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Estructura y propiedades
físicoquímicas de las Proteínas,
Péptidos y Aminoácidos
Dra. Ligbel Sanchez Castillo
Niveles de organización proteica
• Estructura primaria
• Estructura secundaria
• Estructura terciaria
• Estructura cuaternaria
Enlaces responsables de los niveles de
organización de las proteínas
• Enlaces fuertes:
- Enlace peptídico
- Enlace disulfuro
• Enlaces débiles:
- Enlaces puente de hidrógeno
- Interacciones hidrofóbicas
- Fuerzas electrostáticas
- Fuerzas de Van Der Waals
Estructura primaria
• Define el orden de los
aminoácidos, y la ubicación de los
enlaces disulfuros en las cadenas
polipeptídicas.
• La secuencia de A,A de la
estructura primaria puede
predecirse a partir del gen que
codifica a la proteína.
• Se puede apreciar el A,A con el
grupo amino terminal y el que
contiene el grupo carboxilo
terminal.
• Si existen varias cadenas se
identifican con las letras griegas
alfa, beta, gamma,etc.
1 4
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8 9 10 11 12 13 14
15 16 17 18 19 20
Amino
terminal
Carboxilo
terminal
• Está caracterizada por
conformaciones regulares, que
pueden encontrarse en toda o
en una parte de la proteína.
• La planaridad del enlace
peptídico y el impedimento
estérico derivado de la cadena
lateral R, hace que la proteína
adopte la forma de resorte.
• Los enlaces puente de
hidrogeno le dan la estabilidad
a la estructura.
• Existen varios tipos: -hélice,
hoja plegada o lámina 
(paralela o antiparalela).
Estructura secundaria
• Espiral en el mismo sentido de
las manecillas del reloj.
• Cada vuelta contiene de 3 a 6
residuos de A,A.
• Es una configuración elástica.
• La estructura secundaria es
más estable y de menor
energía que la cadena
polipeptídica (estructura
primaria).
Hoja plegada o lámina beta
• Los segmentos de la cadena se
disponen lado a lado en forma
casi completamente
extendida.
• Formada por enlaces puente
de hidrógeno entre los "O "
carbonílicos y los " H "
amídicos de dos o más
cadenas polipeptídicas
extendidas y adyacentes.
• Disposición en zig-zag.
• Pueden ser: paralelas o
antiparalelas.
Lámina -paralela Lámina -antiparalela
Triple hélice
• El colágeno es el ejemplo
característico.
• Espiral enrollado de tres
subunidades polipeptídicas.
• Cada unidad polipeptídica o
cadena alfa está torcida en
una hélice con giro a la
izquierda de 3 residuos por
vuelta.
• La triple hélice del colágeno
está estabilizado por múltiples
enlaces cruzados
intercatenarios entre residuos
de lisina y de hidroxilisina.
• Está caracterizada por
plegamientos a distancia.
• Está constituída por varios
“DOMINIOS".
• Además de enlaces puente
de hidrógeno, se anexan las
interacciones hidrófobas,
fuerzas de Van Der Waals y
las fuerzas electrostáticas.
• Ejemplo: la mioglobina.
Estructura terciaria
Mioglobina
• Se refiere al ensamblaje de
dos o más cadenas
polipeptídicas separadas,
unidas mediante interacciones
o entrecruzamientos no
covalentes.
• El conjunto se denomina
oligomero.
• Las cadenas peptídicas se
denominan monómeros o
subunidades .
• Participan todos los enlaces
débiles.
Estructura cuaternaria
FACTORES DE ESTABILIDAD QUE MANTIENEN A
LAS PROTEÍNAS EN SOLUCIÓN (COLOIDES)
• Atmósfera hidratante
• Carga neta (+) ó (-)
PRECIPITACIÓN
• Con desnaturalización
• Sin desnaturalización
Desnaturalización
Desorganización de la
conformación nativa o
biológicamente activa de
una proteína, que tiene
lugar cuando se cambia el
entorno.
Agentes desnaturalizantes:
• Cambios extremos de pH.
• Calentamiento.
• Úrea, detergentes, cloruro
de guanidino,etc.
Hidrólisis
H2O
Ruptura del enlace
amida (enlace
peptídico) al agregar
agua, con la respectiva
regeneración de los
A,A constituyentes.
Clasificación de las proteínas
• De acuerdo a sus funciones.
• De acuerdo a su solubilidad.
• De acuerdo a su conformación.
• De acuerdo a su composición.
De acuerdo a sus funciones
• Catalíticas
• Estructurales
• Contráctiles
• De defensa natural
• Digestivas
• De transporte
• Hormonales
• Del ADN
• Cromosómicas
• De la membrana-
receptores
• Ribosómicas
• De almacenamiento
• Tóxicas o de toxinas
• De la visión
De acuerdo a su solubilidad
Albúminas:
• Son de origen animal.
• Solubles en agua destilada.
• Precipitan en slns. salinas saturadas.
• PM: < 70.000 Daltons
Globulinas:
• Son de origen vegetal y animal.
• Insolubles en agua destilada.
• Precipitan en slns. medio saturadas de
sales.
• PM: > 150.000 Daltons
Histonas:
• Son de origen vegetal o animal.
• Solubles en agua destilada y ácidos
diluídos.
• Precipitan por adición de amoníaco.
• Están unidas al ADN en el núcleo
celular.
Protaminas:
• Son de origen animal.
• Solubles en agua destilada, slns.
Salinas, ácidos y bases.
• PM: 6.000 Daltons.
• Están unidas a otras proteínas para
formar complejos de alto PM.
De acuerdo a su conformación
Proteínas fibrosas
• Generalmente insolubles en agua.
• Tienen formas moleculares muy
alargadas.
• Conjunto de cadenas
polipeptídicas largas, dispuestas a
manera de haz.
• Resistentes a la
desnaturalización.
• Poseen uniones intermoleculares
fuertes.
• Material estructural de los tejidos
• Ej.: Colágeno, elastina, queratina
Proteínas globulares
• Solubles en agua o slns. salinas.
• Estructura compacta.
• Poseen estructuras casi esféricas
a elípticas.
• Se desnaturalizan fácilmente.
• Fuerzas intermoleculares débiles.
• Regulan procesos vitales.
• Ej.: Hemoglobina, enzimas,
inmunoglobulinas, miosina,
fibrinógeno.
De acuerdo a su composición
Proteínas simples o no
conjugadas
• Sólo tienen material
polipeptídico.
• No poseen adherido ningún
grupo no proteico.
Proteínas conjugadas
• El componente
polipeptídico se encuentra
asociado con un
componente no peptídico,
orgánico o inorgánico,
llamado grupo prostético.
Clasificación de las proteínas
Proteínas simples
•Fibrosas
•Globulares
•Albúmina
•Globulina
Proteínas conjugadas
• Glicoproteínas
• Metaloproteínas
• Hemoproteínas
• Flavoproteínas
• Fosfoproteínas
• Nucleoproteínas
• Lipoproteínas
•Colágeno
•Elastina
•Queratina
PROTEÍNAS SIMPLES:
PROTEÍNAS FIBROSAS
COLÁGENO:
- La unidad básica de la fibra del colágeno es la molécula de
tropocolágeno.
- Forma parte del tejido conectivo, tejido que precisa
resistencia o dureza.
- Es una triple hélice formada por 3 hélices polipeptídicas
enrolladas entre sí. Cada hélice con aprox. 1000 residuos.
- Es rico en los A,A: Glicina, lisina, prolina, hidroxiprolina. La
hidroxilisina es poco frecuente.
- Es más estable mientras tenga más restos de prolina y lisina.
ELASTINA:
- Proteína fibrosa flexible.
- Se encuentra en el tejido conectivo elástico
(ligamentos, vasos sanguíneos arteriales).
- Formada por los A,A: Glicina, leucina, isoleucina,
prolina, y poca cantidad de hidroxiprolina.
- Carece de hidroxilisina.
QUERATINA:
- Proteína insoluble en los animales, derivadas de las células del
ectodermo.
- Están incluídas en este tipo los elementos proteicos estructurales de la
piel, así como los derivados biológicos del ectodermo (pelo, plumas,
lana, escamas,uñas).
- Existen dos clases de queratinas con secuencia de A,A y funciones
similares: -queratinas y -queratinas.
- Las -queratinas son las proteínas más importantes del pelo y las uñas
y forman parte importante de la piel del animal.
- Las -queratinas son miembros de un gran grupo de proteínas
filamentosas intermedias, que desempeñan funciones estructurales en
los núcleos, citoplasmas y superficie de muchas células.
QUERATINA
• Glucoproteínas (Ej.: grupos sanguíneos).
• Metaloproteínas (Ej.: enzima anhidrasa carbónica posee
Zn).
• Hemoproteínas (Ej.: hemoglobina, mioglobina,
citocromos, catalasa).
• Flavoproteínas (Ej.: succinato deshidrogenasa-FAD).
• Fosfoproteínas (Ej.: caseína de la leche).
• Nucleoproteínas (Ej.: cromatina).
• Lipoproteínas (Ej.: quilomicrones, VLDL, LDL,HDL).
PROTEÍNAS CONJUGADAS
HEMOPROTEÍNAS
• GRUPO PROSTÉTICO:
HEM
Nucleo coloreado
tetrapirrólico, formado
por cuatro unidades de
piorrol, conectadas a
modo de anillo por
puentes metenilo. La
estructura es planar y
en el centro tiene un
átomo de hierro.
Fe+2
- Hemoproteína presente en eritrocitos.
- Grupo proteico: Globina (Dos cadenas alfa y dos
beta).
- Grupo prostético: Hem o Hemo.
- Función: Transporte de oxígeno del aparato
respiratorio a los tejidos, y CO2 desde los tejidos
a los pulmones para ser excretado.
HEMOGLOBINA
- Hemoproteína presente en tejido muscular.
- Grupo proteico: Una sola cadena polipeptídica.
- Grupo prostético: Hem o Hemo.
- Función: Fija y almacena O2 cuando la
concentración del mismo es alta, y lo libera
cuando las células así lo requieran.
MIOGLOBINA
- Hemoproteína con actividad enzimática.
- Grupo prostético: Hem o Hemo.
- Función: Actúan como agentes de transferencia
de electrones en las reacciones de oxido-reducción
de la cadena respiratoria.
- Ejemplos: Cit b, Cit c1, Cit c, Cit aa3, Cit P450.
CITOCROMOS
- Hemoproteína con
actividad enzimática.
- Grupo prostético: Hem
o Hemo.
- Función: Degrada el
peróxido de hidrógeno
en agua y oxígeno..
CATALASA
FLAVOPROTEÍNAS
• GRUPO
PROSTÉTICO:
Mononucleótido de
flavina (FMN) o
dinucleótido de flavina
y adenina (FAD).
• Se forma en el cuerpo
a partir de la vitamina
B5 o riboflavina.
• Numerosas enzimas
son flavoproteínas o
metaloflavoproteínas.
LIPOPROTEÍNAS
• GRUPO PROTEICO:
Apolipoproteína o
apoproteína (Apo B48,
apo B100, apo A).
• GRUPO
PROSTÉTICO:
Nucleo lipídico.
• Función: Transporte de
lípidos por el torrente
circulatorio.
• Tipos: Quilomicrón,
VLDL, LDL, HDL.
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2. Proteinas.pdf

  • 1. Estructura y propiedades físicoquímicas de las Proteínas, Péptidos y Aminoácidos Dra. Ligbel Sanchez Castillo
  • 2. Niveles de organización proteica • Estructura primaria • Estructura secundaria • Estructura terciaria • Estructura cuaternaria
  • 3. Enlaces responsables de los niveles de organización de las proteínas • Enlaces fuertes: - Enlace peptídico - Enlace disulfuro • Enlaces débiles: - Enlaces puente de hidrógeno - Interacciones hidrofóbicas - Fuerzas electrostáticas - Fuerzas de Van Der Waals
  • 4.
  • 5. Estructura primaria • Define el orden de los aminoácidos, y la ubicación de los enlaces disulfuros en las cadenas polipeptídicas. • La secuencia de A,A de la estructura primaria puede predecirse a partir del gen que codifica a la proteína. • Se puede apreciar el A,A con el grupo amino terminal y el que contiene el grupo carboxilo terminal. • Si existen varias cadenas se identifican con las letras griegas alfa, beta, gamma,etc. 1 4 3 2 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 Amino terminal Carboxilo terminal
  • 6.
  • 7. • Está caracterizada por conformaciones regulares, que pueden encontrarse en toda o en una parte de la proteína. • La planaridad del enlace peptídico y el impedimento estérico derivado de la cadena lateral R, hace que la proteína adopte la forma de resorte. • Los enlaces puente de hidrogeno le dan la estabilidad a la estructura. • Existen varios tipos: -hélice, hoja plegada o lámina  (paralela o antiparalela). Estructura secundaria
  • 8. • Espiral en el mismo sentido de las manecillas del reloj. • Cada vuelta contiene de 3 a 6 residuos de A,A. • Es una configuración elástica. • La estructura secundaria es más estable y de menor energía que la cadena polipeptídica (estructura primaria).
  • 9.
  • 10. Hoja plegada o lámina beta • Los segmentos de la cadena se disponen lado a lado en forma casi completamente extendida. • Formada por enlaces puente de hidrógeno entre los "O " carbonílicos y los " H " amídicos de dos o más cadenas polipeptídicas extendidas y adyacentes. • Disposición en zig-zag. • Pueden ser: paralelas o antiparalelas.
  • 11. Lámina -paralela Lámina -antiparalela
  • 12. Triple hélice • El colágeno es el ejemplo característico. • Espiral enrollado de tres subunidades polipeptídicas. • Cada unidad polipeptídica o cadena alfa está torcida en una hélice con giro a la izquierda de 3 residuos por vuelta. • La triple hélice del colágeno está estabilizado por múltiples enlaces cruzados intercatenarios entre residuos de lisina y de hidroxilisina.
  • 13. • Está caracterizada por plegamientos a distancia. • Está constituída por varios “DOMINIOS". • Además de enlaces puente de hidrógeno, se anexan las interacciones hidrófobas, fuerzas de Van Der Waals y las fuerzas electrostáticas. • Ejemplo: la mioglobina. Estructura terciaria
  • 15. • Se refiere al ensamblaje de dos o más cadenas polipeptídicas separadas, unidas mediante interacciones o entrecruzamientos no covalentes. • El conjunto se denomina oligomero. • Las cadenas peptídicas se denominan monómeros o subunidades . • Participan todos los enlaces débiles. Estructura cuaternaria
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  • 19. FACTORES DE ESTABILIDAD QUE MANTIENEN A LAS PROTEÍNAS EN SOLUCIÓN (COLOIDES) • Atmósfera hidratante • Carga neta (+) ó (-) PRECIPITACIÓN • Con desnaturalización • Sin desnaturalización
  • 20. Desnaturalización Desorganización de la conformación nativa o biológicamente activa de una proteína, que tiene lugar cuando se cambia el entorno. Agentes desnaturalizantes: • Cambios extremos de pH. • Calentamiento. • Úrea, detergentes, cloruro de guanidino,etc.
  • 21. Hidrólisis H2O Ruptura del enlace amida (enlace peptídico) al agregar agua, con la respectiva regeneración de los A,A constituyentes.
  • 22. Clasificación de las proteínas • De acuerdo a sus funciones. • De acuerdo a su solubilidad. • De acuerdo a su conformación. • De acuerdo a su composición.
  • 23. De acuerdo a sus funciones • Catalíticas • Estructurales • Contráctiles • De defensa natural • Digestivas • De transporte • Hormonales • Del ADN • Cromosómicas • De la membrana- receptores • Ribosómicas • De almacenamiento • Tóxicas o de toxinas • De la visión
  • 24. De acuerdo a su solubilidad Albúminas: • Son de origen animal. • Solubles en agua destilada. • Precipitan en slns. salinas saturadas. • PM: < 70.000 Daltons Globulinas: • Son de origen vegetal y animal. • Insolubles en agua destilada. • Precipitan en slns. medio saturadas de sales. • PM: > 150.000 Daltons Histonas: • Son de origen vegetal o animal. • Solubles en agua destilada y ácidos diluídos. • Precipitan por adición de amoníaco. • Están unidas al ADN en el núcleo celular. Protaminas: • Son de origen animal. • Solubles en agua destilada, slns. Salinas, ácidos y bases. • PM: 6.000 Daltons. • Están unidas a otras proteínas para formar complejos de alto PM.
  • 25. De acuerdo a su conformación Proteínas fibrosas • Generalmente insolubles en agua. • Tienen formas moleculares muy alargadas. • Conjunto de cadenas polipeptídicas largas, dispuestas a manera de haz. • Resistentes a la desnaturalización. • Poseen uniones intermoleculares fuertes. • Material estructural de los tejidos • Ej.: Colágeno, elastina, queratina Proteínas globulares • Solubles en agua o slns. salinas. • Estructura compacta. • Poseen estructuras casi esféricas a elípticas. • Se desnaturalizan fácilmente. • Fuerzas intermoleculares débiles. • Regulan procesos vitales. • Ej.: Hemoglobina, enzimas, inmunoglobulinas, miosina, fibrinógeno.
  • 26. De acuerdo a su composición Proteínas simples o no conjugadas • Sólo tienen material polipeptídico. • No poseen adherido ningún grupo no proteico. Proteínas conjugadas • El componente polipeptídico se encuentra asociado con un componente no peptídico, orgánico o inorgánico, llamado grupo prostético.
  • 27. Clasificación de las proteínas Proteínas simples •Fibrosas •Globulares •Albúmina •Globulina Proteínas conjugadas • Glicoproteínas • Metaloproteínas • Hemoproteínas • Flavoproteínas • Fosfoproteínas • Nucleoproteínas • Lipoproteínas •Colágeno •Elastina •Queratina
  • 28. PROTEÍNAS SIMPLES: PROTEÍNAS FIBROSAS COLÁGENO: - La unidad básica de la fibra del colágeno es la molécula de tropocolágeno. - Forma parte del tejido conectivo, tejido que precisa resistencia o dureza. - Es una triple hélice formada por 3 hélices polipeptídicas enrolladas entre sí. Cada hélice con aprox. 1000 residuos. - Es rico en los A,A: Glicina, lisina, prolina, hidroxiprolina. La hidroxilisina es poco frecuente. - Es más estable mientras tenga más restos de prolina y lisina.
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  • 30. ELASTINA: - Proteína fibrosa flexible. - Se encuentra en el tejido conectivo elástico (ligamentos, vasos sanguíneos arteriales). - Formada por los A,A: Glicina, leucina, isoleucina, prolina, y poca cantidad de hidroxiprolina. - Carece de hidroxilisina.
  • 31. QUERATINA: - Proteína insoluble en los animales, derivadas de las células del ectodermo. - Están incluídas en este tipo los elementos proteicos estructurales de la piel, así como los derivados biológicos del ectodermo (pelo, plumas, lana, escamas,uñas). - Existen dos clases de queratinas con secuencia de A,A y funciones similares: -queratinas y -queratinas. - Las -queratinas son las proteínas más importantes del pelo y las uñas y forman parte importante de la piel del animal. - Las -queratinas son miembros de un gran grupo de proteínas filamentosas intermedias, que desempeñan funciones estructurales en los núcleos, citoplasmas y superficie de muchas células.
  • 33. • Glucoproteínas (Ej.: grupos sanguíneos). • Metaloproteínas (Ej.: enzima anhidrasa carbónica posee Zn). • Hemoproteínas (Ej.: hemoglobina, mioglobina, citocromos, catalasa). • Flavoproteínas (Ej.: succinato deshidrogenasa-FAD). • Fosfoproteínas (Ej.: caseína de la leche). • Nucleoproteínas (Ej.: cromatina). • Lipoproteínas (Ej.: quilomicrones, VLDL, LDL,HDL). PROTEÍNAS CONJUGADAS
  • 34. HEMOPROTEÍNAS • GRUPO PROSTÉTICO: HEM Nucleo coloreado tetrapirrólico, formado por cuatro unidades de piorrol, conectadas a modo de anillo por puentes metenilo. La estructura es planar y en el centro tiene un átomo de hierro. Fe+2
  • 35. - Hemoproteína presente en eritrocitos. - Grupo proteico: Globina (Dos cadenas alfa y dos beta). - Grupo prostético: Hem o Hemo. - Función: Transporte de oxígeno del aparato respiratorio a los tejidos, y CO2 desde los tejidos a los pulmones para ser excretado. HEMOGLOBINA
  • 36. - Hemoproteína presente en tejido muscular. - Grupo proteico: Una sola cadena polipeptídica. - Grupo prostético: Hem o Hemo. - Función: Fija y almacena O2 cuando la concentración del mismo es alta, y lo libera cuando las células así lo requieran. MIOGLOBINA
  • 37. - Hemoproteína con actividad enzimática. - Grupo prostético: Hem o Hemo. - Función: Actúan como agentes de transferencia de electrones en las reacciones de oxido-reducción de la cadena respiratoria. - Ejemplos: Cit b, Cit c1, Cit c, Cit aa3, Cit P450. CITOCROMOS
  • 38. - Hemoproteína con actividad enzimática. - Grupo prostético: Hem o Hemo. - Función: Degrada el peróxido de hidrógeno en agua y oxígeno.. CATALASA
  • 39. FLAVOPROTEÍNAS • GRUPO PROSTÉTICO: Mononucleótido de flavina (FMN) o dinucleótido de flavina y adenina (FAD). • Se forma en el cuerpo a partir de la vitamina B5 o riboflavina. • Numerosas enzimas son flavoproteínas o metaloflavoproteínas.
  • 40. LIPOPROTEÍNAS • GRUPO PROTEICO: Apolipoproteína o apoproteína (Apo B48, apo B100, apo A). • GRUPO PROSTÉTICO: Nucleo lipídico. • Función: Transporte de lípidos por el torrente circulatorio. • Tipos: Quilomicrón, VLDL, LDL, HDL.