H
                           O
        H                    O H                           O
                                                       =

                           =
            N      C       = N N
                          CC                  C    C

        H                    OH H                          OH
                                   H
                   R                          R


                               + H2O        CONDENSACIÓN




Los aminoácidos se unen entre sí mediante uniones peptídicas para
formar cadenas lineales no ramificadas.
                                                                    22
23
Enlace peptídico
•   En un enlace peptídico, los átomos del grupo carboxilo y del grupo
    amino se sitúan en un mismo plano, con distancias y ángulos fijos.

•   Los grupos de aminoácidos unidos por este enlace se denominan
    residuos para resaltar la pérdida de una molécula de agua en cada
    enlace.

•   El amino libre de un extremo y el carboxilo libre del otro extremo de la
    cadena reciben el nombre de N-terminal y C-terminal respectivamente.
    Por convenio, los aminoácidos se numeran desde el N-terminal.




                                                                           24
Enlace peptídico
1. El enlace peptídico tiene un comportamiento similar al de un enlace
   doble, es decir, presenta una cierta rigidez que inmoviliza en un plano
   los átomos que lo forman.

3. Además es un enlace más corto que otros enlaces C-N. Esto le impide
   girar libremente, los únicos enlaces que pueden girar son los Cα-C y los
   Cα-N que no corresponden al enlace peptídico.




                                                                          25
26
Péptidos y oligopéptidos de interés biológico

Existen algunos    péptidos   cortos   con   función
biológica.

Entre ellos podemos citar:

•El tripéptido glutatión (que actúa como
transportador de hidrógeno en algunas reacciones
metabólicas).

•Los nanopéptidos oxitocina y vasopresina (con
actividad hormonal), la insulina y el glucagón que
regulan la concentración de glucosa en sangre.

•Los decapéptidos tirocidina,       gramicidina    y
valinomicina (antibióticos).




                                                       27
Estructura de una
    Proteína?




                    28
Estructura de las proteínas

La organización de una proteína viene definida por cuatro niveles
estructurales ( o cuatro niveles de organización) denominados:

    1.   ESTRUCTURA PRIMARIA
    2.   ESTRUCTURA SECUNDARIA
    3.   ESTRUCTURA TERCIARIA
    4.   ESTRUCTURA CUATERNARIA

Cada una de estas estructuras informa de la disposición de la anterior en
el espacio.




                                                                            29
Estructura primaria

La estructura primaria es la secuencia de aminoácidos de la proteína.

Nos indica qué aminoácidos componen la cadena polipeptídica y el orden
en que dichos aminoácidos se encuentran.

La secuencia de una proteína se escribe enumerando los aminoácidos
desde el extremo N-terminal hasta el C-terminal.




                                                                         30
Estructura primaria



La función de una proteína depende de su secuencia de aminoácidos y
de la forma que ésta adopte. El cambio de un solo aa de la secuencia de
la proteína puede tener efectos muy importantes, como el cambio de un
solo aa en la hemoglobina humana que provoca la anemia falciforme.




                                                                          31
Estructura primaria




                                                        32
   Serina      Glicina   Tirosina   Alanina   Leucina
Estructura primaria




                      33
Estructura secundaria

La estructura secundaria es la disposición de la secuencia de
aminoácidos o estructura primaria en el espacio.

Los aminoácidos, a medida que van siendo enlazados durante la
síntesis de las proteínas, y gracias a la capacidad de giro de sus
enlaces, adquieren una disposición espacial estable, la estructura
secundaria.

Son conocidos tres tipos de estructura secundaria: la α-hélice, la hélice
de colágeno y la conformación β o lámina plegada β. La estructura
secundaria de la cadena polipeptídica depende de los aminoácidos que
la forman.




                                                                            34
Estructura secundaria



•   Las interacciones no covalentes entre los restos laterales de los
    aminoácidos dan origen a la estructura secundaria.

•   Esta conformación viene dada por puentes de hidrógeno
    intercatenarios.

•   La estructura secundaria puede ser:
              – Conformación ɑ (Hélice)
              – Conformación β (Hoja plegada)


•   Si bien las conformaciones anteriores son las más usuales, existen
    otras menos frecuentes.               Conformación β


•   Existen sectores de los polipéptidos cuya estructura no está bien
                        Conformación ɑ
    definida: los enroscamientos aleatorios o “ad-random”.
                                                                        35
α-hélice




           • Estructura en forma de bastón.


           • Los restos laterales de los
           aminoácidos se ubican de forma
           perpendicular al eje de la hélice.


           • Los enlaces puente de hidrógeno se
           establecen entre el hidrógeno unido al
           nitrógeno y el oxígeno del primitivp
           carboxilo.




                                                    36
α-hélice


    La estructura secundaria en α-hélice se forma            al   enrollarse
     helicoidalmente sobre sí misma la estructura primaria.

    Esto se debe a la formación espontánea de enlaces de hidrógeno entre
     el —CO— de un aminoácido y el —NH— del cuarto aminoácido que le
     sigue.

    En la α-hélice, los oxígenos de todos los grupos —CO— quedan
     orientados en el mismo sentido, y los hidrógenos de todos los grupos —
     NH— quedan orientados justo en el sentido contrario.

    La α-hélice presenta 3,6 aminoácidos por vuelta y la rotación es hacia
     la derecha.




                                                                                37
Hélice de colágeno

 •   El colágeno posee una disposición
     en hélice especial, mas alargada
     que la α-hélice, debido a la
     abundancia     de    prolina    e
     hidroxiprolina.




 •   Estos aa poseen una estructura
     que dificulta la formación de
     enlaces de hidrógeno, por lo que
     se forma una hélice más
     extendida,   con      sólo   tres
     aminoácidos por vuelta.
                                         38
Hélice de colágeno


 •   Su estabilidad viene dada por la asociación de tres
     hélices empaquetadas, para formar la triple hélice o
     superhélice que es la responsable de la gran fuerza de
     tensión del colágeno.

 •   Las tres hélices se unen mediante enlaces covalentes y
     enlaces débiles de tipo puente de hidrógeno. Las
     maromas y cables se construyen de forma semejante a
     esta triple hélice.

 •   Hay algunas alteraciones
     del colágeno que provocan
     síndromes como el de el
     hombre de goma o el
     síndrome de Marfán que
     padecía Paganini y que
     explicaba sus dedos largos
     e hiperextensibles
                                                              39
Hélice de colágeno




                     40
Conformación-β




 • Son estructuras flexibles que no se pueden estirar.
 • Los restos laterales se ubican hacia arriba y hacia abajo del plano de las
 hojas.                                                                         41
Conformación-β

•Los aminoácidos forman una cadena en forma de zigzag.

•No existen enlaces de hidrógeno entre los aminoácidos próximos de la
cadena polipeptídica. Si que existen enlaces de hidrógeno intercatenarios, en
los que participan todos los enlaces peptídicos, dando una gran estabilidad a
la estructura.

•Las dos cadenas se pueden unir de dos formas distintas; paralela y
antiparalela. Esta última es un poco mas compacta y aparece con mayor
frecuencia en las proteínas.

•Si la cadena con conformación β se repliega sobre si misma, se pueden
establecer puentes de hidrógeno entre segmentos, antes distantes, que
ahora han quedado próximos. Esto da lugar a una lámina en zigzag muy
estable denominada β-lámina plegada. Esta estructura también se puede
formar entre dos o mas cadenas polipeptídicas diferentes.




                                                                            42
Conformación-β

                 ANTIPARALELA

                                PARALELA




                                     43
Conformación-β

•Muchas proteínas globulares presentan segmentos con conformación β
alternados con segmentos de estructura en α-hélice.
•En general, las proteínas que se quedan en la estructura secundaria, dan
lugar a proteínas filamentosas alargadas.
•Son insolubles en agua y soluciones salinas y realizan funciones
esqueléticas.
•Las más conocidas son la α-queratina del pelo, plumas, uñas, cuernos, etc,
la fibroína del hilo de seda y de las telarañas, y la elastina del tejido
conjuntivo, que forma una red deformable por la tensión.




                                                                          44
45
Conformación-β
   Características de la Hoja plegada (beta-lamina):

   •Los grupos C=O y N-H de los enlaces peptídicos de cadenas
   adyacentes (o de segmentos adyacentes de una misma cadena)
   están en el mismo plano apuntando uno hacia el otro, de tal forma
   que se hace posible el enlace de hidrogeno entre ellos.

   •Los puentes de hidrogeno son mas o menos perpendiculares al eje
   principal de la estructura en hoja plegada.

   •Todos los grupos R en cada una de las cadenas alternan, primero
   arriba del eje de la lamina, después abajo del mismo, y así
   sucesivamente.




                                                                       46
Giros β
Secuencias de la cadena polipeptídica con
estructura α o β a menudo están conectadas
entre sí por medio de los llamados giros β.
Son secuencias cortas, con una conformación
característica que impone un brusco giro de
180o a la cadena principal de un polipéptido.



                         AA como Asn, Gly y Pro (que se acomodan mal
                         en estructuras de tipo α o β) aparecen con
                         frecuencia en este tipo de estructura.

                         La conformación de los giros b está estabilizada
                         generalmente por medio de un puente de
                         hidrógeno entre los residuos 1 y 4 del giro β

                         Sirven para que la proteína adopte estructuras
                         más compactas
                                                                            47
Estructura terciaria
•   La conformación terciaria de una
    proteína globular es la conformación
    tridimensional del polipéptido plegado.

•   Las interacciones que intervienen en el
    plegamiento de la estructura
    secundaria son:
          • Interacciones hidrofóbicas entre
            restos laterales no polares.
          • Uniones de Van der Waals.
          • Puentes de Hidrógeno.
          • Interacciones salinas.
          • Puentes Disulfuro.

•   Las funciones de las proteínas
    dependen del plegamiento particular
    que adopten.

•   Esta estructura está altamente             48
    influenciada por la estructura primaria.
Estructura terciaria

•Es disposición espacial de la estructura secundaria de un polipéptido al
plegarse sobre sí misma originando una conformación globular.

•La conformación globular en las proteínas facilita su solubilidad en agua y en
disoluciones salinas. Esto les permite realizar funciones de transporte,
enzimáticas, hormonales, etc

•Las conformaciones globulares se mantienen estables por la existencia de
enlaces entre los radicales R de los aminoácidos.



                                                       Lámina β


                                                       Hélice α




                                                                              49
Residuos      Residuos
hidrofóbicos    polares


                          50
Enlaces de hidrógeno en estructura terciaria
                 H
                      CH2           HO                 CH2    Y
Aceptores
                      N     H
            HN                      HO CH            S,T
                                            R
                                                             Donadores
                                    H
                      H                 N CH2         K
                                    H
    C,M     CH2       S     H
                      R             H
                                        N       NH    R
                                    H       C
                                            NH2+
                      O     H
   E,G,N,Q        C                 H       O
                      R                 N C        N,Q
                                    H
Enlaces salinos o iónicos en estructura terciaria

      K
          CH2   NH3


      R                                       D,E
          CH2 NH NH2
                C                   OOC CH2
                    NH2
          H
              CH2
                    NH

                HN
Enlaces covalentes en estructura terciaria: disulfuro




                                                        S


                                                        S
Enlaces covalentes en estructura terciaria: amida




                              H              H N
       H N
                                                    C O
D,E                           N
                                                              K
                          C
      O C
                          O                         N H
              N H
                                             O C
       R
                                                          R
             C O
                                             H N
       H N
                                                    C O
                  R
Interacciones que
 intervienen en el
plegamiento de la
estructura terciaria

                       55
•   En los tramos rectos, la cadena polipeptídica posee estructura
    secundaria de tipo α-hélice o β-lámina

•   En los codos o giros presenta secuencias sin estructura precisa.

•   Existen combinaciones estables, compactas y de aspecto globular de α-
    hélice y conformación-β que aparecen repetidamente en proteínas
    distintas.

•   Reciben el nombre de dominios estructurales y cada dominio se pliega
    y se desnaturaliza casi independientemente de los demás.

•   Evolutivamente, se considera que los dominios estructurales han servido
    como unidades modulares para constituir diferentes tipos de proteínas
    globulares.

•   Los distintos dominios suelen estar unidos por zonas estrechas o
    «cuellos», lo que posibilita un cierto movimiento rotacional. Así, al
    separarse dos dominios, permiten la introducción de la molécula de
    sustrato y, al acercarse, la fijan para actuar sobre ella.
                                                                              56
Funciones de los Dominios:

A menudo un dominio realiza una función especifica y separada para la
proteína:
 - Enlaza a un pequeño ligando
 - “Atravesar” la membrana plasmática
 - Contiene el sitio catalítico (enzimas)
 - Enlazar al DNA (en factores de transcripción)
 - Provee una superficie para enlazarse
específicamente a otra proteína.




                                                                        57
Estructura cuaternaria

•   La estructura cuaternaria es la unión mediante
    enlaces débiles (no covalentes) de varias cadenas
    polipeptídicas con estructura terciana, idénticas o
    no, para formar un complejo proteico.
•   Cada una de estas cadenas polipeptídicas recibe
    el nombre de protómero (subunidad o monómero)
•   Según el número de protómeros que se asocian.
    las proteínas que tienen estructura cuaternaria se
    denominan:
      • Dímeros, como la hexoquinasa.
      • tetrámero como la hemoglobina.
      • Pentámeros, como la ARN-polimerasa.
      • Polímeros, cuando en su composición
         intervienen gran número de protómeros.
         (cápsida del virus de la poliomielitis, que
         consta de 60 subunidades proteicas, los
         filamentos de actina y miosina de las células
         musculares, etc).

                                                          58
Estructura cuaternaria


•   Las interacciones que estabilizan esta
    estructura son en general uniones débiles:

        •   Interacciones hidrofóbicas.
        •   Puentes de hidrógeno.
        •   Interacciones salinas.
        •   Fuerza de Van der Waals.
        •   En algunas ocasiones puede haber
            enlaces fuertes tipo puentes disulfuro,
            en el caso de las inmunoglobulinas.




                                                      59
60
El uso de subunidades menores para construir grandes estructuras
        presenta varias ventajas:


•    Reduce la cantidad de información genética necesaria.

•    El ensamblaje y la disgregación se controlan fácilmente, ya que las
     subunidades se asocian por enlaces débiles.

•    Los mecanismos de corrección pueden excluir durante el ensamblaje las
     subunidades defectuosas, con lo que disminuyen los errores en la
     síntesis de la estructura.

Se pueden distinguir dentro de las estructuras cuaternarias dos tipos:

•    Homotípicas: Las cadenas polipeptídicas son idénticas o casi idénticas.

•    Heterotípicas: Las subunidades poseen estructuras muy diferentes.



                                                                               61
En resumen, la estructura de una proteína.




 Primaria       Secundaria              Terciaria                    Cuaternaria

Combinación        Hélice                  Globular              Subunidades iguales
 ilimitada de
aminoácidos.    Hoja Plegada               Fibrosa               Subunidades distintas

                                      Puente de Hidrógeno,
 Unión           Puente de         Interacciones hidrofóbicas,   Fuerzas diversas no
Peptídica        Hidrógeno           salinas, electrostáticas.       covalentes.

Secuencia                    Conformación                            Asociación    62
PROPIEDADES DE LAS PROTEINAS

Las propiedades de las proteínas dependen sobre todo de los radicales R
libres y de que éstos sobresalgan de la molécula y, por tanto, tengan la
posibilidad de reaccionar con otras moléculas.

El conjunto de aminoácidos de una proteína cuyos radicales poseen la
capacidad de unirse a otras moléculas y de reaccionar con éstas se
denomina centro activo de la proteína.




                                                                       63
64
Solubilidad

 Las proteínas globulares poseen un elevado tamaño molecular, por lo
  que al disolverse, dan lugar a disoluciones coloidales.
 La solubilidad de estas moléculas se debe a los radicales R que, al
  ionizarse, establecen puentes de hidrógeno con las moléculas de agua.
  Así, la proteína queda recubierta de una capa de moléculas de agua
  que impide que se pueda unir a otras proteínas, lo que provocaría su
  precipitación.

 La solubilidad depende del pH,
  temperatura,          concentración
  iónica... A pesar de ser solubles, la
  mayoría      de   las   membranas
  biológicas son impermeables al
  paso de proteínas.


                       Capa de moléculas de agua

                                                                          65
Desnaturalización y renaturalización


  Consiste en la pérdida de todas las estructuras de orden superior
  (secundaria, terciaria y cuaternaria) quedando la proteína reducida
  a un polímero con estructura primaria.

  Consecuencias inmediatas son:

           - Disminución drástica de la solubilidad de la
             proteína, acompañada frecuentemente de
             precipitación

           - Pérdida de todas sus funciones biológicas

           - Alteración de sus propiedades hidrodinámicas
Agentes desnaturalizantes

     I. Físicos

             1. Calor. La mayor parte de las proteínas experimentan
     desnaturalizaciones cuando se calientan entre 50 y 60 ºC; otras se
     desnaturalizan también cuando se enfrían por debajo de los 10 a 15 ºC.

              2. Radiaciones

     II. Químicos: todos los agentes que rompen interacciones
         o enlaces presentes en la estructura nativa de la proteína:

              1. Detergentes
              2. Urea y guanidina a altas concentraciones
              3. Altas concentraciones de sal y extremos de pH
              4. Reactivos de grupos -SH
Agentes desnaturalizantes
                                   NH2
  HOCH2 CH2 SH
                                  C O       Urea
  2-mercaptoetanol
                                   NH2
       CH2 SH
  HOCH                             NH2
                                  C NH Guanidina
     HCOH
                                   NH2
       CH2 SH
Ditiotreitol (DTT)
                                                     O
                                               O S O-
                                                     O
        Dodecilsulfato sódico (SDS, laurilsulfato)
69
Especificidad

La especificidad es doble:
    • de especie
    • de función.

Especificidad de especie:

En su secuencia de aminoácidos, las proteínas presentan dos tipos de
sectores:
    • Sectores estables
    • Sectores variables: Algunos aminoácidos pueden ser sustituidos por
       otros distintos sin que se altere la funcionalidad de la molécula.

Ello ha dado lugar, durante la evolución, a una gran variabilidad de proteínas,
lo que permite que cada especie tenga sus proteínas específicas y que,
incluso, aparezcan diferencias entre individuos de la misma especie (rechazo
en trasplantes de tejidos).

Las diferencias entre proteínas homologas, es decir, con la misma función,
son grandes entre especies alejadas evolutivamente y escasas entre especies
emparentadas.
                                                                            70
Especificidad de función.


La especificidad también se refiere a la función.
•Cada proteína realiza una determinada función exclusivamente, por ejemplo,
catalizar cierta reacción química sobre cierto substrato y no sobre otro.
•La especificidad se debe a que su actuación se realiza mediante interacciones
selectivas con otras moléculas, para lo que necesitan una determinada
secuencia de aa y una conformación concreta.
•Un cambio en la secuencia o conformación puede impedir la unión y por lo tanto
dificultar la función.




                                                                           71
Capacidad amortiguadora

Las proteínas, al estar constituidas por aminoácidos, tienen un
comportamiento anfótero. Tienden a neutralizar las variaciones de pH
del medio, ya que pueden comportarse como un ácido o una base y,
por tanto, liberar o retirar protones (H+) del medio




                                                                       72
CLASIFICACIÓN DE PROTEÍNAS

Se clasifican en:
    • Holoproteínas: Formadas solamente por aminoácidos.

   •   Heteroproteínas: Formadas por una fracción proteínica y por
       un grupo no proteínico, que se denomina "grupo prostético.
       Se clasifican según la naturaleza del grupo prostético.



                                        Proteínas filamentosas
                      Holoproteínas
                                        Proteínas globulares

                                        Cromoproteínas

   PROTEÍNAS                            Glucoproteínas

                     Heteroproteínas    Lipoproteínas

                                        Nucleoproteínas

                                        Fosfoproteínas

                                                                     73
HOLOPROTEÍNAS



                  Más complejas que las fibrosas.
 Globulares:    Forman estructuras compactas, casi
                   esféricas, solubles en agua o
                     disolventes polares. Son
                responsables de la actividad celular




    •   Prolaminas: Zeína (maíza),gliadina (trigo), hordeína (cebada)
    •   Gluteninas: Glutenina (trigo), orizanina (arroz).
    •   Albúminas: Seroalbúmina (sangre), ovoalbúmina (huevo),
        lactoalbúmina (leche)
    •   Hormonas: Insulina, hormona del crecimiento, prolactina,
        tirotropina
    •   Enzimas: Hidrolasas, Oxidasas, Ligasas, Liasas, Transferasas .

                                                                         74
HOLOPROTEÍNAS

                  Más simples que las globulares.
Fibrosas:          Forman estructuras alargadas,
                 ordenadas en una sola dimensión,
                   formando haces paralelos. Son
                     responsables de funciones
                      estructurales y protectoras



    •   Colágenos: en tejidos conjuntivos, cartilaginosos
    •   Queratinas: En formaciones epidérmicas: pelos, uñas, plumas,
        cuernos.
    •   Elastinas: En tendones y vasos sanguíneos
    •   Fibroínas: En hilos de seda, (arañas, insectos)




                                                                       75
HETEROPROTEÍNAS


•   Glucoproteínas: ribonucleasa mucoproteínas, anticuerpos, hormona
    luteinizante
•   Lipoproteínas: De alta, baja y muy baja densidad, que transportan
    lípidos en la sangre.
•   Nucleoproteínas: Nucleosomas de la cromatina, ribosomas,
    histonas y protaminas de eucariotas.
•   Cromoproteínas: Pueden ser de dos tipos:
         a) Porfirínicas. Hemoglobina, mioglobina que transportan
             oxígeno, citocromos, que transportan electrones
         b) No profirínicas como la hemocianina (pigmento respiratorio
             de crustáceos y moluscos, de color azul y que contiene
             cobre)
•   Fosfoproteínas: Tienen PO4H3 en el grupo prostético. La caseína de
    la leche.




                                                                     76
FUNCIONES Y EJEMPLOS DE PROTEÍNAS:




2. Estructural
3. Enzimática
4. Hormonal
5. Defensiva
6. Transporte
7. Reserva
8. Función
   homeostática
9. Anticongelante
10. Actividad contráctil



                                             77
Estructural
Es una de las funciones más características:

    •   Algunas glucoproteínas forman parte de las membranas celulares.
        Intervienen en el transporte selectivo de iones (bomba de Na-K)
    •   Otras proteínas forman el citoesqueleto de las células, las fibras del
        huso, de los cilios y flagelos.
    •   Otras, como las histonas forman parte de los cromosomas
        eucariotas.
    •   El colágeno, que mantiene unidos los tejidos animales y forma los
        tendones y la matriz de los huesos y cartílagos.
    •   La elastina, en el tejido conjuntivo elástico (ligamentos paredes de
        vasos sanguíneos).
    •   La queratina, que se sintetiza en la epidermis y forma parte de pelos,
        uñas, escamas de reptiles, plumas, etc.
    •   La fibroína, que forma la seda y las telas de arañas. Es una
        disolución viscosa que solidifica rápidamente al contacto con el aire.




                                                                             78
Enzimática
 •   Es la función más importante.
 •   Las enzimas son las proteínas más numerosas y especializadas y
     actúan como biocatalizadores de las reacciones que constituyen
     el metabolismo celular.
 •   Se diferencian de los catalizadores no biológicos porque las
     enzimas son específicas de la reacción que catalizan y de los
     sustratos que intervienen en ellas.

Hormonal
      Insulina y glucagón
      Hormona del crecimiento segregada por la hipófisis
      Calcitonina


 Defensiva

       Inmunoglobulina, trombina y fibrinógeno
                                                                      79
Transporte

  •    Además de las proteínas transportadoras de las membranas, existen
      otras extracelulares que transportan sustancias a lugares diferentes
      del organismo.
       • Hemoglobina, la hemocianina y la mioglobina del músculo
           estriado.
       • Los citocromos transportan electrones en la cadena respiratoria
           (mitocondrias) y en la fase luminosa de la fotosíntesis
           (cloroplastos).
       • La seroalbúmina transporta ácidos grasos, fármacos y productos
           tóxicos por la sangre.
       • Las lipoproteínas transportan el colesterol y los triacilglicéridos
           por la sangre.




                                                                               80
Reserva

  En general, las proteínas no se utilizan para la obtención de
    energía. No obstante, algunas como la ovoalbúmina de la clara
    de huevo, la caseína de la leche o la gliadina de la semilla de
    trigo, son utilizadas por el embrión en desarrollo como
    nutrientes.




  Función homeostática

  Las proteínas intracelulares y del medio interno intervienen en el
     mantenimiento del equilibrio osmótico en coordinación con los
     tampones.
                                                                       81
Función contráctil
El movimiento y la locomoción en los organismos unicelulares y pluricelulares
   dependen de las proteínas contráctiles:
    • la dineína, en cilios y flagelos,
    • la actina y miosina, responsables de la contracción muscular.




Anticongelante
Presentes en el citoplasma de ciertos peces antárticos.




                                                                          82

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Proteinas

  • 1. 1
  • 2. Concepto de proteínas • La palabra proteína viene del griego protos que significa "lo más antiguo, lo primero”. • Las proteínas son biopolímeros (macromoléculas orgánicas) de elevado peso molecular; compuestos químicos muy complejos que se encuentran en todas las células vivas. • Hay ciertos elementos químicos que todas ellas poseen, pero los diversos tipos de proteínas los contienen en diferentes cantidades. • Están constituidas básicamente por carbono (C), hidrógeno (H), oxígeno (O) y nitrógeno (N); aunque pueden contener también azufre (S) y fósforo (P) y, en menor proporción, hierro (Fe), cobre (Cu), magnesio (Mg), yodo (Y). 2
  • 3. Las proteínas son las moléculas orgánicas más abundantes en las células; constituyen alrededor del 50% de su peso seco o más en algunos casos. • Una bacteria puede tener cerca de 1000 proteínas diferentes, pero en una célula humana puede haber 10.000 clases de proteínas distintas. • Químicamente, las proteínas están formadas por la unión de muchas moléculas relativamente sencillas y no hidrolizables, denominadas Aminoácidos (Aa). • Los aminoácidos se unen entre sí originando péptidos. Según su tamaño molecular, pueden ser oligopéptidos, formados por no más de 10 Aa y polipéptidos, constituidos por más de 10 Aa. • Cuando el número de Aa supera los 50 y el polipéptido tiene una estructura tridimensional específica, entonces se habla propiamente de proteínas. 3
  • 4. Clasificación de las proteínas Proteínas filamentosas Holoproteínas Proteínas globulares Cromo proteínas PROTEÍNAS Glucoproteínas Heteroproteínas Lipoproteínas Nucleoproteínas Fosfoproteínas 4
  • 5. Aminoácidos: Unidades estructurales de las Proteínas Los aminoácidos son compuestos orgánicos de bajo peso molecular. Están compuestos siempre de C, H, O y N y además pueden presentar otros elementos. Se caracterizan por poseer un grupo carboxilo (—COOH) y un grupo amino (—NH2) que se unen al mismo carbono (carbono α). Las otras dos valencias del carbono se saturan con un átomo de H y con un grupo variable denominado radical R. Este radical es el que determina las propiedades químicas y biológicas de cada aminoácido. Según éste se distinguen 20 tipos de aminoácidos. 5
  • 7. Clasificación de aminoácidos • Aminoácidos alifáticos. Son los aminoácidos en los que el radical R es una cadena hidrocarbonada abierta, que puede tener, además, grupos —COOH y —NH2. Los aminoácidos alifáticos se clasifican en neutros, ácidos y básicos. • Neutros. Si el radical R no posee grupos carboxilo ni amino. • Ácidos. Si el radical R presenta grupos carboxilo, pero no amino. • Básicos. Si el radical R tiene grupos amino, pero no grupos carboxilo • Aminoácidos aromáticos. Son aquellos cuyo radical R es una cadena cerrada, generalmente relacionada con el benceno. • Aminoácidos heterocíclicos. Aquellos cuyo radical R es una cadena cerrada, generalmente compleja y con algunos átomos distintos del carbono y del hidrógeno. 7
  • 8. 8
  • 9. Clasificación de aminoácidos Existe otra clasificación basada en función de la carga del radical R (es la que viene en el libro de texto): 1. Aminoácidos con R no polar, hidrófobo 2. Aminoácidos con R polar sin carga, hidrófilos y por tanto más solubles que los anteriores. 3. Aminoácidos ácidos. Presentan carboxilos en el radical R, que normalmente está ionizado. 4. Aminoácidos básicos. Presentan un radical R que se carga positivamente a pH neutro. De los 20 aminoácidos proteicos (hay otros 150 que no forman parte de las proteínas), hay 8 que son esenciales para la especie humana y que deben ser incorporados en la dieta. Sólo los vegetales y las bacterias pueden sintetizarlos, aunque todos los seres vivos los necesitan para fabricar sus proteínas. 9
  • 10. 10
  • 11. 11
  • 12. 12
  • 13. Aminoácidos Esenciales • Son aquellos que los organismos heterótrofos deben • EN ADULTOS: 8 tomar de su dieta ya que no – Fenilalanina pueden sintetizarlos en su – Isoleucina cuerpo (los autótrofos pueden – Leucina sintetizarlos todos) – Lisina – Metionina • Las rutas metabólicas para su – Treonina obtención suelen ser largas y – Triptófano energéticamente costosas, por – Valina lo que los vertebrados las han ido perdiendo a lo largo de la evolución (resulta menos • EN NIÑOS los anteriores y: costoso obtenerlos en los – Arginina alimentos). – Histidina
  • 14. Estructura de los aminoácidos En un aminoácido, un carbono central (ɑ ) se une a: • Un grupo amino –NH2 • Un grupo carboxilo –COOH • Un hidrógeno • Un cadena lateral R que difiere en los 20 aminoácidos existentes. H Monómero AMINOÁCIDO H2N C COOH CH3 14
  • 15. Propiedades de los aminoácidos 1. Los aminoácidos son compuestos sólidos. 2. compuestos cristalinos 3. Presentan un elevado punto de fusión. 4. Son solubles en agua. 5. Tienen actividad óptica • Presentan un comportamiento químico anfótero. Esto se debe a que a pH=7 presentan una ionización dipolar, llamada zwitterion, que permanece en equilibrio con la forma no iónica. Este estado varía con el pH. A pH alcalino, el grupo carboxilo está ionizado (-COO-) y el grupo amino no. A pH ácido, el grupo amino está ionizado (NH3+) y el grupo carboxilo no. 15
  • 16. Actividad óptica de los aminoácidos Todos los aminoácidos, salvo la glicocola o glicina, presentan el carbono α asimétrico, ya que está enlazado a cuatro radicales diferentes: un grupo amino, un grupo carboxilo. un radical R y un hidrógeno. Debido a esta característica, los aminoácidos presentan actividad óptica, es decir, son capaces de desviar el plano de luz polarizada que atraviesa una disolución de aminoácidos. Si un aminoácido desvía el plano de luz polarizada hacia la derecha, se denomina dextrógiro (+), y si lo hace hacia la izquierda, levógiro (—). 16
  • 17. Estereoisomería de los aminoácidos Debido a la presencia del carbono asimétrico, los aminoácidos pueden presentar dos configuraciones espaciales. Un aminoácido tendrá una configuración D si al disponerlo en el espacio, de forma que el grupo carboxilo quede arriba, el grupo —NH2 queda situado a la derecha, mientras que, si se encuentra a la izquierda, poseerá una configuración L. La disposición L o D es independiente de la actividad óptica. Por ello, un L- aminoácido podrá ser levógiro o dextrógiro, e igual ocurrirá con la configuración D. En la naturaleza, la forma L es la más abundante, y todas las proteínas están formadas por aminoácidos L 17
  • 18. Comportamiento químico: propiedades ácido-básicas En disolución acuosa, los aminoácidos muestran un comportamiento anfótero, es decir, pueden ionizarse, dependiendo del pH, como un ácido (los grupos -COOH liberan protones, quedando como -COO- ), como una base (los grupos -NH2 captan protones, quedando como -NH3+) o como un ácido y una base a la vez. En el último caso los aminoácidos se ionizan doblemente, apareciendo una forma dipolar iónica llamada zwitterion. 18
  • 19. La forma dipolar, en un medio ácido, capta protones y se comporta como una base y en un medio básico libera protones y se comporta como un ácido. El pH en el cual el aminoácido tiende a adoptar una forma dipolar neutra, con tantas cargas positivas como negativas, se denomina punto isoeléctrico. El carácter anfótero de los aminoácidos permite la regulación del pH, ya que se comporta como un ácido o como una base según le convenga al organismo. 19
  • 20. El punto isoeléctrico es el valor de pH al que el aminoácido presenta una carga neta igual al cero 20
  • 21. Unión de los aminoácidos. Los enlaces químicos entre aminoácidos se denominan enlaces peptídicos y a las cadenas formadas, péptidos. Si el número de aminoácidos que forma un péptido es dos, se denomina dipéptido, si es tres, tripéptido. etc. Si es inferior a 50 (10 según que textos) se habla de oligopéptido, y si es superior a 50 se denomina polipéptido. Sólo cuando un polipéptido se halla constituido por más de cincuenta moléculas de aminoácidos o si el valor de su peso molecular excede de 5 000 se habla de proteína. 21
  • 22. Unión Peptídica entre Aminoácidos Unión Peptídica H H O H O H O = = N C = N N CC C C H OH H OH H R R + H2O CONDENSACIÓN Los aminoácidos se unen entre sí mediante uniones peptídicas para formar cadenas lineales no ramificadas. 22
  • 23. 23
  • 24. Enlace peptídico • En un enlace peptídico, los átomos del grupo carboxilo y del grupo amino se sitúan en un mismo plano, con distancias y ángulos fijos. • Los grupos de aminoácidos unidos por este enlace se denominan residuos para resaltar la pérdida de una molécula de agua en cada enlace. • El amino libre de un extremo y el carboxilo libre del otro extremo de la cadena reciben el nombre de N-terminal y C-terminal respectivamente. Por convenio, los aminoácidos se numeran desde el N-terminal. 24
  • 25. Enlace peptídico 1. El enlace peptídico tiene un comportamiento similar al de un enlace doble, es decir, presenta una cierta rigidez que inmoviliza en un plano los átomos que lo forman. 3. Además es un enlace más corto que otros enlaces C-N. Esto le impide girar libremente, los únicos enlaces que pueden girar son los Cα-C y los Cα-N que no corresponden al enlace peptídico. 25
  • 26. 26
  • 27. Péptidos y oligopéptidos de interés biológico Existen algunos péptidos cortos con función biológica. Entre ellos podemos citar: •El tripéptido glutatión (que actúa como transportador de hidrógeno en algunas reacciones metabólicas). •Los nanopéptidos oxitocina y vasopresina (con actividad hormonal), la insulina y el glucagón que regulan la concentración de glucosa en sangre. •Los decapéptidos tirocidina, gramicidina y valinomicina (antibióticos). 27
  • 28. Estructura de una Proteína? 28
  • 29. Estructura de las proteínas La organización de una proteína viene definida por cuatro niveles estructurales ( o cuatro niveles de organización) denominados: 1. ESTRUCTURA PRIMARIA 2. ESTRUCTURA SECUNDARIA 3. ESTRUCTURA TERCIARIA 4. ESTRUCTURA CUATERNARIA Cada una de estas estructuras informa de la disposición de la anterior en el espacio. 29
  • 30. Estructura primaria La estructura primaria es la secuencia de aminoácidos de la proteína. Nos indica qué aminoácidos componen la cadena polipeptídica y el orden en que dichos aminoácidos se encuentran. La secuencia de una proteína se escribe enumerando los aminoácidos desde el extremo N-terminal hasta el C-terminal. 30
  • 31. Estructura primaria La función de una proteína depende de su secuencia de aminoácidos y de la forma que ésta adopte. El cambio de un solo aa de la secuencia de la proteína puede tener efectos muy importantes, como el cambio de un solo aa en la hemoglobina humana que provoca la anemia falciforme. 31
  • 32. Estructura primaria 32 Serina Glicina Tirosina Alanina Leucina
  • 34. Estructura secundaria La estructura secundaria es la disposición de la secuencia de aminoácidos o estructura primaria en el espacio. Los aminoácidos, a medida que van siendo enlazados durante la síntesis de las proteínas, y gracias a la capacidad de giro de sus enlaces, adquieren una disposición espacial estable, la estructura secundaria. Son conocidos tres tipos de estructura secundaria: la α-hélice, la hélice de colágeno y la conformación β o lámina plegada β. La estructura secundaria de la cadena polipeptídica depende de los aminoácidos que la forman. 34
  • 35. Estructura secundaria • Las interacciones no covalentes entre los restos laterales de los aminoácidos dan origen a la estructura secundaria. • Esta conformación viene dada por puentes de hidrógeno intercatenarios. • La estructura secundaria puede ser: – Conformación ɑ (Hélice) – Conformación β (Hoja plegada) • Si bien las conformaciones anteriores son las más usuales, existen otras menos frecuentes. Conformación β • Existen sectores de los polipéptidos cuya estructura no está bien Conformación ɑ definida: los enroscamientos aleatorios o “ad-random”. 35
  • 36. α-hélice • Estructura en forma de bastón. • Los restos laterales de los aminoácidos se ubican de forma perpendicular al eje de la hélice. • Los enlaces puente de hidrógeno se establecen entre el hidrógeno unido al nitrógeno y el oxígeno del primitivp carboxilo. 36
  • 37. α-hélice  La estructura secundaria en α-hélice se forma al enrollarse helicoidalmente sobre sí misma la estructura primaria.  Esto se debe a la formación espontánea de enlaces de hidrógeno entre el —CO— de un aminoácido y el —NH— del cuarto aminoácido que le sigue.  En la α-hélice, los oxígenos de todos los grupos —CO— quedan orientados en el mismo sentido, y los hidrógenos de todos los grupos — NH— quedan orientados justo en el sentido contrario.  La α-hélice presenta 3,6 aminoácidos por vuelta y la rotación es hacia la derecha. 37
  • 38. Hélice de colágeno • El colágeno posee una disposición en hélice especial, mas alargada que la α-hélice, debido a la abundancia de prolina e hidroxiprolina. • Estos aa poseen una estructura que dificulta la formación de enlaces de hidrógeno, por lo que se forma una hélice más extendida, con sólo tres aminoácidos por vuelta. 38
  • 39. Hélice de colágeno • Su estabilidad viene dada por la asociación de tres hélices empaquetadas, para formar la triple hélice o superhélice que es la responsable de la gran fuerza de tensión del colágeno. • Las tres hélices se unen mediante enlaces covalentes y enlaces débiles de tipo puente de hidrógeno. Las maromas y cables se construyen de forma semejante a esta triple hélice. • Hay algunas alteraciones del colágeno que provocan síndromes como el de el hombre de goma o el síndrome de Marfán que padecía Paganini y que explicaba sus dedos largos e hiperextensibles 39
  • 41. Conformación-β • Son estructuras flexibles que no se pueden estirar. • Los restos laterales se ubican hacia arriba y hacia abajo del plano de las hojas. 41
  • 42. Conformación-β •Los aminoácidos forman una cadena en forma de zigzag. •No existen enlaces de hidrógeno entre los aminoácidos próximos de la cadena polipeptídica. Si que existen enlaces de hidrógeno intercatenarios, en los que participan todos los enlaces peptídicos, dando una gran estabilidad a la estructura. •Las dos cadenas se pueden unir de dos formas distintas; paralela y antiparalela. Esta última es un poco mas compacta y aparece con mayor frecuencia en las proteínas. •Si la cadena con conformación β se repliega sobre si misma, se pueden establecer puentes de hidrógeno entre segmentos, antes distantes, que ahora han quedado próximos. Esto da lugar a una lámina en zigzag muy estable denominada β-lámina plegada. Esta estructura también se puede formar entre dos o mas cadenas polipeptídicas diferentes. 42
  • 43. Conformación-β ANTIPARALELA PARALELA 43
  • 44. Conformación-β •Muchas proteínas globulares presentan segmentos con conformación β alternados con segmentos de estructura en α-hélice. •En general, las proteínas que se quedan en la estructura secundaria, dan lugar a proteínas filamentosas alargadas. •Son insolubles en agua y soluciones salinas y realizan funciones esqueléticas. •Las más conocidas son la α-queratina del pelo, plumas, uñas, cuernos, etc, la fibroína del hilo de seda y de las telarañas, y la elastina del tejido conjuntivo, que forma una red deformable por la tensión. 44
  • 45. 45
  • 46. Conformación-β Características de la Hoja plegada (beta-lamina): •Los grupos C=O y N-H de los enlaces peptídicos de cadenas adyacentes (o de segmentos adyacentes de una misma cadena) están en el mismo plano apuntando uno hacia el otro, de tal forma que se hace posible el enlace de hidrogeno entre ellos. •Los puentes de hidrogeno son mas o menos perpendiculares al eje principal de la estructura en hoja plegada. •Todos los grupos R en cada una de las cadenas alternan, primero arriba del eje de la lamina, después abajo del mismo, y así sucesivamente. 46
  • 47. Giros β Secuencias de la cadena polipeptídica con estructura α o β a menudo están conectadas entre sí por medio de los llamados giros β. Son secuencias cortas, con una conformación característica que impone un brusco giro de 180o a la cadena principal de un polipéptido. AA como Asn, Gly y Pro (que se acomodan mal en estructuras de tipo α o β) aparecen con frecuencia en este tipo de estructura. La conformación de los giros b está estabilizada generalmente por medio de un puente de hidrógeno entre los residuos 1 y 4 del giro β Sirven para que la proteína adopte estructuras más compactas 47
  • 48. Estructura terciaria • La conformación terciaria de una proteína globular es la conformación tridimensional del polipéptido plegado. • Las interacciones que intervienen en el plegamiento de la estructura secundaria son: • Interacciones hidrofóbicas entre restos laterales no polares. • Uniones de Van der Waals. • Puentes de Hidrógeno. • Interacciones salinas. • Puentes Disulfuro. • Las funciones de las proteínas dependen del plegamiento particular que adopten. • Esta estructura está altamente 48 influenciada por la estructura primaria.
  • 49. Estructura terciaria •Es disposición espacial de la estructura secundaria de un polipéptido al plegarse sobre sí misma originando una conformación globular. •La conformación globular en las proteínas facilita su solubilidad en agua y en disoluciones salinas. Esto les permite realizar funciones de transporte, enzimáticas, hormonales, etc •Las conformaciones globulares se mantienen estables por la existencia de enlaces entre los radicales R de los aminoácidos. Lámina β Hélice α 49
  • 50. Residuos Residuos hidrofóbicos polares 50
  • 51. Enlaces de hidrógeno en estructura terciaria H CH2 HO CH2 Y Aceptores N H HN HO CH S,T R Donadores H H N CH2 K H C,M CH2 S H R H N NH R H C NH2+ O H E,G,N,Q C H O R N C N,Q H
  • 52. Enlaces salinos o iónicos en estructura terciaria K CH2 NH3 R D,E CH2 NH NH2 C OOC CH2 NH2 H CH2 NH HN
  • 53. Enlaces covalentes en estructura terciaria: disulfuro S S
  • 54. Enlaces covalentes en estructura terciaria: amida H H N H N C O D,E N K C O C O N H N H O C R R C O H N H N C O R
  • 55. Interacciones que intervienen en el plegamiento de la estructura terciaria 55
  • 56. En los tramos rectos, la cadena polipeptídica posee estructura secundaria de tipo α-hélice o β-lámina • En los codos o giros presenta secuencias sin estructura precisa. • Existen combinaciones estables, compactas y de aspecto globular de α- hélice y conformación-β que aparecen repetidamente en proteínas distintas. • Reciben el nombre de dominios estructurales y cada dominio se pliega y se desnaturaliza casi independientemente de los demás. • Evolutivamente, se considera que los dominios estructurales han servido como unidades modulares para constituir diferentes tipos de proteínas globulares. • Los distintos dominios suelen estar unidos por zonas estrechas o «cuellos», lo que posibilita un cierto movimiento rotacional. Así, al separarse dos dominios, permiten la introducción de la molécula de sustrato y, al acercarse, la fijan para actuar sobre ella. 56
  • 57. Funciones de los Dominios: A menudo un dominio realiza una función especifica y separada para la proteína: - Enlaza a un pequeño ligando - “Atravesar” la membrana plasmática - Contiene el sitio catalítico (enzimas) - Enlazar al DNA (en factores de transcripción) - Provee una superficie para enlazarse específicamente a otra proteína. 57
  • 58. Estructura cuaternaria • La estructura cuaternaria es la unión mediante enlaces débiles (no covalentes) de varias cadenas polipeptídicas con estructura terciana, idénticas o no, para formar un complejo proteico. • Cada una de estas cadenas polipeptídicas recibe el nombre de protómero (subunidad o monómero) • Según el número de protómeros que se asocian. las proteínas que tienen estructura cuaternaria se denominan: • Dímeros, como la hexoquinasa. • tetrámero como la hemoglobina. • Pentámeros, como la ARN-polimerasa. • Polímeros, cuando en su composición intervienen gran número de protómeros. (cápsida del virus de la poliomielitis, que consta de 60 subunidades proteicas, los filamentos de actina y miosina de las células musculares, etc). 58
  • 59. Estructura cuaternaria • Las interacciones que estabilizan esta estructura son en general uniones débiles: • Interacciones hidrofóbicas. • Puentes de hidrógeno. • Interacciones salinas. • Fuerza de Van der Waals. • En algunas ocasiones puede haber enlaces fuertes tipo puentes disulfuro, en el caso de las inmunoglobulinas. 59
  • 60. 60
  • 61. El uso de subunidades menores para construir grandes estructuras presenta varias ventajas: • Reduce la cantidad de información genética necesaria. • El ensamblaje y la disgregación se controlan fácilmente, ya que las subunidades se asocian por enlaces débiles. • Los mecanismos de corrección pueden excluir durante el ensamblaje las subunidades defectuosas, con lo que disminuyen los errores en la síntesis de la estructura. Se pueden distinguir dentro de las estructuras cuaternarias dos tipos: • Homotípicas: Las cadenas polipeptídicas son idénticas o casi idénticas. • Heterotípicas: Las subunidades poseen estructuras muy diferentes. 61
  • 62. En resumen, la estructura de una proteína. Primaria Secundaria Terciaria Cuaternaria Combinación Hélice Globular Subunidades iguales ilimitada de aminoácidos. Hoja Plegada Fibrosa Subunidades distintas Puente de Hidrógeno, Unión Puente de Interacciones hidrofóbicas, Fuerzas diversas no Peptídica Hidrógeno salinas, electrostáticas. covalentes. Secuencia Conformación Asociación 62
  • 63. PROPIEDADES DE LAS PROTEINAS Las propiedades de las proteínas dependen sobre todo de los radicales R libres y de que éstos sobresalgan de la molécula y, por tanto, tengan la posibilidad de reaccionar con otras moléculas. El conjunto de aminoácidos de una proteína cuyos radicales poseen la capacidad de unirse a otras moléculas y de reaccionar con éstas se denomina centro activo de la proteína. 63
  • 64. 64
  • 65. Solubilidad  Las proteínas globulares poseen un elevado tamaño molecular, por lo que al disolverse, dan lugar a disoluciones coloidales.  La solubilidad de estas moléculas se debe a los radicales R que, al ionizarse, establecen puentes de hidrógeno con las moléculas de agua. Así, la proteína queda recubierta de una capa de moléculas de agua que impide que se pueda unir a otras proteínas, lo que provocaría su precipitación.  La solubilidad depende del pH, temperatura, concentración iónica... A pesar de ser solubles, la mayoría de las membranas biológicas son impermeables al paso de proteínas. Capa de moléculas de agua 65
  • 66. Desnaturalización y renaturalización Consiste en la pérdida de todas las estructuras de orden superior (secundaria, terciaria y cuaternaria) quedando la proteína reducida a un polímero con estructura primaria. Consecuencias inmediatas son: - Disminución drástica de la solubilidad de la proteína, acompañada frecuentemente de precipitación - Pérdida de todas sus funciones biológicas - Alteración de sus propiedades hidrodinámicas
  • 67. Agentes desnaturalizantes I. Físicos 1. Calor. La mayor parte de las proteínas experimentan desnaturalizaciones cuando se calientan entre 50 y 60 ºC; otras se desnaturalizan también cuando se enfrían por debajo de los 10 a 15 ºC. 2. Radiaciones II. Químicos: todos los agentes que rompen interacciones o enlaces presentes en la estructura nativa de la proteína: 1. Detergentes 2. Urea y guanidina a altas concentraciones 3. Altas concentraciones de sal y extremos de pH 4. Reactivos de grupos -SH
  • 68. Agentes desnaturalizantes NH2 HOCH2 CH2 SH C O Urea 2-mercaptoetanol NH2 CH2 SH HOCH NH2 C NH Guanidina HCOH NH2 CH2 SH Ditiotreitol (DTT) O O S O- O Dodecilsulfato sódico (SDS, laurilsulfato)
  • 69. 69
  • 70. Especificidad La especificidad es doble: • de especie • de función. Especificidad de especie: En su secuencia de aminoácidos, las proteínas presentan dos tipos de sectores: • Sectores estables • Sectores variables: Algunos aminoácidos pueden ser sustituidos por otros distintos sin que se altere la funcionalidad de la molécula. Ello ha dado lugar, durante la evolución, a una gran variabilidad de proteínas, lo que permite que cada especie tenga sus proteínas específicas y que, incluso, aparezcan diferencias entre individuos de la misma especie (rechazo en trasplantes de tejidos). Las diferencias entre proteínas homologas, es decir, con la misma función, son grandes entre especies alejadas evolutivamente y escasas entre especies emparentadas. 70
  • 71. Especificidad de función. La especificidad también se refiere a la función. •Cada proteína realiza una determinada función exclusivamente, por ejemplo, catalizar cierta reacción química sobre cierto substrato y no sobre otro. •La especificidad se debe a que su actuación se realiza mediante interacciones selectivas con otras moléculas, para lo que necesitan una determinada secuencia de aa y una conformación concreta. •Un cambio en la secuencia o conformación puede impedir la unión y por lo tanto dificultar la función. 71
  • 72. Capacidad amortiguadora Las proteínas, al estar constituidas por aminoácidos, tienen un comportamiento anfótero. Tienden a neutralizar las variaciones de pH del medio, ya que pueden comportarse como un ácido o una base y, por tanto, liberar o retirar protones (H+) del medio 72
  • 73. CLASIFICACIÓN DE PROTEÍNAS Se clasifican en: • Holoproteínas: Formadas solamente por aminoácidos. • Heteroproteínas: Formadas por una fracción proteínica y por un grupo no proteínico, que se denomina "grupo prostético. Se clasifican según la naturaleza del grupo prostético. Proteínas filamentosas Holoproteínas Proteínas globulares Cromoproteínas PROTEÍNAS Glucoproteínas Heteroproteínas Lipoproteínas Nucleoproteínas Fosfoproteínas 73
  • 74. HOLOPROTEÍNAS Más complejas que las fibrosas. Globulares: Forman estructuras compactas, casi esféricas, solubles en agua o disolventes polares. Son responsables de la actividad celular • Prolaminas: Zeína (maíza),gliadina (trigo), hordeína (cebada) • Gluteninas: Glutenina (trigo), orizanina (arroz). • Albúminas: Seroalbúmina (sangre), ovoalbúmina (huevo), lactoalbúmina (leche) • Hormonas: Insulina, hormona del crecimiento, prolactina, tirotropina • Enzimas: Hidrolasas, Oxidasas, Ligasas, Liasas, Transferasas . 74
  • 75. HOLOPROTEÍNAS Más simples que las globulares. Fibrosas: Forman estructuras alargadas, ordenadas en una sola dimensión, formando haces paralelos. Son responsables de funciones estructurales y protectoras • Colágenos: en tejidos conjuntivos, cartilaginosos • Queratinas: En formaciones epidérmicas: pelos, uñas, plumas, cuernos. • Elastinas: En tendones y vasos sanguíneos • Fibroínas: En hilos de seda, (arañas, insectos) 75
  • 76. HETEROPROTEÍNAS • Glucoproteínas: ribonucleasa mucoproteínas, anticuerpos, hormona luteinizante • Lipoproteínas: De alta, baja y muy baja densidad, que transportan lípidos en la sangre. • Nucleoproteínas: Nucleosomas de la cromatina, ribosomas, histonas y protaminas de eucariotas. • Cromoproteínas: Pueden ser de dos tipos: a) Porfirínicas. Hemoglobina, mioglobina que transportan oxígeno, citocromos, que transportan electrones b) No profirínicas como la hemocianina (pigmento respiratorio de crustáceos y moluscos, de color azul y que contiene cobre) • Fosfoproteínas: Tienen PO4H3 en el grupo prostético. La caseína de la leche. 76
  • 77. FUNCIONES Y EJEMPLOS DE PROTEÍNAS: 2. Estructural 3. Enzimática 4. Hormonal 5. Defensiva 6. Transporte 7. Reserva 8. Función homeostática 9. Anticongelante 10. Actividad contráctil 77
  • 78. Estructural Es una de las funciones más características: • Algunas glucoproteínas forman parte de las membranas celulares. Intervienen en el transporte selectivo de iones (bomba de Na-K) • Otras proteínas forman el citoesqueleto de las células, las fibras del huso, de los cilios y flagelos. • Otras, como las histonas forman parte de los cromosomas eucariotas. • El colágeno, que mantiene unidos los tejidos animales y forma los tendones y la matriz de los huesos y cartílagos. • La elastina, en el tejido conjuntivo elástico (ligamentos paredes de vasos sanguíneos). • La queratina, que se sintetiza en la epidermis y forma parte de pelos, uñas, escamas de reptiles, plumas, etc. • La fibroína, que forma la seda y las telas de arañas. Es una disolución viscosa que solidifica rápidamente al contacto con el aire. 78
  • 79. Enzimática • Es la función más importante. • Las enzimas son las proteínas más numerosas y especializadas y actúan como biocatalizadores de las reacciones que constituyen el metabolismo celular. • Se diferencian de los catalizadores no biológicos porque las enzimas son específicas de la reacción que catalizan y de los sustratos que intervienen en ellas. Hormonal Insulina y glucagón Hormona del crecimiento segregada por la hipófisis Calcitonina Defensiva Inmunoglobulina, trombina y fibrinógeno 79
  • 80. Transporte • Además de las proteínas transportadoras de las membranas, existen otras extracelulares que transportan sustancias a lugares diferentes del organismo. • Hemoglobina, la hemocianina y la mioglobina del músculo estriado. • Los citocromos transportan electrones en la cadena respiratoria (mitocondrias) y en la fase luminosa de la fotosíntesis (cloroplastos). • La seroalbúmina transporta ácidos grasos, fármacos y productos tóxicos por la sangre. • Las lipoproteínas transportan el colesterol y los triacilglicéridos por la sangre. 80
  • 81. Reserva En general, las proteínas no se utilizan para la obtención de energía. No obstante, algunas como la ovoalbúmina de la clara de huevo, la caseína de la leche o la gliadina de la semilla de trigo, son utilizadas por el embrión en desarrollo como nutrientes. Función homeostática Las proteínas intracelulares y del medio interno intervienen en el mantenimiento del equilibrio osmótico en coordinación con los tampones. 81
  • 82. Función contráctil El movimiento y la locomoción en los organismos unicelulares y pluricelulares dependen de las proteínas contráctiles: • la dineína, en cilios y flagelos, • la actina y miosina, responsables de la contracción muscular. Anticongelante Presentes en el citoplasma de ciertos peces antárticos. 82