Este documento describe diferentes métodos para la transfección de células, incluyendo el sistema de doble híbrido en levaduras y mamíferos para estudiar la interacción de proteínas, el uso de marcadores de selección como la G418 y zeocina, y sistemas regulables por tetraciclina. También explica métodos para disminuir la expresión génica mediante ribozimas, ARN antisentido y RNAi utilizando siRNAs. Finalmente, detalla estrategias para diseñar bibliotecas de siRNAs y vectores para la
11. Enriquecimiento de transfectantes
• Cell sorting
Cotransfectando con vectores de expresión
para GFP o proteínas de membrana que
sean reconocidas por Ac-fluorescentes
12. Transfección estable
• Por integración
• Por recombinación homóloga
• Como episoma
• Requiere de un marcador de selección en el
vector
• Util para estudios que impliquen inducción
de la expresión
13.
14. Marcadores de selección eucariontes
• Agent Action Marker Gene
• Blasticidin S Inhiben síntesis BlasticidinS deaminase
• Hygromycin B proteica Gen hyg o hph
• Puromycin
• G-418 Neomycin phosphotransferase
• Zeocina Intercalante del DNA gen Sh ble, se une
• MTX Inhibits DNA syn. Dihydrofolate reductase
15. Marcadores de selección
• G418 (Geneticina)
– Bloquea la traducción
– La resistencia es la neomicina fosfotransferasa ( Neor
)
– Para células de mamífero, plantas y levaduras
• Zeocina
- Antibiótico de la familia bleomicina
- Cliva el DNA
- El producto del gen ble se une e impide el pegado al DNA.
-de amplio espectro (mamíferos, levaduras y bacterias)
35. Síntesis in vitro
• Síntesis química
• Transcripción in vitro
• Digestión de los dsRNA por RNase
III/DICER
Expression in vivo
• Plásmidos
• Templados para PCR (cassette de expresión
siRNA)
• Vectores virales
36. -RNAi (siRNA)
Clivado del mRNA blanco
aaaaa----------------caaucggccccuucguuua----
guuagccggggaagcaaau auuugcuuccccggcuaacRNAi
(30 a 50 nucleotidos)
mRNA
a) Síntesis
cDNA
Degradación por RNAsa
Procesados por la maquinaria celular (dicer…)
38. Expresión de siRNA in vivo
Promotor/Enhancer
• • Pol III (U6, H1)
• • Pol II (CMV)
Secuencia de terminación
• Pol III: string of 3-5
T’s)
Señal de poly(A) SV40
siRNA Templado
Templado para cadenas sense ,
hairpin y antisense del siRNA
40. Vectores Plasmídicos
Expresión transiente
• No se trabaja con RNA
• Produce gran cantidad de vector
• Enriquecimiento de células transfectadas por
sorting o selección
Expresión Estable (marcadores de selección)
• Produce líneas estables
• Animales transgénicos