Este documento trata sobre las competencias digitales para la búsqueda de información bibliográfica en el contexto de la información científica. Explica qué son las competencias digitales y cómo han cambiado los recursos bibliográficos con la transición a lo digital. Luego, detalla los pasos para realizar una búsqueda bibliográfica efectiva, incluyendo cómo formular preguntas, construir estrategias de búsqueda, filtrar literatura y dónde buscar la mejor evidencia, con un enfoque en el uso de PubMed.
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Guías clínicas sobre inducción al parto
1. COMPETENCIAS DIGITALES:
LA BUSQUEDA DE
INFORMACIÓN
BIBLIOGRAFICA EN EL
CONTEXTO DE LA
INFORMACIÓN CIENTIFICA
Antonia María Fernández Luque
14- 20 NOVIEMBRE
2018
2. ¿Que son las competencias
Digitales?
• Son un conjunto de conocimientos,
capacidades, destrezas y habilidades, en
conjunción con valores y actitudes, para la
utilización estratégica de la información, y
para alcanzar objetivos de conocimiento
tácito y explícito, en contextos y con
herramientas propias de las tecnologías
digitales.
9. Competerncia 1. Informacion
¿para qué y porqué documentarse?
Para resolver cualquier problema informativo que se plantee en el curso de cualquier actividad
profesional, necesitamos conocer las fuentes y recursos existentes y unas
nociones de cómo valorar la información que
encontramos.
12. ¿Cómo podemos ayudarte
desde la biblioteca?
*Conocemos las Fuentes de Información específicas
de las distintas áreas de conocimiento.
*Ponemos a disposición de nuestros Usuarios
(matronas) la información disponible para ser utilizada.
*Gestión de los Derechos de Acceso (Los
bibliotecarios médicos respaldan los derechos de autor
y ayudan a mantener la propiedad intelectual de los
autores).
*Los bibliotecarios médicos identifican y crean rutas a
los repositorios de datos que refuerzan la investigación
en informática genómica y biomédica.
*Ayudan a los autores a publicar.
*Conservan los materiales.
13. ¿Para qué necesitas
documentarte?
Investigadores
•Conocer el estado de la cuestión de un
tema.
• Conocer la importancia y relevancia
del problema dentro de la comunidad
científica.
•Conocer los posibles enfoques de la
investigacion.
•Identificar y afrontar nuevos problemas.
Profesionales
*Formación continuada en nuestro
tema.
*Promoción laboral.
*Obtener información para el
desarrollo de un proyecto
14. Objetivos de la Búsqueda
Bibliográfica
Lograr la mayor PRECISIÓN es decir, la más exacta
adecuación entre lo recuperado y los intereses del
usuario.
Lograr mayor EXAHUSTIVIDAD, es decir, lograr un
barrido completo de los registros pertinentes.
15. BUSCAR INFORMACION EN EL CONTEXTO
LABORAL: LA BIBLIOTECA DEL SSPA.
1.- ¿Donde está la BVSSPA?
2.- ¿Cómo puedo acceder a la BVSSPA?
3.- ¿Qué hago para encontrar lo que busco en la
biblioteca?
4.- ¿Qué revistas y libros hay en la BV-SSPA de
MATRONAS?
5.-¿Cómo puedo pedir los artículos de revistas que
no están en la BV-SSPA?
6.-¿Dónde encontrar las mejores evidencias para la
práctica profesional? PubMed
7.- Gestionar tu Biblioteca Personal y tu identidad
Digital.
16. Pregunta 1 ¿DÓNDE ESTÁ LA BV-
SSPA?
La biblioteca para la ciudadanía (abierto)
http://www.bvsspa.es/
La biblioteca para los profesionales (usuarios federados)
http://www.bvsspa.es/profesionales/
17. Pregunta 2. ¿Cómo accedo a la
BVSSPA?
• Desde los ordenadores conectados a la
intranet corporativa (Dentro del Área
Donde trabajamos)
• Desde cualquier dispositivo conectado a
Internet. Smarphone, Tablet, Portatil, etc.
mediante claves corporativas.
• Sitio web: http://www.bvsspa.es
22. Pregunta 3 ¿Qué hago para
buscar en la BV-SSPA?
• El Portal de la Biblioteca
• El Metabuscador Gerión
• A-Z de las revistas y libros
• Las Áreas Temáticas
• Las Fuentes Nativas
32. Servicios digitales de las
revistas en Las plataformas.
• Las RSS permite llevarte los últimos
números a tu sitio web.
• Las alertas las llevas a tu correo
electronico con la periodicidad que tu
decidas.
• Llevarte las actualizaciones a un
agregador de contenidos( Ej. Netvibes,
Google sites, etc.)
38. La búsqueda bibliográfica
• Formulación de la Pregunta
Fases
A) Buscar información pertinente, relevante y
veraz.
B) Gestionar la información seleccionada.
C) Analizar resultados de investigación.
41. Para encontrar información relevante, rigurosa
y actualizada
1.- ¿Cómo hacer la pregunta?
2.- ¿Cómo construir la estrategia
de búsqueda?
3.- ¿Cómo filtrar la literatura?
4.- ¿Dónde buscar?
42. 1.- ¿Cómo formular la pregunta?
Formulario estructurado
• Paciente/población: edad, género.
• Tipo de intervención: Tratamiento,
diagnóstico, etiología, pronóstico.
• Resultados: Positivos, negativos,
comparación.
• Tipos de artículos: revisiones,
metaanálisis, ECC, etc.
• Idioma/Año de publicación, tipos de
revistas
• Términos MeSH
43. Pregunta estructurada PICO
P - Paciente/Población/Problema
I - Intervención
C - Comparación (No siempre)
O - Resultados (Outcomes)
44. Pregunta estructurada
P - Paciente/Población/problema
*Embarazadas con diabetes gestacional
I - Tratamiento con insulina ?
C - Comparación (no siempre)
O - Resultados
48. ¿Cómo se busca información
científica en ciencias de la Salud?
• Acceso a la Bibliografía
Nacional/ Internacional.
– Selección basados en criterios de calidad y
pertinencia. (libros, revistas, BBDD)
– Reunir los recursos y los servicios
(Usabilidad)
• Formación y Entrenamiento en las
estrategias de recuperación y gestión
documental.
52. Qué es
PubMed
Qué es
PubMed
HistoriaHistoria AccesoAcceso BúsquedaBúsqueda
Visualización
de resultados
Visualización
de resultados
Manejo de
resultados
Manejo de
resultados
Uso de
PubMed
Uso de
PubMed
Búsqueda
básica
Búsqueda
básica
Búsqueda
avanzada
Búsqueda
avanzada
Descriptores
MESH
Descriptores
MESH
Pantalla B.
Avanzada
Pantalla B.
Avanzada
Etiquetas y
booleanos
Etiquetas y
booleanos
53. Historia
1865 Dr. Billing cirujano de la oficina
general del ejército de EE.UU es
responsable de una pequeña biblioteca
de 1800 ejemplares.
Crea y publica un catálogo de la
Biblioteca (Index Catalogue) y un índice
periódico de la literatura biomédica de su
época (INDEX MEDICUS) 1879.
55. MEDLINE
5600 revistas en 39 idiomas.
Tema: Ciencias de la salud:
Biomedicina; disciplinas clínicas y
preclínicas, Salud
pública,Medicina, Enfermería,
Odontologia…
19 millones de referencias desde
1946 hasta hoy.
Los artículos indizados con el
tesauro MeSH
56. Diferencias Medline/PubMed
PubMed 22 millones de Registros
MEDLINE 19 Millones de Registros
PubMed Incluye además:
*Las citas enviadas por los editores.
*Citas en proceso de ser incluidas en
MEDLINE
*Inluye OLDMEDLINE
* Incluye citas de publicaciones a texto
completo en PMC
* Incluye los libros : NCBI Bookshelf
58. Búsqueda sencilla en PubMed
https://www.dropbox.com/s/v5d27
252us53a8s/Captura%20de
%20pantalla%202015-02-
07%2000.15.17.png?dl=0
59. Servicios de Valor añadido
PubMed
Enlace a sitios que ofrece el texto
completo (PMC, a las suscripciones de
la BV-SSPA, al SOD-Préstamo de la
BV-SSPA).
Filtros metodológicos “Clinical Queries”
Buscador de citas (Single citation
matcher).
Actualizacion periodica de Búsquedas
por correo, RSS, Filtrar resultados en
MyNCBI, etc.
64. MeSH
(Medical Subject Heading)
• Vocabulario controlado que asigna
términos a cada artículo que ingresa en
Medline.
• Estructura jerárquica. (26.000 términos
aprox.)
• Revisados anualmente.
• 1 referencia bibliográfica_ 12 términos
del tesauro
68. Estrategias de búsqueda
bibliográfica
A. Búsqueda Básica
B. Búsqueda avanzada.
# Pantalla de búsqueda avanzada.
# Búsqueda booleana con etiquetas de
campos.
# Descriptores MeSH
69. Escribir la estrategia en la
ventana de búsqueda basica
Auto-Suggest:
Podemos
seleccionar entre
las sugerencias que
nos ofrece
Auto-Suggest:
Podemos
seleccionar entre
las sugerencias que
nos ofrece
71. Búsqueda Básica
Localiza cualquier término (Automatic term mapping)
en las referencias en el campo título, resumen,
materia, etc.
Busca automáticamente en los indices:
Subject Traslation Table
Journal Tranaslation Table
Author Table
Si no lo encuentra, nos buscará el término del MESH y
en texto libre.
Si no lo encuentra lo divide en pares y vuelve a
intentar el mapeo de cada parte.
Cualquier término que no pueda ser encontrado lo
buscará en All Fields
79. Articulos relacionados
“related articles”
Es un algoritmo de búsqueda en
la que PubMed compara palabras
del Title y Abstract de cada cita,
así como los encabezamientos
Mesh asignados.
Los resultados se muestran por
orden de relevancia.
80. Tipos de Registros
[Epub ahead of print]
[Pubmed-as supplied by publisher]
[PubMed in process]
[PubMed indexed for MEDLINE]
[PubMed OLDMEDLINE] anteriores a 1965
h
81. Uso de los Filtros ¿Para qué?
Seleccionar el idioma.
Acotar un número de años
Artículos referidos a una población
específica
Buscar por tipos de publicacion
(revisiones, metaanálisis, Ensayos
clínicos, etc.).
ES POSIBLE APLICAR MAS DE UN
FILTRO
91. B) Gestión de la Información (II)
• Proceso técnico en la redacción del
manuscrito
- Guías de estilo.
- Normas de edición y de publicación.
- Recomendaciones de los autores editores.
- Utilidades para la redacción.
PubMed es un producto de la NLM.
La National Library of Medicine (NLM) o Biblioteca Nacional de Medicina de Estados Unidos que forma parte de National Institutes of Health (NIH)
Su sede está en Bethesda, Maryland, Estados Unidos es quizá la biblioteca de biomedicina más grande del mundo. y que hace poco, en 2011 ha celebrado el 175 aniversario.
La NLM produce muchas bases de datos y herramientas entre las que destacan:
PubMed = Indiza la literatura mundial de ciencias de la salud
MedlinePlus = Educación al Paciente = educación e información sanitaria al consumidor gratuita y mucha de ella en español.
ClinicalTrials.gov = Base de datos de ensayos clínicos
TOXNET = Base de datos de toxicología, substancias peligrosas, salud medioambiental, etc. http://toxnet.nlm.nih.gov/
PUBMED Central y OMIM ( Online Mendelian Inheritance in Man) Se trata de una base de datos de genes y enfermedades
El contenido de la sesión, lo que vamos a ver y tratar es el siguiente:
Empezaré con una introducción de qué es PubMed y veremos un poco de su historia. Creo importante cuando manejamos PubMed conocer exactamente qué es y qué no es y, sobre todo, saber diferenciarlo de la base de datos MEDLINE.
Continuaremos con las diferentes formas de acceso a PubMed para después comenzar a ver cómo buscar en la base de datos. Como veis hay dos formas de búsqueda, la sencilla o básica y la avanzada. Dentro de esta última yo distingo tres modalidades diferentes: búsqueda utilizando la pantalla de búsqueda avanzada, búsqueda booleana con etiquetas identificativas de cada campo y, por ultimo, la búsqueda empleando el tesauro MeSH tanto descriptores como subencabezamientos, MAJOR MeSH y otros
En este seminario, dado que es para principiantes sólo vamos a analizar la opción de búsqueda sencilla o simple aunque hablaremos algo del tesauro MeSH
En quinto lugar veremos las opciones de visualización del resultado y analizaremos los campos del registro.
Por último, analizaremos las diferentes opciones de manejo de los resultados.
Los objetivos de esta sesión son tres:
Entendáis el propósito y contenido de PubMed
Seamos capaces de realizar una búsqueda sencilla en PubMed y entender qué hace (“automatic term mapping”)
Familiarizarnos con las opciones básicas de visualización y manejo del resultado de PubMed
John Shaw Billings nació en Indiana el 12 de abril de 1838 y murió el 11 de marzo de 1913 ha sido el bibliotecario y cirujano más conocido como el renovador de la Biblioteca de la Oficina General del Ejército de Estados Unidos (Library of the Surgeon General's Office of the Army) y como el primer director de la Biblioteca Pública de Nueva York.
Durante la Guerra Civil americana, llegó ser jefe de la Library of the Surgeon General's Office en Washigton que más tarde sería el núcleo de la NLM National Library of Medicine.
Fue el responsible de la creación del Index Medicus y del Index Catalogue of the Surgeon General's Office.
Como ya hemos dicho, el El Index Medicus comenzó a editarse en 1879 por John Shaw Billings. Tenía una periodicidad mensual. Existío otra versión acumulada anual, el CUMULATED INDEX MEDICUS publicada en papel desde 1960 hasta 2004. También existió una versión reducida desde 1970 hasta 1997 llamada ABRIGDE INDEX MEDICUS con la indización de revistas nucleares.
En su comienzo el enorme volumen de citas bibliográficas se recopilaron manualmente. En 1957 el personal de la NLM comenzó a planificar la mecanización del Index Medicus , dado que se necesitaba era una manera de manipular toda esta información para producir productos auxiliares como índices impresos, catálogos y bibliografías temáticas. En 1960 se preparó un pliego de condiciones detalladas y para la primavera de 1961 se envió a 72 empresas una solicitud de propuestas para desarrollar el sistema. Como resultado, se adjudicó un contrato a la empresa General Electric. Así nació MEDLARS en 1964.
MEDLARS® (MEDical Literature Analysis and Retrieval System), etimológicamente significa “Análisis de la literatura médica y Sistemas de Recuperación de Datos”. MEDLARS tuvo un coste de $ 3 millones para su desarrollo y en el momento de su conclusión no permitía el acceso al público.
Rápidamente la NLM puso a disposición de determinadas instituciones las cintas magnéticas con los datos del sistema disponible para establecer servicios descentralizados de búsqueda en todo el país. En 1971 pasó a llamarse MEDLINE (MEDLARS Online) . Para la búsqueda eficaz en los primeros MEDLINE hacía falta un entrenamiento especial en los encabezamientos de materia, los comandos de búsqueda y la lógica booleana. Además, la consulta era muy costosa pues se realizaba a través de módem telefónico. Por esto los bibliotecarios y especialistas en información buscaban por los investigadores y profesionales de la salud (búsquedas mediadas, con intermediario). Las cintas de datos MEDLINE llegó a estar disponible en la suscripción a las universidades y centros de MEDLARS internacionales.
Con posterioridad se comercilizó MEDLINE en CD-ROM lo que posibilitó la búsqueda directa de los usuarios pues el coste ya no estaba ligado a una conferencia telefónica.
El 26 de junio de 1997 MEDLINE estuvo disponible de forma gratuita en la Web. La NLM inauguró el acceso gratuito a nivel mundial a MEDLINE través de PubMed, un nuevo sistema de acceso creado por la NCBI de la NLM . El vicepresidente Gore, quien participó en el anuncio, dijo que este avance "puede hacer más para reformar y mejorar la calidad de la atención sanitaria en los Estados Unidos que cualquier otra cosa que hemos hecho en mucho tiempo."
Su uso aumentado de manera exponencial.
Medline es la mayor base de datos mundial de ciencias de la salud, o por lo menos la más utilizada, aunque hay que tener en cuenta que no es la única pues tenemos otras tales como EMBASE, CINAHL, etc. Esto hay que tenerlo en cuenta cuando queremos hacer búsquedas exhaustivas pues no es suficiente la búsqueda únicamente en MEDLINE. Para hacernos una idea, aproximadamente hay un solapamiento entre MEDLINE y EMBASE del 35%.
Indiza 5.600 revistas de ámbito mundial procedente de USA y de otros 80 países del total aproximado de 30.000 revistas editadas en todo el mundo y en 39 idiomas (la mayoría, un 91% en inglés) de ahí que se diga que tiene un sesgo anglosajón su cobertura.
Su temática es ciencias de la salud, especialmente de biomedicina, abarcando los campos de la medicina, enfermería, odontología, veterinaria, sistemas de salud, ciencias preclínicas, salud pública,…
En total hay recogidas aproximadamente 19 millones de referencias bibliográficas, desde 1946 hasta la actualidad
La mayoría de estos 19 millones de citas, el 83%, incluye el resumen. La NLM no hace resumen, copia el que está escrito por los autores en los artículos. Hay artículos como cartas o editoriales que no tienen resumen y si el artículo tiene resumen pero no está en inglés tampoco lo traducen para su inclusión. Lo que si traducen es el título del artículo del idioma original al inglés. Nosotros distinguimos que han traducido el título cuando nos encontramos la referencia con el título entre corchetes
Una característica propia de MEDLINE es que los artículos son indizados utilizando el lengiaje controlado de la NLM llamada Medical Subject Heading o MeSH. Este es un valor añadido aportado por la NLM.
No es extraño que nuestros usuarios, e incluso muchas veces los mismos bibliotecarios, tomemos como iguales a PubMed y MEDLINE. De hecho, cuando explicamos que es PubMed simplificamos y decimos que proporciona acceso gratuito a la base de datos MEDLINE. PubMed es una de las muchas interfaces de búsquedas de MEDLINE que existen. Y siendo esto verdad también hay que señalar que PubMed no solo es MEDLINE aunque su mayor componente sea este. El 90% de las citas de PubMed son MEDLINE.
Me ocurrió con un usuario que me solicitó ayuda pues había enviado un manuscrito a una revista y le habían pedido que corrigiera este añadiendo trabajos más recientes. Este médico había realizado una buena búsqueda en PubMed utilizando el tesauro MeSH. Lo que el desconocía es que si busca usando los términos MeSH, al igual que por los campos de tipo de artículo, idioma, etc.), perdía contenido incluido en PubMed y limitaba su resultado a la base de datos MEDLINE. Yo le expliqué que con la estrategia que había empleado perdía todas aquellas referencias de los artículos más recientemente incluidos en PubMed… y más cosas.
Solo hay que ver los siguientes datos: PubMed incluye aproximadamente 21.527.461 registros y MEDLINE
19.415.892 referencias.
Entonces, ¿que contiene PubMed?. Resumiendo diríamos que PubMed incluye cerca de 22 millones de referencias
procedentes de la base de datos MEDLINE, de revistas de ciencias de la vida y libros electrónicos. Veamos
detenidamente que otro contenido diferente a MEDLINE se incluye y podemos recuperar cuando buscamos en PubMed:
Referencias bibliográficas en proceso (In-Process citations) con referencias en alguna etapa de ser analizadas
e indexadas en MEDLINE, incluyendo los registros enviados directamente por el editor y aquellas que se convertirán
en la categoría de citas “fuera de cobertura” (out-of-scope). Dentro de esta categoría encontramos unas 449,898 referencias.
Las citas que son anteriores a la fecha en que la revista fue seleccionada para su indexación en MEDLINE
(cuando se suministra por vía electrónica por el editor).
Algunas citas que forman parte de OLDMEDLINE pero que aún no han sido actualizados con la inclusión del
los términos MeSH y no se han convertido a la categoría de MEDLINE. Estas son aproximadamente 519,953 referencias.
Citas fuera de cobertura (“out-of-scope”) que proceden de revistas de ciencias de las que indizan selectivamente
aquellos artículos pertinentes y otros nunca son incluidos en Medline (por ejemplo, artículos sobre las
placas tectónicas o la astrofísica).
Las referencias de algunas publicaciones científicas adicionales de ciencias de la vida que presenten el texto
completo de PubMedCentral ® pero no pertenecen al grupo de revistas indexadas por MEDLINE.
Las citas a los manuscritos de artículos publicados por investigadores patrocinados por NIH.
Referencias de libros disponibles en la biblioteca NCBI (incluye una cita para el libro completo y citas de cada capítulo o sección del libro).
Aquí vemos la secuencia desde que una referencia es incluida en PubMed hasta que es indizada y pasa a formar parte de MEDLINE. Esto lo vemos por las etiquetas así la referencia cuando se incluye en Pubmed con la información tal cual la proporcionan los editores aparece con la etiqueta de [PubMed – as supplied by publisher].
Una vez el registro va a incluirse en MEDLINE y está a la espera de indización se le cambia la etiqueta a [PubMed – in process].
Por último, el registro es completado con determinados campos como el de descriptores del tesauro MeSH, tipo de artículo o idioma y se comprueba que todo está correcto pasa a formar parte de la base de datos MEDLINE y veremos ya el registro con la etiqueta [PubMed – indexed for MEDLINE]
Aquí vemos una pantalla de resultado tal cual nos puede aparecer tras hacer una búsqueda bibliográfica. Los registros aparecen de más recientes a más antiguos por lo que las primeras referencias suelen aparecer con la etiqueta de [PubMed – as supplied by publisher].
El tiempo que tarda en estar una referencia incluida en MEDLINE es variable y depende de la revista que sea. Por ejemplo, el New England Journal of Medicine se indiza e incluye en MEDLINE antes que la revista española Medicina Clínica.
Hay 5 tipos de etiquetas posibles:
PUBMED AS SUPPLIED BY PUBLISHER
PUBMED IN PROCESS
PUBMED INDEXED FOR MEDLINE
PUBMED
Y PubMed – OLDMEDLINE
Otras opciones:
Crearnos una cuenta personal en MyNCBI par ello tenemos que entrar en el enlace que hay en la parte superior derecha de nuestra pantalla de Pubmed. Cuando creamos una cuenta personal podemos configurar las opciones por defecto de PubMed como, por ejemplo, modificando los formatos de visualización del resultado, desactivando el “Auto-Suggest” o incluyendo la opción de que se vea resaltada en el resultado los términos que hemos empleado de búsqueda.
Otra opción es el acceso institucional. Para ello nuestra Biblioteca o centro de documentación ha de disponer de una cuenta Institucional la cual nos permite visualizar en los resultados la colección suscrita. Para acceder de manera institucional debemos escribir la URL que nuestra Biblioteca tenga para tal fin
Otras opciones:
Crearnos una cuenta personal en MyNCBI par ello tenemos que entrar en el enlace que hay en la parte superior derecha de nuestra pantalla de Pubmed. Cuando creamos una cuenta personal podemos configurar las opciones por defecto de PubMed como, por ejemplo, modificando los formatos de visualización del resultado, desactivando el “Auto-Suggest” o incluyendo la opción de que se vea resaltada en el resultado los términos que hemos empleado de búsqueda.
Otra opción es el acceso institucional. Para ello nuestra Biblioteca o centro de documentación ha de disponer de una cuenta Institucional la cual nos permite visualizar en los resultados la colección suscrita. Para acceder de manera institucional debemos escribir la URL que nuestra Biblioteca tenga para tal fin
En la página de inicio disponemos de varias herramientas de búsqueda.
Entre las más útiles está el “Single Citation Matcher”. Es frecuente el caso de que necesitemos localizar una referencia a partir de ciertos datos que disponemos de esta pero de la cual no conocemos todos. Por ejemplo, podemos saber en que revista se ha publicado, el año, el autor e incluso el título aproximado pero desconocemos el volumen y las páginas.
Para localizar una referencia completa disponemos de la herramienta “Single citation Matcher”. Hay disponibles varios campos para rellenar pero no es necesario cumplimentar todos pudiendo dejar uno o varios vacíos.
Otra herramienta útil para los clínicos es Clinical Queries. Si entramos en esta nos encontraremos con una pantalla muy clara que no es otra cosa que un buscador especializado que tiene incorporados filtros metodológicos. Los filtros metodológicos son estrategias prediseñadas para recuperar determinados tipos de artículos. Dentro de esta nueva pantalla tenemos 3 tipos de filtros de búsqueda:
- Clinical Study Category que nos propone cinco categorías: terapéutica (therapy), diagnóstico (diagnosis), etiología (etiology), pronóstico (prognosis) y clinical prediction guides
- Systematic Reviews que nos recupera revisiones sistemáticas, metaanálisis, conferencias de consenso, guías de práctica clínica, etc
- Medical Genetics con la que recuperamos artículos relativos a la genética médica.
MeSH Database. Es el nombre de una base de datos que ayuda a los usuarios de PubMed a localizar los términos apropiados para la búsqueda
Esta base de datos proporciona información de los términos MeSH incluyendo:
Definiciones
Sinónimos del concepto
Subencabezamientos
Términos relacionados
La posición del encabezamiento dentro de la estructura jerárquica MeSH
Los encabezados de temas médicos NLM o MeSH es un vocabulario controlado de términos biomédicos que se utiliza para describir el tema de cada artículo de la revista en MEDLINE. MeSH contiene aproximadamente 26 mil términos y se actualiza anualmente para reflejar los cambios en la medicina y la terminología médica. Términos MeSH se organizan jerárquicamente por categorías temáticas con términos más específicos organizados bajo términos más amplios. PubMed permite ver esta jerarquía y seleccionar términos para la búsqueda en la base de datos MeSH.
Los indizadores de MEDLINE de la NLM examinan los artículos y asignan los encabezamientos MeSH apropiados más específicos que describan los conceptos específicos de que se tratan en el artículo. El indizador asigna tantos encabezamientos como sean apropiados para cubrir los temas del artículo: generalmente de 10 a 15 (12 de media).
El término MeSH que refleja los puntos principales de un artículo se denomina Major MeSH y es señalado con un asterisco (*) por los indizadores.
Todos los descriptores MeSH se pueden buscar en el MeSH Browser cuya dirección aparece en la pantalla.
Otro recurso es Journal Database que incluye todas las revistas indizadas en PubMed, y se pueden localizar por: título, abreviatura, ISSN, especialidades…
El lenguaje médico de los artículos es un lenguaje natural y, por lo tanto, nos encontramos con situaciones de SINONIMIA, utilización de acrónimos, diferentes speeling en inglés, etc.
Al aplicar el vocabulario MeSH nos asegura que los artículos están uniformemente indexados por temas, sean cuales sean las palabras del autor.
En la diapositiva vemos el ejemplo para úlceras de decubito o presión pero existen muchísimos más:
Brain edema = Brain oedema
Hemorrhage = haemorrhage = bleeding
Brain ischemia = stroke
Otitis media = ear infection or ear ache
Myocardial infarction = heart attack
Los términos MeSH se organizan jerárquicamente en 16 categorías temáticas principales o MAIN BRABCHES que vemos numeradas a la izquierda y que se van dividiendo con términos más específicos organizados bajo términos más amplios.
Las más importantes y usadas en la indización son las 4 primeras categorias: anatomía, organismos, enfermedades y sustancias químicas y drogas.
Si vieramos los términos que hay por debajo de la primera categoría ANATOMÍA nos encontraríamos con otras durramas más espécíficos como “Body regions”. Cuando veamos un signo + significa que ese término se sigue dividiendo en otros más específicos.
Cuando hacemos una búsqueda por un términos MeSH PubMed incluye automáticamente los términos MeSH más específicos en una búsqueda. Es lo que se denomina la búsqueda ampliada del término MeSH.
Cuando empezamos a escribir las primeras letras, se despliega una menú de sugerencias, es el auto-suggest que nos ofrece alternativas de términos de búsqueda. Estos no son necesariamente términos del MeSH ni sacadas de ningún vocabulario o índice establecido. Auto-suggest nos ofrece sugerencias procedentes de los que otras personas han escrito en búsquedas antes que nosotros.
Una vez hemos escribo nuestra estrategia de búsqueda pulsamos la tecla ENTER o el botón de SEARCH. Una vez hecho esto nos aparece la pantalla con el resultado. Esta la podemos dividir en tres partes:
Parte CENTRAl donde nos apararecen las referencias bibliográficas. Estas viene configuradas de forma predeterminadas en un formato, número y orden. Luego veremos como podemos modificar esta visualización con nuestras preferencias.
Columna IZQUIERDA con los filtros para limitar el resultado de nuestra búsqueda
Columna DERECHA con diversas herramientas como Discovery Ads, Related Search, Search Details, etc que luego veremos.
Nos aparece la pantalla de resultados.
Para ver exactamente como interpreta PubMed nuestra estrategia y ver al sintaxis de búsqueda entro en “Search Details” situada en la columna izquierda de la pantalla de resultado. Nos dice cuál es exactamente nuestra sintaxis de búsqueda. Podemos editar esta ventana y modificar la estrategia. Para mayor comodidad podemos pulsar el enlace “See more” y pasamos a ver la estrategia en una nueva pantalla.
Escribimos en la ventana de búsqueda “ Moxibustion for Breech Presentation “ y pulsamos Search.
Nos aparece la pantalla de resultados con 54 referencias localizadas con nuestra estrategia de búsqueda.
Para ver exactamente cual ha sido la sintaxis de nuestra estrategia, voy en la columna de la derecha a la ventana de “Searc Details”. Ahí ya puedo ver la estrategia realizada pero como es muy pequeña esta ventana pulsamos “See more…”
Este ha sido el mapeo que ha ejecutado esta estrategia de búsqueda en modo “búsqueda simple”
Una vez hemos escribo nuestra estrategia de búsqueda pulsamos la tecla ENTER o el botón de SEARCH. Una vez hecho esto nos aparece la pantalla con el resultado. Vamos a ahora a analizar la columna derecha (amarilla), la columna izquierda (azul) y la parte CENTRAl (rosa) donde nos apararecen las referencias bibliográficas. Estas viene configuradas de forma predeterminadas en un formato, número y orden. Vamos a ver como podemos modificar esta visualización con nuestras preferencias y que hacer con el resultado de nuestra búsqueda.
.
Hay veces que no encontramos en la fila de la fuente el volumen, número o pagina y nos aparece otra etiquetas que nos indican el estado del artículo. Es la etiqueta “Epub ahead of print” y es la que solemos encontrar en las primeras referencias que visualizamos tras hacer una búsqueda bibliográfica.
E-pub significa “electronically published”, es decir, artículo publicado electrónicamente previo a su publicación en papel.
Esto tiene implicaciones cuando queremos obtener el texto completo pues solamente se puede conseguir si disponemos de la versión electrónica de la revista ya que en su versión en papel puede tardar varios meses en aparecer publicada.
Por lo tanto, solo lo podremos conseguir solicitándolo a una biblioteca que disponga del acceso electrónico y no la versión en papel de la revista.
Hay muchas razones para querer limitar nuestro resultado y para ello disponemos de los ahora llamados Filtros y antes Limits. Así, por ejemplo, podemos querer excluir idiomas que no entendemos, buscar artículos que han sido publicados en cierto periodo de tiempo, recuperar artículos referentes a una población específica como ancianos o niños, o limitar nuestro resultado a un determinado tipo de artículo como sólo estudios de investigación clínica o revisiones.
Hay más opciones en los filtros como la disponibilidad de texto completo, especies, sexo, o categorías de revistas.
Tipos de filtro:
Abstract Available
Free Full Text available
Full Text available
Publication Dates
Species (Humans or Animals)
Article Type
Languages
Sex (additional Filters)
Subjects
Journals categories
Ages (additional Filters)
Aquí vemos como hemos aplicado dos filtros (publicado en los últimos 5 años y humanos) a nuestra búsqueda de epidemia de gripe.
Cuado aplicamos un o varios filtros en la pantalla de resultamos se indica mediante un mensaje. En nuestro caso vemos que indica: “Filters actived: published in the last 5 years, Human.
Para desactivar o eliminar los filtros aplicados a nuestra búsqueda disponemos del enlace “Clear all” que hay a la derecha de este mensaje de aviso.
Tenemos que tener en cuenta que las referencias "in process" y "supplied by publisher" pueden ser excluidos cuando seleccionamos algún filtro, ya que aún no han completado el proceso de indexación en MEDLINE y estos artículos no disponen, por ejemplo del campo de tipo de artículo, especies, edades, etc.
Podemos modificar las opciones por defecto de visualización. Para ello hacemos click en el enlace “Diaplay Settings” y nos aparece la posibilidad de modificar:
El formato y de esta forma ver la referencia con abstract, MEDLINE con las etiquetas de los campos, XML, Etc.
Número de referencias por página. De esta forma, si nuestros resultados superan los 20 registros como por ejemplo 45, podemos elegir la opción de visualizar 50 ítems por página y de esta forma veremos todos nuestros resultados en una única página
Sort by para alterar el orden de aparición de los resultados a, por ejemplo, orden alfabético del primer autor, de la revista o del título.
Una vez marco las opciones deseadas de este menú desplegable pulso el botón de “Apply” y nos mostrará de nuevo la pantalla de resultados pero ya con la configuración por nosotros realizada.
Veamos una referencia en formato Abstract.
Hay más campos que en el formato Summary como son:
* Afiliación de los autores
* Abstract
* Si el artículo pertenece a una revista incluida a texto completo en el repositorio PMC nos aparecen la previsualización de las imágenes, tablas y figuras del artículo original.
Un desplegable de tipo de publicación, MeSH Terms, Substances, Grant Support. Y otro desplegable de LinKout
Además, visualizamos los iconos de acceso al texto completo, gratuito o de pago. En nuestro caso, vemos que el acceso completo es Free, es decir, gratuito. Si pinchamos en alguno de estos iconos se abrirá una nueva página en nuestro navegador con el artículo a texto completo. En el caso de que no fuera gratuito se abrirá la página pero nos pedirá la clave de acceso antes de abrir el texto completo.
A la derecha también encontramos la herramienta de “Related Citations”, es decir, artículos relacionados con el que estoy visualizando en formato “Abstract”
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