La Auditoría Superior de la Federación ha informado que desde el 2000, Oceanografía incumplía los contratos que le fueron asignados a través de la Coordinación de Servicios Marinos de Petróleos Mexicanos. Además de los 82 contratos otorgados entre 2000 y 2014, se autorizaron 7 convenios de modificación para extender los plazos de entrega, incluyendo uno para construir un gasoducto entre Ixtal y Abkatun cuyo plazo se alargó en 2009 con un pago adicional de 327.4 millones de pesos.