VNTR

1. Número variable de Repeticiones en TandemYeny Posada
FCEN - UdeA

4. Los loci más variables descubiertos en el
genoma humano son los Minisatélites que son
sistemas de marcadores altamente polimórficos,
constituidos por secuencias cortas de DNA de 7
a 100 pb, que se repiten desde dos hasta cientos
de veces, organizadas una a continuación de
otra, por lo cual también se conocen como
número variable de secuencias que se repiten o
VNTR. Su polimorfismo esta dado por el número
de repeticiones.

6. CLASIFICACION DEL ADN EN TANDEM
a. SATELITES: Familia de secuencia simple repetida
puede constituir un gran porcentaje del Genoma
Humano, (5 Mb), están asociados a los centrómeros.
b. MINISATÉLITES: Cientos a miles en diferentes loci
por genoma, longitud de la secuencia de la unidad
repetida (mayor de 7pb) es locus específica, en
bloques repetidos de tamaño intermedio (0,5 a 30 Kb)
c. MICROSATÉLITES: abundantes en el GH, los
repetidos de secuencias cortas (2-6 pb) se disponen
en arreglos cortos (20-100 pb) en cada locus.

8. Dos grandes grupos:
-Con las que se detectan un gran número de loci
hipervariables simultáneamente, denominadas
Sondas multilocus (MLPs), los resultados en las
autorradiografías son patrones de bandas muy
parecidos a los códigos de barra que se utilizan en
los supermercados.
-Sondas con las que se detectan solo una región
en el GH, se denominan Sondas de locus simple
(SLPs), la ventaja frente a las MLPs, es que las
SLPs son más sensibles y se necesita una
cantidad muy pequeña de ADN.

10. Los análisis MLP son realizados simple y
específicamente como una comparación frente
a frente entre las muestras analizadas. En este
caso, con una inspección visual se revela si
existe la presencia de perfiles que coincidan.
Hay una clara similitud entre las secuencias de
los repetidos en tandem de muchos
minisatélites humanos, lo cual define la
secuencia "CENTRAL" del minisatélite.

11. El papel de la secuencia central sugiere que
las sondas que hibridan el DNA incluyen los
repetidos en tandem de la secuencia central y
detecta los múltiples fragmentos variables de
DNA por hibridación Southern Blot, para
producir una huella digital de DNA individuo
específica, las sondas más utilizadas son las
desarrolladas por Jeffreys y llamadas 33.6 y
33.15, que varían en la longitud y precisión de
la secuencia del repetido central.
Todas las bandas deben coincidir en ambas
posiciones e intensidades en cada perfil para
los dos DNA examinados. El ADN degradado
genera mucho background en el perfil.

12. Relaciones Biológicas
En casos forenses, los dos perfiles deben coincidir
totalmente, en el establecimiento de las relaciones
biológicas (por ej., paternidad), se establece si el padre
alegado contribuye con todas las bandas paternas al
perfil del hijo.
Se ha observado que las tasas de mutaciones en estos
marcadores no es significante, utilizando las sondas
33.6 y 33.15 , de los individuos estudiados, el 27% de
la descendencia muestra mutación en una banda, el
1.2% muestra mutaciones en dos bandas y menos 0.3%
muestra tres bandas sin asignar.

14. La mayoría de minisatélites
unilocus muestran sustituciones de
uno o más pb en sus secuencias
repetidas y se les designa MVRs
(SLPs), se estudian por PCR y
técnicas de secuenciamiento
manual y automatizado.
En este tipo de análisis, se estudian
por perfil un máximo de 8 bandas,
para cada prueba se incluye una
escalera alélica y se compara cada
banda de acuerdo al alineamiento
con respecto al patrón.

15. Los SLPs tienen una baja discriminación entre
familiares muy cercanos. Con una sola sonda sólo
hay un 75% de oportunidad de distinguir entre dos
hermanos, con 4 sondas de locus simple se obtiene
una discriminación del 99,6%. Por lo tanto se prefiere
el término “DNA profiling” (perfil de ADN), más que
DNA fingerprinting para describir los análisis con
sondas de locus simple.

16. USOS EN FORENSE
1. FILIACION
2. IDENTIFICACIÓN DE AGRESORES EN
ASALTOS SEXUALES
3. IDENTIFICACIÓN DE ASALTANTES EN
CRÍMENES VIOLENTOS
4. EN INVESTIGACIÓN EN ACCIDENTES
MASIVOS

18. VENTAJAS
-Uso de sondas multiloci dan una gran cantidad de
información con un solo corrido en un gel.
-Muchas sondas sirven para múltiples especies, por lo
tanto (cuando se hacen análisis por especie)
DESVENTAJAS
-La interpretación de resultados requiere un gran
entrenamiento porque puede causar confusiones
-La cantidad y calidad del ADN que se utiliza es alta para
obtener unos óptimos resultados.
-Técnicas son muy dispendiosas y complejos los análisis
de los patrones de bandas que sólo detectan fenotipos y
no genotipos.