El documento presenta el análisis de secuencias del gen 16S realizado mediante el software BioEdit. Se utilizaron tres archivos de secuencias y se identificaron las secuencias a nivel de género y especie mediante BLAST en NCBI. La mayoría de las secuencias correspondían a géneros como Klebsiella, Enterobacter y Pseudomonas. Se presentan tablas con los resultados del análisis incluyendo el código de la secuencia, calidad, tamaño, organismo identificado y porcentaje de identidad.

1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERIA AMBIENTAL
INFORME N° 01:
ANALISIS DE
SECUENCIAS DEL
GEN 16 S
DOCENTE:
Blgo. Hebert Hernan Soto Gonzales
ESTUDIANTE:
MAMANI MAMANI , Josselyn Leidy
ASIGNATURA:
Biotecnología
CICLO:
VII
FECHA DE ENTREGA
19 de septiembre, 2021
ILO - PERÚ

2. INDICE
Introducción ...............................................................................................................................3
1. Objetivos .............................................................................................................................4
2. Materiales y métodos..........................................................................................................4
2.1. Materiales....................................................................................................................4
2.2. Métodos.......................................................................................................................4
3. Resultados...........................................................................................................................8
4. Conclusión.........................................................................................................................10
5. Bibliografía .......................................................................................................................10
INDICE DE ILUSTRACIONES
Ilustración 1. Software BioEdith...................................................................................................4
Ilustración 2. Export as Fasta........................................................................................................4
Ilustración 3. Block de Notas........................................................................................................5
Ilustración 4. NCBI........................................................................................................................5
Ilustración 5. Secuencia muy similares.........................................................................................6
Ilustración 6. Explosión ................................................................................................................6
Ilustración 7. Datos ......................................................................................................................7
Ilustración 8. Nombre científico y identidad ................................................................................7
Ilustración 9. Excel........................................................................................................................7
INDICE DE TABLAS
Tabla 1 Elaboración Propia...........................................................................................................8
Tabla 2. Elaboración Propia..........................................................................................................9
Tabla 3. Elaboración Propia..........................................................................................................9

3. Introducción
La secuencia genética nos permite conocer y descifrar el código genético que tienen todos
los seres vivos. Este código tiene información y un funcionamiento. Estas señas de
identidad, es decir, con características y la firma genética de los organismos biológicos.
En el caso de los virus, hay un debate sobre si son realmente organismos vivos, ya que no
son capaces de realizar algunas de las funciones biológicas. la secuenciación genómica
del nuevo coronavirus ha sido desde su descubrimiento uno de los principales objetivos,
ya que es la puerta de entrada para poder conocerlo y combatirlo.
En la actualidad la mayoría de centros de investigación son capaces de hacer
secuenciación genética. Hay diferentes tecnologías para llevarla a cabo. La secuenciación
de Sanger, una de las primeras en desarrollarse y clave para automatizar el proceso de
secuenciación que se conoce hoy, sigue siendo una referencia. A lo largo de los años han
ido surgiendo nuevas tecnologías que permiten obtener más información del organismo
secuenciado de manera más rápida. Entre ellas destacan tecnologías como Illumina e
IonTorrent, consideradas parte de la segunda generación de secuenciación genómica, y
Pacific Bioscience y Oxford Nanopore, que ya forman parte de una tercera generación de
esta tecnología.
Posiblemente el principal hito del siglo XXI en ciencia haya sido el Proyecto Genoma
Humano y la publicación en el año 2001 del primer borrador de la secuencia del genoma
humano. Es decir, se consiguió determinar la secuencia genética contenida en los 23
cromosomas humanos o dicho de otra manera el orden de los más de 4,500 millones de
nucleótidos que conforman el genoma humano. Esta carrera por conseguir la secuencia
del genoma humano tuvo importantes consecuencias en el desarrollo de nuevas
tecnologías que permitieran producir las grandísimas cantidades de datos que exigía un
proyecto de esta envergadura.

4. 1. Objetivos
• Revisar los fundamentos de las técnicas de secuenciación de ácidos nucleicos.
• Efectuar el análisis y la selección de electroferogramas automatizados de
secuenciación mediante la aplicación de software libre BIOEDIT en específico
el estudio del gen ribosomal 16S.
2. Materiales y métodos
2.1.Materiales
- Software BioEdit
- Página web de NCBI
- Excel
- Laptop
2.2.Métodos
I. Primer paso: Tener listo el software BioEdith , es un editor de alineación de secuencias
biológicas .y nuestro documento para poder analizarlo su electroferograma y la
secuencia.
Ilustración 1. Software BioEdith
II. Segundo Paso: Al tener abierto el documento, seleccionamos °FILE° y seleccionamos
“EXPORT AS FASTA”
Ilustración 2. Export as Fasta

5. III. Tercer Paso: Crear un archivo y colocar su nombre luego lo guardamos. Ese archivo g lo
abrimos en °BLOCK DE NOTAS° y si es necesario borramos la parte mala ( N ) .
Ilustración 3. Block de Notas
IV. Cuarto paso: Abrimos la pagina web de NCBI y seleccionamos “NUCLEOTIDE BLAST°
Ilustración 4. NCBI

6. V. Quinto paso: Se copia la secuencia, configuramos en “SECUENCIA MUY SIMILARES°
luego hacemos click en °EXPLOSIÓN°.
Ilustración 5. Secuencia muy similares
Ilustración 6. Explosión

7. VI. Sexto paso: Nos mostrara algunos datos para el trabajo, como la longitud de la consulta,
nombre científico y el porcentaje de identidad.
Ilustración 7. Datos
Ilustración 8. Nombre científico y identidad
Y estos datos anotamos en nuestro Excel
Ilustración 9. Excel

8. 3. Resultados
- ZIP Hernan 3
Tabla 1 Elaboración Propia.
CODIGO
CALIDAD DE LA SECUENCIA
TAMAÑO DE
LA SECUENCIA ORGANISMO
%
IDENTIDAD
BUENO MALA REGULAR
DIVERSOS-_A07_1H_01.ab1 x 533 - -
DIVERSOS-_A08_9H_02.ab1 X 736 Herbaspirillum seropedicae 88.73%
DIVERSOS-_A09_1_01.ab1 X 582 Pseudonomas putida 83.21%
DIVERSOS-_A10_9_02.ab1 X 696 uncultered bacterium 86.14%
DIVERSOS-_A11_17_01.ab1 X 744 - -
DIVERSOS-_B07_2H_03.ab1 x 632 Stenotrophomonas sp. UYSB32 75.78%
DIVERSOS-_B08_10H_04.ab1 x 765 Leclercia adecarboxylata 83.45%
DIVERSOS-_B09_2_03.ab1 x 750 Klebsiella grimontii 82.35%
DIVERSOS-_B10_10_04.ab1 x 729 Enterobacter soli 71.76%
DIVERSOS-_B11_18_03.ab1 x 762 Pseudonomas sp 72.62%
DIVERSOS-_C07_3H_05.ab1 x 771 leclercia adecarboxilata 91.90%
DIVERSOS-_C08_11H_06.ab1 x 762 Enterobacter mori 91.07%
DIVERSOS-_C09_3_05.ab1 x 769 Phytobacter diasotrophicus 86.58%
DIVERSOS-_C10_11_06.ab1 x 840 Pseudomonas sp. 69.01%
DIVERSOS-_C11_19_05.ab1 x 783 Klebsiella aerogenes 65.62%
DIVERSOS-_D07_4H_07.ab1 x 810 bacteria no cultivadas 90.18%
DIVERSOS-_D08_12H_08.ab1 x 789 Staphylococcus sp. Estados Unidos - 13 84.27%
DIVERSOS-_D09_4_07.ab1 x 770 Phytobacter diazotrophicus 88.43%
DIVERSOS-_D10_12_08.ab1 845 Pseudomonas putida 81.82%
DIVERSOS-_E07_5H_09.ab1 x 816 - -
DIVERSOS-_E08-13H_10.ab1 x 785 Paraburkholderia silvatlantica 79.97%
DIVERSOS-_E09_5_09.ab1 x 872
Enterobacter hormaechei subsp.
Xiangfangensis 85.02%
DIVERSOS-_E10_13_10.ab1 x 915 bacteria no cultivada 67.47%
DIVERSOS-_F07_6H_11.ab1 x 741 Enterobacter ludwigii 95.89%
DIVERSOS-_F09_6_11.ab1 x 768 Klebsiella sp. 81.75
DIVERSOS-_F10_14_12.ab1 X 813 - -
DIVERSOS-_G07_7H_13.ab1 x 759 Enterobacter sp. ICBR 189 91.07%
DIVERSOS-_G09_7_13.ab1 x 830 Enterobacter sp. ICBR 189 73.78%
DIVERSOS._G10_15_14.ab1 x 784 Enterobacter asburiae 93.40%
DIVERSOS-_H07_8H_15.ab1 x 830 - -
DIVERSOS-_H09_8_15.ab1 x 849 - -
DIVERSOS-_H10_16_16.ab1 x 800 Enterobacter sp. IISDBZ9 84.42%

9. - ZIP SeqsHerbert
Tabla 2. Elaboración Propia
CODIGO
CALIDAD DE LA
SECUENCIA TAMAÑO
DE LA
SECUENCIA ORGANISMO
%
IDENTIDAD
BUENO MALA REGULAR
USER_04set2007_01-419NZ_A01_01.ab1 x 721 Klebsiella michiganensis 78.96%
USER_04set2007_02-526NZ_B01_03.ab1 x 812 Klebsiella variicola 85.85%
USER_04set2007_03-419AZ_C01_05.ab1 x 761 Klebsiella sp. MPUS7 97.35%
USER_04set2007_04-88NZ_D01_07.ab1 x 814 Klebsiella pneumoniae 94.39%
USER_04set2007_05-88AZ_E01_09.ab1 x 678 Klebsiella pneumoniae 95.18%
USER_04set2007_06-526Y1_F01_11.ab1 x 824 Klebsiella pneumoniae 95.91%
USER_04set2007_07-419Y1_G01_13.ab1 x 843 Enterobacter sp WF14-6 98.61%
USER_04set2007_08-375H_H01_15.ab1 x 588 Klebsiell oxytoca 73.75%
USER_04set2007_09-419YZ_A02_02.ab1 x 490 Enterobacter sp. CB7 95.81%
USER_04set2007_10-88H_B02_04.ab1 x 835 endosimbionte de Sphenophorus levis 72.46%
USER_04set2007_11-375NZ_C02_06.ab1 x 911 basteria no cultivadas 75.43%
USER_04set2007_12-526YZ_D02_08.ab1 x 370 klebsiella sp. BR3357 95.25%
USER_04set2007_13-483NZ_E02_10.ab1 x 732 Enterobacter sp 88.89%
USER_04set2007_14-483H_F02_12.ab1 x 645 Enterobacter hormaechei 88.47%
USER_04SET2007_15-456NZ_G02_14.ab1 x 778 bacilo turingiensico 91.54%
- ZIP SeqsHerbert_9
Tabla 3. Elaboración Propia
CODIGO
CALIDAD DE LA SECUENCIA
TAMAÑO DE LA
SECUENCIA ORGANISMO
%
IDENTIDAD
BUENO MALA REGULAR
user_12set2007_01_A03_01.ab1 x 692 Kosakonia radicincitans 81.60%
user_12set2007_02_B03_03.ab1 x 616 bacteria del suelo no cultivada 71.52%
user_12set2007_03_C03_05.ab1 x 542 klebsiella pneumoniae 75.71%
user_12set2007_04_D03_07.ab1 x 741 kosakonia oryzae 80.55%
user_12set2007_05_E03_09.ab1 x 627 Enterobacter sp. 92.10%
user_12set2007_06_F03_11.ab1 x 795 - -
user_12set2007_07_G03_13.ab1 x 789 - -
user_12set2007_08_H03_15.ab1 x 347 Erwinia sp ZFGT-4 76.77%
user_12set2007_09_A04_02.ab1 x 776 - -
user_12set2007_10_B04_04.ab1 x 733 Achromobacter sp. 76.67%
user_12set2007_11_C04_06.ab1 x 728 Enterobacter cloacae 72.58%
user_12set2007_12_D04_08.ab1 x 445 Bacteria Enterobacteriaceae 85.71%
user_12set2007_13_E04_10.ab1 x 383 - -
user_12set2007_14_F04_12.ab1 x 827 Pantosa deleyi 75.82%
user_12set2007_15_G04_14.ab1 x 740 Klebsiella sp 88.22%
user_12set2007_16_H04_16.ab1 x 710 Kosakonia sacchari 77.42%
usuarios_12set2007_1Y2_F04_12.ab1 x 874 Kosakonia radicincitans 79.20%
usuarios_12set2007_2Y2_G04_14.ab1 x 576 Herbaspirillum sp 86.75%
usuario_12set2007_3Y2_H04_16.ab1 x 535 Klebsiella sp. MB42 79.04%
usuarios_12set2007_17_A04_02.ab1 x 822 Rhizobium lusitanum 71.09%
usuarios_12set2007_18_B04_04.ab1 x 434 klebsiella michiganensis 82.73%
usuarios_12set2007_19_C04_06.ab1 x 727 Pseudomonas sp. AMF3577 69.78%
usuarios_12set2007_20_D04_08.ab1 x 633 klebsiella pneumoniae 73.08%
usuarios_12set2007_21_E04_10.ab1 x 394 bacteria no cultivada 74.24%

10. 4. Conclusión
Finalizando el proyecto, las secuencias se presenciaba en el programa Biedith eran ruidos.
Teniendo en cuenta la frecuencia que se presentaba en el programa. al utilizar el cuadro de
Excel se dividió en buena, mala y regular para eso se tomo en cuenta que 0 > 90% es regular y
de 90% < n es buena. podemos concluir que la base de datos fueron bacterias y otras sin cultivar y por
otro lado no se pudo reconocer.
5. Bibliografía
✓ Sánchez, M. M., & Castro, N. M. C. (2004). Desarrollo y evaluación de una prueba de
reacción en cadena de la polimerasa (PCR), utilizando la secuencia del gen hilA para
diagnóstico de fiebre entérica por Salmonella spp. Biomédica, 24(2), 194-199.
✓ Directorio, U. V., & de Servicios, C. Secuenciación del gen 16S rRNA.
✓ Camacho Sánchez, T. G. (2018). Secuenciación de la región 16S de cepas
aisladas de BAL y determinación de su capacidad bactericida (Bachelor's thesis,
Universidad del Azuay).