Este documento discute varios temas relacionados con los cambios en el genoma, incluyendo: 1) El tamaño y contenido de ADN repetitivo en genomas procariotas y eucariotas; 2) Los mecanismos de duplicación génica y formación de familias de genes; 3) Los elementos transponibles y su papel en la evolución genómica.
2. CAMBIOS EN EL GENOMA
a. Tamaño del Genoma y ADN repetitivo.
b. Duplicación Génica
c. Familia de genes e importancia evolutiva.
d. Transposiciones y retro-transposiciones.
e. Mezclado de Exones.
f. Conversión génica.
3. El GENOMA es el conjunto del
material hereditario de un organismo,
la secuencia de nucleótidos que
especifican las instrucciones
genéticas para el desarrollo y
funcionamiento del mismo y que son
transmitidas de generación en
generación, de padres a hijos
4. El tamaño del GENOMA PROCARIONTE oscila, dependiendo
de la especie, entre 560 Kb y 9500 Kb.
Los procariontes “especialistas” tienden a tener un tamaño
pequeño de genoma (promedio 1900 Kb).
Los procariontes “generalistas” tienden a tener genomas más
grandes (promedio 4900 Kb).
Esta correlación, sin embargo, no es perfecta, dado que la
distribución de tamaños traslapa extensamente entre estas dos
categorías.
6. ¿Hay una relación entre tamaño de genoma y
número de genes?
El tamaño del gen procariótico es uniforme. La
densidad génica es más o menos constante, tanto en
bacterias, como en arqueas.
En los procariotas, los genomas mayores tienen más
genes y son más complejos.
7. EL GENOMA EUCARIOTA
El tamaño del Genoma en Eucariotas se
define como el valor C o cantidad de ADN por
genoma haploide. Se denomina C, por constante
o característico, para indicar el hecho de que el
tamaño es prácticamente constante dentro de una
especie
8. ¿las diferencias en los tamaños del genoma son debidas a ADN
génico o no génico?
El genoma de Eucariotas está compuesto de una gran cantidad de
ADN repetitivo. Los genes se encuentran interrumpidos por
secuencias no codificantes e intrones. Se trata, en ambos casos de
ADN aparentemente superfluo, que contribuye a la gran variación
en los valores C
10. A la falta de correspondencia entre los valores C y la cantidad
presumible de información genética contenida dentro de los
genomas se le llamó Paradoja del Valor C.
Tenemos miles de secuencias repetidas de varios tamaños
dispersas por los cromosomas.
11. ADN no Codificante
ADN espaciador situado entre regiones
codificantes del genoma
ADN Repetitivo consta de numerosas copias
idénticas entre sí, que se sitúan a lo largo de todo
el genoma.
12. ADN Repetitivo
Secuencias repetitivas en
tándem, relativamente cortas.
Secuencias repetidas
intercaladas más largas.
Altamente repetitivo
microsatélites, minisatélites
VNTRs
Moderadamente repetitivo
(copias dispersas)
Elementos transponibles.
13. Asociado a centrómeros y telómeros.
Secuencias cortas <10 pb.
Función: mantener la arquitectura del
cromosoma
ADN altamente repetitivo.
Microsatélite
14. • El contenido total de micro satélites de un organismo se
correlaciona positivamente por el tamaño del genoma. En los
humanos existe alrededor de un millón de loci microsatelitales
que comprenden aproximadamente 3% del genoma.
• El estudio de los microsatélites ha tenido múltiples usos, por su
alta variabilidad y su herencia codominante, que facilita la
identificación de los alelos.
• En medicina, se los ha utilizado para estudiar la evolución de
algunos carcinomas, puesto que la tasa de mutación aumenta con
la progresión de la enfermedad.
15. ADN minisatélite (VNTR)
Repeticiones de tamaño moderado (60pb)
Distribuidas por todo el genoma, principalmente en
telómeros
Normalmente no se transcriben
Tipos:
ADN minisatélite hipervariable
ADN telomérico
16. Transposiciones y
Retrotransposiciones
Una poderosa fuente de cambio tanto en los
genomas de eucariotas como de procariotas está
dada por los referidos Elementos Transponibles,
genéricamente llamados Elementos Móviles.
17. TRANSPOSONES Y ELEMENTOS GENÉTICOS MÓVILES
“ ….. Un EGM es un segmento de ADN que puede moverse de un lugar a otro en el
genoma de un organismo.…. Puede ser sacado de un lugar y ser insertado en otro. El
movimiento de un EGM puede producir mutaciones o rearreglos cromosómicos y
afectar de esa manera la expresión de otros genes .… ”
Barbara McClintock al inicio de los años 50.
Herencia del color y distribución de la
pigmentación del maíz demostró la existencia
de elementos genéticos que pueden
transponerse.
18. Estas secuencias llegan a ocupar el 50% del
genoma del maíz, el 35% del genoma de
humanos, o el 10% del genoma de Drosophila
localizándose principalmente en regiones de la
heterocromatina.
Se ha estimado que el genoma del maíz se ha
duplicado a causa de los elementos transponibles
en los últimos tres millones de años de su
evolución
19. Las secuencias repetidas-dispersas se han
calificado como elementos egoístas, se mantienen en
el genoma por su posibilidad de replicarse junto a él.
Posibilitan una importante flexibilidad y capacidad
evolutiva a los genomas hospederos
20. Los elementos pueden moverse a través
de ADN o pueden moverse a través de un
intermediario de ARN
Los elementos móviles que se mueven a
través de ADN como intermediarios se
conocen como TRANSPOSONES
Los elementos móviles que se mueven a
través de ARN se conocen como
RETROTRANSPOSONES
22. EGM’s en cereales son responsables por las diferencias en
el tamaño del genoma
23. .
ESTOS ELEMENTOS CONTRIBUYEN A LA EVOLUCIÓN
Los transposones tienen la capacidad para producir
duplicados de sí mismos y dispersar estos duplicados en otros
sitios del mismo cromosoma o de otros cromosomas.
Estos genes duplicados son entonces libres para transitar su
propio camino evolutivo, dejando que sus funciones sean
desempeñadas por los genes parentales originales.
Los genes duplicados están libres, por lo tanto, de
restricciones selectivas, permitiendo que se acumulen las
mutaciones.
24. Duplicación Génica y familia de
genes
Una Duplicación es una repetición de un fragmento de ADN.
Estos sucesos pueden ocurrir por errores en la Replicación, pero
también por Recombinaciones Desiguales entre cromátidas y por la
acción de Retrotransposones
Las Familias de GENES están formadas
de genes similares pero no idénticos. La
familia de genes de la globina es la
familia de genes mejor estudiada.
25. Una FAMILIA GÉNICA O FAMILIA MULTIGÉNICA es un grupo
de loci cromosómicos cuya secuencia de nucleótidos es
similar y que derivan de una secuencia común ancestral.
Este hecho se explica por una mayor acumulación de
mutaciones debido a la menor presión de selección
existente sobre una variante génica cuando existe otra
copia viable en correcto funcionamiento.
ESTE HECHO SE CONSIDERA UN MÉTODO DE GENERACIÓN
DE VARIABILIDAD.
26. La importancia evolutiva de la duplicación génica fue destacada por Ohno (1968) y
desde entonces se lo considera uno de los procesos mas eficientes para GENERAR
NOVEDAD EVOLUTIVA.
El material duplicado también crea oportunidades únicas para una mayor expansión
de las familias génicas, como lo ilustra la evolución de los complejos Hox y otras
familias génicas de vertebrados.
Los genes Hox pueden constituir
una familia de genes producida por
duplicaciones y divergencia
Son responsables del desarrollo
embriológico de todos los animales.
Determinan los diferentes
segmentos de un cuerpo.